62 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Phep_1020 on replicon NC_013061
Organism: Pedobacter heparinus DSM 2366



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013061  Phep_1020  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  100 
 
 		 334 aa  684    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1018  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  67.86 
 
 		 318 aa  415  9.999999999999999e-116  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.706274  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1021  protein of unknown function DUF1080  68.15 
 
 		 515 aa  410  1e-113  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.943633  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1019  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  62.54 
 
 		 307 aa  405  1.0000000000000001e-112  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4869  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  43.69 
 
 		 310 aa  246  4.9999999999999997e-64  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0551  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  37.4 
 
 		 322 aa  157  3e-37  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.784831  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1349  xylose isomerase domain-containing protein  28.68 
 
 		 280 aa  122  9.999999999999999e-27  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0895  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  26.14 
 
 		 281 aa  93.6  5e-18  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3402  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  25.76 
 
 		 324 aa  91.7  2e-17  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1662  xylose isomerase domain-containing protein  26.12 
 
 		 274 aa  89.4  9e-17  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.36383  hitchhiker  0.00346458 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2598  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  25.83 
 
 		 316 aa  83.2  0.000000000000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1743  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  25.56 
 
 		 309 aa  76.6  0.0000000000006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31660  sugar phosphate isomerase/epimerase  26.01 
 
 		 297 aa  74.7  0.000000000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0534  hypothetical protein  24.34 
 
 		 318 aa  70.1  0.00000000005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.434063 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1044  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  26.7 
 
 		 305 aa  68.2  0.0000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2642  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  26.64 
 
 		 313 aa  67.8  0.0000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0509  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  24.49 
 
 		 289 aa  65.5  0.000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.440598  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0333  xylose isomerase-like TIM barrel  22.95 
 
 		 314 aa  64.3  0.000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.601498  normal  0.557772 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0870  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  22.29 
 
 		 280 aa  59.3  0.00000008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.505971  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1113  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  25.77 
 
 		 277 aa  58.5  0.0000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0504  xylose isomerase domain-containing protein  26.58 
 
 		 270 aa  58.9  0.0000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000275929  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6459  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  24.36 
 
 		 343 aa  58.9  0.0000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4673  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  25.09 
 
 		 341 aa  58.5  0.0000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4652  Xylose isomerase domain-containing protein TIM barrel  26.84 
 
 		 290 aa  58.2  0.0000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00059422 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1525  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  22.52 
 
 		 306 aa  57.8  0.0000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1009  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  21.77 
 
 		 308 aa  56.6  0.0000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3986  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  25.23 
 
 		 338 aa  55.1  0.000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.984461  normal  0.0421745 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1709  hypothetical protein  24.02 
 
 		 306 aa  55.1  0.000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.53026  normal  0.973713 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31360  sugar phosphate isomerase/epimerase  23.74 
 
 		 274 aa  55.1  0.000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0781  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  27.42 
 
 		 282 aa  54.3  0.000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1085  xylose isomerase domain-containing protein  29.45 
 
 		 305 aa  52.8  0.000008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.230737 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4299  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  24.8 
 
 		 275 aa  51.2  0.00002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.172805  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1698  xylose isomerase domain-containing protein TIM barrel  22.94 
 
 		 268 aa  51.2  0.00003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0204  xylose isomerase domain-containing protein  23.81 
 
 		 322 aa  50.8  0.00003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0210  xylose isomerase domain-containing protein  23.81 
 
 		 322 aa  50.8  0.00003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0500  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  26.02 
 
 		 266 aa  50.8  0.00003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.00000000106724  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3511  AP endonuclease  25.67 
 
 		 328 aa  51.2  0.00003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.17674 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6694  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  26.39 
 
 		 286 aa  50.4  0.00004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.382585 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0469  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  23.7 
 
 		 307 aa  50.4  0.00004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0294161  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2792  xylose isomerase domain-containing protein  31.78 
 
 		 305 aa  49.7  0.00006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1910  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  22.03 
 
 		 282 aa  48.9  0.0001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4718  protein IolH  29.17 
 
 		 294 aa  48.1  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.745442  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0621  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  21.22 
 
 		 281 aa  48.5  0.0002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3493  iolH protein  25 
 
 		 286 aa  48.5  0.0002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.00667421  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3267  AP endonuclease  25 
 
 		 286 aa  47.8  0.0003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0779  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  25.58 
 
 		 276 aa  47.4  0.0003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4538  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  23.16 
 
 		 281 aa  47.4  0.0003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.535239 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5791  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  29.09 
 
 		 286 aa  47  0.0004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.864508  normal  0.0412869 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1257  xylose isomerase domain-containing protein  26.43 
 
 		 264 aa  46.6  0.0007  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.666664  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0991  xylose isomerase domain-containing protein  29.25 
 
 		 304 aa  46.2  0.0009  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1076  xylose isomerase domain-containing protein  23.57 
 
 		 308 aa  45.8  0.001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0589  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  24.24 
 
 		 337 aa  45.4  0.001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00102847 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3156  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  27.42 
 
 		 331 aa  45.8  0.001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1167  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  25 
 
 		 306 aa  45.4  0.002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.100222 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0499  xylose isomerase domain-containing protein  35 
 
 		 304 aa  44.7  0.002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00421742  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4657  xylose isomerase domain-containing protein  29.51 
 
 		 294 aa  45.1  0.002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.480222 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1981  xylose isomerase domain-containing protein  20.47 
 
 		 287 aa  44.3  0.003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4090  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  23.58 
 
 		 645 aa  43.9  0.004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00816269 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_50120  myo-inositol catabolism protein IolH  23.28 
 
 		 285 aa  43.9  0.004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0943  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  27.22 
 
 		 291 aa  43.5  0.005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6113  4-hydroxyphenylpyruvate dioxygenase  25.11 
 
 		 623 aa  42.7  0.009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.471766 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3913  xylose isomerase domain-containing protein  24.29 
 
 		 617 aa  42.4  0.01  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.974395  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>