236 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bpro_4876 on replicon NC_007948
Organism: Polaromonas sp. JS666



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007948  Bpro_4876  hydroxypyruvate isomerase  100 
 
 		 273 aa  564  1e-160  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.857442 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5142  Hydroxypyruvate isomerase  82.4 
 
 		 272 aa  459  9.999999999999999e-129  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0443  hydroxypyruvate isomerase  80.45 
 
 		 265 aa  454  1e-127  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2809  hydroxypyruvate isomerase  70.3 
 
 		 265 aa  397  1e-109  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.356992 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2462  hydroxypyruvate isomerase  68.8 
 
 		 266 aa  387  1e-106  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.684146  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1913  Hydroxypyruvate isomerase  65.04 
 
 		 275 aa  360  9e-99  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1815  hydroxypyruvate isomerase  65.04 
 
 		 275 aa  360  9e-99  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0352764  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3533  hydroxypyruvate isomerase  66.17 
 
 		 258 aa  345  4e-94  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.238199  normal  0.267377 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5077  hydroxypyruvate isomerase  62.55 
 
 		 257 aa  338  4e-92  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.814935  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3496  hydroxypyruvate isomerase  63.91 
 
 		 258 aa  338  8e-92  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0849997  normal  0.283205 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4554  hydroxypyruvate isomerase  62.03 
 
 		 258 aa  337  9.999999999999999e-92  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.695496  normal  0.368967 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0474  hydroxypyruvate isomerase  62.03 
 
 		 258 aa  336  2.9999999999999997e-91  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.166076  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1423  hydroxypyruvate isomerase  64.44 
 
 		 260 aa  334  1e-90  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0831912  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1839  xylose isomerase-like TIM barrel  63.16 
 
 		 260 aa  333  1e-90  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0157456  normal  0.118454 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5120  hydroxypyruvate isomerase  61.8 
 
 		 258 aa  333  1e-90  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3208  hydroxypyruvate isomerase  61.8 
 
 		 258 aa  332  3e-90  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5159  hydroxypyruvate isomerase  61.8 
 
 		 258 aa  332  3e-90  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.324976  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4427  hydroxypyruvate isomerase  61.65 
 
 		 262 aa  332  4e-90  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.198005  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4098  hydroxypyruvate isomerase  60.79 
 
 		 284 aa  328  7e-89  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.832044 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0652  hypothetical protein  63.67 
 
 		 265 aa  326  2.0000000000000001e-88  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5064  hydroxypyruvate isomerase, putative  62.55 
 
 		 261 aa  324  8.000000000000001e-88  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5927  Hydroxypyruvate isomerase  60.29 
 
 		 262 aa  324  1e-87  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3413  Hydroxypyruvate isomerase  61.28 
 
 		 262 aa  321  8e-87  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0020  hypothetical protein  61.28 
 
 		 262 aa  320  9.999999999999999e-87  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.138735  normal  0.842888 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0462  hydroxypyruvate isomerase  62.55 
 
 		 261 aa  320  9.999999999999999e-87  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_07150  hypothetical protein  62.17 
 
 		 265 aa  320  9.999999999999999e-87  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2169  hydroxypyruvate isomerase  59.19 
 
 		 262 aa  320  1.9999999999999998e-86  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.196604  normal  0.222817 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1631  hydroxypyruvate isomerase  56.93 
 
 		 258 aa  319  3.9999999999999996e-86  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3736  Hydroxypyruvate isomerase  60.15 
 
 		 262 aa  317  2e-85  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0973  hydroxypyruvate isomerase  59.62 
 
 		 269 aa  314  9.999999999999999e-85  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1924  hydroxypyruvate isomerase  59.25 
 
 		 258 aa  310  1e-83  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0442  hydroxypyruvate isomerase  59.25 
 
 		 258 aa  310  2e-83  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3181  hydroxypyruvate isomerase  57.3 
 
 		 262 aa  310  2e-83  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.365148  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2017  hydroxypyruvate isomerase  59.25 
 
