262 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnuc_1567 on replicon NC_009379
Organism: Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009379  Pnuc_1567  hydroxypyruvate isomerase  100 
 
 		 258 aa  536  1e-151  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1631  hydroxypyruvate isomerase  83.14 
 
 		 258 aa  458  9.999999999999999e-129  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4554  hydroxypyruvate isomerase  60.85 
 
 		 258 aa  342  4e-93  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.695496  normal  0.368967 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0474  hydroxypyruvate isomerase  59.69 
 
 		 258 aa  336  1.9999999999999998e-91  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.166076  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5077  hydroxypyruvate isomerase  60.47 
 
 		 257 aa  335  3.9999999999999995e-91  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.814935  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5120  hydroxypyruvate isomerase  60.47 
 
 		 258 aa  331  7.000000000000001e-90  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3208  hydroxypyruvate isomerase  60.47 
 
 		 258 aa  330  1e-89  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5159  hydroxypyruvate isomerase  60.47 
 
 		 258 aa  330  1e-89  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.324976  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3496  hydroxypyruvate isomerase  60.47 
 
 		 258 aa  330  2e-89  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0849997  normal  0.283205 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4427  hydroxypyruvate isomerase  56.98 
 
 		 262 aa  326  3e-88  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.198005  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3181  hydroxypyruvate isomerase  58.37 
 
 		 262 aa  321  7e-87  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.365148  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3413  Hydroxypyruvate isomerase  57.59 
 
 		 262 aa  320  9.999999999999999e-87  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1839  xylose isomerase-like TIM barrel  57.36 
 
 		 260 aa  318  5e-86  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0157456  normal  0.118454 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2169  hydroxypyruvate isomerase  56.59 
 
 		 262 aa  317  2e-85  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.196604  normal  0.222817 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0443  hydroxypyruvate isomerase  55.85 
 
 		 265 aa  316  3e-85  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3736  Hydroxypyruvate isomerase  56.42 
 
 		 262 aa  315  4e-85  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5927  Hydroxypyruvate isomerase  56.98 
 
 		 262 aa  314  9e-85  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2809  hydroxypyruvate isomerase  54.72 
 
 		 265 aa  312  2.9999999999999996e-84  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.356992 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1597  hydroxypyruvate isomerase  55.64 
 
 		 260 aa  309  4e-83  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00143749  normal  0.674901 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0973  hydroxypyruvate isomerase  55.81 
 
 		 269 aa  308  6.999999999999999e-83  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0020  hypothetical protein  54.47 
 
 		 262 aa  307  1.0000000000000001e-82  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.138735  normal  0.842888 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0573  hydroxypyruvate isomerase  55.43 
 
 		 258 aa  306  3e-82  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1423  hydroxypyruvate isomerase  57.75 
 
 		 260 aa  306  3e-82  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0831912  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0894  hydroxypyruvate isomerase  55.43 
 
 		 258 aa  306  3e-82  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1924  hydroxypyruvate isomerase  55.43 
 
 		 258 aa  305  3e-82  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1861  hydroxypyruvate isomerase  55.43 
 
 		 258 aa  306  3e-82  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0442  hydroxypyruvate isomerase  55.43 
 
 		 258 aa  305  4.0000000000000004e-82  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2017  hydroxypyruvate isomerase  55.04 
 
 		 258 aa  304  8.000000000000001e-82  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.45932  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0147  hydroxypyruvate isomerase, putative  54.86 
 
 		 261 aa  303  3.0000000000000004e-81  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.999741  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0132  putative hydroxypyruvate isomerase  54.86 
 
 		 261 aa  303  3.0000000000000004e-81  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2462  hydroxypyruvate isomerase  55.47 
 
 		 266 aa  301  5.000000000000001e-81  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.684146  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1571  hydroxypyruvate isomerase  55.25 
 
 		 260 aa  300  1e-80  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.148654  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4298  hydroxypyruvate isomerase  54.86 
 
