204 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aaci_2206 on replicon NC_013205
Organism: Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013205  Aaci_2206  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  100 
 
 
260 aa  530  1e-150  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0313924  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2201  xylose isomerase domain-containing protein  33.46 
 
 
258 aa  144  1e-33  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.586932  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2682  xylose isomerase domain-containing protein  34.63 
 
 
258 aa  142  6e-33  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1902  xylose isomerase domain-containing protein  34.55 
 
 
299 aa  134  9.999999999999999e-31  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2228  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  28.69 
 
 
287 aa  130  2.0000000000000002e-29  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.498591  normal  0.437814 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1112  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  30.59 
 
 
259 aa  129  4.0000000000000003e-29  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3269  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  30.63 
 
 
303 aa  129  5.0000000000000004e-29  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29590  sugar phosphate isomerase/epimerase  36.32 
 
 
739 aa  118  9.999999999999999e-26  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4979  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  28.06 
 
 
283 aa  87.4  2e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.426661  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0782  xylose isomerase domain-containing protein  29.74 
 
 
289 aa  85.9  6e-16  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0653  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  30.52 
 
 
285 aa  85.1  0.000000000000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1297  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  31.32 
 
 
262 aa  82.8  0.000000000000005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0504  xylose isomerase domain-containing protein  29.63 
 
 
270 aa  79.7  0.00000000000004  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000275929  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3271  xylose isomerase domain-containing protein  29.86 
 
 
295 aa  78.2  0.0000000000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.170281  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4701  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  26.59 
 
 
290 aa  75.9  0.0000000000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1698  xylose isomerase domain-containing protein TIM barrel  29.25 
 
 
268 aa  75.1  0.0000000000009  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01291  predicted enzyme  27.13 
 
 
262 aa  74.7  0.000000000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2332  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  27.13 
 
 
262 aa  74.7  0.000000000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.297697  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2160  xylose isomerase domain-containing protein  30.06 
 
 
262 aa  75.1  0.000000000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.26775 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3635  xylose isomerase domain-containing protein  30.11 
 
 
282 aa  75.1  0.000000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0666  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  30.61 
 
 
264 aa  75.1  0.000000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.539887 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1429  AP endonuclease  27.13 
 
 
262 aa  74.7  0.000000000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01302  hypothetical protein  27.13 
 
 
262 aa  74.7  0.000000000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1959  AP endonuclease, family 2  26.98 
 
 
262 aa  73.9  0.000000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0839995  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5868  xylose isomerase domain-containing protein  31.06 
 
 
283 aa  73.9  0.000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1808  AP endonuclease  27.13 
 
 
262 aa  73.9  0.000000000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_08170  hydroxypyruvate isomerase  31.58 
 
 
276 aa  73.6  0.000000000003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.461944  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3563  xylose isomerase domain-containing protein  27.23 
 
 
297 aa  73.6  0.000000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1524  AP endonuclease  26.72 
 
 
262 aa  73.2  0.000000000004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2311  xylose isomerase domain-containing protein  31.55 
 
 
262 aa  73.2  0.000000000004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0554  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  31.38 
 
 
275 aa  72  0.000000000009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0509  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  24.11 
 
 
289 aa  71.2  0.00000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.440598  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0941  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  33.93 
 
 
293 aa  70.9  0.00000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0820  xylose isomerase domain-containing protein  33.87 
 
 
278 aa  70.5  0.00000000002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4619  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  24.4 
 
 
282 aa  69.7  0.00000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.154569  normal  0.87312 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4538  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  28.67 
 
 
281 aa  68.9  0.00000000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.535239 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0259  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  28.33 
 
 
294 aa  68.9  0.00000000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0189  xylose isomerase domain-containing protein  31.58 
 
 
293 aa  68.2  0.0000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.258985  normal 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5314  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  24.88 
 
 
282 aa  67.4  0.0000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4299  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  25.22 
 
 
275 aa  66.6  0.0000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.172805  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0036  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  31.45 
 
 
283 aa  66.2  0.0000000005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1910  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  32.28 
 
 
282 aa  66.2  0.0000000005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0721  Hydroxypyruvate isomerase  29.63 
 
 
265 aa  65.9  0.0000000007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1528  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  25.9 
 
 
264 aa  65.5  0.0000000008  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4185  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  24.52 
 
 
273 aa  65.1  0.000000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4045  xylose isomerase domain-containing protein  27.67 
 
 
283 aa  64.3  0.000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4652  Xylose isomerase domain-containing protein TIM barrel  28.07 
 
 
290 aa  63.2  0.000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00059422 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1536  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  30.4 
 
 
292 aa  62.4  0.000000007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.00467401  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0288  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  31.96 
 
 
294 aa  61.6  0.00000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.341149  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2365  hydroxypyruvate isomerase  31.06 
 
 
266 aa  60.5  0.00000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1251  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  23.79 
 
 
274 aa  60.5  0.00000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.725023  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3436  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  31.06 
 
 
266 aa  60.1  0.00000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0529  xylose isomerase-like TIM barrel  30 
 
 
281 aa  60.1  0.00000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0189964  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0533  xylose isomerase domain protein TIM barrel  25.58 
 
