17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Krad_2693 on replicon NC_009664
Organism: Kineococcus radiotolerans SRS30216



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009664  Krad_2693  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  100 
 
 		 279 aa  545  1e-154  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31360  sugar phosphate isomerase/epimerase  46.67 
 
 		 274 aa  187  2e-46  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6694  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  39.93 
 
 		 286 aa  182  4.0000000000000006e-45  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.382585 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5791  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  40.67 
 
 		 286 aa  182  5.0000000000000004e-45  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.864508  normal  0.0412869 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0469  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  27.88 
 
 		 307 aa  65.5  0.000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0294161  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1709  hypothetical protein  27.14 
 
 		 306 aa  61.2  0.00000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.53026  normal  0.973713 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1743  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  29.55 
 
 		 309 aa  59.7  0.00000006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1349  xylose isomerase domain-containing protein  26.25 
 
 		 280 aa  58.5  0.0000001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0589  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  25.98 
 
 		 337 aa  57.8  0.0000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00102847 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1009  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  25.66 
 
 		 308 aa  57.8  0.0000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2642  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  27.6 
 
 		 313 aa  56.6  0.0000004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1662  xylose isomerase domain-containing protein  22.87 
 
 		 274 aa  56.2  0.0000006  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.36383  hitchhiker  0.00346458 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4673  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  25.09 
 
 		 341 aa  53.1  0.000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6459  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  25.78 
 
 		 343 aa  52.4  0.000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4869  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  25.35 
 
 		 310 aa  44.3  0.002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0895  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  20.81 
 
 		 281 aa  43.5  0.003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0551  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  25.81 
 
 		 322 aa  43.5  0.003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.784831  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>