24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avi_7610 on replicon NC_011981
Organism: Agrobacterium vitis S4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011981  Avi_7610  hypothetical protein  100 
 
 		 376 aa  778    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5126  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  78.19 
 
 		 376 aa  624  1e-178  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.764351  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5378  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  77.13 
 
 		 376 aa  617  1e-175  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4460  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  30.92 
 
 		 331 aa  94.7  2e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3986  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  26.42 
 
 		 338 aa  76.3  0.0000000000008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.984461  normal  0.0421745 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03707  hypothetical protein  26.86 
 
 		 326 aa  67.8  0.0000000003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4100  AP endonuclease  26.86 
 
 		 326 aa  67.8  0.0000000003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03758  predicted sugar phosphate isomerase  26.86 
 
 		 326 aa  67.8  0.0000000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4258  AP endonuclease  26.64 
 
 		 292 aa  67.8  0.0000000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4143  xylose isomerase domain-containing protein  26.86 
 
 		 326 aa  67.8  0.0000000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.805588 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5319  AP endonuclease, family 2  26.86 
 
 		 326 aa  67.4  0.0000000004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.44383 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4396  AP endonuclease  26.78 
 
 		 326 aa  67.4  0.0000000004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4113  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  26.78 
 
 		 326 aa  67.4  0.0000000004  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3511  AP endonuclease  29.32 
 
 		 328 aa  66.6  0.0000000007  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.17674 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3156  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  22.61 
 
 		 331 aa  58.2  0.0000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3581  xylose isomerase domain-containing protein  23.04 
 
 		 325 aa  52.8  0.00001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.257163 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2650  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  27.88 
 
 		 266 aa  52  0.00002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2721  xylose isomerase domain-containing protein  25.63 
 
 		 280 aa  47  0.0006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.543869  normal  0.780906 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1134  xylose isomerase domain-containing protein  26.86 
 
 		 389 aa  46.6  0.0008  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.155957  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3268  xylose isomerase domain-containing protein  28 
 
 		 333 aa  45.4  0.001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.60758 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1018  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  24.31 
 
 		 318 aa  46.2  0.001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.706274  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1019  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  23.58 
 
 		 307 aa  45.8  0.001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2516  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  28.4 
 
 		 271 aa  43.5  0.006  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.610941  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4190  xylose isomerase-like TIM barrel  26.58 
 
 		 371 aa  42.7  0.009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.720259  hitchhiker  0.00898811 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>