96 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Phep_1019 on replicon NC_013061
Organism: Pedobacter heparinus DSM 2366



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013061  Phep_1019  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  100 
 
 		 307 aa  632  1e-180  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1021  protein of unknown function DUF1080  71.09 
 
 		 515 aa  434  1e-121  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.943633  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1020  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  62.54 
 
 		 334 aa  405  1.0000000000000001e-112  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1018  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  64.4 
 
 		 318 aa  407  1.0000000000000001e-112  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.706274  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4869  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  46.04 
 
 		 310 aa  252  5.000000000000001e-66  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0551  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  37.6 
 
 		 322 aa  162  5.0000000000000005e-39  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.784831  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1349  xylose isomerase domain-containing protein  32.64 
 
 		 280 aa  133  3.9999999999999996e-30  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3402  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  25.7 
 
 		 324 aa  100  4e-20  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0895  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  25.53 
 
 		 281 aa  99.4  6e-20  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1662  xylose isomerase domain-containing protein  25.82 
 
 		 274 aa  96.3  6e-19  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.36383  hitchhiker  0.00346458 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2598  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  26.82 
 
 		 316 aa  93.6  4e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1743  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  25.97 
 
 		 309 aa  85.1  0.000000000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1709  hypothetical protein  28.7 
 
 		 306 aa  82  0.00000000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.53026  normal  0.973713 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31660  sugar phosphate isomerase/epimerase  23.6 
 
 		 297 aa  79.7  0.00000000000005  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0534  hypothetical protein  24.89 
 
 		 318 aa  73.2  0.000000000005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.434063 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2642  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  28.7 
 
 		 313 aa  71.6  0.00000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6459  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  26.12 
 
 		 343 aa  70.5  0.00000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4673  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  26.24 
 
 		 341 aa  69.7  0.00000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1044  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  28.9 
 
 		 305 aa  67.8  0.0000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1525  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  24.71 
 
 		 306 aa  67.4  0.0000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1009  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  26.78 
 
 		 308 aa  66.2  0.0000000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1113  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  26.34 
 
 		 277 aa  64.7  0.000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0621  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  21.67 
 
 		 281 aa  64.3  0.000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0469  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  27.81 
 
 		 307 aa  63.9  0.000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0294161  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0509  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  23.77 
 
 		 289 aa  62  0.00000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.440598  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0870  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  24 
 
 		 280 aa  61.6  0.00000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.505971  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4090  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  26.23 
 
 		 645 aa  59.7  0.00000007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00816269 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0504  xylose isomerase domain-containing protein  23.5 
 
 		 270 aa  58.2  0.0000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000275929  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3986  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  27.57 
 
 		 338 aa  58.5  0.0000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.984461  normal  0.0421745 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0333  xylose isomerase-like TIM barrel  23.83 
 
 		 314 aa  55.8  0.0000009  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.601498  normal  0.557772 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0204  xylose isomerase domain-containing protein  24.62 
 
 		 322 aa  55.1  0.000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0210  xylose isomerase domain-containing protein  24.62 
 
 		 322 aa  55.1  0.000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5194  4-hydroxyphenylpyruvate dioxygenase  26.94 
 
 		 630 aa  53.5  0.000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2155  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  22.42 
 
 		 322 aa  53.1  0.000005  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0418  xylose isomerase domain-containing protein  26.88 
 
 		 635 aa  52.4  0.00001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6694  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  28.93 
 
 		 286 aa  52  0.00001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.382585 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5305  4-hydroxyphenylpyruvate dioxygenase  27.35 
 
 		 630 aa  51.6  0.00001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.114512 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3062  4-hydroxyphenylpyruvate dioxygenase  27.35 
 
 		 630 aa  51.6  0.00001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0779  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  24.28 
 
 		 276 aa  51.6  0.00002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0589  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  24.08 
 
 		 337 aa  51.6  0.00002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00102847 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0781  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  27.5 
 
 		 282 aa  51.2  0.00002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4666  4-hydroxyphenylpyruvate dioxygenase  26.12 
 
 		 630 aa  50.4  0.00004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.735725 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3418  4-hydroxyphenylpyruvate dioxygenase  26.94 
 
 		 630 aa  49.7  0.00007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0242311  normal  0.14685 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1560  4-hydroxyphenylpyruvate dioxygenase  23.46 
 
 		 632 aa  49.7  0.00007  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.288895  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4701  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  27.59 
 
 		 290 aa  49.7  0.00007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3156  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  27.2 
 
 		 331 aa  49.7  0.00007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31360  sugar phosphate isomerase/epimerase  22.87 
 
 		 274 aa  49.3  0.00008  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0499  xylose isomerase domain-containing protein  30 
 
 		 304 aa  49.3  0.00008  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00421742  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3671  putative D-tagatose 3-epimerase  26.94 
 
 		 295 aa  48.9  0.00009  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.325979  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4299  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  23.53 
 
 		 275 aa  48.5  0.0001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.172805  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0943  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  26.09 
 
