More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene EcSMS35_4865 on replicon NC_010498
Organism: Escherichia coli SMS-3-5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010498  EcSMS35_4865  hydroxypyruvate isomerase Gcxl  100 
 
 		 260 aa  546  1e-154  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.798851  normal  0.469511 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2770  hydroxypyruvate isomerase  60.55 
 
 		 265 aa  340  2e-92  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0252433  normal  0.732675 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3623  hydroxypyruvate isomerase  62.75 
 
 		 260 aa  338  4e-92  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_45010  putative hydroxypyruvate isomerase  61.33 
 
 		 260 aa  335  2.9999999999999997e-91  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.224213  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3830  hydroxypyruvate isomerase  61.18 
 
 		 260 aa  334  7e-91  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3863  hydroxypyruvate isomerase  62.75 
 
 		 260 aa  333  2e-90  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.531245  normal  0.545966 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1571  hydroxypyruvate isomerase  61.96 
 
 		 260 aa  332  3e-90  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.148654  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1597  hydroxypyruvate isomerase  61.57 
 
 		 260 aa  332  4e-90  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00143749  normal  0.674901 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4298  hydroxypyruvate isomerase  61.96 
 
 		 260 aa  330  1e-89  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1298  hydroxypyruvate isomerase  58.04 
 
 		 259 aa  330  2e-89  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2311  hydroxypyruvate isomerase  60 
 
 		 256 aa  325  5e-88  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.279204  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3955  hydroxypyruvate isomerase  57.14 
 
 		 259 aa  322  5e-87  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2368  hydroxypyruvate isomerase  57.48 
 
 		 259 aa  316  2e-85  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.592212  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3292  hydroxypyruvate isomerase  58.89 
 
 		 260 aa  316  3e-85  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.202186  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3449  xylose isomerase-like TIM barrel  58.89 
 
 		 271 aa  315  4e-85  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0958  hydroxypyruvate isomerase  56.76 
 
 		 267 aa  312  2.9999999999999996e-84  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3088  hydroxypyruvate isomerase  55.21 
 
 		 263 aa  312  3.9999999999999997e-84  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.645228  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1395  hydroxypyruvate isomerase  56.25 
 
 		 269 aa  311  6.999999999999999e-84  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0279437  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1902  hydroxypyruvate isomerase  55.86 
 
 		 269 aa  311  1e-83  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000606406 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6200  hydroxypyruvate isomerase  55.86 
 
 		 269 aa  311  1e-83  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0219655  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1816  hydroxypyruvate isomerase  55.86 
 
 		 269 aa  310  1e-83  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1879  hydroxypyruvate isomerase  55.86 
 
 		 269 aa  311  1e-83  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0860973  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1788  hydroxypyruvate isomerase  55.86 
 
 		 269 aa  310  1e-83  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5179  hydroxypyruvate isomerase  55.86 
 
 		 269 aa  309  2.9999999999999997e-83  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.265819  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_43410  hydroxypyruvate isomerase  60.63 
 
 		 259 aa  309  2.9999999999999997e-83  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5560  hydroxypyruvate isomerase  55.29 
 
 		 261 aa  308  8e-83  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.446227  normal  0.0996892 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3479  hydroxypyruvate isomerase  56.13 
 
 		 260 aa  306  2.0000000000000002e-82  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1781  hydroxypyruvate isomerase  56.64 
 
 		 269 aa  305  3e-82  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.168778  normal  0.857209 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3152  hydroxypyruvate isomerase  54.94 
 
 		 260 aa  304  1.0000000000000001e-81  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2172  hydroxypyruvate isomerase  53.73 
 
 		 269 aa  302  4.0000000000000003e-81  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.42054  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2461  hydroxypyruvate isomerase  56.25 
 
 		 269 aa  301  6.000000000000001e-81  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.731976  normal  0.599526 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0567  hydroxypyruvate isomerase  54.33 
 
