249 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphyt_5927 on replicon NC_010676
Organism: Burkholderia phytofirmans PsJN



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010676  Bphyt_5927  Hydroxypyruvate isomerase  100 
 
 		 262 aa  539  9.999999999999999e-153  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2169  hydroxypyruvate isomerase  96.18 
 
 		 262 aa  504  9.999999999999999e-143  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.196604  normal  0.222817 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4427  hydroxypyruvate isomerase  83.78 
 
 		 262 aa  458  9.999999999999999e-129  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.198005  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4554  hydroxypyruvate isomerase  81.4 
 
 		 258 aa  444  1.0000000000000001e-124  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.695496  normal  0.368967 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0474  hydroxypyruvate isomerase  80.62 
 
 		 258 aa  441  1e-123  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.166076  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0973  hydroxypyruvate isomerase  82.69 
 
 		 269 aa  441  1e-123  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3496  hydroxypyruvate isomerase  83.33 
 
 		 258 aa  443  1e-123  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0849997  normal  0.283205 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5077  hydroxypyruvate isomerase  81.01 
 
 		 257 aa  438  9.999999999999999e-123  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.814935  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0442  hydroxypyruvate isomerase  82.17 
 
 		 258 aa  434  1e-121  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2017  hydroxypyruvate isomerase  82.17 
 
 		 258 aa  435  1e-121  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.45932  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1924  hydroxypyruvate isomerase  82.17 
 
 		 258 aa  434  1e-121  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0573  hydroxypyruvate isomerase  81.78 
 
 		 258 aa  432  1e-120  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3208  hydroxypyruvate isomerase  81.4 
 
 		 258 aa  432  1e-120  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5159  hydroxypyruvate isomerase  81.4 
 
 		 258 aa  432  1e-120  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.324976  normal  1 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0894  hydroxypyruvate isomerase  81.78 
 
 		 258 aa  432  1e-120  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1861  hydroxypyruvate isomerase  81.78 
 
 		 258 aa  432  1e-120  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5120  hydroxypyruvate isomerase  81.4 
 
 		 258 aa  433  1e-120  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3413  Hydroxypyruvate isomerase  72.9 
 
 		 262 aa  401  1e-111  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1839  xylose isomerase-like TIM barrel  74.13 
 
 		 260 aa  400  1e-111  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0157456  normal  0.118454 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1423  hydroxypyruvate isomerase  77.61 
 
 		 260 aa  400  9.999999999999999e-111  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0831912  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3736  Hydroxypyruvate isomerase  71.76 
 
 		 262 aa  397  9.999999999999999e-111  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0020  hypothetical protein  72.37 
 
 		 262 aa  387  1e-107  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.138735  normal  0.842888 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0652  hypothetical protein  71.86 
 
 		 265 aa  380  1e-104  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_07150  hypothetical protein  71.48 
 
 		 265 aa  376  1e-103  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5064  hydroxypyruvate isomerase, putative  69.02 
 
 		 261 aa  360  1e-98  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0462  hydroxypyruvate isomerase  69.02 
 
 		 261 aa  355  2.9999999999999997e-97  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0443  hydroxypyruvate isomerase  65.28 
 
 		 265 aa  349  2e-95  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3181  hydroxypyruvate isomerase  62.26 
 
 		 262 aa  331  6e-90  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.365148  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2462  hydroxypyruvate isomerase  61.28 
 
 		 266 aa  330  1e-89  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.684146  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4876  hydroxypyruvate isomerase  60.29 
 
 		 273 aa  329  3e-89  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.857442 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2809  hydroxypyruvate isomerase  59.25 
 
 		 265 aa  327  1.0000000000000001e-88  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.356992 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1567  hydroxypyruvate isomerase  56.98 
 
 		 258 aa  321  8e-87  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5142  Hydroxypyruvate isomerase  60.53 
 
 		 272 aa  312  2.9999999999999996e-84  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1913  Hydroxypyruvate isomerase  57.68 
 
