236 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oter_2976 on replicon NC_010571
Organism: Opitutus terrae PB90-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010571  Oter_2976  xylose isomerase domain-containing protein  100 
 
 		 295 aa  608  1e-173  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0423  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  49.32 
 
 		 287 aa  293  2e-78  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.985837  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3461  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  49.66 
 
 		 293 aa  291  8e-78  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0698  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  46.42 
 
 		 297 aa  284  1.0000000000000001e-75  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2364  xylose isomerase domain-containing protein  54.22 
 
 		 294 aa  282  6.000000000000001e-75  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.807591  normal  0.185458 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3652  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  47.78 
 
 		 293 aa  275  5e-73  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.449047  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1032  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  48.11 
 
 		 272 aa  265  8.999999999999999e-70  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0870608 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1033  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  46.67 
 
 		 285 aa  256  5e-67  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0514922 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1041  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  44.44 
 
 		 298 aa  240  2e-62  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2687  twin-arginine translocation pathway signal  45.14 
 
 		 301 aa  237  1e-61  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00433  Twin-arginine translocation pathway signal  45.14 
 
 		 309 aa  234  1.0000000000000001e-60  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1642  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  40.73 
 
 		 310 aa  221  9.999999999999999e-57  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.331171  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0431  xylose isomerase domain-containing protein  36.39 
 
 		 326 aa  187  2e-46  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2533  xylose isomerase domain-containing protein  38.84 
 
 		 259 aa  155  1e-36  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.685925  normal  0.744094 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4472  Hydroxypyruvate isomerase  39.47 
 
 		 250 aa  126  5e-28  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0435966  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3052  xylose isomerase domain-containing protein  33.05 
 
 		 256 aa  110  2.0000000000000002e-23  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.0431176 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4865  hydroxypyruvate isomerase Gcxl  29.24 
 
 		 260 aa  97.4  2e-19  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.798851  normal  0.469511 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2311  hydroxypyruvate isomerase  31.88 
 
 		 256 aa  95.9  8e-19  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.279204  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3623  hydroxypyruvate isomerase  31.08 
 
 		 260 aa  93.2  5e-18  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2770  hydroxypyruvate isomerase  31.47 
 
 		 265 aa  92.4  8e-18  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0252433  normal  0.732675 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1597  hydroxypyruvate isomerase  31.08 
 
 		 260 aa  92  1e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00143749  normal  0.674901 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1571  hydroxypyruvate isomerase  30.49 
 
 		 260 aa  92  1e-17  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.148654  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4298  hydroxypyruvate isomerase  30.18 
 
 		 260 aa  90.5  3e-17  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1855  hydroxypyruvate isomerase  35.33 
 
 		 260 aa  90.9  3e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2368  hydroxypyruvate isomerase  28.21 
 
 		 259 aa  90.5  3e-17  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.592212  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5294  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  40 
 
 		 265 aa  90.1  4e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.111966  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0462  hydroxypyruvate isomerase  35.36 
 
 		 261 aa  89.7  5e-17  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3955  hydroxypyruvate isomerase  30.42 
 
 		 259 aa  89.7  5e-17  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2086  hydroxypyruvate isomerase  33.19 
 
 		 269 aa  89  8e-17  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3863  hydroxypyruvate isomerase  30.18 
 
 		 260 aa  89  8e-17  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.531245  normal  0.545966 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2461  hydroxypyruvate isomerase  34.81 
 
 		 269 aa  88.6  1e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.731976  normal  0.599526 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_07150  hypothetical protein  30.36 
 
 		 265 aa  88.2  1e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0973  hydroxypyruvate isomerase  30.54 
 
 		 269 aa  87.8  2e-16  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2169  hydroxypyruvate isomerase  33.2 
 
 		 262 aa  87  4e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.196604  normal  0.222817 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0652  hypothetical protein  30.77 
 
