289 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_3088 on replicon NC_011894
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011894  Mnod_3088  hydroxypyruvate isomerase  100 
 
 		 263 aa  543  1e-153  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.645228  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3955  hydroxypyruvate isomerase  64.82 
 
 		 259 aa  361  5.0000000000000005e-99  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1298  hydroxypyruvate isomerase  66.54 
 
 		 259 aa  360  1e-98  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1395  hydroxypyruvate isomerase  65.12 
 
 		 269 aa  348  6e-95  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0279437  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1902  hydroxypyruvate isomerase  64.73 
 
 		 269 aa  347  1e-94  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000606406 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6200  hydroxypyruvate isomerase  64.73 
 
 		 269 aa  347  1e-94  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0219655  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1879  hydroxypyruvate isomerase  64.73 
 
 		 269 aa  347  1e-94  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0860973  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1816  hydroxypyruvate isomerase  64.73 
 
 		 269 aa  347  2e-94  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1788  hydroxypyruvate isomerase  64.73 
 
 		 269 aa  347  2e-94  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5179  hydroxypyruvate isomerase  64.73 
 
 		 269 aa  345  3e-94  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.265819  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1781  hydroxypyruvate isomerase  65.5 
 
 		 269 aa  344  1e-93  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.168778  normal  0.857209 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2461  hydroxypyruvate isomerase  65.5 
 
 		 269 aa  342  2.9999999999999997e-93  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.731976  normal  0.599526 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3449  xylose isomerase-like TIM barrel  63.24 
 
 		 271 aa  342  2.9999999999999997e-93  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2770  hydroxypyruvate isomerase  63.92 
 
 		 265 aa  342  4e-93  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0252433  normal  0.732675 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2118  hydroxypyruvate isomerase  64.31 
 
 		 266 aa  342  5e-93  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0266277 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2172  hydroxypyruvate isomerase  63.32 
 
 		 269 aa  341  5.999999999999999e-93  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.42054  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3292  hydroxypyruvate isomerase  61.45 
 
 		 260 aa  340  2e-92  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.202186  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1571  hydroxypyruvate isomerase  63.92 
 
 		 260 aa  340  2e-92  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.148654  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1134  hydroxypyruvate isomerase  61 
 
 		 259 aa  339  2.9999999999999998e-92  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.852559 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3863  hydroxypyruvate isomerase  63.92 
 
 		 260 aa  339  2.9999999999999998e-92  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.531245  normal  0.545966 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3623  hydroxypyruvate isomerase  63.92 
 
 		 260 aa  338  4e-92  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2311  hydroxypyruvate isomerase  65.1 
 
 		 256 aa  338  4e-92  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.279204  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3830  hydroxypyruvate isomerase  64.71 
 
 		 260 aa  338  5e-92  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4298  hydroxypyruvate isomerase  63.53 
 
 		 260 aa  337  9.999999999999999e-92  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2425  hydroxypyruvate isomerase  64.48 
 
 		 262 aa  337  9.999999999999999e-92  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2260  hydroxypyruvate isomerase  64.48 
 
 		 262 aa  337  9.999999999999999e-92  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.654587  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2300  hydroxypyruvate isomerase  64.48 
 
 		 262 aa  337  9.999999999999999e-92  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.946761  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_45010  putative hydroxypyruvate isomerase  63.92 
 
 		 260 aa  335  3.9999999999999995e-91  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.224213  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1597  hydroxypyruvate isomerase  63.92 
 
 		 260 aa  333  2e-90  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00143749  normal  0.674901 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3152  hydroxypyruvate isomerase  61.69 
 
 		 260 aa  332  3e-90  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3479  hydroxypyruvate isomerase  60.92 
 
 		 260 aa  330  1e-89  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4562  hydroxypyruvate isomerase  63.18 
 
 		 259 aa  328  4e-89  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.427343  normal  0.384122 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3282  hydroxypyruvate isomerase protein  62.35 
 
