More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_0509 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013730  Slin_0509  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  100 
 
 		 289 aa  605  9.999999999999999e-173  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.440598  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4299  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  50.36 
 
 		 275 aa  308  1.0000000000000001e-82  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.172805  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0391  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  45.68 
 
 		 279 aa  258  7e-68  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5868  xylose isomerase domain-containing protein  37.59 
 
 		 283 aa  217  1e-55  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4979  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  37.09 
 
 		 283 aa  214  9.999999999999999e-55  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.426661  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1263  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  37.41 
 
 		 297 aa  203  3e-51  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.281951  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0653  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  35.87 
 
 		 285 aa  189  7e-47  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4701  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  35.48 
 
 		 290 aa  185  9e-46  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3174  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  34.42 
 
 		 283 aa  176  5e-43  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4059  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  34.27 
 
 		 290 aa  171  1e-41  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4652  Xylose isomerase domain-containing protein TIM barrel  32.86 
 
 		 290 aa  171  2e-41  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00059422 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_12330  sugar phosphate isomerase/epimerase  34.49 
 
 		 288 aa  169  6e-41  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.205248  normal  0.361397 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4538  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  30.58 
 
 		 281 aa  154  2e-36  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.535239 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3635  xylose isomerase domain-containing protein  30.88 
 
 		 282 aa  153  2.9999999999999998e-36  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0782  xylose isomerase domain-containing protein  30.53 
 
 		 289 aa  149  7e-35  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0036  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  28.37 
 
 		 283 aa  147  2.0000000000000003e-34  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5314  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  29.82 
 
 		 282 aa  139  7e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0533  xylose isomerase domain protein TIM barrel  28.62 
 
 		 282 aa  138  1e-31  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.605213  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4619  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  29.12 
 
 		 282 aa  137  2e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.154569  normal  0.87312 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1536  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  30.99 
 
 		 292 aa  136  4e-31  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.00467401  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3671  putative D-tagatose 3-epimerase  32.13 
 
 		 295 aa  133  3.9999999999999996e-30  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.325979  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4045  xylose isomerase domain-containing protein  30.39 
 
 		 283 aa  132  5e-30  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0189  xylose isomerase domain-containing protein  32.17 
 
 		 293 aa  132  6e-30  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.258985  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3406  xylose isomerase domain-containing protein  31.77 
 
 		 295 aa  132  7.999999999999999e-30  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.784337 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1698  xylose isomerase domain-containing protein TIM barrel  31 
 
 		 268 aa  129  6e-29  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0941  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  29.71 
 
 		 293 aa  129  6e-29  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3563  xylose isomerase domain-containing protein  29.12 
 
 		 297 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0259  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  30.45 
 
 		 294 aa  126  5e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1910  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  31.62 
 
 		 282 aa  124  3e-27  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0288  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  30.8 
 
 		 294 aa  116  5e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.341149  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0504  xylose isomerase domain-containing protein  29.18 
 
 		 270 aa  116  5e-25  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000275929  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3261  hypothetical protein  28.11 
 
 		 282 aa  113  4.0000000000000004e-24  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.879119  normal  0.639309 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5867  xylose isomerase domain-containing protein  31.3 
 
 		 295 aa  111  1.0000000000000001e-23  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.102013  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3271  xylose isomerase domain-containing protein  26.3 
 
 		 295 aa  111  1.0000000000000001e-23  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.170281  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3760  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  28.17 
 
 		 288 aa  109  7.000000000000001e-23  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1297  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  27.86 
 
 		 262 aa  106  4e-22  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4980  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  30.04 
 
 		 295 aa  102  8e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.263775  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0666  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  25.68 
 
 		 264 aa  96.3  6e-19  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.539887 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1969  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  26.41 
 
 		 270 aa  92.4  7e-18  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0820  xylose isomerase domain-containing protein  28.03 
 
 		 278 aa  89  9e-17  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1251  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  25.81 
 
 		 274 aa  85.9  7e-16  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.725023  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1174  hydroxypyruvate isomerase  32.35 
 
 		 262 aa  84  0.000000000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.970176  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01291  predicted enzyme  23.7 
 
 		 262 aa  80.1  0.00000000000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2332  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  23.7 
 
 		 262 aa  80.1  0.00000000000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.297697  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1524  AP endonuclease  23.7 
 
 		 262 aa  80.5  0.00000000000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1429  AP endonuclease  23.7 
 
 		 262 aa  80.1  0.00000000000003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0057  xylose isomerase domain-containing protein  34.06 
 
 		 268 aa  80.5  0.00000000000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01302  hypothetical protein  23.7 
 
 		 262 aa  80.1  0.00000000000003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1808  AP endonuclease  23.7 
 
 		 262 aa  80.1  0.00000000000004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1959  AP endonuclease, family 2  23.7 
 
 		 262 aa  79.3  0.00000000000007  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0839995  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2929  hydroxypyruvate isomerase  34.88 
 
 		 263 aa  79  0.00000000000008  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.452433 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5018  hydroxypyruvate isomerase  37.82 
 
 		 258 aa  79.3  0.00000000000008  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.189718  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2311  xylose isomerase domain-containing protein  23.7 
 