 		 265 aa  87  4e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3449  xylose isomerase-like TIM barrel  29.18 
 
 		 271 aa  86.7  5e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04753  hydroxypyruvate isomerase  40.98 
 
 		 258 aa  86.7  5e-16  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4427  hydroxypyruvate isomerase  30.74 
 
 		 262 aa  86.3  5e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.198005  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0020  hypothetical protein  31.38 
 
 		 262 aa  86.3  6e-16  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.138735  normal  0.842888 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5927  Hydroxypyruvate isomerase  33.2 
 
 		 262 aa  85.9  7e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3741  hydroxypyruvate isomerase  27.06 
 
 		 259 aa  85.5  9e-16  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.476363  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2898  putative sugar isomerase (interconverting aldoses and ketoses)  29.86 
 
 		 250 aa  85.1  0.000000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.236626  normal  0.0851666 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3088  hydroxypyruvate isomerase  29.61 
 
 		 263 aa  85.1  0.000000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.645228  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0442  hydroxypyruvate isomerase  29.36 
 
 		 258 aa  84.3  0.000000000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2017  hydroxypyruvate isomerase  29.36 
 
 		 258 aa  84.7  0.000000000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.45932  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1924  hydroxypyruvate isomerase  29.36 
 
 		 258 aa  84.7  0.000000000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_43410  hydroxypyruvate isomerase  30.84 
 
 		 259 aa  84.3  0.000000000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1298  hydroxypyruvate isomerase  28.63 
 
 		 259 aa  84.3  0.000000000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3292  hydroxypyruvate isomerase  28.76 
 
 		 260 aa  84  0.000000000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.202186  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_45010  putative hydroxypyruvate isomerase  29.86 
 
 		 260 aa  83.6  0.000000000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.224213  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3575  xylose isomerase domain-containing protein  30.48 
 
 		 256 aa  84  0.000000000000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3457  Hydroxypyruvate isomerase  30.17 
 
 		 273 aa  84  0.000000000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.000196511  decreased coverage  0.00813341 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5064  hydroxypyruvate isomerase, putative  34.25 
 
 		 261 aa  83.6  0.000000000000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1781  hydroxypyruvate isomerase  33.54 
 
 		 269 aa  83.2  0.000000000000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.168778  normal  0.857209 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3317  xylose isomerase-like TIM barrel  28.09 
 
 		 257 aa  83.2  0.000000000000005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.695295  hitchhiker  0.00275233 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3479  hydroxypyruvate isomerase  28.45 
 
 		 260 aa  83.2  0.000000000000005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3736  Hydroxypyruvate isomerase  40.17 
 
 		 262 aa  83.2  0.000000000000005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2268  Hydroxypyruvate isomerase  28.45 
 
 		 281 aa  83.2  0.000000000000005  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.822354 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3830  hydroxypyruvate isomerase  30.13 
 
 		 260 aa  83.2  0.000000000000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1631  hydroxypyruvate isomerase  34.97 
 
 		 258 aa  82.4  0.000000000000007  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3413  Hydroxypyruvate isomerase  40.17 
 
 		 262 aa  82.4  0.000000000000008  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1423  hydroxypyruvate isomerase  39.64 
 
 		 260 aa  82  0.00000000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0831912  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1839  xylose isomerase-like TIM barrel  28.22 
 
 		 260 aa  82  0.00000000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0157456  normal  0.118454 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4554  hydroxypyruvate isomerase  31.28 
 
 		 258 aa  82  0.00000000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.695496  normal  0.368967 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1621  hydroxypyruvate isomerase  31.1 
 
 		 266 aa  82  0.00000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.377689  normal  0.533551 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3282  hydroxypyruvate isomerase protein  33.94 
 
 		 260 aa  81.6  0.00000000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.257483  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3048  hypothetical protein  31.73 
 
 		 262 aa  80.9  0.00000000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.127987  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0573  hydroxypyruvate isomerase  28.94 
 