 		 275 aa  310  2e-83  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1815  hydroxypyruvate isomerase  57.68 
 
 		 275 aa  310  2e-83  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0352764  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1631  hydroxypyruvate isomerase  55.29 
 
 		 258 aa  309  2e-83  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1597  hydroxypyruvate isomerase  55.25 
 
 		 260 aa  296  2e-79  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00143749  normal  0.674901 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3533  hydroxypyruvate isomerase  60.39 
 
 		 258 aa  294  1e-78  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.238199  normal  0.267377 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04753  hydroxypyruvate isomerase  50.39 
 
 		 258 aa  292  3e-78  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1026  hydroxypyruvate isomerase  55.64 
 
 		 267 aa  292  4e-78  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.43264  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2625  hydroxypyruvate isomerase  55.77 
 
 		 260 aa  291  5e-78  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.90554  normal  0.173091 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0147  hydroxypyruvate isomerase, putative  53.49 
 
 		 261 aa  289  4e-77  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.999741  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0132  putative hydroxypyruvate isomerase  53.49 
 
 		 261 aa  289  4e-77  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2311  hydroxypyruvate isomerase  54.12 
 
 		 256 aa  287  1e-76  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.279204  normal  1 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0211  hydroxypyruvate isomerase  50.39 
 
 		 258 aa  286  2e-76  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2770  hydroxypyruvate isomerase  52.69 
 
 		 265 aa  287  2e-76  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0252433  normal  0.732675 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3378  hydroxypyruvate isomerase  52.29 
 
 		 264 aa  286  2e-76  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.490297  normal  0.0397331 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3863  hydroxypyruvate isomerase  53.7 
 
 		 260 aa  286  2.9999999999999996e-76  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.531245  normal  0.545966 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3623  hydroxypyruvate isomerase  54.09 
 
 		 260 aa  285  4e-76  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1571  hydroxypyruvate isomerase  52.92 
 
 		 260 aa  285  5e-76  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.148654  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3830  hydroxypyruvate isomerase  53.7 
 
 		 260 aa  285  7e-76  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_45010  putative hydroxypyruvate isomerase  53.7 
 
 		 260 aa  284  1.0000000000000001e-75  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.224213  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4298  hydroxypyruvate isomerase  52.92 
 
 		 260 aa  283  2.0000000000000002e-75  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2268  Hydroxypyruvate isomerase  53.7 
 
 		 281 aa  283  3.0000000000000004e-75  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.822354 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4320  hydroxypyruvate isomerase  54.47 
 
 		 258 aa  282  4.0000000000000003e-75  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.166388  normal  0.0980927 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2086  hydroxypyruvate isomerase  54.47 
 
 		 269 aa  282  5.000000000000001e-75  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3088  hydroxypyruvate isomerase  52.16 
 
 		 263 aa  280  2e-74  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.645228  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1953  Hydroxypyruvate isomerase  53.7 
 
 		 259 aa  276  2e-73  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.346217  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1134  hydroxypyruvate isomerase  54.51 
 
 		 259 aa  276  2e-73  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.852559 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1133  hydroxypyruvate isomerase  53.44 
 
 		 260 aa  275  5e-73  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.926547  normal  0.304342 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4098  hydroxypyruvate isomerase  56 
 
 		 284 aa  275  8e-73  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.832044 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1855  hydroxypyruvate isomerase  52.92 
 
 		 260 aa  274  1.0000000000000001e-72  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2552  hydroxypyruvate isomerase  47.1 
 
 		 258 aa  274  1.0000000000000001e-72  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0908348  hitchhiker  0.00501624 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3611  hydroxypyruvate isomerase  53.46 
 
 		 260 aa  272  3e-72  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.233278  normal  0.528482 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4653  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  54.86 
 
 		 260 aa  272  4.0000000000000004e-72  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0700232  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2368  hydroxypyruvate isomerase  49.81 
 
 		 259 aa  271  5.000000000000001e-72  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.592212  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2430  hydroxypyruvate isomerase  56.69 
 
