51 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_4771 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013730  Slin_4771  protein of unknown function DUF1080  100 
 
 
268 aa  554  1e-157  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.30257  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3234  protein of unknown function DUF1080  59.84 
 
 
254 aa  300  1e-80  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.000172621  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5826  protein of unknown function DUF1080  48.8 
 
 
255 aa  238  5e-62  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.515492  normal  0.0752665 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2684  hypothetical protein  46.67 
 
 
254 aa  233  2.0000000000000002e-60  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.231915  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1044  protein of unknown function DUF1080  48.13 
 
 
247 aa  231  1e-59  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4614  hypothetical protein  47.76 
 
 
259 aa  225  6e-58  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.906786 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00436  putative multi-domain protein  46.92 
 
 
281 aa  221  7e-57  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0594334  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3796  protein of unknown function DUF1080  50.44 
 
 
257 aa  219  3.9999999999999997e-56  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.537243  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3044  hypothetical protein  50.22 
 
 
352 aa  215  7e-55  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.20864 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1623  protein of unknown function DUF1080  47.83 
 
 
255 aa  209  4e-53  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2130  protein of unknown function DUF1080  41.73 
 
 
258 aa  201  1.9999999999999998e-50  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0703426  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3945  protein of unknown function DUF1080  39.62 
 
 
540 aa  134  1.9999999999999998e-30  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0676  protein of unknown function DUF1080  39.52 
 
 
345 aa  128  1.0000000000000001e-28  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0038  protein of unknown function DUF1080  35.21 
 
 
325 aa  119  3.9999999999999996e-26  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1017  protein of unknown function DUF1080  34.96 
 
 
786 aa  107  2e-22  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0838366  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1879  protein of unknown function DUF1080  33.33 
 
 
629 aa  93.2  4e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.985217 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2871  protein of unknown function DUF1080  33 
 
 
326 aa  81.6  0.00000000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0516361  normal  0.710867 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1970  protein of unknown function DUF1080  29.67 
 
 
260 aa  79  0.00000000000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.46172 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5384  protein of unknown function DUF1080  32.14 
 
 
322 aa  77.8  0.0000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2206  protein of unknown function DUF1080  35.86 
 
 
478 aa  74.7  0.000000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.84038  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3370  protein of unknown function DUF1080  29.37 
 
 
263 aa  72.8  0.000000000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.443238  normal  0.281271 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2324  hypothetical protein  32.82 
 
 
308 aa  71.6  0.00000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.460066  normal  0.0304211 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3405  protein of unknown function DUF1080  31.76 
 
 
321 aa  70.5  0.00000000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.177564  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6272  protein of unknown function DUF1080  31.55 
 
 
482 aa  70.5  0.00000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.00000049717  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4772  protein of unknown function DUF1080  35.97 
 
 
628 aa  69.7  0.00000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.205682  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3462  protein of unknown function DUF1080  28.26 
 
 
261 aa  67.8  0.0000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.772407  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3650  protein of unknown function DUF1080  27.88 
 
 
230 aa  67  0.0000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3235  protein of unknown function DUF1080  30.94 
 
 
595 aa  64.7  0.000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.0080488  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0046  protein of unknown function DUF1080  24.7 
 
 
451 aa  63.5  0.000000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1742  protein of unknown function DUF1080  28.76 
 
 
241 aa  63.2  0.000000005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4583  protein of unknown function DUF1080  27.83 
 
 
234 aa  60.5  0.00000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00498268  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2672  protein of unknown function DUF1080  21.82 
 
 
1140 aa  59.3  0.00000006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.189319 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2202  protein of unknown function DUF1080  29.36 
 
 
453 aa  57.4  0.0000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.262021  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4651  protein of unknown function DUF1080  27.76 
 
 
226 aa  56.2  0.0000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.264791  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3566  hypothetical protein  27.19 
 
 
222 aa  55.5  0.0000009  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0845109  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2976  protein of unknown function DUF1080  26.46 
 
 
1145 aa  53.9  0.000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.657239  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0438  protein of unknown function DUF1080  28.88 
 
 
247 aa  53.9  0.000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.11505  normal  0.50578 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0366  hypothetical protein  26.55 
 
 
239 aa  52.8  0.000005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5676  protein of unknown function DUF1080  27.39 
 
 
455 aa  52.4  0.000008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.644868  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1060  protein of unknown function DUF1080  27 
 
 
260 aa  48.9  0.00009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2881  protein of unknown function DUF1080  25.11 
 
 
452 aa  48.5  0.0001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1130  protein of unknown function DUF1080  27.84 
 
 
240 aa  48.1  0.0002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.342121 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6569  protein of unknown function DUF1080  28.26 
 
 
238 aa  47.4  0.0002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.301124  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7277  protein of unknown function DUF1080  24.02 
 
 
237 aa  47  0.0003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.271098  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2940  protein of unknown function DUF1080  25.93 
 
 
216 aa  45.4  0.0009  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.221061  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3433  protein of unknown function DUF1080  23.79 
 
 
239 aa  45.4  0.001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.552511  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1648  hypothetical protein  23.35 
 
 
193 aa  44.7  0.001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.761562  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7254  protein of unknown function DUF1080  25.97 
 
 
440 aa  44.7  0.002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.0000293635  normal  0.71245 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1099  hypothetical protein  26.38 
 
 
579 aa  42.7  0.006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.699009  normal  0.558006 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5725  protein of unknown function DUF1080  25.23 
 
 
198 aa  42.7  0.007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.0208334 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2385  protein of unknown function DUF1080  25.33 
 
 
217 aa  42.4  0.009  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.40187  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>