223 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene YpAngola_A1461 on replicon NC_010159
Organism: Yersinia pestis Angola



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009708  YpsIP31758_2745  AP endonuclease  100 
 
 		 264 aa  547  1e-155  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.978898  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1461  AP endonuclease  100 
 
 		 264 aa  547  1e-155  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.331039  normal  0.325369 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2823  hydroxypyruvate isomerase  99.62 
 
 		 264 aa  546  1e-154  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04753  hydroxypyruvate isomerase  46.46 
 
 		 258 aa  241  7.999999999999999e-63  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2552  hydroxypyruvate isomerase  46.06 
 
 		 258 aa  236  2e-61  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0908348  hitchhiker  0.00501624 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0459  hydroxypyruvate isomerase  45.28 
 
 		 264 aa  236  3e-61  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0230369  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3181  hydroxypyruvate isomerase  44.49 
 
 		 262 aa  234  1.0000000000000001e-60  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.365148  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0211  hydroxypyruvate isomerase  45.67 
 
 		 258 aa  234  1.0000000000000001e-60  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3955  hydroxypyruvate isomerase  44.27 
 
 		 259 aa  231  8.000000000000001e-60  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0147  hydroxypyruvate isomerase, putative  44.66 
 
 		 261 aa  231  1e-59  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.999741  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0132  putative hydroxypyruvate isomerase  44.66 
 
 		 261 aa  231  1e-59  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1134  hydroxypyruvate isomerase  45.06 
 
 		 259 aa  229  3e-59  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.852559 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4309  hydroxypyruvate isomerase  44.06 
 
 		 271 aa  229  4e-59  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0533507 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4554  hydroxypyruvate isomerase  45.67 
 
 		 258 aa  228  7e-59  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.695496  normal  0.368967 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5077  hydroxypyruvate isomerase  46.48 
 
 		 257 aa  228  8e-59  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.814935  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3088  hydroxypyruvate isomerase  43.58 
 
 		 263 aa  228  8e-59  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.645228  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1597  hydroxypyruvate isomerase  43.85 
 
 		 260 aa  227  1e-58  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00143749  normal  0.674901 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1298  hydroxypyruvate isomerase  45.28 
 
 		 259 aa  227  2e-58  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3208  hydroxypyruvate isomerase  46.06 
 
 		 258 aa  227  2e-58  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5159  hydroxypyruvate isomerase  46.06 
 
 		 258 aa  227  2e-58  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.324976  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3496  hydroxypyruvate isomerase  46.46 
 
 		 258 aa  226  3e-58  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0849997  normal  0.283205 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3036  hypothetical protein  46.46 
 
 		 258 aa  226  3e-58  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2625  hydroxypyruvate isomerase  42.21 
 
 		 260 aa  226  4e-58  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.90554  normal  0.173091 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3863  hydroxypyruvate isomerase  44.23 
 
 		 260 aa  225  4e-58  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.531245  normal  0.545966 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2118  hydroxypyruvate isomerase  43.89 
 
 		 266 aa  225  5.0000000000000005e-58  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0266277 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0474  hydroxypyruvate isomerase  45.28 
 
 		 258 aa  225  5.0000000000000005e-58  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.166076  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3065  hypothetical protein  46.46 
 
 		 258 aa  225  6e-58  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.765519  normal  0.510591 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2770  hydroxypyruvate isomerase  42.47 
 
 		 265 aa  225  6e-58  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0252433  normal  0.732675 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4427  hydroxypyruvate isomerase  43.51 
 
 		 262 aa  225  7e-58  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.198005  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3120  hypothetical protein  46.06 
 
 		 258 aa  225  7e-58  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.0148759 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3104  hypothetical protein  46.06 
 
 		 258 aa  225  7e-58  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5120  hydroxypyruvate isomerase  45.67 
 
 		 258 aa  224  1e-57  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1571  hydroxypyruvate isomerase  43.46 
 
 		 260 aa  224  1e-57  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.148654  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0958  hydroxypyruvate isomerase  42.91 
 