 		 257 aa  270  1e-71  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3282  hydroxypyruvate isomerase protein  51.75 
 
 		 260 aa  270  2e-71  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.257483  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1395  hydroxypyruvate isomerase  49.81 
 
 		 269 aa  270  2e-71  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0279437  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2898  putative sugar isomerase (interconverting aldoses and ketoses)  53.85 
 
 		 250 aa  268  7e-71  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.236626  normal  0.0851666 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5560  hydroxypyruvate isomerase  50.98 
 
 		 261 aa  268  8.999999999999999e-71  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.446227  normal  0.0996892 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3317  xylose isomerase-like TIM barrel  50.59 
 
 		 257 aa  267  1e-70  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.695295  hitchhiker  0.00275233 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3479  hydroxypyruvate isomerase  51.78 
 
 		 260 aa  267  1e-70  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3955  hydroxypyruvate isomerase  52.17 
 
 		 259 aa  266  2e-70  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5011  Hydroxypyruvate isomerase  54.86 
 
 		 258 aa  266  2e-70  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.336729  normal  0.3021 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_43410  hydroxypyruvate isomerase  53.67 
 
 		 259 aa  266  2.9999999999999995e-70  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5307  Hydroxypyruvate isomerase  55.25 
 
 		 258 aa  265  4e-70  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.314618  normal  0.971312 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3152  hydroxypyruvate isomerase  50.59 
 
 		 260 aa  265  7e-70  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4562  hydroxypyruvate isomerase  52.96 
 
 		 259 aa  264  1e-69  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.427343  normal  0.384122 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2172  hydroxypyruvate isomerase  50.2 
 
 		 269 aa  262  4e-69  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.42054  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1298  hydroxypyruvate isomerase  49.8 
 
 		 259 aa  261  6e-69  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6200  hydroxypyruvate isomerase  49.02 
 
 		 269 aa  260  1e-68  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0219655  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1816  hydroxypyruvate isomerase  49.02 
 
 		 269 aa  261  1e-68  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1879  hydroxypyruvate isomerase  49.02 
 
 		 269 aa  260  1e-68  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0860973  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1788  hydroxypyruvate isomerase  49.02 
 
 		 269 aa  261  1e-68  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1902  hydroxypyruvate isomerase  49.02 
 
 		 269 aa  261  1e-68  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000606406 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5179  hydroxypyruvate isomerase  49.02 
 
 		 269 aa  260  2e-68  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.265819  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4309  hydroxypyruvate isomerase  50.39 
 
 		 271 aa  260  2e-68  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0533507 
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4459  xylose isomerase-like TIM barrel  50.8 
 
 		 255 aa  259  3e-68  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2118  hydroxypyruvate isomerase  52.12 
 
 		 266 aa  259  3e-68  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0266277 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3449  xylose isomerase-like TIM barrel  49.01 
 
 		 271 aa  259  4e-68  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2461  hydroxypyruvate isomerase  49.24 
 
 		 269 aa  257  1e-67  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.731976  normal  0.599526 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4865  hydroxypyruvate isomerase Gcxl  46.67 
 
 		 260 aa  257  1e-67  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.798851  normal  0.469511 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1781  hydroxypyruvate isomerase  47.71 
 
 		 269 aa  256  3e-67  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.168778  normal  0.857209 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2425  hydroxypyruvate isomerase  50.59 
 
 		 262 aa  256  3e-67  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2260  hydroxypyruvate isomerase  50.59 
 
 		 262 aa  256  3e-67  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.654587  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2300  hydroxypyruvate isomerase  50.59 
 
 		 262 aa  256  3e-67  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.946761  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1489  hydroxypyruvate isomerase  47.67 
 
 		 258 aa  256  3e-67  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1158  hydroxypyruvate isomerase  50.2 
 
 		 268 aa  255  6e-67  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.671898  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0459  hydroxypyruvate isomerase  48.63 
 
 		 264 aa  254  7e-67  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0230369  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>