253 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Reut_A1423 on replicon NC_007347
Organism: Ralstonia eutropha JMP134



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007347  Reut_A1423  hydroxypyruvate isomerase  100 
 
 		 260 aa  531  1e-150  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0831912  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1839  xylose isomerase-like TIM barrel  84.23 
 
 		 260 aa  457  9.999999999999999e-129  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0157456  normal  0.118454 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0474  hydroxypyruvate isomerase  76.36 
 
 		 258 aa  415  9.999999999999999e-116  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.166076  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4554  hydroxypyruvate isomerase  76.36 
 
 		 258 aa  414  9.999999999999999e-116  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.695496  normal  0.368967 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4427  hydroxypyruvate isomerase  76.06 
 
 		 262 aa  414  1e-114  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.198005  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0442  hydroxypyruvate isomerase  77.13 
 
 		 258 aa  407  1e-113  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0973  hydroxypyruvate isomerase  76.83 
 
 		 269 aa  410  1e-113  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5077  hydroxypyruvate isomerase  76.36 
 
 		 257 aa  409  1e-113  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.814935  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3496  hydroxypyruvate isomerase  77.91 
 
 		 258 aa  410  1e-113  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0849997  normal  0.283205 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1924  hydroxypyruvate isomerase  77.13 
 
 		 258 aa  408  1e-113  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5927  Hydroxypyruvate isomerase  77.61 
 
 		 262 aa  407  1e-113  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0573  hydroxypyruvate isomerase  76.74 
 
 		 258 aa  405  1.0000000000000001e-112  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5120  hydroxypyruvate isomerase  77.52 
 
 		 258 aa  406  1.0000000000000001e-112  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3208  hydroxypyruvate isomerase  77.52 
 
 		 258 aa  405  1.0000000000000001e-112  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5159  hydroxypyruvate isomerase  77.52 
 
 		 258 aa  405  1.0000000000000001e-112  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.324976  normal  1 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0894  hydroxypyruvate isomerase  76.74 
 
 		 258 aa  405  1.0000000000000001e-112  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2017  hydroxypyruvate isomerase  76.74 
 
 		 258 aa  407  1.0000000000000001e-112  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.45932  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1861  hydroxypyruvate isomerase  76.74 
 
 		 258 aa  405  1.0000000000000001e-112  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2169  hydroxypyruvate isomerase  76.06 
 
 		 262 aa  402  1e-111  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.196604  normal  0.222817 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5064  hydroxypyruvate isomerase, putative  73.33 
 
 		 261 aa  381  1e-105  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_07150  hypothetical protein  71.32 
 
 		 265 aa  377  1e-104  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0652  hypothetical protein  70.93 
 
 		 265 aa  378  1e-104  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0462  hydroxypyruvate isomerase  73.73 
 
 		 261 aa  377  1e-103  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3413  Hydroxypyruvate isomerase  68.48 
 
 		 262 aa  370  1e-102  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0443  hydroxypyruvate isomerase  66.79 
 
 		 265 aa  365  1e-100  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3736  Hydroxypyruvate isomerase  67.32 
 
 		 262 aa  366  1e-100  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0020  hypothetical protein  67.7 
 
 		 262 aa  360  1e-98  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.138735  normal  0.842888 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4876  hydroxypyruvate isomerase  65.04 
 
 		 273 aa  347  8e-95  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.857442 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2462  hydroxypyruvate isomerase  64.66 
 
 		 266 aa  345  4e-94  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.684146  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2809  hydroxypyruvate isomerase  60.38 
 
 		 265 aa  328  6e-89  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.356992 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5142  Hydroxypyruvate isomerase  61.62 
 
 		 272 aa  327  1.0000000000000001e-88  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3181  hydroxypyruvate isomerase  60.23 
 
 		 262 aa  323  1e-87  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.365148  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1567  hydroxypyruvate isomerase  57.75 
 