 		 267 aa  224  2e-57  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3135  hypothetical protein  43.7 
 
 		 258 aa  223  3e-57  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3036  hypothetical protein  43.7 
 
 		 258 aa  222  4e-57  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4298  hydroxypyruvate isomerase  43.46 
 
 		 260 aa  222  4.9999999999999996e-57  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_45010  putative hydroxypyruvate isomerase  43.08 
 
 		 260 aa  222  4.9999999999999996e-57  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.224213  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1395  hydroxypyruvate isomerase  43.7 
 
 		 269 aa  222  4.9999999999999996e-57  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0279437  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2461  hydroxypyruvate isomerase  44.88 
 
 		 269 aa  222  6e-57  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.731976  normal  0.599526 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3830  hydroxypyruvate isomerase  43.08 
 
 		 260 aa  221  9e-57  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1855  hydroxypyruvate isomerase  42.97 
 
 		 260 aa  221  9.999999999999999e-57  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1839  xylose isomerase-like TIM barrel  44.49 
 
 		 260 aa  221  9.999999999999999e-57  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0157456  normal  0.118454 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3623  hydroxypyruvate isomerase  42.69 
 
 		 260 aa  220  1.9999999999999999e-56  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1781  hydroxypyruvate isomerase  44.09 
 
 		 269 aa  220  1.9999999999999999e-56  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.168778  normal  0.857209 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02589  hypothetical protein  43.31 
 
 		 258 aa  219  3e-56  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3378  hydroxypyruvate isomerase  39.76 
 
 		 264 aa  219  3e-56  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.490297  normal  0.0397331 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02554  hypothetical protein  43.31 
 
 		 258 aa  219  3e-56  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0973  hypothetical protein  43.31 
 
 		 258 aa  219  3e-56  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.898115  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2877  hypothetical protein  43.31 
 
 		 258 aa  219  3e-56  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6200  hydroxypyruvate isomerase  42.91 
 
 		 269 aa  219  3.9999999999999997e-56  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0219655  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1788  hydroxypyruvate isomerase  43.19 
 
 		 269 aa  219  3.9999999999999997e-56  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1816  hydroxypyruvate isomerase  43.19 
 
 		 269 aa  219  3.9999999999999997e-56  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1879  hydroxypyruvate isomerase  42.91 
 
 		 269 aa  219  3.9999999999999997e-56  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0860973  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1902  hydroxypyruvate isomerase  42.91 
 
 		 269 aa  219  3.9999999999999997e-56  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000606406 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0949  Hydroxypyruvate isomerase  42.91 
 
 		 258 aa  218  5e-56  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0973  hydroxypyruvate isomerase  42.8 
 
 		 269 aa  219  5e-56  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4865  hydroxypyruvate isomerase Gcxl  41.73 
 
 		 260 aa  219  5e-56  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.798851  normal  0.469511 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3611  hydroxypyruvate isomerase  43.92 
 
 		 260 aa  218  7.999999999999999e-56  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.233278  normal  0.528482 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2462  hydroxypyruvate isomerase  43.68 
 
 		 266 aa  218  7.999999999999999e-56  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.684146  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3317  xylose isomerase-like TIM barrel  45.14 
 
 		 257 aa  218  1e-55  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.695295  hitchhiker  0.00275233 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5179  hydroxypyruvate isomerase  42.91 
 
 		 269 aa  218  1e-55  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.265819  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2169  hydroxypyruvate isomerase  42.91 
 
 		 262 aa  218  1e-55  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.196604  normal  0.222817 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1631  hydroxypyruvate isomerase  42.64 
 
 		 258 aa  217  2e-55  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1489  hydroxypyruvate isomerase  44.09 
 
 		 258 aa  217  2e-55  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0442  hydroxypyruvate isomerase  42.91 
 
 		 258 aa  216  2.9999999999999998e-55  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3413  Hydroxypyruvate isomerase  41.41 
 
 		 262 aa  216  2.9999999999999998e-55  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5927  Hydroxypyruvate isomerase  43.31 
 
