224 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_2898 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009485  BBta_2898  putative sugar isomerase (interconverting aldoses and ketoses)  100 
 
 		 250 aa  514  1.0000000000000001e-145  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.236626  normal  0.0851666 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3611  hydroxypyruvate isomerase  73.09 
 
 		 260 aa  377  1e-104  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.233278  normal  0.528482 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1855  hydroxypyruvate isomerase  73.9 
 
 		 260 aa  378  1e-104  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1026  hydroxypyruvate isomerase  75.1 
 
 		 267 aa  371  1e-102  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.43264  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2625  hydroxypyruvate isomerase  67.2 
 
 		 260 aa  354  5.999999999999999e-97  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.90554  normal  0.173091 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4653  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  70.04 
 
 		 260 aa  349  3e-95  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0700232  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1133  hydroxypyruvate isomerase  68.29 
 
 		 260 aa  345  5e-94  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.926547  normal  0.304342 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1953  Hydroxypyruvate isomerase  69.23 
 
 		 259 aa  343  2e-93  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.346217  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2268  Hydroxypyruvate isomerase  65.71 
 
 		 281 aa  339  2.9999999999999998e-92  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.822354 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2086  hydroxypyruvate isomerase  66 
 
 		 269 aa  330  1e-89  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5011  Hydroxypyruvate isomerase  68.16 
 
 		 258 aa  325  5e-88  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.336729  normal  0.3021 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4320  hydroxypyruvate isomerase  63.41 
 
 		 258 aa  323  2e-87  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.166388  normal  0.0980927 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5307  Hydroxypyruvate isomerase  67.76 
 
 		 258 aa  317  1e-85  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.314618  normal  0.971312 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2430  hydroxypyruvate isomerase  67.49 
 
 		 257 aa  304  8.000000000000001e-82  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4427  hydroxypyruvate isomerase  52.59 
 
 		 262 aa  278  7e-74  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.198005  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1839  xylose isomerase-like TIM barrel  55.47 
 
 		 260 aa  276  3e-73  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0157456  normal  0.118454 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04753  hydroxypyruvate isomerase  52.23 
 
 		 258 aa  271  6e-72  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5927  Hydroxypyruvate isomerase  53.85 
 
 		 262 aa  269  2e-71  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2169  hydroxypyruvate isomerase  53.85 
 
 		 262 aa  268  8e-71  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.196604  normal  0.222817 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0973  hydroxypyruvate isomerase  53.44 
 
 		 269 aa  265  5.999999999999999e-70  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0020  hypothetical protein  52.82 
 
 		 262 aa  264  1e-69  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.138735  normal  0.842888 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2552  hydroxypyruvate isomerase  49.39 
 
 		 258 aa  263  2e-69  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0908348  hitchhiker  0.00501624 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0474  hydroxypyruvate isomerase  51.41 
 
 		 258 aa  260  1e-68  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.166076  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4554  hydroxypyruvate isomerase  51.82 
 
 		 258 aa  260  1e-68  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.695496  normal  0.368967 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1924  hydroxypyruvate isomerase  52.63 
 
 		 258 aa  260  1e-68  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0442  hydroxypyruvate isomerase  52.63 
 
 		 258 aa  260  2e-68  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2017  hydroxypyruvate isomerase  52.63 
 
 		 258 aa  259  2e-68  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.45932  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5077  hydroxypyruvate isomerase  50.81 
 
 		 257 aa  258  7e-68  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.814935  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0573  hydroxypyruvate isomerase  52.23 
 
 		 258 aa  257  1e-67  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0894  hydroxypyruvate isomerase  52.23 
 
 		 258 aa  257  1e-67  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1861  hydroxypyruvate isomerase  52.23 
 
 		 258 aa  257  1e-67  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0147  hydroxypyruvate isomerase, putative  49.39 
 
 		 261 aa  256  2e-67  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.999741  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1631  hydroxypyruvate isomerase  50 
 
 		 258 aa  256  2e-67  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0132  putative hydroxypyruvate isomerase  49.39 
 
