232 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrad2831_1133 on replicon NC_010505
Organism: Methylobacterium radiotolerans JCM 2831



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010505  Mrad2831_1133  hydroxypyruvate isomerase  100 
 
 		 260 aa  523  1e-147  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.926547  normal  0.304342 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2625  hydroxypyruvate isomerase  78.68 
 
 		 260 aa  402  1e-111  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.90554  normal  0.173091 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4653  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  81.64 
 
 		 260 aa  400  9.999999999999999e-111  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0700232  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1026  hydroxypyruvate isomerase  72.94 
 
 		 267 aa  359  2e-98  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.43264  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2268  Hydroxypyruvate isomerase  64.71 
 
 		 281 aa  341  5.999999999999999e-93  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.822354 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4320  hydroxypyruvate isomerase  65.12 
 
 		 258 aa  340  1e-92  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.166388  normal  0.0980927 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2898  putative sugar isomerase (interconverting aldoses and ketoses)  68.29 
 
 		 250 aa  337  9.999999999999999e-92  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.236626  normal  0.0851666 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2086  hydroxypyruvate isomerase  67.06 
 
 		 269 aa  331  7.000000000000001e-90  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1855  hydroxypyruvate isomerase  63.92 
 
 		 260 aa  327  8e-89  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5011  Hydroxypyruvate isomerase  67.44 
 
 		 258 aa  327  1.0000000000000001e-88  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.336729  normal  0.3021 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3611  hydroxypyruvate isomerase  64.31 
 
 		 260 aa  320  9.999999999999999e-87  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.233278  normal  0.528482 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5307  Hydroxypyruvate isomerase  66.28 
 
 		 258 aa  316  3e-85  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.314618  normal  0.971312 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2430  hydroxypyruvate isomerase  69.29 
 
 		 257 aa  312  3.9999999999999997e-84  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1953  Hydroxypyruvate isomerase  62.93 
 
 		 259 aa  305  6e-82  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.346217  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5927  Hydroxypyruvate isomerase  53.44 
 
 		 262 aa  272  4.0000000000000004e-72  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4427  hydroxypyruvate isomerase  52.92 
 
 		 262 aa  269  2.9999999999999997e-71  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.198005  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2169  hydroxypyruvate isomerase  53.05 
 
 		 262 aa  268  8e-71  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.196604  normal  0.222817 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0973  hydroxypyruvate isomerase  53.85 
 
 		 269 aa  267  1e-70  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2770  hydroxypyruvate isomerase  49.62 
 
 		 265 aa  266  2.9999999999999995e-70  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0252433  normal  0.732675 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0020  hypothetical protein  54.2 
 
 		 262 aa  265  4e-70  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.138735  normal  0.842888 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1597  hydroxypyruvate isomerase  49.61 
 
 		 260 aa  265  7e-70  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00143749  normal  0.674901 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3181  hydroxypyruvate isomerase  53.64 
 
 		 262 aa  264  1e-69  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.365148  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0442  hydroxypyruvate isomerase  53.7 
 
 		 258 aa  263  2e-69  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2017  hydroxypyruvate isomerase  53.7 
 
 		 258 aa  263  2e-69  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.45932  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1924  hydroxypyruvate isomerase  53.7 
 
 		 258 aa  263  2e-69  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3736  Hydroxypyruvate isomerase  53.44 
 
 		 262 aa  261  6e-69  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1631  hydroxypyruvate isomerase  51.16 
 
 		 258 aa  261  6e-69  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1839  xylose isomerase-like TIM barrel  52.53 
 
 		 260 aa  261  8e-69  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0157456  normal  0.118454 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3413  Hydroxypyruvate isomerase  53.05 
 
 		 262 aa  261  8.999999999999999e-69  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0573  hydroxypyruvate isomerase  53.31 
 
 		 258 aa  260  1e-68  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5077  hydroxypyruvate isomerase  51.56 
 
 		 257 aa  260  1e-68  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.814935  normal  1 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0894  hydroxypyruvate isomerase  53.31 
 
