110 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Phep_1021 on replicon NC_013061
Organism: Pedobacter heparinus DSM 2366



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013061  Phep_1021  protein of unknown function DUF1080  100 
 
 		 515 aa  1061    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.943633  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1019  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  71.09 
 
 		 307 aa  434  1e-120  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1020  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  68.15 
 
 		 334 aa  410  1e-113  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1018  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  62.5 
 
 		 318 aa  378  1e-103  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.706274  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2202  protein of unknown function DUF1080  46.32 
 
 		 453 aa  239  8e-62  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.262021  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4869  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  45.08 
 
 		 310 aa  237  4e-61  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7254  protein of unknown function DUF1080  53.4 
 
 		 440 aa  222  9.999999999999999e-57  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.0000293635  normal  0.71245 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5676  protein of unknown function DUF1080  48.89 
 
 		 455 aa  220  3.9999999999999997e-56  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.644868  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2881  protein of unknown function DUF1080  50.24 
 
 		 452 aa  207  3e-52  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1708  protein of unknown function DUF1080  47.87 
 
 		 451 aa  170  6e-41  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.978176  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0551  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  37.98 
 
 		 322 aa  164  4.0000000000000004e-39  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.784831  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1349  xylose isomerase domain-containing protein  34.93 
 
 		 280 aa  130  7.000000000000001e-29  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0895  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  27.57 
 
 		 281 aa  113  7.000000000000001e-24  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3402  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  26.41 
 
 		 324 aa  107  3e-22  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5725  protein of unknown function DUF1080  34.59 
 
 		 198 aa  104  5e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0208334 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4384  protein of unknown function DUF1080  36.76 
 
 		 211 aa  98.6  2e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.968412  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0627  protein of unknown function DUF1080  27.27 
 
 		 558 aa  98.6  3e-19  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7244  protein of unknown function DUF1080  34.04 
 
 		 198 aa  98.2  3e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.709056  normal  0.87316 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2598  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  25.34 
 
 		 316 aa  96.3  1e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1743  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  29.28 
 
 		 309 aa  94  5e-18  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1662  xylose isomerase domain-containing protein  24.29 
 
 		 274 aa  93.2  9e-18  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.36383  hitchhiker  0.00346458 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2385  protein of unknown function DUF1080  30.99 
 
 		 217 aa  92.4  2e-17  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.40187  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31660  sugar phosphate isomerase/epimerase  24.54 
 
 		 297 aa  82  0.00000000000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0295  protein of unknown function DUF1080  31.77 
 
 		 212 aa  80.9  0.00000000000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.154289  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0347  hypothetical protein  30.1 
 
 		 215 aa  76.6  0.0000000000009  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.794857  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3175  protein of unknown function DUF1080  28.38 
 
 		 258 aa  72  0.00000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0534  hypothetical protein  24.81 
 
 		 318 aa  70.9  0.00000000005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.434063 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1044  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  27.17 
 
 		 305 aa  69.7  0.0000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2642  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  24.62 
 
 		 313 aa  69.7  0.0000000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3462  protein of unknown function DUF1080  30.58 
 
 		 261 aa  69.7  0.0000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.772407  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6337  protein of unknown function DUF1080  32.09 
 
 		 218 aa  69.7  0.0000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.975208  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0966  protein of unknown function DUF1080  25.78 
 
 		 259 aa  69.3  0.0000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0225828 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4651  protein of unknown function DUF1080  29.44 
 
 		 226 aa  67  0.0000000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.264791  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4053  protein of unknown function DUF1080  28.19 
 
 		 244 aa  66.2  0.000000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0552867  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3511  AP endonuclease  25.7 
 
 		 328 aa  66.2  0.000000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.17674 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1709  hypothetical protein  25.97 
 
 		 306 aa  65.1  0.000000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.53026  normal  0.973713 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4583  protein of unknown function DUF1080  28.77 
 
 		 234 aa  65.1  0.000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00498268  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4673  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  24 
 
 		 341 aa  63.9  0.000000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0958  protein of unknown function DUF1080  27.75 
 
 		 212 aa  62.8  0.00000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0509  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  22.74 
 
 		 289 aa  63.2  0.00000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.440598  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11080  glucose/sorbosone dehydrogenase  28.64 
 
 		 1505 aa  62.8  0.00000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.120578  normal  0.319442 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6459  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  24.07 
 
 		 343 aa  60.1  0.0000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7277  protein of unknown function DUF1080  26.73 
 
 		 237 aa  59.3  0.0000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.271098  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3566  hypothetical protein  30.68 
 
 		 222 aa  58.9  0.0000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0845109  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3650  protein of unknown function DUF1080  29.88 
 
 		 230 aa  58.9  0.0000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1113  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  28.22 
 
 		 277 aa  58.9  0.0000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1009  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  24.76 
 
 		 308 aa  59.3  0.0000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1648  hypothetical protein  28.81 
 
 		 193 aa  58.2  0.0000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.761562  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0639  protein of unknown function DUF1080  27.04 
 
 		 231 aa  57.8  0.0000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.798724  normal  0.087669 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31360  sugar phosphate isomerase/epimerase  27.6 
 
