14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plim_1438 on replicon NC_014148
Organism: Planctomyces limnophilus DSM 3776



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014148  Plim_1438  hypothetical protein  100 
 
 		 828 aa  1718    Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.45862  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1581  PA14 domain protein  28.37 
 
 		 969 aa  269  2e-70  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0200  cytochrome c class I  21.39 
 
 		 743 aa  89.7  2e-16  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3235  protein of unknown function DUF1080  25.91 
 
 		 595 aa  64.3  0.00000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.0080488  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4772  protein of unknown function DUF1080  27.27 
 
 		 628 aa  60.8  0.0000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.205682  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1416  hypothetical protein  26.29 
 
 		 252 aa  50.4  0.0001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6272  protein of unknown function DUF1080  22.82 
 
 		 482 aa  50.8  0.0001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.00000049717  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3383  cytochrome c class I  35.8 
 
 		 120 aa  50.1  0.0002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1775  cytochrome c family protein  36.49 
 
 		 272 aa  47.4  0.001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.579886  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1099  hypothetical protein  23.38 
 
 		 579 aa  47.4  0.001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.699009  normal  0.558006 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6139  hypothetical protein  23.81 
 
 		 563 aa  47.4  0.001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1229  cytochrome c class I  45.28 
 
 		 98 aa  46.6  0.002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2759  cytochrome c class I  37.29 
 
 		 253 aa  45.8  0.003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3334  cytochrome c family protein, putative  38.24 
 
 		 104 aa  44.3  0.009  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.115462  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>