49 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_7254 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013132  Cpin_7254  protein of unknown function DUF1080  100 
 
 
440 aa  912    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.0000293635  normal  0.71245 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2202  protein of unknown function DUF1080  65.91 
 
 
453 aa  583  1.0000000000000001e-165  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.262021  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5676  protein of unknown function DUF1080  58.14 
 
 
455 aa  528  1e-149  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.644868  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2881  protein of unknown function DUF1080  57.44 
 
 
452 aa  490  1e-137  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0438  protein of unknown function DUF1080  57.58 
 
 
247 aa  257  3e-67  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.11505  normal  0.50578 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1021  protein of unknown function DUF1080  53.4 
 
 
515 aa  222  8e-57  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.943633  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1708  protein of unknown function DUF1080  34.4 
 
 
451 aa  199  6e-50  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.978176  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3462  protein of unknown function DUF1080  45.45 
 
 
261 aa  181  2e-44  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.772407  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4583  protein of unknown function DUF1080  42.27 
 
 
234 aa  166  5.9999999999999996e-40  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00498268  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6569  protein of unknown function DUF1080  43.53 
 
 
238 aa  165  2.0000000000000002e-39  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.301124  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7277  protein of unknown function DUF1080  40.27 
 
 
237 aa  163  5.0000000000000005e-39  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.271098  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4651  protein of unknown function DUF1080  41.63 
 
 
226 aa  143  7e-33  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.264791  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3650  protein of unknown function DUF1080  38.94 
 
 
230 aa  141  1.9999999999999998e-32  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1742  protein of unknown function DUF1080  38.6 
 
 
241 aa  141  3e-32  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3566  hypothetical protein  35.4 
 
 
222 aa  139  7.999999999999999e-32  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0845109  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3433  protein of unknown function DUF1080  37.72 
 
 
239 aa  134  1.9999999999999998e-30  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.552511  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1060  protein of unknown function DUF1080  37.66 
 
 
260 aa  125  2e-27  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3358  hypothetical protein  36.95 
 
 
272 aa  112  1.0000000000000001e-23  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0905705  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0366  hypothetical protein  35.11 
 
 
239 aa  111  3e-23  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3047  protein of unknown function DUF1080  32.27 
 
 
242 aa  108  3e-22  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.134306 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1130  protein of unknown function DUF1080  31.36 
 
 
240 aa  105  1e-21  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.342121 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5725  protein of unknown function DUF1080  37.1 
 
 
198 aa  103  8e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.0208334 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2385  protein of unknown function DUF1080  35.38 
 
 
217 aa  99  1e-19  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.40187  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2976  protein of unknown function DUF1080  25.95 
 
 
1145 aa  91.7  2e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.657239  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5403  protein of unknown function DUF1080  32.89 
 
 
240 aa  90.5  5e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.784732 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7244  protein of unknown function DUF1080  32.63 
 
 
198 aa  90.1  7e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.709056  normal  0.87316 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4384  protein of unknown function DUF1080  35.83 
 
 
211 aa  89.7  1e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.968412  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2672  protein of unknown function DUF1080  26.17 
 
 
1140 aa  89  2e-16  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.189319 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6337  protein of unknown function DUF1080  32.04 
 
 
218 aa  85.9  0.000000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.975208  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0046  protein of unknown function DUF1080  24.63 
 
 
451 aa  85.1  0.000000000000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3499  protein of unknown function DUF1080  29.36 
 
 
234 aa  76.6  0.0000000000008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.0089925  normal  0.745497 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0295  protein of unknown function DUF1080  31.21 
 
 
212 aa  73.6  0.000000000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.154289  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0627  protein of unknown function DUF1080  27.42 
 
 
558 aa  68.9  0.0000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2356  protein of unknown function DUF1080  25.39 
 
 
453 aa  67.4  0.0000000005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0347  hypothetical protein  30.95 
 
 
215 aa  60.8  0.00000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.794857  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0248  protein of unknown function DUF1080  28.38 
 
 
290 aa  60.5  0.00000006  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0966  protein of unknown function DUF1080  25.79 
 
 
259 aa  57  0.0000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.0225828 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1648  hypothetical protein  28.48 
 
 
193 aa  57  0.0000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.761562  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4053  protein of unknown function DUF1080  29.06 
 
 
244 aa  53.1  0.000009  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0552867  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0639  protein of unknown function DUF1080  31.33 
 
 
231 aa  52.4  0.00002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.798724  normal  0.087669 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2322  protein of unknown function DUF1080  27.27 
 
 
1444 aa  51.2  0.00004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.205839  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3175  protein of unknown function DUF1080  25.45 
 
 
258 aa  50.4  0.00007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4607  hypothetical protein  23.4 
 
 
276 aa  49.3  0.0001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.0827513 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1112  hypothetical protein  26.16 
 
 
197 aa  49.7  0.0001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.58426  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2871  protein of unknown function DUF1080  31.29 
 
 
326 aa  48.1  0.0003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0516361  normal  0.710867 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1607  protein of unknown function DUF1080  26.9 
 
 
234 aa  47.8  0.0004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0308822  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2940  protein of unknown function DUF1080  26.46 
 
 
216 aa  47.8  0.0004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.221061  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4771  protein of unknown function DUF1080  25.97 
 
 
268 aa  44.7  0.004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.30257  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3234  protein of unknown function DUF1080  24.19 
 
 
254 aa  44.3  0.004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.000172621  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>