 		 258 aa  322  3e-87  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3533  hydroxypyruvate isomerase  65.88 
 
 		 258 aa  322  4e-87  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.238199  normal  0.267377 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1631  hydroxypyruvate isomerase  57.25 
 
 		 258 aa  317  9e-86  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1913  Hydroxypyruvate isomerase  58.05 
 
 		 275 aa  316  2e-85  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1815  hydroxypyruvate isomerase  58.05 
 
 		 275 aa  316  2e-85  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0352764  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1597  hydroxypyruvate isomerase  54.09 
 
 		 260 aa  298  6e-80  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00143749  normal  0.674901 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3863  hydroxypyruvate isomerase  53.31 
 
 		 260 aa  291  5e-78  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.531245  normal  0.545966 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2311  hydroxypyruvate isomerase  54.12 
 
 		 256 aa  291  6e-78  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.279204  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0147  hydroxypyruvate isomerase, putative  53.31 
 
 		 261 aa  290  2e-77  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.999741  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0132  putative hydroxypyruvate isomerase  53.31 
 
 		 261 aa  290  2e-77  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1571  hydroxypyruvate isomerase  52.14 
 
 		 260 aa  290  2e-77  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.148654  normal  1 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0211  hydroxypyruvate isomerase  51.55 
 
 		 258 aa  288  6e-77  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4298  hydroxypyruvate isomerase  52.14 
 
 		 260 aa  288  9e-77  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2770  hydroxypyruvate isomerase  51.36 
 
 		 265 aa  287  1e-76  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0252433  normal  0.732675 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1026  hydroxypyruvate isomerase  56.81 
 
 		 267 aa  287  1e-76  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.43264  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2086  hydroxypyruvate isomerase  56.92 
 
 		 269 aa  286  2e-76  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3623  hydroxypyruvate isomerase  52.14 
 
 		 260 aa  286  2e-76  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04753  hydroxypyruvate isomerase  50.78 
 
 		 258 aa  285  2.9999999999999996e-76  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3830  hydroxypyruvate isomerase  52.53 
 
 		 260 aa  285  4e-76  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2625  hydroxypyruvate isomerase  55.25 
 
 		 260 aa  284  1.0000000000000001e-75  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.90554  normal  0.173091 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3378  hydroxypyruvate isomerase  51.74 
 
 		 264 aa  283  2.0000000000000002e-75  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.490297  normal  0.0397331 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_45010  putative hydroxypyruvate isomerase  52.14 
 
 		 260 aa  283  2.0000000000000002e-75  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.224213  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4098  hydroxypyruvate isomerase  56.93 
 
 		 284 aa  281  5.000000000000001e-75  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.832044 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3317  xylose isomerase-like TIM barrel  52.55 
 
 		 257 aa  280  1e-74  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.695295  hitchhiker  0.00275233 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1953  Hydroxypyruvate isomerase  55.64 
 
 		 259 aa  279  2e-74  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.346217  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3088  hydroxypyruvate isomerase  51.37 
 
 		 263 aa  277  1e-73  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.645228  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2503  hydroxypyruvate isomerase  54.26 
 
 		 264 aa  276  3e-73  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2552  hydroxypyruvate isomerase  48.06 
 
 		 258 aa  274  8e-73  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0908348  hitchhiker  0.00501624 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1489  hydroxypyruvate isomerase  52.71 
 
 		 258 aa  273  2.0000000000000002e-72  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3955  hydroxypyruvate isomerase  51.38 
 
 		 259 aa  273  2.0000000000000002e-72  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4320  hydroxypyruvate isomerase  54.62 
 
 		 258 aa  273  2.0000000000000002e-72  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.166388  normal  0.0980927 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2430  hydroxypyruvate isomerase  58.66 
 
 		 257 aa  272  5.000000000000001e-72  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5560  hydroxypyruvate isomerase  51.37 
 
 		 261 aa  271  7e-72  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.446227  normal  0.0996892 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2268  Hydroxypyruvate isomerase  52.53 
 
