72 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Phep_1018 on replicon NC_013061
Organism: Pedobacter heparinus DSM 2366



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013061  Phep_1018  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  100 
 
 		 318 aa  647    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.706274  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1020  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  67.86 
 
 		 334 aa  415  9.999999999999999e-116  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1019  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  64.4 
 
 		 307 aa  407  1.0000000000000001e-112  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1021  protein of unknown function DUF1080  62.5 
 
 		 515 aa  378  1e-104  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.943633  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4869  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  44.95 
 
 		 310 aa  245  9e-64  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0551  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  36.16 
 
 		 322 aa  160  4e-38  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.784831  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1349  xylose isomerase domain-containing protein  27.82 
 
 		 280 aa  122  8e-27  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0895  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  27.97 
 
 		 281 aa  107  4e-22  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3402  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  25.09 
 
 		 324 aa  95.1  1e-18  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1662  xylose isomerase domain-containing protein  23.86 
 
 		 274 aa  87.4  3e-16  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.36383  hitchhiker  0.00346458 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31660  sugar phosphate isomerase/epimerase  25.9 
 
 		 297 aa  86.7  5e-16  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2598  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  26.67 
 
 		 316 aa  82  0.00000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1743  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  25.97 
 
 		 309 aa  79  0.0000000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1709  hypothetical protein  24.8 
 
 		 306 aa  70.9  0.00000000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.53026  normal  0.973713 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0870  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  21.46 
 
 		 280 aa  66.6  0.0000000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.505971  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4673  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  25.26 
 
 		 341 aa  65.9  0.0000000009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1044  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  26.25 
 
 		 305 aa  64.7  0.000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1525  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  22.22 
 
 		 306 aa  63.5  0.000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0509  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  23.57 
 
 		 289 aa  63.5  0.000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.440598  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0333  xylose isomerase-like TIM barrel  25.75 
 
 		 314 aa  63.2  0.000000006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.601498  normal  0.557772 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3986  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  29.21 
 
 		 338 aa  62.8  0.000000008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.984461  normal  0.0421745 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2642  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  24.82 
 
 		 313 aa  61.6  0.00000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0534  hypothetical protein  21.81 
 
 		 318 aa  61.2  0.00000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.434063 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6459  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  24.12 
 
 		 343 aa  61.6  0.00000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1113  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  26.73 
 
 		 277 aa  60.5  0.00000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1009  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  25.15 
 
 		 308 aa  58.9  0.0000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0621  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  20.9 
 
 		 281 aa  58.2  0.0000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4299  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  26.69 
 
 		 275 aa  58.2  0.0000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.172805  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1981  xylose isomerase domain-containing protein  23.65 
 
 		 287 aa  55.8  0.0000009  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0210  xylose isomerase domain-containing protein  26.37 
 
 		 322 aa  53.5  0.000005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0204  xylose isomerase domain-containing protein  26.37 
 
 		 322 aa  53.5  0.000005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0504  xylose isomerase domain-containing protein  25.37 
 
 		 270 aa  52.8  0.000008  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000275929  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0781  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  27.03 
 
 		 282 aa  52.4  0.00001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4718  protein IolH  26.99 
 
 		 294 aa  52  0.00001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.745442  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0469  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  24.71 
 
 		 307 aa  50.8  0.00003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0294161  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0991  xylose isomerase domain-containing protein  23.83 
 
 		 304 aa  50.8  0.00003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0388  xylose isomerase domain-containing protein  30.49 
 
 		 290 aa  49.7  0.00006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4460  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  28.15 
 
 		 331 aa  49.7  0.00007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0779  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  25.53 
 
 		 276 aa  49.7  0.00007  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3156  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  21.72 
 
 		 331 aa  49.3  0.00009  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4050  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  28.23 
 
 		 284 aa  49.3  0.00009  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  hitchhiker  0.00790933  normal  0.0910238 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0943  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  29.56 
 
 		 291 aa  49.3  0.0001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2792  xylose isomerase domain-containing protein  23.65 
 
 		 305 aa  48.9  0.0001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1085  xylose isomerase domain-containing protein  23.15 
 
 		 305 aa  48.9  0.0001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.230737 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2155  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  23.36 
 
 		 322 aa  48.5  0.0002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31360  sugar phosphate isomerase/epimerase  23.74 
 
 		 274 aa  48.5  0.0002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3493  iolH protein  21.76 
 
 		 286 aa  47  0.0004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.00667421  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0499  xylose isomerase domain-containing protein  27.78 
 
 		 304 aa  47  0.0004  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00421742  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0589  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  24.04 
 
 		 337 aa  47  0.0005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00102847 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0435  xylose isomerase domain-containing protein  23.08 
 
 		 266 aa  46.6  0.0005  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3267  AP endonuclease  21.76 
 
 		 286 aa  46.6  0.0006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3511  AP endonuclease  25.71 
 
 		 328 aa  46.6  0.0006  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.17674 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1980  xylose isomerase domain-containing protein  23.12 
 
 		 274 aa  46.6  0.0006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7610  hypothetical protein  24.31 
 
 		 376 aa  46.2  0.0007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4228  xylose isomerase domain-containing protein  23.88 
 
 		 268 aa  46.2  0.0007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0500  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  26.86 
 
 		 266 aa  45.8  0.0009  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.00000000106724  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0401  xylose isomerase-like TIM barrel  26.92 
 
 		 354 aa  45.4  0.001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.0010085  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1361  xylose isomerase domain-containing protein  22.86 
 
 		 278 aa  45.4  0.001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1167  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  24.84 
 
 		 306 aa  44.3  0.002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.100222 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2372  hypothetical protein  22.59 
 
 		 347 aa  44.7  0.002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0241326  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2375  xylose isomerase-like TIM barrel  25.68 
 
 		 477 aa  44.7  0.002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0826  xylose isomerase domain-containing protein  28.37 
 
 		 290 aa  44.7  0.002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0008  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  29.63 
 
 		 322 aa  45.1  0.002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5694  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  23.42 
 
 		 300 aa  44.7  0.002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.986609  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6694  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  29.57 
 
 		 286 aa  44.3  0.003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.382585 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2962  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  21.96 
 
 		 304 aa  43.9  0.003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1810  xylose isomerase domain-containing protein  22.43 
 
 		 287 aa  43.9  0.004  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.753291 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1257  xylose isomerase domain-containing protein  24.76 
 
 		 264 aa  43.9  0.004  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.666664  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4045  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  24.57 
 
 		 278 aa  43.9  0.004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1980  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  29.88 
 
 		 291 aa  43.5  0.005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.401459  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_50120  myo-inositol catabolism protein IolH  21.56 
 
 		 285 aa  43.5  0.005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0418  xylose isomerase domain-containing protein  26.09 
 
 		 635 aa  42.7  0.008  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>