 		 258 aa  260  1e-68  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1861  hydroxypyruvate isomerase  53.31 
 
 		 258 aa  260  1e-68  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2311  hydroxypyruvate isomerase  50.39 
 
 		 256 aa  260  2e-68  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.279204  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3830  hydroxypyruvate isomerase  49.22 
 
 		 260 aa  259  2e-68  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3741  hydroxypyruvate isomerase  51.36 
 
 		 259 aa  259  3e-68  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.476363  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2809  hydroxypyruvate isomerase  50.94 
 
 		 265 aa  258  5.0000000000000005e-68  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.356992 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3863  hydroxypyruvate isomerase  48.84 
 
 		 260 aa  258  6e-68  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.531245  normal  0.545966 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0443  hydroxypyruvate isomerase  50.76 
 
 		 265 aa  258  8e-68  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4876  hydroxypyruvate isomerase  48.16 
 
 		 273 aa  258  9e-68  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.857442 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5120  hydroxypyruvate isomerase  52.14 
 
 		 258 aa  257  1e-67  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2929  hydroxypyruvate isomerase  52.09 
 
 		 263 aa  257  1e-67  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.452433 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0474  hydroxypyruvate isomerase  50.97 
 
 		 258 aa  256  2e-67  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.166076  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3208  hydroxypyruvate isomerase  52.14 
 
 		 258 aa  256  2e-67  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_45010  putative hydroxypyruvate isomerase  48.84 
 
 		 260 aa  256  2e-67  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.224213  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5159  hydroxypyruvate isomerase  52.14 
 
 		 258 aa  256  2e-67  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.324976  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3496  hydroxypyruvate isomerase  53.31 
 
 		 258 aa  256  3e-67  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0849997  normal  0.283205 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1423  hydroxypyruvate isomerase  52.92 
 
 		 260 aa  255  4e-67  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0831912  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4554  hydroxypyruvate isomerase  51.75 
 
 		 258 aa  255  4e-67  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.695496  normal  0.368967 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1567  hydroxypyruvate isomerase  49.42 
 
 		 258 aa  254  7e-67  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3088  hydroxypyruvate isomerase  50.59 
 
 		 263 aa  254  7e-67  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.645228  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1571  hydroxypyruvate isomerase  48.45 
 
 		 260 aa  254  7e-67  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.148654  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4298  hydroxypyruvate isomerase  48.45 
 
 		 260 aa  254  9e-67  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5560  hydroxypyruvate isomerase  49.03 
 
 		 261 aa  253  2.0000000000000002e-66  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.446227  normal  0.0996892 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04753  hydroxypyruvate isomerase  46.69 
 
 		 258 aa  253  2.0000000000000002e-66  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0147  hydroxypyruvate isomerase, putative  48.46 
 
 		 261 aa  252  4.0000000000000004e-66  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.999741  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0132  putative hydroxypyruvate isomerase  48.46 
 
 		 261 aa  252  4.0000000000000004e-66  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3317  xylose isomerase-like TIM barrel  50.98 
 
 		 257 aa  252  5.000000000000001e-66  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.695295  hitchhiker  0.00275233 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2462  hydroxypyruvate isomerase  49.43 
 
 		 266 aa  250  1e-65  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.684146  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1134  hydroxypyruvate isomerase  50.2 
 
 		 259 aa  250  2e-65  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.852559 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0211  hydroxypyruvate isomerase  47.08 
 
 		 258 aa  249  2e-65  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3533  hydroxypyruvate isomerase  51.76 
 
 		 258 aa  249  3e-65  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.238199  normal  0.267377 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3623  hydroxypyruvate isomerase  47.67 
 
 		 260 aa  248  7e-65  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5142  Hydroxypyruvate isomerase  48.16 
 
 		 272 aa  245  4.9999999999999997e-64  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2118  hydroxypyruvate isomerase  51.75 
 
 		 266 aa  245  6e-64  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0266277 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5064  hydroxypyruvate isomerase, putative  49.22 
 