 		 260 aa  326  2.0000000000000001e-88  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.257483  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1621  hydroxypyruvate isomerase  64.73 
 
 		 266 aa  325  3e-88  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.377689  normal  0.533551 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0459  hydroxypyruvate isomerase  60.78 
 
 		 264 aa  325  6e-88  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0230369  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4309  hydroxypyruvate isomerase  61.42 
 
 		 271 aa  317  1e-85  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0533507 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0958  hydroxypyruvate isomerase  58.69 
 
 		 267 aa  314  9.999999999999999e-85  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4865  hydroxypyruvate isomerase Gcxl  55.21 
 
 		 260 aa  312  3.9999999999999997e-84  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.798851  normal  0.469511 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2368  hydroxypyruvate isomerase  56.47 
 
 		 259 aa  310  1e-83  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.592212  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_43410  hydroxypyruvate isomerase  64.96 
 
 		 259 aa  309  2.9999999999999997e-83  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3378  hydroxypyruvate isomerase  56.11 
 
 		 264 aa  306  2.0000000000000002e-82  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.490297  normal  0.0397331 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1158  hydroxypyruvate isomerase  58.62 
 
 		 268 aa  306  3e-82  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.671898  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3741  hydroxypyruvate isomerase  54.26 
 
 		 259 aa  304  9.000000000000001e-82  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.476363  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0443  hydroxypyruvate isomerase  55.73 
 
 		 265 aa  303  2.0000000000000002e-81  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0567  hydroxypyruvate isomerase  56.64 
 
 		 258 aa  301  7.000000000000001e-81  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0572  hydroxypyruvate isomerase  56.64 
 
 		 258 aa  301  7.000000000000001e-81  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3114  hydroxypyruvate isomerase  57.25 
 
 		 258 aa  300  1e-80  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.334824 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0582  hydroxypyruvate isomerase  57.25 
 
 		 258 aa  300  1e-80  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0545  hydroxypyruvate isomerase  57.25 
 
 		 258 aa  300  1e-80  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00458  hydroxypyruvate isomerase  57.25 
 
 		 258 aa  300  2e-80  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.751856  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3104  hydroxypyruvate isomerase  57.25 
 
 		 258 aa  300  2e-80  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0565  hydroxypyruvate isomerase  56.25 
 
 		 258 aa  300  2e-80  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.551663  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0609  hydroxypyruvate isomerase  57.25 
 
 		 258 aa  300  2e-80  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00463  hypothetical protein  57.25 
 
 		 258 aa  300  2e-80  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0551  hydroxypyruvate isomerase  56.86 
 
 		 258 aa  300  2e-80  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3317  xylose isomerase-like TIM barrel  54.09 
 
 		 257 aa  299  3e-80  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.695295  hitchhiker  0.00275233 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0626  hydroxypyruvate isomerase  56.25 
 
 		 258 aa  299  4e-80  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.396658  normal  1 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2613  hydroxypyruvate isomerase  55.06 
 
 		 267 aa  298  8e-80  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5560  hydroxypyruvate isomerase  56.08 
 
 		 261 aa  297  1e-79  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.446227  normal  0.0996892 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2929  hydroxypyruvate isomerase  57.81 
 
 		 263 aa  296  3e-79  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.452433 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3181  hydroxypyruvate isomerase  52.49 
 
 		 262 aa  289  4e-77  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.365148  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4876  hydroxypyruvate isomerase  50.37 
 
 		 273 aa  288  5.0000000000000004e-77  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.857442 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0652  hypothetical protein  54.09 
 
 		 265 aa  286  2e-76  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2462  hydroxypyruvate isomerase  52.11 
 
 		 266 aa  283  2.0000000000000002e-75  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.684146  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4719  hydroxypyruvate isomerase  57.65 
 
 		 258 aa  283  3.0000000000000004e-75  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00317481 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_07150  hypothetical protein  53.7 
 
 		 265 aa  282  4.0000000000000003e-75  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4427  hydroxypyruvate isomerase  51.97 
 
