50 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_4384 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013037  Dfer_4384  protein of unknown function DUF1080  100 
 
 
211 aa  434  1e-121  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.968412  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5725  protein of unknown function DUF1080  74.48 
 
 
198 aa  300  1e-80  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.0208334 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7244  protein of unknown function DUF1080  67.24 
 
 
198 aa  254  8e-67  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.709056  normal  0.87316 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1708  protein of unknown function DUF1080  37.29 
 
 
451 aa  103  2e-21  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.978176  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2385  protein of unknown function DUF1080  39.36 
 
 
217 aa  102  5e-21  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.40187  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0347  hypothetical protein  34.86 
 
 
215 aa  100  1e-20  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.794857  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1021  protein of unknown function DUF1080  36.76 
 
 
515 aa  98.6  6e-20  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.943633  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2202  protein of unknown function DUF1080  35.48 
 
 
453 aa  98.2  7e-20  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.262021  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2881  protein of unknown function DUF1080  34.59 
 
 
452 aa  90.5  2e-17  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5676  protein of unknown function DUF1080  34.95 
 
 
455 aa  89.7  3e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.644868  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7254  protein of unknown function DUF1080  35.83 
 
 
440 aa  89.7  3e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.0000293635  normal  0.71245 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0295  protein of unknown function DUF1080  31.94 
 
 
212 aa  82  0.000000000000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.154289  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0966  protein of unknown function DUF1080  28.76 
 
 
259 aa  76.6  0.0000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.0225828 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6337  protein of unknown function DUF1080  32.99 
 
 
218 aa  75.9  0.0000000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.975208  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4053  protein of unknown function DUF1080  31.02 
 
 
244 aa  71.6  0.000000000008  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0552867  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2940  protein of unknown function DUF1080  27.51 
 
 
216 aa  70.5  0.00000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.221061  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1130  protein of unknown function DUF1080  27.73 
 
 
240 aa  69.7  0.00000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.342121 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3175  protein of unknown function DUF1080  27.6 
 
 
258 aa  68.9  0.00000000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3566  hypothetical protein  32.14 
 
 
222 aa  67.8  0.0000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0845109  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0069  protein of unknown function DUF1080  27.89 
 
 
209 aa  64.7  0.0000000009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.334679 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4651  protein of unknown function DUF1080  28.25 
 
 
226 aa  62.8  0.000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.264791  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1648  hypothetical protein  29.95 
 
 
193 aa  62  0.000000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.761562  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4583  protein of unknown function DUF1080  28.44 
 
 
234 aa  62  0.000000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00498268  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1112  hypothetical protein  30.6 
 
 
197 aa  61.6  0.000000008  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.58426  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3650  protein of unknown function DUF1080  28.78 
 
 
230 aa  60.1  0.00000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3462  protein of unknown function DUF1080  28.99 
 
 
261 aa  59.3  0.00000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.772407  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0366  hypothetical protein  30.48 
 
 
239 aa  58.9  0.00000005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6569  protein of unknown function DUF1080  27.72 
 
 
238 aa  58.5  0.00000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.301124  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3499  protein of unknown function DUF1080  28.71 
 
 
234 aa  57  0.0000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.0089925  normal  0.745497 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7277  protein of unknown function DUF1080  28.76 
 
 
237 aa  57  0.0000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.271098  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2871  protein of unknown function DUF1080  30.56 
 
 
326 aa  56.2  0.0000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0516361  normal  0.710867 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1177  protein of unknown function DUF1080  29.49 
 
 
214 aa  56.6  0.0000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2324  hypothetical protein  31.13 
 
 
308 aa  55.8  0.0000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.460066  normal  0.0304211 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1060  protein of unknown function DUF1080  26.85 
 
 
260 aa  54.7  0.0000009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3433  protein of unknown function DUF1080  29.61 
 
 
239 aa  54.7  0.000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.552511  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0046  protein of unknown function DUF1080  27.78 
 
 
451 aa  53.1  0.000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2976  protein of unknown function DUF1080  28.97 
 
 
1145 aa  52.4  0.000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.657239  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2672  protein of unknown function DUF1080  28.93 
 
 
1140 aa  52  0.000007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.189319 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2356  protein of unknown function DUF1080  25.7 
 
 
453 aa  51.6  0.000008  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1742  protein of unknown function DUF1080  24.87 
 
 
241 aa  50.8  0.00001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0438  protein of unknown function DUF1080  28.83 
 
 
247 aa  50.4  0.00002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.11505  normal  0.50578 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0639  protein of unknown function DUF1080  33.13 
 
 
231 aa  49.7  0.00003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.798724  normal  0.087669 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0627  protein of unknown function DUF1080  27.32 
 
 
558 aa  49.7  0.00003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1206  protein of unknown function DUF1080  27.05 
 
 
229 aa  49.7  0.00004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.219996 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0958  protein of unknown function DUF1080  28.67 
 
 
212 aa  48.5  0.00006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2322  protein of unknown function DUF1080  27.75 
 
 
1444 aa  48.5  0.00007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.205839  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0153  hypothetical protein  25.74 
 
 
501 aa  47.4  0.0001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0248  protein of unknown function DUF1080  22.99 
 
 
290 aa  46.6  0.0003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5384  protein of unknown function DUF1080  26.95 
 
 
322 aa  46.6  0.0003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3358  hypothetical protein  26.98 
 
 
272 aa  45.8  0.0004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0905705  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>