30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_6337 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013730  Slin_6337  protein of unknown function DUF1080  100 
 
 
218 aa  450  1.0000000000000001e-126  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.975208  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2385  protein of unknown function DUF1080  45.5 
 
 
217 aa  161  8.000000000000001e-39  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.40187  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0295  protein of unknown function DUF1080  41.62 
 
 
212 aa  151  5.9999999999999996e-36  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.154289  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1708  protein of unknown function DUF1080  33.9 
 
 
451 aa  92.4  5e-18  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.978176  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3175  protein of unknown function DUF1080  31.25 
 
 
258 aa  88.2  8e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5725  protein of unknown function DUF1080  32.38 
 
 
198 aa  86.7  3e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.0208334 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7254  protein of unknown function DUF1080  33.01 
 
 
440 aa  85.9  5e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.0000293635  normal  0.71245 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2881  protein of unknown function DUF1080  32.11 
 
 
452 aa  85.1  7e-16  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5676  protein of unknown function DUF1080  34.76 
 
 
455 aa  84.3  0.000000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.644868  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2202  protein of unknown function DUF1080  31.36 
 
 
453 aa  82.8  0.000000000000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.262021  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0627  protein of unknown function DUF1080  33.33 
 
 
558 aa  81.6  0.000000000000009  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0966  protein of unknown function DUF1080  29.34 
 
 
259 aa  79.3  0.00000000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.0225828 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4384  protein of unknown function DUF1080  32.08 
 
 
211 aa  78.6  0.00000000000008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.968412  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1021  protein of unknown function DUF1080  29.9 
 
 
515 aa  72.8  0.000000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.943633  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7244  protein of unknown function DUF1080  31.82 
 
 
198 aa  73.2  0.000000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.709056  normal  0.87316 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0347  hypothetical protein  27.83 
 
 
215 aa  72.8  0.000000000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.794857  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4053  protein of unknown function DUF1080  28.57 
 
 
244 aa  57  0.0000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0552867  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2672  protein of unknown function DUF1080  27.8 
 
 
1140 aa  55.1  0.0000007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.189319 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0639  protein of unknown function DUF1080  29.59 
 
 
231 aa  50.4  0.00002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.798724  normal  0.087669 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0046  protein of unknown function DUF1080  25.93 
 
 
451 aa  50.1  0.00003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2976  protein of unknown function DUF1080  24.89 
 
 
1145 aa  48.1  0.00009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.657239  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2324  hypothetical protein  26.45 
 
 
308 aa  47.8  0.0001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.460066  normal  0.0304211 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3462  protein of unknown function DUF1080  28.82 
 
 
261 aa  47  0.0002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.772407  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0069  protein of unknown function DUF1080  21.39 
 
 
209 aa  45.1  0.0007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.334679 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0438  protein of unknown function DUF1080  27.14 
 
 
247 aa  44.7  0.001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.11505  normal  0.50578 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7277  protein of unknown function DUF1080  27.81 
 
 
237 aa  45.1  0.001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.271098  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2356  protein of unknown function DUF1080  25 
 
 
453 aa  43.5  0.002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0153  hypothetical protein  26.83 
 
 
501 aa  43.1  0.003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6569  protein of unknown function DUF1080  23.69 
 
 
238 aa  42.7  0.004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.301124  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1112  hypothetical protein  22.97 
 
 
197 aa  42  0.007  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.58426  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>