69 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plim_1682 on replicon NC_014148
Organism: Planctomyces limnophilus DSM 3776



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014148  Plim_1682  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  100 
 
 		 287 aa  595  1e-169  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3194  hypothetical protein  33.53 
 
 		 269 aa  90.1  4e-17  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0561892  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2120  hypothetical protein  34.48 
 
 		 269 aa  82.8  0.000000000000007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.565953  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1962  hypothetical protein  35.11 
 
 		 148 aa  77  0.0000000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.370718  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2110  hypothetical protein  35.11 
 
 		 148 aa  77  0.0000000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1917  sugar phosphate isomerase/epimerase  35.11 
 
 		 148 aa  75.1  0.000000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1941  sugar phosphate isomerase/epimerase  35.11 
 
 		 148 aa  74.7  0.000000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2144  hypothetical protein  35.11 
 
 		 148 aa  74.7  0.000000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1807  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  29.37 
 
 		 277 aa  57.4  0.0000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2516  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  29.48 
 
 		 271 aa  55.8  0.0000008  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.610941  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3316  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  25.93 
 
 		 285 aa  55.1  0.000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0367293 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2848  xylose isomerase-like TIM barrel  26.11 
 
 		 282 aa  54.7  0.000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.561386  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0568  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  28.87 
 
 		 272 aa  53.5  0.000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0781  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  26.9 
 
 		 282 aa  52.4  0.000009  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0509  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  26 
 
 		 289 aa  51.6  0.00001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.440598  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0155  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  34.34 
 
 		 332 aa  51.6  0.00001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1733  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  29.73 
 
 		 339 aa  50.4  0.00003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1781  xylose isomerase domain-containing protein  27.2 
 
 		 347 aa  50.8  0.00003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03707  hypothetical protein  26.89 
 
 		 326 aa  50.1  0.00005  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4720  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  22.53 
 
 		 284 aa  49.7  0.00005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_50050  2-keto-myo-inositol dehydratase  31.91 
 
 		 303 aa  49.7  0.00005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.602375  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28710  sugar phosphate isomerase/epimerase  27.34 
 
 		 307 aa  50.1  0.00005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0885144  normal  0.0589318 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4143  xylose isomerase domain-containing protein  26.89 
 
 		 326 aa  50.1  0.00005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.805588 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4100  AP endonuclease  26.89 
 
 		 326 aa  50.1  0.00005  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03758  predicted sugar phosphate isomerase  26.89 
 
 		 326 aa  50.1  0.00005  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3837  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  32.69 
 
 		 290 aa  49.3  0.00007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.746736  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2206  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  25.15 
 
 		 260 aa  48.9  0.0001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0313924  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4396  AP endonuclease  26.89 
 
 		 326 aa  48.5  0.0001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5319  AP endonuclease, family 2  25.59 
 
 		 326 aa  48.1  0.0001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.44383 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1485  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  24.38 
 
 		 310 aa  48.5  0.0001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1842  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  23.89 
 
 		 287 aa  48.5  0.0001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4113  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  26.89 
 
 		 326 aa  48.5  0.0001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4258  AP endonuclease  26.42 
 
 		 292 aa  47.4  0.0002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1444  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  35.92 
 
 		 327 aa  48.1  0.0002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.133087 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4061  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  32.32 
 
 		 334 aa  47.4  0.0003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2826  xylose isomerase-like TIM barrel  26.26 
 
 		 338 aa  47.4  0.0003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.112108  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4651  Xylose isomerase domain-containing protein TIM barrel  24.6 
 
 		 334 aa  47  0.0004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000654958 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0391  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  28.93 
 
 		 338 aa  47  0.0004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.639101  normal  0.0346444 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0249  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  29.7 
 
 		 333 aa  46.2  0.0007  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2650  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  25.48 
 
 		 266 aa  46.2  0.0007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2335  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  22.52 
 
 		 271 aa  45.4  0.001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1698  xylose isomerase domain-containing protein TIM barrel  26.79 
 
 		 268 aa  45.4  0.001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4327  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  31.63 
 
 		 337 aa  45.4  0.001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.239694 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31660  sugar phosphate isomerase/epimerase  24.53 
 
 		 297 aa  45.4  0.001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0345  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  20.4 
 
 		 312 aa  44.7  0.002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8255  xylose isomerase domain-containing protein  31.31 
 
 		 335 aa  44.3  0.002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.018151 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1909  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  23 
 
 		 280 aa  44.7  0.002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2300  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  29.03 
 
 		 334 aa  44.7  0.002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.0000000686385  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1263  hypothetical protein  28.8 
 
 		 269 aa  44.3  0.003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3268  xylose isomerase domain-containing protein  25 
 
 		 333 aa  43.9  0.003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.60758 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1355  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  31 
 
 		 335 aa  43.9  0.003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.4275  normal  0.774655 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2200  xylose isomerase domain-containing protein  30.16 
 
 		 288 aa  43.5  0.004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1640  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  35.09 
 
 		 270 aa  43.5  0.004  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.264646  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1257  xylose isomerase domain-containing protein  27.52 
 
 		 264 aa  43.5  0.004  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.666664  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2929  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  30.48 
 
 		 327 aa  43.5  0.004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.712071  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1920  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  25.14 
 
 		 338 aa  43.1  0.005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3264  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  32.67 
 
 		 331 aa  43.1  0.005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.26961  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3581  xylose isomerase domain-containing protein  25 
 
 		 325 aa  43.1  0.006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.257163 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1019  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  22.34 
 
 		 307 aa  42.7  0.006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1399  xylose isomerase domain-containing protein  28.33 
 
 		 309 aa  42.7  0.007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14000  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  22.41 
 
 		 254 aa  42.7  0.007  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.50908  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_15580  sugar phosphate isomerase/epimerase  29.84 
 
 		 333 aa  42.7  0.007  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0086  xylose isomerase domain-containing protein  29.59 
 
 		 334 aa  42.4  0.008  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0939  xylose isomerase-like TIM barrel  28.33 
 
 		 309 aa  42.7  0.008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.00907131  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0499  xylose isomerase domain-containing protein  31 
 
 		 282 aa  42.4  0.008  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1421  xylose isomerase domain-containing protein  28.33 
 
 		 309 aa  42.7  0.008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3847  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  22.53 
 
 		 335 aa  42.4  0.009  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7610  hypothetical protein  37.18 
 
 		 376 aa  42.4  0.01  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1909  xylose isomerase domain-containing protein  27.55 
 
 		 333 aa  42  0.01  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>