47 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plim_0551 on replicon NC_014148
Organism: Planctomyces limnophilus DSM 3776



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014148  Plim_0551  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  100 
 
 		 322 aa  660    Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.784831  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4869  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  34.55 
 
 		 310 aa  183  4.0000000000000006e-45  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1021  protein of unknown function DUF1080  38.19 
 
 		 515 aa  164  2.0000000000000002e-39  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.943633  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1019  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  37.6 
 
 		 307 aa  163  3e-39  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1018  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  36.16 
 
 		 318 aa  160  3e-38  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.706274  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1020  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  36.1 
 
 		 334 aa  157  2e-37  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0895  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  30.8 
 
 		 281 aa  136  4e-31  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2598  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  29.73 
 
 		 316 aa  112  8.000000000000001e-24  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1349  xylose isomerase domain-containing protein  29.65 
 
 		 280 aa  108  1e-22  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1662  xylose isomerase domain-containing protein  27.88 
 
 		 274 aa  105  1e-21  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.36383  hitchhiker  0.00346458 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3402  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  26.25 
 
 		 324 aa  89  9e-17  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1044  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  26.75 
 
 		 305 aa  86.7  5e-16  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1743  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  28.25 
 
 		 309 aa  79.3  0.00000000000009  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0621  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  26.25 
 
 		 281 aa  78.2  0.0000000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2642  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  25.16 
 
 		 313 aa  76.6  0.0000000000005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0333  xylose isomerase-like TIM barrel  26.15 
 
 		 314 aa  75.5  0.000000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.601498  normal  0.557772 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31660  sugar phosphate isomerase/epimerase  24.73 
 
 		 297 aa  74.7  0.000000000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0469  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  30.63 
 
 		 307 aa  67  0.0000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0294161  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0534  hypothetical protein  24.9 
 
 		 318 aa  66.2  0.0000000007  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.434063 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1709  hypothetical protein  24.46 
 
 		 306 aa  65.9  0.0000000009  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.53026  normal  0.973713 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6459  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  26.6 
 
 		 343 aa  64.7  0.000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4673  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  23.87 
 
 		 341 aa  63.9  0.000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1009  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  30.19 
 
 		 308 aa  62.8  0.000000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0589  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  25.25 
 
 		 337 aa  63.2  0.000000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00102847 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0435  xylose isomerase domain-containing protein  22.9 
 
 		 266 aa  60.5  0.00000004  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2372  hypothetical protein  26.43 
 
 		 347 aa  57.8  0.0000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0241326  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1113  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  22.07 
 
 		 277 aa  57  0.0000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2200  xylose isomerase domain-containing protein  25.55 
 
 		 288 aa  56.2  0.0000007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3156  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  27.93 
 
 		 331 aa  50.1  0.00005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1525  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  23.17 
 
 		 306 aa  49.7  0.00007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1020  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  24.02 
 
 		 275 aa  47.4  0.0003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2516  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  25.15 
 
 		 271 aa  47.4  0.0003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.610941  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5791  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  24.89 
 
 		 286 aa  47  0.0004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.864508  normal  0.0412869 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29070  sugar phosphate isomerase/epimerase  23.44 
 
 		 288 aa  47  0.0005  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.92681  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2721  xylose isomerase domain-containing protein  31.2 
 
 		 280 aa  46.6  0.0006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.543869  normal  0.780906 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1909  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  28.88 
 
 		 280 aa  46.2  0.0007  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0509  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  25.45 
 
 		 289 aa  46.2  0.0008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.440598  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2976  xylose isomerase domain-containing protein  24.86 
 
 		 295 aa  45.8  0.001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1722  xylose isomerase-like TIM barrel  25.6 
 
 		 299 aa  45.8  0.001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.688264  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0115  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  25.65 
 
 		 293 aa  44.7  0.002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.221119 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31360  sugar phosphate isomerase/epimerase  25.7 
 
 		 274 aa  44.3  0.003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1674  xylose isomerase domain-containing protein  29.73 
 
 		 298 aa  43.5  0.005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6694  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  25.1 
 
 		 286 aa  43.5  0.005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.382585 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1406  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  21.89 
 
 		 292 aa  43.1  0.006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.179801  normal  0.416427 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1842  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  34.62 
 
 		 287 aa  42.7  0.007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4186  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  36.52 
 
 		 300 aa  42.7  0.007  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2693  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  25.81 
 
 		 279 aa  42.7  0.008  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>