 		 262 aa  281  7.000000000000001e-75  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.198005  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1631  hydroxypyruvate isomerase  51.37 
 
 		 258 aa  281  7.000000000000001e-75  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5142  Hydroxypyruvate isomerase  52.08 
 
 		 272 aa  276  2e-73  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5927  Hydroxypyruvate isomerase  52.16 
 
 		 262 aa  274  1.0000000000000001e-72  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04753  hydroxypyruvate isomerase  46.85 
 
 		 258 aa  272  4.0000000000000004e-72  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4554  hydroxypyruvate isomerase  49.41 
 
 		 258 aa  270  2e-71  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.695496  normal  0.368967 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1839  xylose isomerase-like TIM barrel  50.59 
 
 		 260 aa  268  5e-71  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0157456  normal  0.118454 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2809  hydroxypyruvate isomerase  48.85 
 
 		 265 aa  268  5e-71  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.356992 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3496  hydroxypyruvate isomerase  50.98 
 
 		 258 aa  268  7e-71  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0849997  normal  0.283205 
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4459  xylose isomerase-like TIM barrel  53.66 
 
 		 255 aa  268  7e-71  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5064  hydroxypyruvate isomerase, putative  52.36 
 
 		 261 aa  267  1e-70  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0020  hypothetical protein  51.95 
 
 		 262 aa  266  2e-70  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.138735  normal  0.842888 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3413  Hydroxypyruvate isomerase  50.39 
 
 		 262 aa  266  2e-70  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1567  hydroxypyruvate isomerase  49.02 
 
 		 258 aa  267  2e-70  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1423  hydroxypyruvate isomerase  51.37 
 
 		 260 aa  265  7e-70  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0831912  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5077  hydroxypyruvate isomerase  49.41 
 
 		 257 aa  265  7e-70  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.814935  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0474  hydroxypyruvate isomerase  48.63 
 
 		 258 aa  264  1e-69  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.166076  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5120  hydroxypyruvate isomerase  49.02 
 
 		 258 aa  264  1e-69  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2169  hydroxypyruvate isomerase  50 
 
 		 262 aa  263  2e-69  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.196604  normal  0.222817 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2552  hydroxypyruvate isomerase  47.45 
 
 		 258 aa  263  2e-69  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0908348  hitchhiker  0.00501624 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0211  hydroxypyruvate isomerase  45.88 
 
 		 258 aa  263  2e-69  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0462  hydroxypyruvate isomerase  52.36 
 
 		 261 aa  262  4.999999999999999e-69  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3208  hydroxypyruvate isomerase  49.02 
 
 		 258 aa  262  4.999999999999999e-69  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5159  hydroxypyruvate isomerase  49.02 
 
 		 258 aa  262  4.999999999999999e-69  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.324976  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3736  Hydroxypyruvate isomerase  49.61 
 
 		 262 aa  262  4.999999999999999e-69  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4202  hydroxypyruvate isomerase  56.47 
 
 		 268 aa  261  1e-68  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.407118 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1918  Hydroxypyruvate isomerase  45.74 
 
 		 260 aa  258  7e-68  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0177301  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1174  hydroxypyruvate isomerase  48.62 
 
 		 262 aa  257  1e-67  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.970176  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0973  hydroxypyruvate isomerase  49.02 
 
 		 269 aa  256  2e-67  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1133  hydroxypyruvate isomerase  50.59 
 
 		 260 aa  254  7e-67  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.926547  normal  0.304342 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4572  hydroxypyruvate isomerase  55.69 
 
 		 258 aa  254  1.0000000000000001e-66  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0168162 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1924  hydroxypyruvate isomerase  48.63 
 
 		 258 aa  254  1.0000000000000001e-66  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0147  hydroxypyruvate isomerase, putative  46.67 
 
 		 261 aa  253  2.0000000000000002e-66  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.999741  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0132  putative hydroxypyruvate isomerase  46.67 
 
 		 261 aa  253  2.0000000000000002e-66  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>