 		 281 aa  270  2e-71  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.822354 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2368  hydroxypyruvate isomerase  49.03 
 
 		 259 aa  270  2e-71  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.592212  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1855  hydroxypyruvate isomerase  52.92 
 
 		 260 aa  269  4e-71  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5307  Hydroxypyruvate isomerase  56.92 
 
 		 258 aa  269  4e-71  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.314618  normal  0.971312 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4865  hydroxypyruvate isomerase Gcxl  47.06 
 
 		 260 aa  267  1e-70  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.798851  normal  0.469511 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1133  hydroxypyruvate isomerase  52.92 
 
 		 260 aa  266  2e-70  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.926547  normal  0.304342 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1298  hydroxypyruvate isomerase  50.2 
 
 		 259 aa  266  2.9999999999999995e-70  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4719  hydroxypyruvate isomerase  54.09 
 
 		 258 aa  265  4e-70  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00317481 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_43410  hydroxypyruvate isomerase  52.36 
 
 		 259 aa  266  4e-70  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4653  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  54.09 
 
 		 260 aa  263  2e-69  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0700232  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1134  hydroxypyruvate isomerase  52.57 
 
 		 259 aa  263  2e-69  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.852559 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3611  hydroxypyruvate isomerase  52.92 
 
 		 260 aa  263  3e-69  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.233278  normal  0.528482 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2898  putative sugar isomerase (interconverting aldoses and ketoses)  53.44 
 
 		 250 aa  262  4e-69  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.236626  normal  0.0851666 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2118  hydroxypyruvate isomerase  50.58 
 
 		 266 aa  262  4e-69  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0266277 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0565  hydroxypyruvate isomerase  47.47 
 
 		 258 aa  261  6e-69  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.551663  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0015  hydroxypyruvate isomerase  49.81 
 
 		 258 aa  261  6e-69  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3036  hypothetical protein  49.42 
 
 		 258 aa  259  2e-68  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5011  Hydroxypyruvate isomerase  55.6 
 
 		 258 aa  260  2e-68  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.336729  normal  0.3021 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0572  hydroxypyruvate isomerase  47.08 
 
 		 258 aa  259  2e-68  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0567  hydroxypyruvate isomerase  47.08 
 
 		 258 aa  259  2e-68  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0109  Hydroxypyruvate isomerase  48.46 
 
 		 260 aa  259  3e-68  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1781  hydroxypyruvate isomerase  48.24 
 
 		 269 aa  259  3e-68  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.168778  normal  0.857209 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3135  hypothetical protein  49.42 
 
 		 258 aa  259  3e-68  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02589  hypothetical protein  49.42 
 
 		 258 aa  259  4e-68  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3282  hydroxypyruvate isomerase protein  49.42 
 
 		 260 aa  259  4e-68  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.257483  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0973  hypothetical protein  49.42 
 
 		 258 aa  259  4e-68  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.898115  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3479  hydroxypyruvate isomerase  49.01 
 
 		 260 aa  259  4e-68  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2172  hydroxypyruvate isomerase  48.63 
 
 		 269 aa  259  4e-68  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.42054  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02554  hypothetical protein  49.42 
 
 		 258 aa  259  4e-68  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2877  hypothetical protein  49.42 
 
 		 258 aa  259  4e-68  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1621  hydroxypyruvate isomerase  50.2 
 
 		 266 aa  259  4e-68  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.377689  normal  0.533551 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0115  Hydroxypyruvate isomerase  48.85 
 
 		 260 aa  258  5.0000000000000005e-68  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0551  hydroxypyruvate isomerase  48.25 
 
 		 258 aa  258  5.0000000000000005e-68  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2461  hydroxypyruvate isomerase  49.02 
 
 		 269 aa  258  6e-68  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.731976  normal  0.599526 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0582  hydroxypyruvate isomerase  47.86 
 
 		 258 aa  258  8e-68  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>