219 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dtpsy_1913 on replicon NC_011992
Organism: Acidovorax ebreus TPSY



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011992  Dtpsy_1913  Hydroxypyruvate isomerase  100 
 
 		 275 aa  558  1e-158  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1815  hydroxypyruvate isomerase  100 
 
 		 275 aa  558  1e-158  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0352764  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4876  hydroxypyruvate isomerase  65.04 
 
 		 273 aa  360  9e-99  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.857442 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2462  hydroxypyruvate isomerase  63.81 
 
 		 266 aa  349  2e-95  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.684146  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0443  hydroxypyruvate isomerase  63.43 
 
 		 265 aa  348  4e-95  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2809  hydroxypyruvate isomerase  62.31 
 
 		 265 aa  341  8e-93  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.356992 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5142  Hydroxypyruvate isomerase  62.78 
 
 		 272 aa  335  3.9999999999999995e-91  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4427  hydroxypyruvate isomerase  59.18 
 
 		 262 aa  327  1.0000000000000001e-88  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.198005  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5120  hydroxypyruvate isomerase  60.67 
 
 		 258 aa  322  6e-87  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5077  hydroxypyruvate isomerase  60.3 
 
 		 257 aa  320  9.999999999999999e-87  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.814935  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0474  hydroxypyruvate isomerase  59.55 
 
 		 258 aa  320  1.9999999999999998e-86  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.166076  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4554  hydroxypyruvate isomerase  59.93 
 
 		 258 aa  320  1.9999999999999998e-86  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.695496  normal  0.368967 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3208  hydroxypyruvate isomerase  60.3 
 
 		 258 aa  318  3.9999999999999996e-86  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5159  hydroxypyruvate isomerase  60.3 
 
 		 258 aa  318  3.9999999999999996e-86  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.324976  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1839  xylose isomerase-like TIM barrel  58.43 
 
 		 260 aa  318  5e-86  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0157456  normal  0.118454 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3413  Hydroxypyruvate isomerase  59.55 
 
 		 262 aa  317  1e-85  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3496  hydroxypyruvate isomerase  59.93 
 
 		 258 aa  314  9e-85  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0849997  normal  0.283205 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3736  Hydroxypyruvate isomerase  59.18 
 
 		 262 aa  314  9.999999999999999e-85  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0973  hydroxypyruvate isomerase  58.94 
 
 		 269 aa  310  1e-83  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5927  Hydroxypyruvate isomerase  57.68 
 
 		 262 aa  306  3e-82  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0020  hypothetical protein  56.93 
 
 		 262 aa  304  1.0000000000000001e-81  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.138735  normal  0.842888 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3533  hydroxypyruvate isomerase  61.28 
 
 		 258 aa  303  2.0000000000000002e-81  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.238199  normal  0.267377 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0442  hydroxypyruvate isomerase  57.79 
 
 		 258 aa  303  3.0000000000000004e-81  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1924  hydroxypyruvate isomerase  57.79 
 
 		 258 aa  303  3.0000000000000004e-81  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2017  hydroxypyruvate isomerase  57.79 
 
 		 258 aa  302  4.0000000000000003e-81  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.45932  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1423  hydroxypyruvate isomerase  58.05 
 
 		 260 aa  301  6.000000000000001e-81  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0831912  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0652  hypothetical protein  57.14 
 
 		 265 aa  301  8.000000000000001e-81  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0573  hydroxypyruvate isomerase  57.41 
 
 		 258 aa  300  1e-80  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_07150  hypothetical protein  56.78 
 
 		 265 aa  300  1e-80  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0894  hydroxypyruvate isomerase  57.41 
 
 		 258 aa  300  1e-80  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1861  hydroxypyruvate isomerase  57.41 
 
 		 258 aa  300  1e-80  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2169  hydroxypyruvate isomerase  57.79 
 
 		 262 aa  299  4e-80  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.196604  normal  0.222817 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5064  hydroxypyruvate isomerase, putative  56.23 
 
