56 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_3433 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013037  Dfer_3433  protein of unknown function DUF1080  100 
 
 
239 aa  496  1e-139  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.552511  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7277  protein of unknown function DUF1080  46.33 
 
 
237 aa  186  2e-46  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.271098  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3462  protein of unknown function DUF1080  38.62 
 
 
261 aa  169  3e-41  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.772407  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1742  protein of unknown function DUF1080  35 
 
 
241 aa  159  4e-38  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1060  protein of unknown function DUF1080  39.35 
 
 
260 aa  156  3e-37  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0438  protein of unknown function DUF1080  38.4 
 
 
247 aa  154  8e-37  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.11505  normal  0.50578 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4583  protein of unknown function DUF1080  38.97 
 
 
234 aa  152  2.9999999999999998e-36  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00498268  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3650  protein of unknown function DUF1080  37.08 
 
 
230 aa  153  2.9999999999999998e-36  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3566  hypothetical protein  34.5 
 
 
222 aa  149  3e-35  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0845109  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4651  protein of unknown function DUF1080  37.39 
 
 
226 aa  145  8.000000000000001e-34  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.264791  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0366  hypothetical protein  33.33 
 
 
239 aa  142  4e-33  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3047  protein of unknown function DUF1080  35.98 
 
 
242 aa  138  8.999999999999999e-32  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.134306 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6569  protein of unknown function DUF1080  37.3 
 
 
238 aa  135  4e-31  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.301124  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7254  protein of unknown function DUF1080  37.72 
 
 
440 aa  134  9e-31  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.0000293635  normal  0.71245 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1130  protein of unknown function DUF1080  28.03 
 
 
240 aa  132  3.9999999999999996e-30  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.342121 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5403  protein of unknown function DUF1080  35.75 
 
 
240 aa  129  4.0000000000000003e-29  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.784732 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2202  protein of unknown function DUF1080  36.28 
 
 
453 aa  123  2e-27  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.262021  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5676  protein of unknown function DUF1080  33.63 
 
 
455 aa  113  2.0000000000000002e-24  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.644868  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3358  hypothetical protein  32.02 
 
 
272 aa  107  1e-22  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0905705  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2881  protein of unknown function DUF1080  33.63 
 
 
452 aa  106  3e-22  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2672  protein of unknown function DUF1080  30.09 
 
 
1140 aa  89  7e-17  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.189319 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2976  protein of unknown function DUF1080  31.58 
 
 
1145 aa  83.2  0.000000000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.657239  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0046  protein of unknown function DUF1080  25.93 
 
 
451 aa  72  0.000000000007  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11080  glucose/sorbosone dehydrogenase  30.52 
 
 
1505 aa  71.6  0.00000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.120578  normal  0.319442 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5725  protein of unknown function DUF1080  29.56 
 
 
198 aa  61.6  0.000000009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.0208334 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2322  protein of unknown function DUF1080  26.7 
 
 
1444 aa  61.6  0.00000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.205839  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3499  protein of unknown function DUF1080  23.98 
 
 
234 aa  60.1  0.00000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.0089925  normal  0.745497 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1206  protein of unknown function DUF1080  26.07 
 
 
229 aa  57.4  0.0000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.219996 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1177  protein of unknown function DUF1080  25.73 
 
 
214 aa  56.2  0.0000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5826  protein of unknown function DUF1080  25.65 
 
 
255 aa  55.1  0.0000009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.515492  normal  0.0752665 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4384  protein of unknown function DUF1080  29.61 
 
 
211 aa  54.7  0.000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.968412  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2940  protein of unknown function DUF1080  23.58 
 
 
216 aa  54.3  0.000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.221061  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7244  protein of unknown function DUF1080  29.25 
 
 
198 aa  53.9  0.000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.709056  normal  0.87316 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0627  protein of unknown function DUF1080  26.94 
 
 
558 aa  52.8  0.000005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0295  protein of unknown function DUF1080  31.68 
 
 
212 aa  51.6  0.00001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.154289  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1648  hypothetical protein  24.3 
 
 
193 aa  50.8  0.00002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.761562  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2356  protein of unknown function DUF1080  32.58 
 
 
453 aa  50.4  0.00002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3234  protein of unknown function DUF1080  25.68 
 
 
254 aa  50.1  0.00003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.000172621  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0347  hypothetical protein  24.05 
 
 
215 aa  47.8  0.0001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.794857  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0966  protein of unknown function DUF1080  23.97 
 
 
259 aa  47.8  0.0001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.0225828 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1112  hypothetical protein  21.66 
 
 
197 aa  48.1  0.0001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.58426  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4614  hypothetical protein  22.77 
 
 
259 aa  47  0.0003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.906786 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1021  protein of unknown function DUF1080  25.32 
 
 
515 aa  46.6  0.0003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.943633  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4771  protein of unknown function DUF1080  23.79 
 
 
268 aa  45.4  0.0008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.30257  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1607  protein of unknown function DUF1080  24.62 
 
 
234 aa  45.4  0.0009  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0308822  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0153  hypothetical protein  23.15 
 
 
501 aa  45.1  0.0009  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0884  hypothetical protein  22.39 
 
 
259 aa  45.1  0.001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.596872  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3175  protein of unknown function DUF1080  27.18 
 
 
258 aa  45.1  0.001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1708  protein of unknown function DUF1080  24.85 
 
 
451 aa  43.9  0.002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.978176  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0069  protein of unknown function DUF1080  25 
 
 
209 aa  43.9  0.002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.334679 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0958  protein of unknown function DUF1080  24.68 
 
 
212 aa  43.5  0.003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5719  protein of unknown function DUF1080  22.11 
 
 
298 aa  43.1  0.004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00753929 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1169  hypothetical protein  24.37 
 
 
224 aa  43.1  0.004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.520226 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2283  protein of unknown function DUF1080  23.21 
 
 
313 aa  42.7  0.005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.835923  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4053  protein of unknown function DUF1080  29.07 
 
 
244 aa  42.4  0.007  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0552867  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1044  protein of unknown function DUF1080  21.78 
 
 
247 aa  42  0.008  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>