More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpen_0820 on replicon NC_008698
Organism: Thermofilum pendens Hrk 5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008698  Tpen_0820  xylose isomerase domain-containing protein  100 
 
 		 278 aa  546  1e-154  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0504  xylose isomerase domain-containing protein  41.82 
 
 		 270 aa  191  1e-47  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000275929  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1251  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  36.73 
 
 		 274 aa  156  3e-37  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.725023  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1969  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  35.5 
 
 		 270 aa  124  1e-27  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0666  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  36.65 
 
 		 264 aa  120  3e-26  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.539887 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1297  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  43.61 
 
 		 262 aa  117  1.9999999999999998e-25  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1910  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  40 
 
 		 282 aa  112  7.000000000000001e-24  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0941  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  31.12 
 
 		 293 aa  112  8.000000000000001e-24  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4652  Xylose isomerase domain-containing protein TIM barrel  37.1 
 
 		 290 aa  110  2.0000000000000002e-23  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00059422 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1698  xylose isomerase domain-containing protein TIM barrel  34.09 
 
 		 268 aa  109  6e-23  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0782  xylose isomerase domain-containing protein  34.43 
 
 		 289 aa  108  8.000000000000001e-23  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4701  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  34.03 
 
 		 290 aa  107  2e-22  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1528  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  35.71 
 
 		 264 aa  102  5e-21  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3671  putative D-tagatose 3-epimerase  45.22 
 
 		 295 aa  100  3e-20  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.325979  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3406  xylose isomerase domain-containing protein  45.22 
 
 		 295 aa  100  3e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.784337 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5867  xylose isomerase domain-containing protein  31.35 
 
 		 295 aa  99.4  6e-20  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.102013  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4980  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  31.84 
 
 		 295 aa  97.8  2e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.263775  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3563  xylose isomerase domain-containing protein  29.44 
 
 		 297 aa  97.4  2e-19  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0509  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  28.03 
 
 		 289 aa  96.7  4e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.440598  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2160  xylose isomerase domain-containing protein  35.82 
 
 		 262 aa  96.3  5e-19  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.26775 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4538  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  38.76 
 
 		 281 aa  95.9  7e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.535239 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0259  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  33.49 
 
 		 294 aa  94.4  2e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0036  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  31.52 
 
 		 283 aa  93.6  3e-18  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4619  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  33.53 
 
 		 282 aa  91.7  1e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.154569  normal  0.87312 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01291  predicted enzyme  33.1 
 
 		 262 aa  90.5  2e-17  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2332  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  33.1 
 
 		 262 aa  90.5  2e-17  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.297697  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1808  AP endonuclease  33.1 
 
 		 262 aa  91.3  2e-17  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01302  hypothetical protein  33.1 
 
 		 262 aa  90.5  2e-17  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2311  xylose isomerase domain-containing protein  33.1 
 
 		 262 aa  90.9  2e-17  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1429  AP endonuclease  33.1 
 
 		 262 aa  90.5  2e-17  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1959  AP endonuclease, family 2  33.1 
 
 		 262 aa  90.5  3e-17  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0839995  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4045  xylose isomerase domain-containing protein  35.96 
 
 		 283 aa  90.5  3e-17  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4059  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  45.95 
 
 		 290 aa  90.1  4e-17  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5314  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  33.14 
 
 		 282 aa  90.1  4e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0189  xylose isomerase domain-containing protein  42.34 
 
 		 293 aa  89.7  5e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.258985  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4299  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  28.33 
 
 		 275 aa  89.4  6e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.172805  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1524  AP endonuclease  32.41 
 
 		 262 aa  88.6  1e-16  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3631  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  31.02 
 
 		 275 aa  86.3  5e-16  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.9121  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_12330  sugar phosphate isomerase/epimerase  41.35 
 
 		 288 aa  85.9  6e-16  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.205248  normal  0.361397 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0391  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  28.82 
 
 		 279 aa  85.5  9e-16  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5868  xylose isomerase domain-containing protein  27.2 
 
 		 283 aa  85.5  9e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2613  hydroxypyruvate isomerase  30.74 
 
 		 267 aa  85.1  0.000000000000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3271  xylose isomerase domain-containing protein  30.59 
 
 		 295 aa  85.1  0.000000000000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.170281  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3635  xylose isomerase domain-containing protein  35.83 
 
 		 282 aa  84.3  0.000000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0288  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  44.33 
 
 		 294 aa  84.7  0.000000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.341149  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0533  xylose isomerase domain protein TIM barrel  37.96 
 
 		 282 aa  83.6  0.000000000000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.605213  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1536  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  30.49 
 
 		 292 aa  81.3  0.00000000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.00467401  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4979  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  26.96 
 
 		 283 aa  81.3  0.00000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.426661  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0653  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  24.68 
 
 		 285 aa  79  0.00000000000007  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3269  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  31.37 
 
 		 303 aa  79.3  0.00000000000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3760  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  37.29 
 
 		 288 aa  78.2  0.0000000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4472  Hydroxypyruvate isomerase  32.28 
 
 		 250 aa  77  0.0000000000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0435966  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0459  hydroxypyruvate isomerase  29.37 
 
 		 264 aa  77  0.0000000000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0230369  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3195  hydroxypyruvate isomerase  31.53 
 