 		 262 aa  78.6  0.0000000000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2604  xylose isomerase domain-containing protein  29.14 
 
 		 271 aa  77.4  0.0000000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04753  hydroxypyruvate isomerase  33.9 
 
 		 258 aa  77  0.0000000000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4012  xylose isomerase domain-containing protein  28.95 
 
 		 260 aa  77.4  0.0000000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.167546  normal  0.990546 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3088  hydroxypyruvate isomerase  32.2 
 
 		 263 aa  75.9  0.0000000000007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.645228  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3564  xylose isomerase domain-containing protein  26.38 
 
 		 257 aa  75.9  0.0000000000007  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0379741  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2411  xylose isomerase domain-containing protein  30.61 
 
 		 260 aa  75.5  0.000000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.446483 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5990  xylose isomerase domain-containing protein  28.23 
 
 		 339 aa  74.7  0.000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0730403  normal  0.114286 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4852  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  27.21 
 
 		 264 aa  73.2  0.000000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.859546  normal  0.0990251 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2394  xylose isomerase domain-containing protein  29.25 
 
 		 259 aa  73.2  0.000000000005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2365  hydroxypyruvate isomerase  34.75 
 
 		 266 aa  71.6  0.00000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1554  putative isomerase  25.2 
 
 		 254 aa  71.6  0.00000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.534878  normal  0.610325 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3955  hydroxypyruvate isomerase  31.36 
 
 		 259 aa  71.6  0.00000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2206  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  24.11 
 
 		 260 aa  71.2  0.00000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0313924  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1197  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  29.46 
 
 		 259 aa  71.6  0.00000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.597378  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2160  xylose isomerase domain-containing protein  23.4 
 
 		 262 aa  71.6  0.00000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.26775 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1528  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  22.27 
 
 		 264 aa  70.9  0.00000000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0958  hydroxypyruvate isomerase  27.56 
 
 		 267 aa  70.1  0.00000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3449  xylose isomerase-like TIM barrel  31.36 
 
 		 271 aa  69.7  0.00000000006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0211  hydroxypyruvate isomerase  28.81 
 
 		 258 aa  68.6  0.0000000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1136  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  21.61 
 
 		 312 aa  67.4  0.0000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3269  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  24.69 
 
 		 303 aa  67.8  0.0000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5294  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  28.57 
 
 		 265 aa  67.4  0.0000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.111966  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1112  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  25.32 
 
 		 259 aa  66.6  0.0000000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3052  xylose isomerase domain-containing protein  25 
 
 		 256 aa  67  0.0000000004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.0431176 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2118  hydroxypyruvate isomerase  35.64 
 
 		 266 aa  66.6  0.0000000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0266277 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0459  hydroxypyruvate isomerase  27.97 
 
 		 264 aa  66.2  0.0000000005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0230369  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0810  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  22.13 
 
 		 310 aa  65.9  0.0000000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0113296  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3292  hydroxypyruvate isomerase  29.66 
 
 		 260 aa  65.9  0.0000000008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.202186  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2151  xylose isomerase-like TIM barrel  24.29 
 
 		 257 aa  65.9  0.0000000008  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00601378  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3741  hydroxypyruvate isomerase  28.12 
 
 		 259 aa  65.5  0.0000000009  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.476363  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1020  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  24.49 
 
 		 334 aa  65.5  0.000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4157  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  31.29 
 
 		 264 aa  65.1  0.000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.831007 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1134  hydroxypyruvate isomerase  26.99 
 
 		 259 aa  65.5  0.000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.852559 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4554  hydroxypyruvate isomerase  27.22 
 
 		 258 aa  64.7  0.000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.695496  normal  0.368967 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5560  hydroxypyruvate isomerase  26.79 
 
 		 261 aa  63.9  0.000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.446227  normal  0.0996892 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1918  Hydroxypyruvate isomerase  29.01 
 
 		 260 aa  63.9  0.000000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0177301  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0551  hydroxypyruvate isomerase  28.81 
 
 		 258 aa  63.9  0.000000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1018  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  23.57 
 
 		 318 aa  63.5  0.000000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.706274  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5077  hydroxypyruvate isomerase  27.22 
 
 		 257 aa  63.5  0.000000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.814935  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4865  hydroxypyruvate isomerase Gcxl  25.42 
 
 		 260 aa  63.5  0.000000004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.798851  normal  0.469511 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3152  hydroxypyruvate isomerase  27.12 
 
 		 260 aa  63.5  0.000000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3479  hydroxypyruvate isomerase  27.97 
 
 		 260 aa  63.5  0.000000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1781  hydroxypyruvate isomerase  27.97 
 
 		 269 aa  63.2  0.000000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.168778  normal  0.857209 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1021  protein of unknown function DUF1080  22.74 
 
 		 515 aa  63.2  0.000000005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.943633  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1298  hydroxypyruvate isomerase  28.81 
 
 		 259 aa  63.2  0.000000005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3648  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  24.48 
 
 		 286 aa  63.2  0.000000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.0394614 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0147  hydroxypyruvate isomerase, putative  31.36 
 
 		 261 aa  62.8  0.000000006  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.999741  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>