 		 261 aa  288  5.0000000000000004e-77  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0462  hydroxypyruvate isomerase  56.98 
 
 		 261 aa  288  1e-76  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3181  hydroxypyruvate isomerase  53.56 
 
 		 262 aa  283  3.0000000000000004e-75  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.365148  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1631  hydroxypyruvate isomerase  48.68 
 
 		 258 aa  276  3e-73  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1567  hydroxypyruvate isomerase  48.31 
 
 		 258 aa  269  2.9999999999999997e-71  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4098  hydroxypyruvate isomerase  54.15 
 
 		 284 aa  268  5e-71  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.832044 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2625  hydroxypyruvate isomerase  50.19 
 
 		 260 aa  265  8e-70  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.90554  normal  0.173091 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4320  hydroxypyruvate isomerase  51.71 
 
 		 258 aa  264  1e-69  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.166388  normal  0.0980927 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04753  hydroxypyruvate isomerase  45.69 
 
 		 258 aa  264  1e-69  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0147  hydroxypyruvate isomerase, putative  49.81 
 
 		 261 aa  263  2e-69  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.999741  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0132  putative hydroxypyruvate isomerase  49.81 
 
 		 261 aa  263  2e-69  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0211  hydroxypyruvate isomerase  44.19 
 
 		 258 aa  260  2e-68  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1298  hydroxypyruvate isomerase  47.92 
 
 		 259 aa  259  4e-68  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3317  xylose isomerase-like TIM barrel  49.62 
 
 		 257 aa  257  2e-67  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.695295  hitchhiker  0.00275233 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2552  hydroxypyruvate isomerase  42.32 
 
 		 258 aa  253  2.0000000000000002e-66  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0908348  hitchhiker  0.00501624 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3378  hydroxypyruvate isomerase  46.27 
 
 		 264 aa  253  3e-66  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.490297  normal  0.0397331 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1026  hydroxypyruvate isomerase  49.43 
 
 		 267 aa  253  3e-66  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.43264  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5560  hydroxypyruvate isomerase  45.66 
 
 		 261 aa  251  6e-66  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.446227  normal  0.0996892 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4865  hydroxypyruvate isomerase Gcxl  42.48 
 
 		 260 aa  250  2e-65  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.798851  normal  0.469511 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0572  hydroxypyruvate isomerase  42.32 
 
 		 258 aa  249  5e-65  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0567  hydroxypyruvate isomerase  42.32 
 
 		 258 aa  249  5e-65  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1158  hydroxypyruvate isomerase  47.53 
 
 		 268 aa  248  8e-65  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.671898  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1134  hydroxypyruvate isomerase  47.74 
 
 		 259 aa  248  9e-65  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.852559 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0565  hydroxypyruvate isomerase  41.95 
 
 		 258 aa  247  1e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.551663  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3741  hydroxypyruvate isomerase  48.11 
 
 		 259 aa  246  2e-64  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.476363  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0626  hydroxypyruvate isomerase  41.95 
 
 		 258 aa  246  2e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.396658  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4653  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  49.81 
 
 		 260 aa  245  4.9999999999999997e-64  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0700232  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3863  hydroxypyruvate isomerase  45.19 
 
 		 260 aa  245  6.999999999999999e-64  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.531245  normal  0.545966 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1597  hydroxypyruvate isomerase  43.7 
 
 		 260 aa  244  9.999999999999999e-64  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00143749  normal  0.674901 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3623  hydroxypyruvate isomerase  44.81 
 
 		 260 aa  244  9.999999999999999e-64  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1133  hydroxypyruvate isomerase  48.29 
 
 		 260 aa  244  9.999999999999999e-64  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.926547  normal  0.304342 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2770  hydroxypyruvate isomerase  45.25 
 
 		 265 aa  243  1.9999999999999999e-63  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0252433  normal  0.732675 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2368  hydroxypyruvate isomerase  43.73 
 