 		 258 aa  310  2e-83  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.45932  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0573  hydroxypyruvate isomerase  58.87 
 
 		 258 aa  307  1.0000000000000001e-82  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0894  hydroxypyruvate isomerase  58.87 
 
 		 258 aa  307  1.0000000000000001e-82  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1861  hydroxypyruvate isomerase  58.87 
 
 		 258 aa  307  1.0000000000000001e-82  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3955  hydroxypyruvate isomerase  53.56 
 
 		 259 aa  295  6e-79  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1567  hydroxypyruvate isomerase  53.01 
 
 		 258 aa  294  9e-79  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0211  hydroxypyruvate isomerase  50.38 
 
 		 258 aa  293  3e-78  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04753  hydroxypyruvate isomerase  50.38 
 
 		 258 aa  290  2e-77  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3088  hydroxypyruvate isomerase  50.37 
 
 		 263 aa  288  5.0000000000000004e-77  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.645228  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1298  hydroxypyruvate isomerase  53.16 
 
 		 259 aa  287  2e-76  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2172  hydroxypyruvate isomerase  51.28 
 
 		 269 aa  283  2.0000000000000002e-75  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.42054  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2552  hydroxypyruvate isomerase  48.87 
 
 		 258 aa  283  2.0000000000000002e-75  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0908348  hitchhiker  0.00501624 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2118  hydroxypyruvate isomerase  49.82 
 
 		 266 aa  276  2e-73  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0266277 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1489  hydroxypyruvate isomerase  51.5 
 
 		 258 aa  276  3e-73  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3378  hydroxypyruvate isomerase  49.09 
 
 		 264 aa  274  1.0000000000000001e-72  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.490297  normal  0.0397331 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2425  hydroxypyruvate isomerase  50.92 
 
 		 262 aa  272  4.0000000000000004e-72  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2260  hydroxypyruvate isomerase  50.92 
 
 		 262 aa  272  4.0000000000000004e-72  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.654587  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2300  hydroxypyruvate isomerase  50.92 
 
 		 262 aa  272  4.0000000000000004e-72  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.946761  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2770  hydroxypyruvate isomerase  47.97 
 
 		 265 aa  272  4.0000000000000004e-72  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0252433  normal  0.732675 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1597  hydroxypyruvate isomerase  48.88 
 
 		 260 aa  271  1e-71  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00143749  normal  0.674901 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1134  hydroxypyruvate isomerase  50.74 
 
 		 259 aa  270  2e-71  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.852559 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3830  hydroxypyruvate isomerase  49.25 
 
 		 260 aa  270  2e-71  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0147  hydroxypyruvate isomerase, putative  49.82 
 
 		 261 aa  269  4e-71  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.999741  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3317  xylose isomerase-like TIM barrel  51.88 
 
 		 257 aa  269  4e-71  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.695295  hitchhiker  0.00275233 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0132  putative hydroxypyruvate isomerase  49.82 
 
 		 261 aa  269  4e-71  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3863  hydroxypyruvate isomerase  48.88 
 
 		 260 aa  268  7e-71  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.531245  normal  0.545966 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_45010  putative hydroxypyruvate isomerase  48.88 
 
 		 260 aa  268  8e-71  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.224213  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5560  hydroxypyruvate isomerase  48.87 
 
 		 261 aa  267  1e-70  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.446227  normal  0.0996892 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2311  hydroxypyruvate isomerase  49.44 
 
 		 256 aa  266  2e-70  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.279204  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4865  hydroxypyruvate isomerase Gcxl  45.86 
 
 		 260 aa  266  2.9999999999999995e-70  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.798851  normal  0.469511 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1395  hydroxypyruvate isomerase  47.62 
 
 		 269 aa  266  2.9999999999999995e-70  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0279437  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3449  xylose isomerase-like TIM barrel  47.76 
 
 		 271 aa  265  8e-70  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2086  hydroxypyruvate isomerase  51.47 
 