 
282 aa  59.7  0.00000005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.605213  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3689  xylose isomerase domain-containing protein  38.37 
 
 
266 aa  59.3  0.00000006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0565  hydroxypyruvate isomerase  26.11 
 
 
258 aa  58.2  0.0000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.551663  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1174  hydroxypyruvate isomerase  31.45 
 
 
262 aa  57.8  0.0000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.970176  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1026  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  26.67 
 
 
287 aa  57.8  0.0000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0459  hydroxypyruvate isomerase  29.27 
 
 
264 aa  57.4  0.0000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0230369  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0572  hydroxypyruvate isomerase  26.11 
 
 
258 aa  57.4  0.0000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5560  hydroxypyruvate isomerase  31.3 
 
 
261 aa  57  0.0000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.446227  normal  0.0996892 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0567  hydroxypyruvate isomerase  26.11 
 
 
258 aa  57.4  0.0000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3671  putative D-tagatose 3-epimerase  26.32 
 
 
295 aa  56.2  0.0000005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.325979  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3631  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  25 
 
 
275 aa  55.8  0.0000006  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.9121  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4865  hydroxypyruvate isomerase Gcxl  25.15 
 
 
260 aa  55.8  0.0000007  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.798851  normal  0.469511 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3406  xylose isomerase domain-containing protein  27.36 
 
 
295 aa  55.5  0.0000008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.784337 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0391  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  22.39 
 
 
279 aa  55.5  0.0000008  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1918  Hydroxypyruvate isomerase  25.88 
 
 
260 aa  55.1  0.000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0177301  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1263  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  25.35 
 
 
297 aa  54.3  0.000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.281951  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0626  hydroxypyruvate isomerase  25.48 
 
 
258 aa  54.7  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.396658  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3558  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  35.56 
 
 
269 aa  53.5  0.000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007488  RSP_3944  AP endonuclease  26 
 
 
285 aa  53.1  0.000004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0718494  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1924  Hydroxypyruvate isomerase  38.17 
 
 
280 aa  52.8  0.000006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.00000000334865  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1099  xylose isomerase domain-containing protein  28.06 
 
 
293 aa  52.4  0.000007  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1969  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  25 
 
 
270 aa  52.4  0.000007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2929  hydroxypyruvate isomerase  31.65 
 
 
263 aa  52.4  0.000008  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.452433 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4572  hydroxypyruvate isomerase  28.03 
 
 
258 aa  51.2  0.00001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.0168162 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3195  hydroxypyruvate isomerase  30.83 
 
 
263 aa  51.6  0.00001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.568718  normal  0.0120723 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1498  xylose isomerase domain-containing protein  27.27 
 
 
290 aa  51.2  0.00001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  unclonable  0.0000000000176809  normal 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4472  Hydroxypyruvate isomerase  26.97 
 
 
250 aa  51.2  0.00002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0435966  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0339  Hydroxypyruvate isomerase  39.47 
 
 
267 aa  50.8  0.00002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4202  hydroxypyruvate isomerase  26.85 
 
 
268 aa  51.2  0.00002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.407118 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3261  hypothetical protein  23.44 
 
 
282 aa  50.4  0.00003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.879119  normal  0.639309 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3623  hydroxypyruvate isomerase  27.56 
 
 
260 aa  50.4  0.00003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3863  hydroxypyruvate isomerase  28.21 
 
 
260 aa  50.1  0.00003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.531245  normal  0.545966 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0015  hydroxypyruvate isomerase  28.57 
 
 
258 aa  50.1  0.00004  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4012  xylose isomerase domain-containing protein  27.27 
 
 
260 aa  50.1  0.00004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.167546  normal  0.990546 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1621  hydroxypyruvate isomerase  25.76 
 
 
266 aa  49.7  0.00004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.377689  normal  0.533551 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5018  hydroxypyruvate isomerase  25.31 
 
 
258 aa  49.3  0.00006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.189718  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4298  hydroxypyruvate isomerase  27.56 
 
 
260 aa  49.3  0.00007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3029  xylose isomerase-like TIM barrel  24.51 
 
 
265 aa  49.3  0.00007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.599496  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2842  Hydroxypyruvate isomerase  29.33 
 
 
271 aa  48.9  0.00007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0814661  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4719  hydroxypyruvate isomerase  31.03 
 
 
258 aa  48.9  0.00007  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00317481 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1158  hydroxypyruvate isomerase  33.72 
 
 
268 aa  48.9  0.00008  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.671898  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1571  hydroxypyruvate isomerase  27.56 
 
 
260 aa  48.9  0.00008  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.148654  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1682  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  25.15 
 
 
287 aa  48.9  0.00008  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1597  hydroxypyruvate isomerase  28.03 
 
 
260 aa  48.1  0.0001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00143749  normal  0.674901 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3760  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  24.03 
 
 
288 aa  48.5  0.0001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0609  hydroxypyruvate isomerase  24.2 
 
 
258 aa  48.5  0.0001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3479  hydroxypyruvate isomerase  27.48 
 
 
260 aa  48.1  0.0001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>