 		 263 aa  76.6  0.0000000000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.568718  normal  0.0120723 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3261  hypothetical protein  41.84 
 
 		 282 aa  76.3  0.0000000000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.879119  normal  0.639309 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1263  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  28.68 
 
 		 297 aa  75.5  0.000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.281951  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1174  hydroxypyruvate isomerase  28.96 
 
 		 262 aa  75.5  0.000000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.970176  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2461  hydroxypyruvate isomerase  35.51 
 
 		 269 aa  74.7  0.000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.731976  normal  0.599526 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1781  hydroxypyruvate isomerase  33.59 
 
 		 269 aa  73.9  0.000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.168778  normal  0.857209 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1621  hydroxypyruvate isomerase  32.56 
 
 		 266 aa  73.9  0.000000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.377689  normal  0.533551 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29590  sugar phosphate isomerase/epimerase  33.52 
 
 		 739 aa  73.2  0.000000000005  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3378  hydroxypyruvate isomerase  32.64 
 
 		 264 aa  72.8  0.000000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.490297  normal  0.0397331 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1301  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  32.37 
 
 		 256 aa  72.4  0.000000000007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00429624  normal  0.0206952 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1571  hydroxypyruvate isomerase  34.29 
 
 		 260 aa  72  0.000000000009  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.148654  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2206  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  31.07 
 
 		 260 aa  71.2  0.00000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0313924  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2765  hydroxypyruvate isomerase  32.67 
 
 		 255 aa  70.1  0.00000000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3863  hydroxypyruvate isomerase  33.33 
 
 		 260 aa  70.1  0.00000000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.531245  normal  0.545966 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1158  hydroxypyruvate isomerase  33.06 
 
 		 268 aa  69.7  0.00000000005  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.671898  n/a   
 
 
-
 
NC_007488  RSP_3944  AP endonuclease  33.15 
 
 		 285 aa  69.3  0.00000000006  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0718494  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5018  hydroxypyruvate isomerase  31.65 
 
 		 258 aa  69.3  0.00000000006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.189718  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4298  hydroxypyruvate isomerase  33.83 
 
 		 260 aa  69.3  0.00000000007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4719  hydroxypyruvate isomerase  33.59 
 
 		 258 aa  69.3  0.00000000007  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00317481 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2425  hydroxypyruvate isomerase  34.15 
 
 		 262 aa  68.9  0.00000000009  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4309  hydroxypyruvate isomerase  30.65 
 
 		 271 aa  68.9  0.00000000009  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0533507 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2260  hydroxypyruvate isomerase  34.15 
 
 		 262 aa  68.9  0.00000000009  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.654587  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2300  hydroxypyruvate isomerase  34.15 
 
 		 262 aa  68.9  0.00000000009  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.946761  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2368  hydroxypyruvate isomerase  31.54 
 
 		 259 aa  68.6  0.0000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.592212  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2682  xylose isomerase domain-containing protein  34.53 
 
 		 258 aa  68.6  0.0000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0565  hydroxypyruvate isomerase  28.69 
 
 		 258 aa  67.8  0.0000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.551663  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3282  hydroxypyruvate isomerase protein  29.92 
 
 		 260 aa  67.8  0.0000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.257483  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0567  hydroxypyruvate isomerase  28.69 
 
 		 258 aa  67.8  0.0000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2172  hydroxypyruvate isomerase  33.33 
 
 		 269 aa  67.4  0.0000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.42054  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0443  hydroxypyruvate isomerase  32.03 
 
 		 265 aa  67.8  0.0000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4459  xylose isomerase-like TIM barrel  32.23 
 
 		 255 aa  67.4  0.0000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2201  xylose isomerase domain-containing protein  34.58 
 
 		 258 aa  67.4  0.0000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.586932  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1134  hydroxypyruvate isomerase  30.65 
 
 		 259 aa  67.8  0.0000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.852559 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0572  hydroxypyruvate isomerase  28.69 
 
 		 258 aa  67.8  0.0000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1788  hydroxypyruvate isomerase  32.52 
 
 		 269 aa  67.4  0.0000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1395  hydroxypyruvate isomerase  32.52 
 
 		 269 aa  67.4  0.0000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0279437  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5179  hydroxypyruvate isomerase  32.52 
 
 		 269 aa  67  0.0000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.265819  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1902  hydroxypyruvate isomerase  32.52 
 
 		 269 aa  67.4  0.0000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000606406 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3088  hydroxypyruvate isomerase  29.41 
 
 		 263 aa  67.4  0.0000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.645228  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3174  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  27.11 
 
 		 283 aa  67.4  0.0000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6200  hydroxypyruvate isomerase  32.52 
 
 		 269 aa  67.4  0.0000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0219655  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1816  hydroxypyruvate isomerase  32.52 
 
 		 269 aa  67.4  0.0000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1879  hydroxypyruvate isomerase  32.52 
 
 		 269 aa  67.4  0.0000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0860973  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3623  hydroxypyruvate isomerase  33.1 
 
 		 260 aa  67.4  0.0000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3955  hydroxypyruvate isomerase  24.36 
 
 		 259 aa  64.7  0.000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2228  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  29.38 
 
 		 287 aa  65.1  0.000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.498591  normal  0.437814 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0626  hydroxypyruvate isomerase  27.87 
 
 		 258 aa  65.1  0.000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.396658  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>