 		 269 aa  264  8.999999999999999e-70  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1158  hydroxypyruvate isomerase  49.82 
 
 		 268 aa  264  1e-69  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.671898  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1571  hydroxypyruvate isomerase  47.76 
 
 		 260 aa  263  2e-69  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.148654  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4298  hydroxypyruvate isomerase  47.76 
 
 		 260 aa  262  6e-69  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2625  hydroxypyruvate isomerase  49.81 
 
 		 260 aa  261  8e-69  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.90554  normal  0.173091 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2613  hydroxypyruvate isomerase  49.82 
 
 		 267 aa  261  8.999999999999999e-69  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6200  hydroxypyruvate isomerase  47.21 
 
 		 269 aa  261  8.999999999999999e-69  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0219655  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1816  hydroxypyruvate isomerase  47.21 
 
 		 269 aa  261  8.999999999999999e-69  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3623  hydroxypyruvate isomerase  48.13 
 
 		 260 aa  261  8.999999999999999e-69  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1879  hydroxypyruvate isomerase  47.21 
 
 		 269 aa  261  8.999999999999999e-69  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0860973  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1788  hydroxypyruvate isomerase  47.21 
 
 		 269 aa  261  8.999999999999999e-69  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3292  hydroxypyruvate isomerase  47.39 
 
 		 260 aa  261  1e-68  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.202186  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1781  hydroxypyruvate isomerase  47.58 
 
 		 269 aa  260  1e-68  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.168778  normal  0.857209 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5179  hydroxypyruvate isomerase  47.21 
 
 		 269 aa  260  2e-68  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.265819  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1902  hydroxypyruvate isomerase  46.84 
 
 		 269 aa  259  2e-68  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000606406 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2368  hydroxypyruvate isomerase  48.3 
 
 		 259 aa  259  3e-68  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.592212  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2461  hydroxypyruvate isomerase  47.58 
 
 		 269 aa  259  4e-68  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.731976  normal  0.599526 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1026  hydroxypyruvate isomerase  49.43 
 
 		 267 aa  259  5.0000000000000005e-68  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.43264  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0115  Hydroxypyruvate isomerase  49.25 
 
 		 260 aa  258  7e-68  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4320  hydroxypyruvate isomerase  52.26 
 
 		 258 aa  258  8e-68  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.166388  normal  0.0980927 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4562  hydroxypyruvate isomerase  50.38 
 
 		 259 aa  258  9e-68  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.427343  normal  0.384122 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1133  hydroxypyruvate isomerase  48.16 
 
 		 260 aa  258  9e-68  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.926547  normal  0.304342 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0109  Hydroxypyruvate isomerase  48.5 
 
 		 260 aa  257  2e-67  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3036  hypothetical protein  48.31 
 
 		 258 aa  255  5e-67  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3135  hypothetical protein  48.31 
 
 		 258 aa  255  5e-67  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02589  hypothetical protein  48.31 
 
 		 258 aa  255  6e-67  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2877  hypothetical protein  48.31 
 
 		 258 aa  255  6e-67  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0973  hypothetical protein  48.31 
 
 		 258 aa  255  6e-67  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.898115  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02554  hypothetical protein  48.31 
 
 		 258 aa  255  6e-67  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0949  Hydroxypyruvate isomerase  47.94 
 
 		 258 aa  254  1.0000000000000001e-66  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2430  hydroxypyruvate isomerase  51.11 
 
 		 257 aa  254  1.0000000000000001e-66  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3479  hydroxypyruvate isomerase  46.13 
 
 		 260 aa  253  2.0000000000000002e-66  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0459  hydroxypyruvate isomerase  46.24 
 
 		 264 aa  254  2.0000000000000002e-66  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0230369  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3152  hydroxypyruvate isomerase  46.13 
 
 		 260 aa  253  2.0000000000000002e-66  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3282  hydroxypyruvate isomerase protein  47.94 
 
 		 260 aa  253  3e-66  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.257483  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>