 		 261 aa  256  2e-67  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3496  hydroxypyruvate isomerase  52.61 
 
 		 258 aa  256  3e-67  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0849997  normal  0.283205 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5120  hydroxypyruvate isomerase  51.81 
 
 		 258 aa  254  8e-67  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3208  hydroxypyruvate isomerase  51.81 
 
 		 258 aa  254  1.0000000000000001e-66  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5159  hydroxypyruvate isomerase  51.81 
 
 		 258 aa  254  1.0000000000000001e-66  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.324976  normal  1 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0211  hydroxypyruvate isomerase  47.77 
 
 		 258 aa  252  3e-66  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0443  hydroxypyruvate isomerase  50 
 
 		 265 aa  252  4.0000000000000004e-66  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3413  Hydroxypyruvate isomerase  51.2 
 
 		 262 aa  252  4.0000000000000004e-66  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1423  hydroxypyruvate isomerase  53.44 
 
 		 260 aa  251  6e-66  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0831912  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3736  Hydroxypyruvate isomerase  51.2 
 
 		 262 aa  251  8.000000000000001e-66  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3181  hydroxypyruvate isomerase  50.4 
 
 		 262 aa  250  2e-65  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.365148  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1567  hydroxypyruvate isomerase  49.39 
 
 		 258 aa  249  2e-65  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2462  hydroxypyruvate isomerase  47.64 
 
 		 266 aa  239  4e-62  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.684146  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4876  hydroxypyruvate isomerase  47.45 
 
 		 273 aa  238  5e-62  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.857442 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2809  hydroxypyruvate isomerase  45.42 
 
 		 265 aa  236  3e-61  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.356992 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0462  hydroxypyruvate isomerase  49.6 
 
 		 261 aa  235  5.0000000000000005e-61  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0115  Hydroxypyruvate isomerase  45.34 
 
 		 260 aa  234  7e-61  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0109  Hydroxypyruvate isomerase  44.94 
 
 		 260 aa  234  7e-61  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0652  hypothetical protein  47.22 
 
 		 265 aa  234  9e-61  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3317  xylose isomerase-like TIM barrel  49.39 
 
 		 257 aa  234  1.0000000000000001e-60  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.695295  hitchhiker  0.00275233 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1597  hydroxypyruvate isomerase  44.4 
 
 		 260 aa  234  1.0000000000000001e-60  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00143749  normal  0.674901 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3533  hydroxypyruvate isomerase  50.2 
 
 		 258 aa  234  1.0000000000000001e-60  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.238199  normal  0.267377 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1489  hydroxypyruvate isomerase  46.56 
 
 		 258 aa  231  6e-60  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_07150  hypothetical protein  46.85 
 
 		 265 aa  231  1e-59  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5064  hydroxypyruvate isomerase, putative  48.39 
 
 		 261 aa  230  2e-59  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2929  hydroxypyruvate isomerase  48.4 
 
 		 263 aa  229  4e-59  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.452433 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1134  hydroxypyruvate isomerase  46.5 
 
 		 259 aa  229  4e-59  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.852559 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1913  Hydroxypyruvate isomerase  45.8 
 
 		 275 aa  228  8e-59  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1815  hydroxypyruvate isomerase  45.8 
 
 		 275 aa  228  8e-59  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0352764  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2770  hydroxypyruvate isomerase  44.76 
 
 		 265 aa  227  1e-58  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0252433  normal  0.732675 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2311  hydroxypyruvate isomerase  46.31 
 
 		 256 aa  225  4e-58  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.279204  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3741  hydroxypyruvate isomerase  45.12 
 
 		 259 aa  225  5.0000000000000005e-58  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.476363  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5142  Hydroxypyruvate isomerase  47.06 
 
 		 272 aa  224  9e-58  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3282  hydroxypyruvate isomerase protein  45.56 
 
 		 260 aa  224  1e-57  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.257483  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1571  hydroxypyruvate isomerase  42.8 
 