 		 262 aa  216  2.9999999999999998e-55  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3152  hydroxypyruvate isomerase  42.8 
 
 		 260 aa  216  2.9999999999999998e-55  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5560  hydroxypyruvate isomerase  42.13 
 
 		 261 aa  216  2.9999999999999998e-55  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.446227  normal  0.0996892 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2172  hydroxypyruvate isomerase  41.98 
 
 		 269 aa  215  5e-55  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.42054  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3479  hydroxypyruvate isomerase  42.8 
 
 		 260 aa  215  5e-55  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1567  hydroxypyruvate isomerase  42.91 
 
 		 258 aa  215  5e-55  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1621  hydroxypyruvate isomerase  45.21 
 
 		 266 aa  215  5e-55  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.377689  normal  0.533551 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2809  hydroxypyruvate isomerase  42.53 
 
 		 265 aa  215  5e-55  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.356992 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1423  hydroxypyruvate isomerase  45.67 
 
 		 260 aa  215  5.9999999999999996e-55  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0831912  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0443  hydroxypyruvate isomerase  42.42 
 
 		 265 aa  215  7e-55  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1924  hydroxypyruvate isomerase  42.91 
 
 		 258 aa  215  7e-55  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0573  hydroxypyruvate isomerase  42.52 
 
 		 258 aa  214  9.999999999999999e-55  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3533  hydroxypyruvate isomerase  42.75 
 
 		 258 aa  214  9.999999999999999e-55  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.238199  normal  0.267377 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0894  hydroxypyruvate isomerase  42.52 
 
 		 258 aa  214  9.999999999999999e-55  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1861  hydroxypyruvate isomerase  42.52 
 
 		 258 aa  214  9.999999999999999e-55  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1133  hydroxypyruvate isomerase  41.7 
 
 		 260 aa  214  9.999999999999999e-55  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.926547  normal  0.304342 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3282  hydroxypyruvate isomerase protein  43.36 
 
 		 260 aa  213  1.9999999999999998e-54  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.257483  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0609  hydroxypyruvate isomerase  40.94 
 
 		 258 aa  213  1.9999999999999998e-54  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2017  hydroxypyruvate isomerase  42.52 
 
 		 258 aa  213  1.9999999999999998e-54  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.45932  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0551  hydroxypyruvate isomerase  41.34 
 
 		 258 aa  213  1.9999999999999998e-54  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3114  hydroxypyruvate isomerase  40.94 
 
 		 258 aa  214  1.9999999999999998e-54  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.334824 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1953  Hydroxypyruvate isomerase  41.73 
 
 		 259 aa  214  1.9999999999999998e-54  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.346217  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0582  hydroxypyruvate isomerase  40.94 
 
 		 258 aa  214  1.9999999999999998e-54  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0545  hydroxypyruvate isomerase  40.94 
 
 		 258 aa  214  1.9999999999999998e-54  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3292  hydroxypyruvate isomerase  42.58 
 
 		 260 aa  213  2.9999999999999995e-54  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.202186  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2425  hydroxypyruvate isomerase  43.13 
 
 		 262 aa  213  2.9999999999999995e-54  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4562  hydroxypyruvate isomerase  44.27 
 
 		 259 aa  213  2.9999999999999995e-54  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.427343  normal  0.384122 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2260  hydroxypyruvate isomerase  43.13 
 
 		 262 aa  213  2.9999999999999995e-54  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.654587  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2300  hydroxypyruvate isomerase  43.13 
 
 		 262 aa  213  2.9999999999999995e-54  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.946761  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1026  hydroxypyruvate isomerase  42.91 
 
 		 267 aa  213  2.9999999999999995e-54  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.43264  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3736  Hydroxypyruvate isomerase  40.94 
 
 		 262 aa  212  3.9999999999999995e-54  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2311  hydroxypyruvate isomerase  42.52 
 
 		 256 aa  212  4.9999999999999996e-54  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.279204  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3104  hydroxypyruvate isomerase  40.55 
 
 		 258 aa  212  5.999999999999999e-54  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>