 		 258 aa  297  1e-79  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0572  hydroxypyruvate isomerase  54.33 
 
 		 258 aa  297  1e-79  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0459  hydroxypyruvate isomerase  55.47 
 
 		 264 aa  296  2e-79  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0230369  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0551  hydroxypyruvate isomerase  55.51 
 
 		 258 aa  296  2e-79  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0582  hydroxypyruvate isomerase  55.12 
 
 		 258 aa  296  3e-79  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0545  hydroxypyruvate isomerase  55.12 
 
 		 258 aa  296  3e-79  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3114  hydroxypyruvate isomerase  55.12 
 
 		 258 aa  296  3e-79  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.334824 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0565  hydroxypyruvate isomerase  53.94 
 
 		 258 aa  295  4e-79  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.551663  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00458  hydroxypyruvate isomerase  55.12 
 
 		 258 aa  295  5e-79  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.751856  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00463  hypothetical protein  55.12 
 
 		 258 aa  295  5e-79  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3104  hydroxypyruvate isomerase  55.12 
 
 		 258 aa  295  5e-79  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0609  hydroxypyruvate isomerase  55.12 
 
 		 258 aa  295  6e-79  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4562  hydroxypyruvate isomerase  56.92 
 
 		 259 aa  295  6e-79  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.427343  normal  0.384122 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2118  hydroxypyruvate isomerase  52.9 
 
 		 266 aa  295  6e-79  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0266277 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3282  hydroxypyruvate isomerase protein  54.55 
 
 		 260 aa  295  7e-79  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.257483  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2929  hydroxypyruvate isomerase  53.52 
 
 		 263 aa  294  9e-79  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.452433 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2425  hydroxypyruvate isomerase  53.52 
 
 		 262 aa  294  9e-79  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0626  hydroxypyruvate isomerase  53.94 
 
 		 258 aa  294  9e-79  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.396658  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2260  hydroxypyruvate isomerase  53.52 
 
 		 262 aa  294  9e-79  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.654587  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2300  hydroxypyruvate isomerase  53.52 
 
 		 262 aa  294  9e-79  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.946761  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3741  hydroxypyruvate isomerase  52.73 
 
 		 259 aa  293  3e-78  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.476363  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3317  xylose isomerase-like TIM barrel  50.98 
 
 		 257 aa  292  4e-78  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.695295  hitchhiker  0.00275233 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2613  hydroxypyruvate isomerase  54.23 
 
 		 267 aa  291  6e-78  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4309  hydroxypyruvate isomerase  54.83 
 
 		 271 aa  290  1e-77  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0533507 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1134  hydroxypyruvate isomerase  52.9 
 
 		 259 aa  290  2e-77  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.852559 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2552  hydroxypyruvate isomerase  50.59 
 
 		 258 aa  286  2.9999999999999996e-76  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0908348  hitchhiker  0.00501624 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1621  hydroxypyruvate isomerase  55.47 
 
 		 266 aa  285  4e-76  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.377689  normal  0.533551 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04753  hydroxypyruvate isomerase  50.2 
 
 		 258 aa  285  5e-76  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3181  hydroxypyruvate isomerase  49.41 
 
 		 262 aa  283  2.0000000000000002e-75  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.365148  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0211  hydroxypyruvate isomerase  49.8 
 
 		 258 aa  282  4.0000000000000003e-75  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0147  hydroxypyruvate isomerase, putative  48.03 
 
 		 261 aa  279  3e-74  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.999741  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0132  putative hydroxypyruvate isomerase  48.03 
 
 		 261 aa  279  3e-74  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0474  hydroxypyruvate isomerase  48.24 
 
 		 258 aa  274  1.0000000000000001e-72  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.166076  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2809  hydroxypyruvate isomerase  46.95 
 
 		 265 aa  272  5.000000000000001e-72  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.356992 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3378  hydroxypyruvate isomerase  47.45 
 