 		 258 aa  81.6  0.00000000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2503  hydroxypyruvate isomerase  28.49 
 
 		 264 aa  81.3  0.00000000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3611  hydroxypyruvate isomerase  34.92 
 
 		 260 aa  81.3  0.00000000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.233278  normal  0.528482 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3152  hydroxypyruvate isomerase  28.45 
 
 		 260 aa  81.3  0.00000000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6200  hydroxypyruvate isomerase  33.14 
 
 		 269 aa  80.9  0.00000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0219655  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1788  hydroxypyruvate isomerase  33.14 
 
 		 269 aa  80.9  0.00000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1816  hydroxypyruvate isomerase  33.14 
 
 		 269 aa  80.9  0.00000000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1879  hydroxypyruvate isomerase  33.14 
 
 		 269 aa  80.9  0.00000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0860973  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0894  hydroxypyruvate isomerase  28.94 
 
 		 258 aa  81.6  0.00000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1861  hydroxypyruvate isomerase  28.94 
 
 		 258 aa  81.6  0.00000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5077  hydroxypyruvate isomerase  39.32 
 
 		 257 aa  80.9  0.00000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.814935  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2425  hydroxypyruvate isomerase  32.73 
 
 		 262 aa  80.5  0.00000000000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1902  hydroxypyruvate isomerase  33.14 
 
 		 269 aa  80.9  0.00000000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000606406 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_31430  Xylose isomerase-like TIM barrel protein, probably inolved in myo-inositol catabolism  37.86 
 
 		 262 aa  80.9  0.00000000000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.161007  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3113  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  30.05 
 
 		 256 aa  80.5  0.00000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.787534  normal  0.440249 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2260  hydroxypyruvate isomerase  32.73 
 
 		 262 aa  80.5  0.00000000000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.654587  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2300  hydroxypyruvate isomerase  32.73 
 
 		 262 aa  80.5  0.00000000000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.946761  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1301  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  36.17 
 
 		 256 aa  80.1  0.00000000000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00429624  normal  0.0206952 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2552  hydroxypyruvate isomerase  39.83 
 
 		 258 aa  80.1  0.00000000000004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0908348  hitchhiker  0.00501624 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0147  hydroxypyruvate isomerase, putative  29.96 
 
 		 261 aa  79.7  0.00000000000005  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.999741  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1567  hydroxypyruvate isomerase  33.54 
 
 		 258 aa  79.7  0.00000000000005  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0132  putative hydroxypyruvate isomerase  29.96 
 
 		 261 aa  79.7  0.00000000000005  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0211  hydroxypyruvate isomerase  36.97 
 
 		 258 aa  79.3  0.00000000000007  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5179  hydroxypyruvate isomerase  32.56 
 
 		 269 aa  78.6  0.0000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.265819  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4876  hydroxypyruvate isomerase  30.36 
 
 		 273 aa  78.6  0.0000000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.857442 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3181  hydroxypyruvate isomerase  27.63 
 
 		 262 aa  78.2  0.0000000000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.365148  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1953  Hydroxypyruvate isomerase  38.18 
 
 		 259 aa  78.2  0.0000000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.346217  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3496  hydroxypyruvate isomerase  29.82 
 
 		 258 aa  77.8  0.0000000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0849997  normal  0.283205 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0474  hydroxypyruvate isomerase  30.83 
 
 		 258 aa  78.2  0.0000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.166076  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2929  hydroxypyruvate isomerase  30.73 
 
 		 263 aa  77.8  0.0000000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.452433 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1395  hydroxypyruvate isomerase  32.73 
 
 		 269 aa  78.2  0.0000000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0279437  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0443  hydroxypyruvate isomerase  33.14 
 
 		 265 aa  77.4  0.0000000000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3371  Hydroxypyruvate isomerase  29.63 
 
 		 256 aa  77.4  0.0000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.55933  normal  0.171039 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>