276 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RSc3282 on replicon NC_003295
Organism: Ralstonia solanacearum GMI1000



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003295  RSc3282  hydroxypyruvate isomerase protein  100 
 
 		 260 aa  535  1e-151  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.257483  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3152  hydroxypyruvate isomerase  87.31 
 
 		 260 aa  476  1e-133  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3479  hydroxypyruvate isomerase  85 
 
 		 260 aa  467  1.0000000000000001e-131  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3449  xylose isomerase-like TIM barrel  78.76 
 
 		 271 aa  427  1e-119  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3292  hydroxypyruvate isomerase  77.61 
 
 		 260 aa  423  1e-117  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.202186  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1298  hydroxypyruvate isomerase  66.41 
 
 		 259 aa  353  1e-96  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2172  hydroxypyruvate isomerase  67.19 
 
 		 269 aa  350  1e-95  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.42054  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6200  hydroxypyruvate isomerase  67.19 
 
 		 269 aa  347  1e-94  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0219655  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1816  hydroxypyruvate isomerase  67.19 
 
 		 269 aa  347  1e-94  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1879  hydroxypyruvate isomerase  67.19 
 
 		 269 aa  347  1e-94  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0860973  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1902  hydroxypyruvate isomerase  67.19 
 
 		 269 aa  347  1e-94  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000606406 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1788  hydroxypyruvate isomerase  67.19 
 
 		 269 aa  347  1e-94  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5179  hydroxypyruvate isomerase  67.19 
 
 		 269 aa  346  3e-94  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.265819  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2425  hydroxypyruvate isomerase  67.59 
 
 		 262 aa  345  5e-94  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2260  hydroxypyruvate isomerase  67.59 
 
 		 262 aa  345  5e-94  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.654587  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2300  hydroxypyruvate isomerase  67.59 
 
 		 262 aa  345  5e-94  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.946761  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1395  hydroxypyruvate isomerase  66.8 
 
 		 269 aa  343  2e-93  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0279437  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4562  hydroxypyruvate isomerase  67.32 
 
 		 259 aa  341  7e-93  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.427343  normal  0.384122 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2461  hydroxypyruvate isomerase  65.61 
 
 		 269 aa  340  2e-92  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.731976  normal  0.599526 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1781  hydroxypyruvate isomerase  65.22 
 
 		 269 aa  339  2e-92  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.168778  normal  0.857209 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1621  hydroxypyruvate isomerase  66.8 
 
 		 266 aa  338  5e-92  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.377689  normal  0.533551 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3955  hydroxypyruvate isomerase  62.5 
 
 		 259 aa  333  1e-90  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2118  hydroxypyruvate isomerase  65.37 
 
 		 266 aa  328  4e-89  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0266277 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2368  hydroxypyruvate isomerase  59.3 
 
 		 259 aa  327  9e-89  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.592212  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3088  hydroxypyruvate isomerase  62.35 
 
 		 263 aa  326  2.0000000000000001e-88  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.645228  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2770  hydroxypyruvate isomerase  60.85 
 
 		 265 aa  319  3e-86  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0252433  normal  0.732675 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4309  hydroxypyruvate isomerase  60.47 
 
 		 271 aa  318  3.9999999999999996e-86  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0533507 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1597  hydroxypyruvate isomerase  62.45 
 
 		 260 aa  315  3e-85  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00143749  normal  0.674901 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1134  hydroxypyruvate isomerase  61.18 
 
 		 259 aa  315  4e-85  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.852559 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_45010  putative hydroxypyruvate isomerase  60.62 
 
 		 260 aa  313  9.999999999999999e-85  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.224213  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3623  hydroxypyruvate isomerase  61.24 
 
 		 260 aa  314  9.999999999999999e-85  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3830  hydroxypyruvate isomerase  60.62 
 
 		 260 aa  313  1.9999999999999998e-84  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0459  hydroxypyruvate isomerase  59.29 
 
