30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_2130 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013037  Dfer_2130  protein of unknown function DUF1080  100 
 
 		 258 aa  537  9.999999999999999e-153  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0703426  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1623  protein of unknown function DUF1080  47 
 
 		 255 aa  210  2e-53  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1044  protein of unknown function DUF1080  49.78 
 
 		 247 aa  208  8e-53  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2684  hypothetical protein  45.97 
 
 		 254 aa  207  1e-52  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.231915  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5826  protein of unknown function DUF1080  44.07 
 
 		 255 aa  207  1e-52  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.515492  normal  0.0752665 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3234  protein of unknown function DUF1080  46.58 
 
 		 254 aa  207  2e-52  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.000172621  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4771  protein of unknown function DUF1080  41.73 
 
 		 268 aa  201  9.999999999999999e-51  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.30257  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3796  protein of unknown function DUF1080  46.98 
 
 		 257 aa  195  6e-49  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.537243  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4614  hypothetical protein  47.66 
 
 		 259 aa  193  2e-48  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.906786 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3044  hypothetical protein  44.55 
 
 		 352 aa  189  2.9999999999999997e-47  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.20864 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00436  putative multi-domain protein  39.54 
 
 		 281 aa  186  3e-46  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0594334  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3945  protein of unknown function DUF1080  32.35 
 
 		 540 aa  100  2e-20  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0038  protein of unknown function DUF1080  33.84 
 
 		 325 aa  100  2e-20  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1017  protein of unknown function DUF1080  33.8 
 
 		 786 aa  89  7e-17  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0838366  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0676  protein of unknown function DUF1080  31.5 
 
 		 345 aa  88.2  1e-16  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6272  protein of unknown function DUF1080  32.76 
 
 		 482 aa  75.1  0.000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.00000049717  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1879  protein of unknown function DUF1080  29.94 
 
 		 629 aa  74.7  0.000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.985217 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4772  protein of unknown function DUF1080  30.86 
 
 		 628 aa  68.6  0.00000000009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.205682  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1970  protein of unknown function DUF1080  27.64 
 
 		 260 aa  66.2  0.0000000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.46172 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2206  protein of unknown function DUF1080  30.34 
 
 		 478 aa  65.1  0.000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.84038  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3235  protein of unknown function DUF1080  27.51 
 
 		 595 aa  62.8  0.000000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.0080488  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3370  protein of unknown function DUF1080  26.4 
 
 		 263 aa  60.5  0.00000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.443238  normal  0.281271 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2672  protein of unknown function DUF1080  25.53 
 
 		 1140 aa  58.2  0.0000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.189319 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5384  protein of unknown function DUF1080  25.56 
 
 		 322 aa  53.9  0.000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2871  protein of unknown function DUF1080  26.99 
 
 		 326 aa  50.4  0.00003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0516361  normal  0.710867 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2324  hypothetical protein  28.12 
 
 		 308 aa  47  0.0003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.460066  normal  0.0304211 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2976  protein of unknown function DUF1080  22.56 
 
 		 1145 aa  44.3  0.002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.657239  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3462  protein of unknown function DUF1080  24.51 
 
 		 261 aa  43.5  0.003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.772407  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3566  hypothetical protein  26.83 
 
 		 222 aa  43.5  0.004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0845109  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3405  protein of unknown function DUF1080  30.1 
 
 		 321 aa  42.4  0.008  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.177564  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>