 		 264 aa  271  6e-72  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.490297  normal  0.0397331 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1631  hydroxypyruvate isomerase  47.84 
 
 		 258 aa  271  8.000000000000001e-72  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5120  hydroxypyruvate isomerase  48.05 
 
 		 258 aa  270  2e-71  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3208  hydroxypyruvate isomerase  48.05 
 
 		 258 aa  269  4e-71  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5159  hydroxypyruvate isomerase  48.05 
 
 		 258 aa  269  4e-71  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.324976  normal  1 
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4459  xylose isomerase-like TIM barrel  51.6 
 
 		 255 aa  268  7e-71  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5077  hydroxypyruvate isomerase  48.05 
 
 		 257 aa  268  7e-71  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.814935  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0443  hydroxypyruvate isomerase  46.18 
 
 		 265 aa  266  2e-70  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4554  hydroxypyruvate isomerase  47.45 
 
 		 258 aa  266  2e-70  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.695496  normal  0.368967 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1158  hydroxypyruvate isomerase  49.41 
 
 		 268 aa  266  2e-70  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.671898  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4876  hydroxypyruvate isomerase  45.86 
 
 		 273 aa  266  2.9999999999999995e-70  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.857442 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4427  hydroxypyruvate isomerase  47.84 
 
 		 262 aa  266  2.9999999999999995e-70  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.198005  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3496  hydroxypyruvate isomerase  48.24 
 
 		 258 aa  265  7e-70  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0849997  normal  0.283205 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1839  xylose isomerase-like TIM barrel  49.02 
 
 		 260 aa  264  1e-69  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0157456  normal  0.118454 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2140  Hydroxypyruvate isomerase  48.8 
 
 		 273 aa  262  4e-69  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1567  hydroxypyruvate isomerase  47.06 
 
 		 258 aa  260  2e-68  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3413  Hydroxypyruvate isomerase  46.09 
 
 		 262 aa  258  7e-68  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3104  hypothetical protein  47.64 
 
 		 258 aa  255  6e-67  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3120  hypothetical protein  47.64 
 
 		 258 aa  255  6e-67  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.0148759 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0020  hypothetical protein  46.48 
 
 		 262 aa  254  1.0000000000000001e-66  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.138735  normal  0.842888 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0652  hypothetical protein  45.91 
 
 		 265 aa  254  1.0000000000000001e-66  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1423  hydroxypyruvate isomerase  47.06 
 
 		 260 aa  253  2.0000000000000002e-66  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0831912  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5927  Hydroxypyruvate isomerase  46.67 
 
 		 262 aa  253  2.0000000000000002e-66  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3736  Hydroxypyruvate isomerase  44.92 
 
 		 262 aa  253  2.0000000000000002e-66  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2462  hydroxypyruvate isomerase  46.18 
 
 		 266 aa  253  3e-66  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.684146  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3135  hypothetical protein  46.46 
 
 		 258 aa  251  6e-66  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02589  hypothetical protein  46.46 
 
 		 258 aa  251  9.000000000000001e-66  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02554  hypothetical protein  46.46 
 
 		 258 aa  251  9.000000000000001e-66  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0973  hypothetical protein  46.46 
 
 		 258 aa  251  9.000000000000001e-66  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.898115  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2877  hypothetical protein  46.46 
 
 		 258 aa  251  9.000000000000001e-66  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1489  hydroxypyruvate isomerase  44.31 
 
 		 258 aa  250  1e-65  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3036  hypothetical protein  46.46 
 
 		 258 aa  251  1e-65  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2169  hydroxypyruvate isomerase  45.1 
 
 		 262 aa  249  2e-65  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.196604  normal  0.222817 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1815  hydroxypyruvate isomerase  42.48 
 
 		 275 aa  250  2e-65  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0352764  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1913  Hydroxypyruvate isomerase  42.48 
 
 		 275 aa  250  2e-65  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>