 		 259 aa  243  1.9999999999999999e-63  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.592212  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5307  Hydroxypyruvate isomerase  50.19 
 
 		 258 aa  243  3e-63  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.314618  normal  0.971312 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3479  hydroxypyruvate isomerase  45.63 
 
 		 260 aa  243  3e-63  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3830  hydroxypyruvate isomerase  45.56 
 
 		 260 aa  243  3e-63  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2086  hydroxypyruvate isomerase  50.57 
 
 		 269 aa  241  7e-63  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2268  Hydroxypyruvate isomerase  47.53 
 
 		 281 aa  241  7.999999999999999e-63  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.822354 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3282  hydroxypyruvate isomerase protein  46.84 
 
 		 260 aa  241  1e-62  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.257483  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4562  hydroxypyruvate isomerase  48.12 
 
 		 259 aa  241  1e-62  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.427343  normal  0.384122 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3449  xylose isomerase-like TIM barrel  45.35 
 
 		 271 aa  241  1e-62  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_45010  putative hydroxypyruvate isomerase  45.19 
 
 		 260 aa  241  1e-62  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.224213  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1855  hydroxypyruvate isomerase  48.29 
 
 		 260 aa  240  2e-62  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3152  hydroxypyruvate isomerase  45.25 
 
 		 260 aa  240  2e-62  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1571  hydroxypyruvate isomerase  44.44 
 
 		 260 aa  239  2.9999999999999997e-62  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.148654  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4298  hydroxypyruvate isomerase  44.44 
 
 		 260 aa  239  4e-62  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1489  hydroxypyruvate isomerase  45.28 
 
 		 258 aa  238  5e-62  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0958  hydroxypyruvate isomerase  45.28 
 
 		 267 aa  238  9e-62  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2503  hydroxypyruvate isomerase  47.62 
 
 		 264 aa  237  2e-61  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0109  Hydroxypyruvate isomerase  44.57 
 
 		 260 aa  236  3e-61  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2430  hydroxypyruvate isomerase  52.85 
 
 		 257 aa  236  3e-61  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3292  hydroxypyruvate isomerase  44.61 
 
 		 260 aa  236  4e-61  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.202186  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2425  hydroxypyruvate isomerase  44.81 
 
 		 262 aa  236  4e-61  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2260  hydroxypyruvate isomerase  44.81 
 
 		 262 aa  236  4e-61  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.654587  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2300  hydroxypyruvate isomerase  44.81 
 
 		 262 aa  236  4e-61  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.946761  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1953  Hydroxypyruvate isomerase  47.57 
 
 		 259 aa  235  6e-61  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.346217  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0115  Hydroxypyruvate isomerase  44.94 
 
 		 260 aa  234  9e-61  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2172  hydroxypyruvate isomerase  42.96 
 
 		 269 aa  234  1.0000000000000001e-60  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.42054  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3114  hydroxypyruvate isomerase  42.97 
 
 		 258 aa  234  1.0000000000000001e-60  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.334824 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3135  hypothetical protein  45.32 
 
 		 258 aa  234  1.0000000000000001e-60  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3088  hydroxypyruvate isomerase  43.61 
 
 		 263 aa  234  1.0000000000000001e-60  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.645228  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0582  hydroxypyruvate isomerase  42.97 
 
 		 258 aa  234  1.0000000000000001e-60  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0545  hydroxypyruvate isomerase  42.97 
 
 		 258 aa  234  1.0000000000000001e-60  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3036  hypothetical protein  45.32 
 
 		 258 aa  234  1.0000000000000001e-60  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02554  hypothetical protein  45.32 
 
 		 258 aa  233  2.0000000000000002e-60  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0609  hydroxypyruvate isomerase  42.97 
 
 		 258 aa  233  2.0000000000000002e-60  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0973  hypothetical protein  45.32 
 
 		 258 aa  233  2.0000000000000002e-60  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.898115  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2877  hypothetical protein  45.32 
 
 		 258 aa  233  2.0000000000000002e-60  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>