267 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPTO_5064 on replicon NC_004578
Organism: Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004578  PSPTO_5064  hydroxypyruvate isomerase, putative  100 
 
 		 261 aa  541  1e-153  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0462  hydroxypyruvate isomerase  95.79 
 
 		 261 aa  496  1e-139  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1839  xylose isomerase-like TIM barrel  72.94 
 
 		 260 aa  395  1e-109  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0157456  normal  0.118454 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4427  hydroxypyruvate isomerase  69.8 
 
 		 262 aa  387  1e-106  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.198005  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0652  hypothetical protein  72.31 
 
 		 265 aa  384  1e-106  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1423  hydroxypyruvate isomerase  73.33 
 
 		 260 aa  380  1e-104  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0831912  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4554  hydroxypyruvate isomerase  69.41 
 
 		 258 aa  377  1e-104  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.695496  normal  0.368967 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_07150  hypothetical protein  71.15 
 
 		 265 aa  379  1e-104  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0474  hydroxypyruvate isomerase  69.02 
 
 		 258 aa  376  1e-103  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.166076  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5077  hydroxypyruvate isomerase  69.65 
 
 		 257 aa  375  1e-103  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.814935  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5120  hydroxypyruvate isomerase  70.2 
 
 		 258 aa  372  1e-102  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3208  hydroxypyruvate isomerase  70.2 
 
 		 258 aa  371  1e-102  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5159  hydroxypyruvate isomerase  70.2 
 
 		 258 aa  371  1e-102  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.324976  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0442  hydroxypyruvate isomerase  71.65 
 
 		 258 aa  369  1e-101  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0973  hydroxypyruvate isomerase  71.26 
 
 		 269 aa  370  1e-101  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3496  hydroxypyruvate isomerase  69.8 
 
 		 258 aa  370  1e-101  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0849997  normal  0.283205 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2017  hydroxypyruvate isomerase  71.65 
 
 		 258 aa  369  1e-101  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.45932  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1924  hydroxypyruvate isomerase  71.65 
 
 		 258 aa  369  1e-101  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5927  Hydroxypyruvate isomerase  69.02 
 
 		 262 aa  369  1e-101  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0573  hydroxypyruvate isomerase  71.26 
 
 		 258 aa  366  1e-100  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2169  hydroxypyruvate isomerase  68.11 
 
 		 262 aa  364  1e-100  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.196604  normal  0.222817 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0894  hydroxypyruvate isomerase  71.26 
 
 		 258 aa  366  1e-100  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1861  hydroxypyruvate isomerase  71.26 
 
 		 258 aa  366  1e-100  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3413  Hydroxypyruvate isomerase  67.45 
 
 		 262 aa  362  3e-99  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3736  Hydroxypyruvate isomerase  67.06 
 
 		 262 aa  361  7.0000000000000005e-99  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0020  hypothetical protein  66.8 
 
 		 262 aa  358  5e-98  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.138735  normal  0.842888 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0443  hydroxypyruvate isomerase  64.12 
 
 		 265 aa  345  6e-94  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4876  hydroxypyruvate isomerase  62.55 
 
 		 273 aa  341  5.999999999999999e-93  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.857442 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5142  Hydroxypyruvate isomerase  61.99 
 
 		 272 aa  330  1e-89  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2809  hydroxypyruvate isomerase  59.54 
 
 		 265 aa  320  9.999999999999999e-87  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.356992 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2462  hydroxypyruvate isomerase  59.92 
 
 		 266 aa  315  4e-85  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.684146  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1913  Hydroxypyruvate isomerase  56.23 
 
 		 275 aa  306  2.0000000000000002e-82  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1815  hydroxypyruvate isomerase  56.23 
 
 		 275 aa  306  2.0000000000000002e-82  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0352764  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1631  hydroxypyruvate isomerase  54.3 
 
 		 258 aa  306  2.0000000000000002e-82  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1567  hydroxypyruvate isomerase  52.55 
 
 		 258 aa  301  5.000000000000001e-81  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3181  hydroxypyruvate isomerase  56.2 
 
 		 262 aa  301  7.000000000000001e-81  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.365148  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3533  hydroxypyruvate isomerase  59.22 
 
 		 258 aa  293  2e-78  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.238199  normal  0.267377 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04753  hydroxypyruvate isomerase  51.37 
 
 		 258 aa  287  2e-76  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1597  hydroxypyruvate isomerase  50.97 
 
 		 260 aa  281  6.000000000000001e-75  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00143749  normal  0.674901 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0211  hydroxypyruvate isomerase  49.02 
 
 		 258 aa  280  1e-74  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3088  hydroxypyruvate isomerase  52.36 
 
 		 263 aa  280  2e-74  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.645228  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4098  hydroxypyruvate isomerase  56.93 
 
 		 284 aa  280  2e-74  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.832044 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1571  hydroxypyruvate isomerase  50.58 
 
 		 260 aa  279  4e-74  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.148654  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3863  hydroxypyruvate isomerase  50.58 
 
 		 260 aa  278  9e-74  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.531245  normal  0.545966 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2552  hydroxypyruvate isomerase  50.78 
 
 		 258 aa  277  1e-73  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0908348  hitchhiker  0.00501624 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3623  hydroxypyruvate isomerase  50.58 
 
 		 260 aa  276  2e-73  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4298  hydroxypyruvate isomerase  50.19 
 
 		 260 aa  275  4e-73  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2311  hydroxypyruvate isomerase  51.95 
 
 		 256 aa  275  6e-73  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.279204  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2770  hydroxypyruvate isomerase  49.22 
 
 		 265 aa  273  2.0000000000000002e-72  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0252433  normal  0.732675 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5560  hydroxypyruvate isomerase  50.39 
 
