65 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aaci_2516 on replicon NC_013205
Organism: Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013205  Aaci_2516  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  100 
 
 		 271 aa  547  1e-155  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.610941  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2628  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  31.52 
 
 		 289 aa  79.3  0.00000000000006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2298  xylose isomerase-like TIM barrel  32.81 
 
 		 296 aa  77.4  0.0000000000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1988  petrobactin biosynthesis protein AsbF  25.56 
 
 		 280 aa  69.7  0.00000000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1817  hypothetical protein  26.01 
 
 		 280 aa  68.6  0.00000000009  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2021  petrobactin biosynthesis protein AsbF  26.01 
 
 		 280 aa  68.6  0.00000000009  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.84806e-44 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3527  xylose isomerase domain-containing protein  27.34 
 
 		 291 aa  68.9  0.00000000009  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1843  hypothetical protein  26.01 
 
 		 280 aa  68.6  0.00000000009  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1986  hypothetical protein  26.01 
 
 		 280 aa  68.6  0.00000000009  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3341  petrobactin biosynthesis protein AsbF  25.19 
 
 		 280 aa  68.2  0.0000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.935338  hitchhiker  0.0000000000000165736 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1849  xylose isomerase domain-containing protein  25.66 
 
 		 280 aa  67.8  0.0000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.159061  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1800  hypothetical protein  26.01 
 
 		 280 aa  67  0.0000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4019  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  29.9 
 
 		 278 aa  63.5  0.000000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.72992  normal  0.677617 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3763  xylose isomerase domain-containing protein  28.72 
 
 		 278 aa  60.1  0.00000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.189394 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4058  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  28.72 
 
 		 278 aa  59.7  0.00000005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.939722  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1113  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  23.67 
 
 		 277 aa  59.3  0.00000007  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0621  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  24.14 
 
 		 281 aa  59.3  0.00000007  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0500  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  26.92 
 
 		 266 aa  59.3  0.00000007  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.00000000106724  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1537  xylose isomerase domain-containing protein  27.84 
 
 		 283 aa  58.9  0.00000008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.505536  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1807  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  24.31 
 
 		 277 aa  58.2  0.0000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0435  xylose isomerase domain-containing protein  26.17 
 
 		 266 aa  58.5  0.0000001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1971  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  24.43 
 
 		 265 aa  57  0.0000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1909  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  28.04 
 
 		 280 aa  56.2  0.0000005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1682  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  29.48 
 
 		 287 aa  55.8  0.0000007  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1349  xylose isomerase domain-containing protein  24.7 
 
 		 280 aa  55.1  0.000001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3314  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  30.06 
 
 		 279 aa  53.5  0.000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0346457 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0870  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  21.37 
 
 		 280 aa  49.7  0.00005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.505971  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2296  xylose isomerase domain-containing protein  29.93 
 
 		 284 aa  49.3  0.00007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.837995  normal  0.299582 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1021  protein of unknown function DUF1080  24.02 
 
 		 515 aa  49.3  0.00007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.943633  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_50050  2-keto-myo-inositol dehydratase  27.81 
 
 		 303 aa  48.9  0.00009  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.602375  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1254  xylose isomerase domain-containing protein  24.76 
 
 		 254 aa  48.5  0.0001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.258522  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3316  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  26.91 
 
 		 285 aa  47.8  0.0002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0367293 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2598  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  23.26 
 
 		 316 aa  47.4  0.0002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1019  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  24.46 
 
 		 307 aa  47.8  0.0002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0895  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  24.15 
 
 		 281 aa  48.1  0.0002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0551  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  25.15 
 
 		 322 aa  47.4  0.0002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.784831  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1662  xylose isomerase domain-containing protein  25 
 
 		 274 aa  47.8  0.0002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.36383  hitchhiker  0.00346458 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1722  xylose isomerase-like TIM barrel  28.99 
 
 		 299 aa  47.4  0.0003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.688264  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0499  xylose isomerase domain-containing protein  25.76 
 
 		 282 aa  47.4  0.0003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3955  xylose isomerase domain-containing protein  31.25 
 
 		 276 aa  47  0.0003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  decreased coverage  0.00177251  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0234  AMP-dependent synthetase and ligase  22.57 
 
 		 843 aa  47  0.0003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.0000591284  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3899  hydroxypyruvate isomerase  31.3 
 
 		 251 aa  46.2  0.0005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.194463  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1487  xylose isomerase domain-containing protein  25.88 
 
 		 271 aa  46.2  0.0006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0182  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  25.54 
 
 		 321 aa  45.4  0.0008  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000874694 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3402  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  21.76 
 
 		 324 aa  45.4  0.0009  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1912  xylose isomerase domain-containing protein  25.43 
 
 		 271 aa  45.1  0.001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.193983  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0779  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  23.68 
 
 		 276 aa  45.1  0.001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1525  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  25 
 
 		 306 aa  44.3  0.002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2200  xylose isomerase domain-containing protein  28.3 
 
 		 288 aa  44.3  0.002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3702  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  35.14 
 
 		 313 aa  44.7  0.002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.909161  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0622  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  28.79 
 
 		 308 aa  44.3  0.002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3869  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  27.1 
 
 		 274 aa  43.9  0.003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0966717  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0501  xylose isomerase domain-containing protein  26.16 
 
 		 301 aa  43.5  0.003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2326  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  25 
 
 		 284 aa  43.1  0.004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  decreased coverage  0.00147679  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_00560  sugar phosphate isomerase/epimerase  22.73 
 
 		 309 aa  43.5  0.004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  hitchhiker  0.00706398  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7610  hypothetical protein  28.4 
 
 		 376 aa  43.5  0.004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2255  myo-inositol catabolism protein  23.94 
 
 		 298 aa  42.7  0.005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0689  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  34.62 
 
 		 256 aa  43.1  0.005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.208396  normal  0.278119 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2968  AP endonuclease  25.35 
 
 		 306 aa  43.1  0.005  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0534  hypothetical protein  23.55 
 
 		 318 aa  43.1  0.005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.434063 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3040  xylose isomerase domain-containing protein  25.35 
 
 		 368 aa  42.7  0.006  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1869  AP endonuclease  25.35 
 
 		 350 aa  42.7  0.006  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.0234676 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7800  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  25.48 
 
 		 301 aa  42.7  0.007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4190  xylose isomerase-like TIM barrel  22.14 
 
 		 371 aa  42.4  0.009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.720259  hitchhiker  0.00898811 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1076  xylose isomerase domain-containing protein  19.21 
 
 		 308 aa  42  0.01  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>