 		 261 aa  244  9.999999999999999e-64  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1815  hydroxypyruvate isomerase  48.29 
 
 		 275 aa  244  9.999999999999999e-64  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0352764  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1913  Hydroxypyruvate isomerase  48.29 
 
 		 275 aa  244  9.999999999999999e-64  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0462  hydroxypyruvate isomerase  49.61 
 
 		 261 aa  243  1.9999999999999999e-63  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1298  hydroxypyruvate isomerase  48.85 
 
 		 259 aa  243  1.9999999999999999e-63  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_43410  hydroxypyruvate isomerase  50.78 
 
 		 259 aa  240  1e-62  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3378  hydroxypyruvate isomerase  46.18 
 
 		 264 aa  239  2.9999999999999997e-62  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.490297  normal  0.0397331 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2552  hydroxypyruvate isomerase  43.97 
 
 		 258 aa  238  6.999999999999999e-62  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0908348  hitchhiker  0.00501624 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3292  hydroxypyruvate isomerase  47.08 
 
 		 260 aa  238  9e-62  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.202186  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3955  hydroxypyruvate isomerase  46.72 
 
 		 259 aa  238  1e-61  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2172  hydroxypyruvate isomerase  48.82 
 
 		 269 aa  236  3e-61  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.42054  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3449  xylose isomerase-like TIM barrel  47.47 
 
 		 271 aa  236  3e-61  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0652  hypothetical protein  47.94 
 
 		 265 aa  234  8e-61  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1781  hydroxypyruvate isomerase  47.33 
 
 		 269 aa  234  1.0000000000000001e-60  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.168778  normal  0.857209 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3282  hydroxypyruvate isomerase protein  48.46 
 
 		 260 aa  233  2.0000000000000002e-60  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.257483  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3152  hydroxypyruvate isomerase  46.9 
 
 		 260 aa  233  2.0000000000000002e-60  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4459  xylose isomerase-like TIM barrel  48.39 
 
 		 255 aa  233  3e-60  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4865  hydroxypyruvate isomerase Gcxl  41.73 
 
 		 260 aa  233  3e-60  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.798851  normal  0.469511 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1918  Hydroxypyruvate isomerase  43.58 
 
 		 260 aa  232  4.0000000000000004e-60  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0177301  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1395  hydroxypyruvate isomerase  47.86 
 
 		 269 aa  232  5e-60  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0279437  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2425  hydroxypyruvate isomerase  50.2 
 
 		 262 aa  231  1e-59  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4719  hydroxypyruvate isomerase  50.78 
 
 		 258 aa  231  1e-59  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00317481 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6200  hydroxypyruvate isomerase  47.47 
 
 		 269 aa  231  1e-59  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0219655  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1816  hydroxypyruvate isomerase  47.47 
 
 		 269 aa  231  1e-59  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1879  hydroxypyruvate isomerase  47.47 
 
 		 269 aa  231  1e-59  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0860973  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2260  hydroxypyruvate isomerase  50.2 
 
 		 262 aa  231  1e-59  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.654587  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2300  hydroxypyruvate isomerase  50.2 
 
 		 262 aa  231  1e-59  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.946761  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1902  hydroxypyruvate isomerase  47.47 
 
 		 269 aa  231  1e-59  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000606406 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1788  hydroxypyruvate isomerase  47.47 
 
 		 269 aa  231  1e-59  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5179  hydroxypyruvate isomerase  47.47 
 
 		 269 aa  230  2e-59  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.265819  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3479  hydroxypyruvate isomerase  46.12 
 
 		 260 aa  229  4e-59  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_07150  hypothetical protein  46.39 
 
 		 265 aa  229  5e-59  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1489  hydroxypyruvate isomerase  45.14 
 
 		 258 aa  228  9e-59  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0109  Hydroxypyruvate isomerase  42.69 
 
 		 260 aa  227  1e-58  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0958  hydroxypyruvate isomerase  45.67 
 
 		 267 aa  228  1e-58  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>