 		 274 aa  57.8  0.0000005  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1981  xylose isomerase domain-containing protein  22.86 
 
 		 287 aa  56.6  0.0000009  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1112  hypothetical protein  28.74 
 
 		 197 aa  56.6  0.000001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.58426  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1257  xylose isomerase domain-containing protein  25.12 
 
 		 264 aa  56.6  0.000001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.666664  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0621  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  20 
 
 		 281 aa  55.8  0.000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3499  protein of unknown function DUF1080  23.77 
 
 		 234 aa  55.5  0.000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.0089925  normal  0.745497 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0870  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  21.95 
 
 		 280 aa  55.1  0.000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.505971  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0204  xylose isomerase domain-containing protein  25.41 
 
 		 322 aa  54.7  0.000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0210  xylose isomerase domain-containing protein  25.41 
 
 		 322 aa  54.7  0.000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3986  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  26.4 
 
 		 338 aa  54.3  0.000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.984461  normal  0.0421745 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2322  protein of unknown function DUF1080  27.1 
 
 		 1444 aa  53.5  0.000009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.205839  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0435  xylose isomerase domain-containing protein  24.64 
 
 		 266 aa  52.8  0.00001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2155  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  23.94 
 
 		 322 aa  52.8  0.00001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0779  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  22.66 
 
 		 276 aa  53.1  0.00001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0366  hypothetical protein  29.05 
 
 		 239 aa  52  0.00002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0333  xylose isomerase-like TIM barrel  25.87 
 
 		 314 aa  52  0.00003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.601498  normal  0.557772 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3493  iolH protein  23.83 
 
 		 286 aa  51.6  0.00004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.00667421  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0438  protein of unknown function DUF1080  29.87 
 
 		 247 aa  51.2  0.00004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.11505  normal  0.50578 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3267  AP endonuclease  23.83 
 
 		 286 aa  50.8  0.00006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0469  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  22.66 
 
 		 307 aa  50.8  0.00006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0294161  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0781  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  26.37 
 
 		 282 aa  50.8  0.00006  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0653  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  24.23 
 
 		 285 aa  50.4  0.00007  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1525  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  24.22 
 
 		 306 aa  50.4  0.00008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4718  protein IolH  26.85 
 
 		 294 aa  50.1  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.745442  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5791  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  25.69 
 
 		 286 aa  49.7  0.0001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.864508  normal  0.0412869 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0500  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  26.27 
 
 		 266 aa  49.7  0.0001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.00000000106724  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0008  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  32.77 
 
 		 322 aa  49.7  0.0001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_12330  sugar phosphate isomerase/epimerase  22.75 
 
 		 288 aa  49.3  0.0002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.205248  normal  0.361397 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2516  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  24.02 
 
 		 271 aa  49.3  0.0002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.610941  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6569  protein of unknown function DUF1080  26.75 
 
 		 238 aa  48.9  0.0002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.301124  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1085  xylose isomerase domain-containing protein  28.08 
 
 		 305 aa  48.5  0.0003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.230737 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3156  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  20.55 
 
 		 331 aa  48.5  0.0003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6694  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  24.31 
 
 		 286 aa  48.5  0.0003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.382585 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1079  Xylose isomerase domain-containing protein TIM barrel  27.98 
 
 		 266 aa  48.5  0.0003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3358  hypothetical protein  26.86 
 
 		 272 aa  48.1  0.0004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0905705  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3671  putative D-tagatose 3-epimerase  25.82 
 
 		 295 aa  47.8  0.0005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.325979  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0863  xylose isomerase domain-containing protein  26.67 
 
 		 268 aa  47.4  0.0006  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.780816  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1121  xylose isomerase domain-containing protein  27.34 
 
 		 268 aa  47.4  0.0006  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0991  xylose isomerase domain-containing protein  23.83 
 
 		 304 aa  47.4  0.0006  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1076  xylose isomerase domain-containing protein  24.45 
 
 		 308 aa  47.4  0.0006  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2256  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  33.33 
 
 		 321 aa  47.4  0.0006  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.480899 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4657  xylose isomerase domain-containing protein  29.51 
 
 		 294 aa  47  0.0008  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.480222 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0504  xylose isomerase domain-containing protein  24.42 
 
 		 270 aa  46.2  0.001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000275929  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4691  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  21.79 
 
 		 284 aa  46.6  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_50120  myo-inositol catabolism protein IolH  21.58 
 
 		 285 aa  46.2  0.001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3433  protein of unknown function DUF1080  25.32 
 
 		 239 aa  46.6  0.001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.552511  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2871  protein of unknown function DUF1080  33.77 
 
 		 326 aa  46.2  0.001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0516361  normal  0.710867 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0189  xylose isomerase domain-containing protein  25 
 
 		 293 aa  45.8  0.002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.258985  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1361  xylose isomerase domain-containing protein  26.23 
 
 		 278 aa  45.4  0.002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0153  hypothetical protein  21.33 
 
 		 501 aa  45.1  0.003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1742  protein of unknown function DUF1080  27.92 
 
 		 241 aa  45.4  0.003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>