25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene EcE24377A_4396 on replicon NC_009801
Organism: Escherichia coli E24377A



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001637  EcDH1_4113  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  99.69 
 
 		 326 aa  669    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03707  hypothetical protein  99.08 
 
 		 326 aa  665    Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5319  AP endonuclease, family 2  97.55 
 
 		 326 aa  655    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.44383 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4143  xylose isomerase domain-containing protein  99.08 
 
 		 326 aa  665    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.805588 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4396  AP endonuclease  100 
 
 		 326 aa  671    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03758  predicted sugar phosphate isomerase  99.08 
 
 		 326 aa  665    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4100  AP endonuclease  99.08 
 
 		 326 aa  665    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4258  AP endonuclease  98.63 
 
 		 292 aa  593  1e-168  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3581  xylose isomerase domain-containing protein  66.88 
 
 		 325 aa  444  1e-123  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.257163 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5378  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  37.89 
 
 		 376 aa  74.7  0.000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5126  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  36.17 
 
 		 376 aa  68.2  0.0000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.764351  normal  1 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7610  hypothetical protein  26.78 
 
 		 376 aa  67.4  0.0000000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3511  AP endonuclease  23.74 
 
 		 328 aa  55.1  0.000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.17674 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3986  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  25.19 
 
 		 338 aa  54.7  0.000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.984461  normal  0.0421745 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4460  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  26.36 
 
 		 331 aa  50.8  0.00003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2482  oxidoreductase domain-containing protein  26.5 
 
 		 644 aa  49.3  0.00008  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.230989  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1040  Xylose isomerase domain-containing protein TIM barrel  22.67 
 
 		 250 aa  49.3  0.00009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.384562  normal  0.731226 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3156  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  21.05 
 
 		 331 aa  48.1  0.0002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1682  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  26.89 
 
 		 287 aa  48.5  0.0002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1525  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  22.52 
 
 		 306 aa  45.8  0.001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0435  xylose isomerase domain-containing protein  23.53 
 
 		 266 aa  44.7  0.002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1962  hypothetical protein  28.21 
 
 		 148 aa  44.7  0.003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.370718  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2110  hypothetical protein  28.21 
 
 		 148 aa  44.7  0.003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0542  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  22.82 
 
 		 250 aa  43.1  0.006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2650  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  24.76 
 
 		 266 aa  42.7  0.009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>