 		 260 aa  297  1e-79  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3863  hydroxypyruvate isomerase  54.86 
 
 		 260 aa  296  2e-79  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.531245  normal  0.545966 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0462  hydroxypyruvate isomerase  54.51 
 
 		 261 aa  295  7e-79  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4876  hydroxypyruvate isomerase  53.01 
 
 		 273 aa  294  8e-79  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.857442 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3623  hydroxypyruvate isomerase  54.47 
 
 		 260 aa  293  2e-78  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_07150  hypothetical protein  52.71 
 
 		 265 aa  292  3e-78  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2770  hydroxypyruvate isomerase  52.14 
 
 		 265 aa  290  2e-77  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0252433  normal  0.732675 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0652  hypothetical protein  52.33 
 
 		 265 aa  290  2e-77  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5064  hydroxypyruvate isomerase, putative  52.55 
 
 		 261 aa  287  1e-76  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2311  hydroxypyruvate isomerase  53.73 
 
 		 256 aa  287  1e-76  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.279204  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2552  hydroxypyruvate isomerase  50.78 
 
 		 258 aa  286  2.9999999999999996e-76  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0908348  hitchhiker  0.00501624 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04753  hydroxypyruvate isomerase  50.39 
 
 		 258 aa  285  4e-76  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0211  hydroxypyruvate isomerase  49.22 
 
 		 258 aa  282  3.0000000000000004e-75  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_45010  putative hydroxypyruvate isomerase  51.75 
 
 		 260 aa  281  6.000000000000001e-75  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.224213  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1134  hydroxypyruvate isomerase  53.75 
 
 		 259 aa  281  6.000000000000001e-75  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.852559 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5142  Hydroxypyruvate isomerase  52.26 
 
 		 272 aa  280  1e-74  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3830  hydroxypyruvate isomerase  51.36 
 
 		 260 aa  280  2e-74  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0115  Hydroxypyruvate isomerase  49.61 
 
 		 260 aa  278  5e-74  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0109  Hydroxypyruvate isomerase  49.61 
 
 		 260 aa  277  1e-73  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4320  hydroxypyruvate isomerase  53.1 
 
 		 258 aa  276  2e-73  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.166388  normal  0.0980927 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3282  hydroxypyruvate isomerase protein  50.58 
 
 		 260 aa  276  3e-73  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.257483  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3955  hydroxypyruvate isomerase  52.57 
 
 		 259 aa  276  3e-73  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1489  hydroxypyruvate isomerase  50.39 
 
 		 258 aa  275  4e-73  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3036  hypothetical protein  51.36 
 
 		 258 aa  275  5e-73  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3135  hypothetical protein  51.36 
 
 		 258 aa  275  6e-73  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02589  hypothetical protein  51.36 
 
 		 258 aa  275  7e-73  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02554  hypothetical protein  51.36 
 
 		 258 aa  275  7e-73  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0973  hypothetical protein  51.36 
 
 		 258 aa  275  7e-73  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.898115  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2877  hypothetical protein  51.36 
 
 		 258 aa  275  7e-73  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1298  hydroxypyruvate isomerase  51.76 
 
 		 259 aa  274  9e-73  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3317  xylose isomerase-like TIM barrel  50.59 
 
 		 257 aa  274  1.0000000000000001e-72  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.695295  hitchhiker  0.00275233 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3378  hydroxypyruvate isomerase  50.39 
 
 		 264 aa  274  1.0000000000000001e-72  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.490297  normal  0.0397331 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3449  xylose isomerase-like TIM barrel  50.99 
 
 		 271 aa  273  2.0000000000000002e-72  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3479  hydroxypyruvate isomerase  50.99 
 
 		 260 aa  273  2.0000000000000002e-72  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0949  Hydroxypyruvate isomerase  50.97 
 