 		 291 aa  48.5  0.0001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1981  xylose isomerase domain-containing protein  20.62 
 
 		 287 aa  48.9  0.0001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2372  hypothetical protein  23.21 
 
 		 347 aa  48.9  0.0001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0241326  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4963  4-hydroxyphenylpyruvate dioxygenase  26.94 
 
 		 630 aa  48.9  0.0001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0115166 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2375  xylose isomerase-like TIM barrel  29.25 
 
 		 477 aa  48.5  0.0001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0500  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  27.2 
 
 		 266 aa  47.8  0.0002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.00000000106724  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4718  protein IolH  23.35 
 
 		 294 aa  47.8  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.745442  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2516  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  24.46 
 
 		 271 aa  47.8  0.0002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.610941  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0991  xylose isomerase domain-containing protein  22.45 
 
 		 304 aa  47.4  0.0003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3371  Hydroxypyruvate isomerase  24.62 
 
 		 256 aa  47  0.0004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.55933  normal  0.171039 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3493  iolH protein  22.92 
 
 		 286 aa  46.6  0.0005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.00667421  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0189  xylose isomerase domain-containing protein  24.75 
 
 		 293 aa  46.2  0.0006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.258985  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3406  xylose isomerase domain-containing protein  26.42 
 
 		 295 aa  46.2  0.0007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.784337 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1698  xylose isomerase domain-containing protein TIM barrel  22.22 
 
 		 268 aa  46.2  0.0007  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2059  4-hydroxyphenylpyruvate dioxygenase, putative  24.8 
 
 		 687 aa  46.2  0.0008  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0008  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  29.06 
 
 		 322 aa  46.2  0.0008  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3267  AP endonuclease  22.92 
 
 		 286 aa  45.8  0.0008  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4460  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  24.73 
 
 		 331 aa  45.4  0.001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4496  4-hydroxyphenylpyruvate dioxygenase  22.75 
 
 		 638 aa  45.4  0.001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.460677 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0826  xylose isomerase domain-containing protein  24.86 
 
 		 290 aa  45.4  0.001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS02058  hypothetical protein  23.95 
 
 		 626 aa  45.4  0.001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0224521  normal  0.842888 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0388  xylose isomerase domain-containing protein  26.22 
 
 		 290 aa  45.8  0.001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7610  hypothetical protein  23.58 
 
 		 376 aa  45.8  0.001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5791  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  26.42 
 
 		 286 aa  45.1  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.864508  normal  0.0412869 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0435  xylose isomerase domain-containing protein  21.22 
 
 		 266 aa  45.8  0.001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3511  AP endonuclease  27.2 
 
 		 328 aa  45.8  0.001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.17674 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1521  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  27.38 
 
 		 294 aa  44.7  0.002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3913  xylose isomerase domain-containing protein  26.23 
 
 		 617 aa  44.7  0.002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.974395  normal  1 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02478  4-hydroxyphenylpyruvate dioxygenase, putative (AFU_orthologue; AFUA_6G00240)  25.44 
 
 		 332 aa  44.3  0.003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0343  4-hydroxyphenylpyruvate dioxygenase  25.71 
 
 		 630 aa  44.3  0.003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.880013 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1980  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  25.9 
 
 		 291 aa  43.9  0.004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.401459  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1167  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  25.66 
 
 		 306 aa  43.5  0.004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.100222 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1980  xylose isomerase domain-containing protein  22.35 
 
 		 274 aa  43.5  0.005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0027  xylose isomerase domain-containing protein  26.83 
 
 		 268 aa  43.1  0.006  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  decreased coverage  0.0054119  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1810  xylose isomerase domain-containing protein  22.35 
 
 		 287 aa  43.1  0.006  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.753291 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5095  Xylose isomerase domain-containing protein TIM barrel  23.05 
 
 		 604 aa  43.1  0.006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0443788 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2792  xylose isomerase domain-containing protein  27.1 
 
 		 305 aa  42.7  0.007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1682  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  22.34 
 
 		 287 aa  42.7  0.007  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1081  4-hydroxyphenylpyruvate dioxygenase  22.8 
 
 		 628 aa  42.7  0.007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.796659  normal  0.416218 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1085  xylose isomerase domain-containing protein  21.95 
 
 		 305 aa  43.1  0.007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.230737 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0146  hexulose-6-phosphate isomerase  27.12 
 
 		 291 aa  42.7  0.008  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1361  xylose isomerase domain-containing protein  24.14 
 
 		 278 aa  42.4  0.009  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1079  Xylose isomerase domain-containing protein TIM barrel  23.73 
 
 		 266 aa  42.4  0.009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4050  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  22.75 
 
 		 284 aa  42.4  0.009  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  hitchhiker  0.00790933  normal  0.0910238 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0126  hexulose-6-phosphate isomerase  27.12 
 
 		 291 aa  42.4  0.01  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0797  xylose isomerase domain-containing protein  26.09 
 
 		 268 aa  42.4  0.01  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0606735  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>