 		 261 aa  273  2.0000000000000002e-72  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.446227  normal  0.0996892 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1134  hydroxypyruvate isomerase  52.14 
 
 		 259 aa  272  3e-72  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.852559 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2613  hydroxypyruvate isomerase  50.76 
 
 		 267 aa  270  2e-71  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1298  hydroxypyruvate isomerase  49.81 
 
 		 259 aa  269  4e-71  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2172  hydroxypyruvate isomerase  48.64 
 
 		 269 aa  268  7e-71  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.42054  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3955  hydroxypyruvate isomerase  50.97 
 
 		 259 aa  268  8.999999999999999e-71  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2086  hydroxypyruvate isomerase  52.16 
 
 		 269 aa  267  1e-70  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3378  hydroxypyruvate isomerase  50.59 
 
 		 264 aa  267  1e-70  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.490297  normal  0.0397331 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_45010  putative hydroxypyruvate isomerase  49.61 
 
 		 260 aa  266  2e-70  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.224213  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2625  hydroxypyruvate isomerase  50.39 
 
 		 260 aa  265  5e-70  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.90554  normal  0.173091 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3830  hydroxypyruvate isomerase  49.22 
 
 		 260 aa  265  5.999999999999999e-70  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2368  hydroxypyruvate isomerase  48.43 
 
 		 259 aa  264  1e-69  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.592212  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2425  hydroxypyruvate isomerase  49.81 
 
 		 262 aa  262  4e-69  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2260  hydroxypyruvate isomerase  49.81 
 
 		 262 aa  262  4e-69  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.654587  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2300  hydroxypyruvate isomerase  49.81 
 
 		 262 aa  262  4e-69  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.946761  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0147  hydroxypyruvate isomerase, putative  47.84 
 
 		 261 aa  262  4.999999999999999e-69  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.999741  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0132  putative hydroxypyruvate isomerase  47.84 
 
 		 261 aa  262  4.999999999999999e-69  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1395  hydroxypyruvate isomerase  47.08 
 
 		 269 aa  261  8.999999999999999e-69  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0279437  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2430  hydroxypyruvate isomerase  53.15 
 
 		 257 aa  261  1e-68  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1902  hydroxypyruvate isomerase  46.69 
 
 		 269 aa  260  1e-68  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000606406 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6200  hydroxypyruvate isomerase  46.3 
 
 		 269 aa  258  5.0000000000000005e-68  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0219655  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1879  hydroxypyruvate isomerase  46.3 
 
 		 269 aa  258  5.0000000000000005e-68  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0860973  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3317  xylose isomerase-like TIM barrel  49.02 
 
 		 257 aa  258  6e-68  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.695295  hitchhiker  0.00275233 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1816  hydroxypyruvate isomerase  46.3 
 
 		 269 aa  258  6e-68  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1788  hydroxypyruvate isomerase  46.3 
 
 		 269 aa  258  6e-68  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_43410  hydroxypyruvate isomerase  52.14 
 
 		 259 aa  258  8e-68  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5179  hydroxypyruvate isomerase  46.3 
 
 		 269 aa  257  1e-67  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.265819  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0565  hydroxypyruvate isomerase  48.82 
 
 		 258 aa  257  1e-67  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.551663  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1133  hydroxypyruvate isomerase  49.22 
 
 		 260 aa  257  2e-67  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.926547  normal  0.304342 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3135  hypothetical protein  49.81 
 
 		 258 aa  256  2e-67  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02589  hypothetical protein  49.81 
 
 		 258 aa  256  3e-67  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02554  hypothetical protein  49.81 
 
 		 258 aa  256  3e-67  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2877  hypothetical protein  49.81 
 
 		 258 aa  256  3e-67  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0973  hypothetical protein  49.81 
 
 		 258 aa  256  3e-67  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.898115  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3741  hydroxypyruvate isomerase  48.24 
 
 		 259 aa  256  3e-67  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.476363  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3036  hypothetical protein  49.81 
 
 		 258 aa  256  3e-67  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0572  hydroxypyruvate isomerase  48.43 
 
 		 258 aa  255  4e-67  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1026  hydroxypyruvate isomerase  49.21 
 
 		 267 aa  255  4e-67  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.43264  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0567  hydroxypyruvate isomerase  48.43 
 
 		 258 aa  255  4e-67  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4719  hydroxypyruvate isomerase  51.95 
 
 		 258 aa  255  5e-67  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00317481 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0949  Hydroxypyruvate isomerase  49.42 
 
 		 258 aa  255  6e-67  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4320  hydroxypyruvate isomerase  49.22 
 
 		 258 aa  254  9e-67  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.166388  normal  0.0980927 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4865  hydroxypyruvate isomerase Gcxl  46.27 
 
 		 260 aa  253  2.0000000000000002e-66  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.798851  normal  0.469511 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0626  hydroxypyruvate isomerase  48.03 
 
 		 258 aa  253  3e-66  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.396658  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2503  hydroxypyruvate isomerase  49.61 
 
 		 264 aa  252  5.000000000000001e-66  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4459  xylose isomerase-like TIM barrel  48.78 
 
 		 255 aa  252  5.000000000000001e-66  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2929  hydroxypyruvate isomerase  49.61 
 
 		 263 aa  251  6e-66  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.452433 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5307  Hydroxypyruvate isomerase  51.76 
 
 		 258 aa  251  6e-66  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.314618  normal  0.971312 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2118  hydroxypyruvate isomerase  49.61 
 
 		 266 aa  251  6e-66  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0266277 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3479  hydroxypyruvate isomerase  47.43 
 
 		 260 aa  251  9.000000000000001e-66  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0551  hydroxypyruvate isomerase  48.43 
 
 		 258 aa  250  1e-65  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>