 		 258 aa  272  3e-72  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3152  hydroxypyruvate isomerase  49.8 
 
 		 260 aa  271  6e-72  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2086  hydroxypyruvate isomerase  52.92 
 
 		 269 aa  269  2.9999999999999997e-71  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1815  hydroxypyruvate isomerase  48.31 
 
 		 275 aa  269  2.9999999999999997e-71  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0352764  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2118  hydroxypyruvate isomerase  52.14 
 
 		 266 aa  269  2.9999999999999997e-71  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0266277 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1913  Hydroxypyruvate isomerase  48.31 
 
 		 275 aa  269  2.9999999999999997e-71  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5560  hydroxypyruvate isomerase  50.2 
 
 		 261 aa  269  2.9999999999999997e-71  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.446227  normal  0.0996892 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3120  hypothetical protein  50.97 
 
 		 258 aa  268  7e-71  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.0148759 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3104  hypothetical protein  50.97 
 
 		 258 aa  268  7e-71  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4562  hydroxypyruvate isomerase  54.94 
 
 		 259 aa  267  1e-70  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.427343  normal  0.384122 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1855  hydroxypyruvate isomerase  50.58 
 
 		 260 aa  267  1e-70  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2929  hydroxypyruvate isomerase  52.69 
 
 		 263 aa  267  1e-70  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.452433 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0459  hydroxypyruvate isomerase  49.02 
 
 		 264 aa  266  2e-70  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0230369  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3088  hydroxypyruvate isomerase  49.02 
 
 		 263 aa  267  2e-70  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.645228  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2172  hydroxypyruvate isomerase  49.8 
 
 		 269 aa  266  2e-70  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.42054  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2268  Hydroxypyruvate isomerase  51.36 
 
 		 281 aa  266  2e-70  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.822354 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4309  hydroxypyruvate isomerase  50.79 
 
 		 271 aa  266  2e-70  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0533507 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0545  hydroxypyruvate isomerase  49.03 
 
 		 258 aa  266  2.9999999999999995e-70  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3292  hydroxypyruvate isomerase  50.2 
 
 		 260 aa  266  2.9999999999999995e-70  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.202186  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3114  hydroxypyruvate isomerase  49.03 
 
 		 258 aa  266  2.9999999999999995e-70  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.334824 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0582  hydroxypyruvate isomerase  49.03 
 
 		 258 aa  266  2.9999999999999995e-70  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0551  hydroxypyruvate isomerase  49.42 
 
 		 258 aa  266  4e-70  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0609  hydroxypyruvate isomerase  49.03 
 
 		 258 aa  265  4e-70  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3036  hypothetical protein  50.58 
 
 		 258 aa  265  5.999999999999999e-70  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1953  Hydroxypyruvate isomerase  50.97 
 
 		 259 aa  265  5.999999999999999e-70  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.346217  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00458  hydroxypyruvate isomerase  48.64 
 
 		 258 aa  264  1e-69  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.751856  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3104  hydroxypyruvate isomerase  48.64 
 
 		 258 aa  264  1e-69  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3533  hydroxypyruvate isomerase  49.41 
 
 		 258 aa  264  1e-69  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.238199  normal  0.267377 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00463  hypothetical protein  48.64 
 
 		 258 aa  264  1e-69  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3065  hypothetical protein  50.58 
 
 		 258 aa  264  1e-69  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.765519  normal  0.510591 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2625  hydroxypyruvate isomerase  49.03 
 
 		 260 aa  262  4e-69  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.90554  normal  0.173091 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1158  hydroxypyruvate isomerase  50.2 
 
 		 268 aa  262  4.999999999999999e-69  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.671898  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5307  Hydroxypyruvate isomerase  53.49 
 
 		 258 aa  261  6.999999999999999e-69  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.314618  normal  0.971312 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1026  hydroxypyruvate isomerase  51.75 
 
 		 267 aa  261  8e-69  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.43264  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>