 		 264 aa  313  1.9999999999999998e-84  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0230369  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1158  hydroxypyruvate isomerase  61.42 
 
 		 268 aa  312  2.9999999999999996e-84  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.671898  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1571  hydroxypyruvate isomerase  61.26 
 
 		 260 aa  308  5e-83  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.148654  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2311  hydroxypyruvate isomerase  60.94 
 
 		 256 aa  308  5.9999999999999995e-83  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.279204  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3863  hydroxypyruvate isomerase  61.26 
 
 		 260 aa  307  1.0000000000000001e-82  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.531245  normal  0.545966 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0565  hydroxypyruvate isomerase  57.36 
 
 		 258 aa  306  2.0000000000000002e-82  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.551663  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0567  hydroxypyruvate isomerase  56.98 
 
 		 258 aa  305  6e-82  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0572  hydroxypyruvate isomerase  56.98 
 
 		 258 aa  305  6e-82  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4298  hydroxypyruvate isomerase  60.47 
 
 		 260 aa  304  7e-82  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0626  hydroxypyruvate isomerase  56.59 
 
 		 258 aa  302  4.0000000000000003e-81  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.396658  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0545  hydroxypyruvate isomerase  56.2 
 
 		 258 aa  299  3e-80  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3114  hydroxypyruvate isomerase  56.2 
 
 		 258 aa  299  3e-80  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.334824 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0582  hydroxypyruvate isomerase  56.2 
 
 		 258 aa  299  3e-80  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00458  hydroxypyruvate isomerase  56.2 
 
 		 258 aa  298  4e-80  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.751856  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3104  hydroxypyruvate isomerase  56.2 
 
 		 258 aa  298  4e-80  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00463  hypothetical protein  56.2 
 
 		 258 aa  298  4e-80  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0609  hydroxypyruvate isomerase  56.2 
 
 		 258 aa  298  4e-80  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0958  hydroxypyruvate isomerase  58.5 
 
 		 267 aa  298  5e-80  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0551  hydroxypyruvate isomerase  55.81 
 
 		 258 aa  298  7e-80  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4865  hydroxypyruvate isomerase Gcxl  54.55 
 
 		 260 aa  295  7e-79  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.798851  normal  0.469511 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5560  hydroxypyruvate isomerase  55.73 
 
 		 261 aa  287  1e-76  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.446227  normal  0.0996892 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3181  hydroxypyruvate isomerase  53.1 
 
 		 262 aa  281  1e-74  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.365148  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_43410  hydroxypyruvate isomerase  60.87 
 
 		 259 aa  280  1e-74  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3378  hydroxypyruvate isomerase  51.36 
 
 		 264 aa  278  5e-74  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.490297  normal  0.0397331 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1631  hydroxypyruvate isomerase  51.94 
 
 		 258 aa  278  6e-74  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1567  hydroxypyruvate isomerase  50.58 
 
 		 258 aa  276  3e-73  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4427  hydroxypyruvate isomerase  53.49 
 
 		 262 aa  272  3e-72  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.198005  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2929  hydroxypyruvate isomerase  56.32 
 
 		 263 aa  273  3e-72  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.452433 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4719  hydroxypyruvate isomerase  54.26 
 
 		 258 aa  270  2e-71  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00317481 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3741  hydroxypyruvate isomerase  52.34 
 
 		 259 aa  268  5.9999999999999995e-71  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.476363  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0474  hydroxypyruvate isomerase  51.36 
 
 		 258 aa  267  1e-70  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.166076  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4554  hydroxypyruvate isomerase  51.36 
 
 		 258 aa  266  2e-70  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.695496  normal  0.368967 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5077  hydroxypyruvate isomerase  51.55 
 
 		 257 aa  265  7e-70  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.814935  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2809  hydroxypyruvate isomerase  49.62 
 
 		 265 aa  262  4e-69  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.356992 
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4459  xylose isomerase-like TIM barrel  54.84 
 
