25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_0589 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013037  Dfer_0589  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  100 
 
 		 337 aa  696    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00102847 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4673  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  65.99 
 
 		 341 aa  439  9.999999999999999e-123  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6459  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  46.5 
 
 		 343 aa  306  3e-82  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1044  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  51.19 
 
 		 305 aa  297  1e-79  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1009  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  47.76 
 
 		 308 aa  293  3e-78  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0469  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  50.15 
 
 		 307 aa  291  1e-77  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0294161  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2642  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  44.77 
 
 		 313 aa  249  6e-65  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1743  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  40.6 
 
 		 309 aa  238  1e-61  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0534  hypothetical protein  41.72 
 
 		 318 aa  233  5e-60  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.434063 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1709  hypothetical protein  38.74 
 
 		 306 aa  187  2e-46  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.53026  normal  0.973713 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2372  hypothetical protein  28.31 
 
 		 347 aa  100  3e-20  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0241326  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0333  xylose isomerase-like TIM barrel  29.6 
 
 		 314 aa  93.2  5e-18  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.601498  normal  0.557772 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1349  xylose isomerase domain-containing protein  23.95 
 
 		 280 aa  67.8  0.0000000002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1662  xylose isomerase domain-containing protein  24.32 
 
 		 274 aa  67  0.0000000005  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.36383  hitchhiker  0.00346458 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0551  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  25.25 
 
 		 322 aa  62.8  0.000000009  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.784831  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2598  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  26.2 
 
 		 316 aa  59.7  0.00000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4869  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  23.62 
 
 		 310 aa  58.9  0.0000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3402  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  25.78 
 
 		 324 aa  57.8  0.0000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0895  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  24.15 
 
 		 281 aa  55.8  0.0000009  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2693  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  27.54 
 
 		 279 aa  53.5  0.000005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1019  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  24.08 
 
 		 307 aa  51.6  0.00002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1018  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  24.04 
 
 		 318 aa  47  0.0005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.706274  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1020  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  24.24 
 
 		 334 aa  45.4  0.001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0710  xylose isomerase-like TIM barrel  22.22 
 
 		 343 aa  43.5  0.006  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1021  protein of unknown function DUF1080  23.08 
 
 		 515 aa  42.7  0.008  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.943633  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>