 		 260 aa  222  4.9999999999999996e-57  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.148654  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3863  hydroxypyruvate isomerase  43.2 
 
 		 260 aa  221  6e-57  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.531245  normal  0.545966 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1902  hydroxypyruvate isomerase  44.44 
 
 		 269 aa  221  6e-57  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000606406 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1788  hydroxypyruvate isomerase  44.44 
 
 		 269 aa  221  7e-57  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6200  hydroxypyruvate isomerase  44.44 
 
 		 269 aa  221  7e-57  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0219655  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1816  hydroxypyruvate isomerase  44.44 
 
 		 269 aa  221  7e-57  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1879  hydroxypyruvate isomerase  44.44 
 
 		 269 aa  221  7e-57  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0860973  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3830  hydroxypyruvate isomerase  44 
 
 		 260 aa  221  7e-57  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4298  hydroxypyruvate isomerase  42.8 
 
 		 260 aa  220  9.999999999999999e-57  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5179  hydroxypyruvate isomerase  44.44 
 
 		 269 aa  221  9.999999999999999e-57  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.265819  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3623  hydroxypyruvate isomerase  43.2 
 
 		 260 aa  221  9.999999999999999e-57  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3088  hydroxypyruvate isomerase  44.49 
 
 		 263 aa  220  9.999999999999999e-57  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.645228  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2118  hydroxypyruvate isomerase  45.42 
 
 		 266 aa  220  9.999999999999999e-57  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0266277 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3292  hydroxypyruvate isomerase  44.13 
 
 		 260 aa  220  1.9999999999999999e-56  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.202186  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1461  AP endonuclease  41.9 
 
 		 264 aa  219  3.9999999999999997e-56  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.331039  normal  0.325369 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_45010  putative hydroxypyruvate isomerase  43.2 
 
 		 260 aa  219  3.9999999999999997e-56  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.224213  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2823  hydroxypyruvate isomerase  41.9 
 
 		 264 aa  219  3.9999999999999997e-56  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2745  AP endonuclease  41.9 
 
 		 264 aa  219  3.9999999999999997e-56  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.978898  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3152  hydroxypyruvate isomerase  44.18 
 
 		 260 aa  218  7.999999999999999e-56  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5560  hydroxypyruvate isomerase  44.31 
 
 		 261 aa  218  7.999999999999999e-56  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.446227  normal  0.0996892 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3479  hydroxypyruvate isomerase  43.15 
 
 		 260 aa  217  1e-55  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3955  hydroxypyruvate isomerase  45.27 
 
 		 259 aa  215  5.9999999999999996e-55  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3378  hydroxypyruvate isomerase  41.7 
 
 		 264 aa  214  9.999999999999999e-55  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.490297  normal  0.0397331 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1781  hydroxypyruvate isomerase  45.78 
 
 		 269 aa  213  1.9999999999999998e-54  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.168778  normal  0.857209 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2503  hydroxypyruvate isomerase  44.86 
 
 		 264 aa  213  1.9999999999999998e-54  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4459  xylose isomerase-like TIM barrel  42.51 
 
 		 255 aa  213  1.9999999999999998e-54  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4865  hydroxypyruvate isomerase Gcxl  39.34 
 
 		 260 aa  213  2.9999999999999995e-54  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.798851  normal  0.469511 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1395  hydroxypyruvate isomerase  43.6 
 
 		 269 aa  213  2.9999999999999995e-54  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0279437  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3135  hypothetical protein  43.55 
 
 		 258 aa  212  3.9999999999999995e-54  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02589  hypothetical protein  43.55 
 
 		 258 aa  212  4.9999999999999996e-54  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0973  hypothetical protein  43.55 
 
 		 258 aa  212  4.9999999999999996e-54  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.898115  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2368  hydroxypyruvate isomerase  42.97 
 
 		 259 aa  212  4.9999999999999996e-54  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.592212  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2877  hypothetical protein  43.55 
 
 		 258 aa  212  4.9999999999999996e-54  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>