 		 255 aa  261  6e-69  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2613  hydroxypyruvate isomerase  54.09 
 
 		 267 aa  261  6.999999999999999e-69  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3317  xylose isomerase-like TIM barrel  50.79 
 
 		 257 aa  261  8.999999999999999e-69  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.695295  hitchhiker  0.00275233 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2462  hydroxypyruvate isomerase  50.77 
 
 		 266 aa  261  8.999999999999999e-69  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.684146  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5120  hydroxypyruvate isomerase  51.75 
 
 		 258 aa  260  1e-68  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4202  hydroxypyruvate isomerase  53.88 
 
 		 268 aa  260  2e-68  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.407118 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5927  Hydroxypyruvate isomerase  51.75 
 
 		 262 aa  260  2e-68  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0443  hydroxypyruvate isomerase  50.76 
 
 		 265 aa  258  6e-68  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3208  hydroxypyruvate isomerase  51.75 
 
 		 258 aa  258  6e-68  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5159  hydroxypyruvate isomerase  51.75 
 
 		 258 aa  258  6e-68  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.324976  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2169  hydroxypyruvate isomerase  50.97 
 
 		 262 aa  257  1e-67  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.196604  normal  0.222817 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3496  hydroxypyruvate isomerase  51.75 
 
 		 258 aa  256  4e-67  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0849997  normal  0.283205 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4572  hydroxypyruvate isomerase  53.49 
 
 		 258 aa  256  4e-67  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0168162 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3413  Hydroxypyruvate isomerase  48.84 
 
 		 262 aa  253  2.0000000000000002e-66  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1924  hydroxypyruvate isomerase  50.19 
 
 		 258 aa  253  2.0000000000000002e-66  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0573  hydroxypyruvate isomerase  50.19 
 
 		 258 aa  253  3e-66  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0442  hydroxypyruvate isomerase  50.19 
 
 		 258 aa  252  3e-66  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0973  hydroxypyruvate isomerase  49.81 
 
 		 269 aa  253  3e-66  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4876  hydroxypyruvate isomerase  47.94 
 
 		 273 aa  253  3e-66  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.857442 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0894  hydroxypyruvate isomerase  50.19 
 
 		 258 aa  253  3e-66  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2017  hydroxypyruvate isomerase  50.19 
 
 		 258 aa  252  3e-66  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.45932  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1861  hydroxypyruvate isomerase  50.19 
 
 		 258 aa  253  3e-66  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1918  Hydroxypyruvate isomerase  45.91 
 
 		 260 aa  253  3e-66  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0177301  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3736  Hydroxypyruvate isomerase  49.01 
 
 		 262 aa  248  5e-65  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0652  hypothetical protein  50.39 
 
 		 265 aa  248  7e-65  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0020  hypothetical protein  50.57 
 
 		 262 aa  247  1e-64  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.138735  normal  0.842888 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04753  hydroxypyruvate isomerase  43.58 
 
 		 258 aa  246  4e-64  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0211  hydroxypyruvate isomerase  44.36 
 
 		 258 aa  244  9.999999999999999e-64  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2552  hydroxypyruvate isomerase  44.75 
 
 		 258 aa  244  9.999999999999999e-64  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0908348  hitchhiker  0.00501624 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1839  xylose isomerase-like TIM barrel  48.22 
 
 		 260 aa  243  1.9999999999999999e-63  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0157456  normal  0.118454 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_07150  hypothetical protein  49.61 
 
 		 265 aa  243  1.9999999999999999e-63  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0462  hydroxypyruvate isomerase  49.22 
 
 		 261 aa  241  6e-63  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5142  Hydroxypyruvate isomerase  47.96 
 
 		 272 aa  241  7.999999999999999e-63  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1815  hydroxypyruvate isomerase  46.84 
 
 		 275 aa  241  1e-62  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0352764  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>