129 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Arth_3955 on replicon NC_008541
Organism: Arthrobacter sp. FB24



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008541  Arth_3955  xylose isomerase domain-containing protein  100 
 
 		 276 aa  553  1e-156  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  decreased coverage  0.00177251  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0409  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  82.12 
 
 		 274 aa  419  1e-116  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2874  oxidoreductase domain protein  34.65 
 
 		 699 aa  113  4.0000000000000004e-24  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2966  oxidoreductase domain protein  33.86 
 
 		 699 aa  108  1e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5464  xylose isomerase domain-containing protein  27.84 
 
 		 279 aa  59.7  0.00000006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.448037  normal  0.953141 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5062  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  28.46 
 
 		 286 aa  58.9  0.00000009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1934  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  29.06 
 
 		 281 aa  56.2  0.0000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1324  putative myo-inositol catabolism LolE protein  35.35 
 
 		 308 aa  55.1  0.000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0781  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  25.8 
 
 		 282 aa  55.1  0.000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0043  xylose isomerase domain-containing protein  31.39 
 
 		 308 aa  55.1  0.000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1508  xylose isomerase-like TIM barrel  25.94 
 
 		 295 aa  54.3  0.000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.291962  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6321  xylose isomerase domain-containing protein  25.94 
 
 		 295 aa  54.3  0.000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3648  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  27.02 
 
 		 286 aa  53.9  0.000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.0394614 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3595  Myo-inosose-2 dehydratase  31.53 
 
 		 297 aa  53.5  0.000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5169  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  26.42 
 
 		 294 aa  53.9  0.000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.193202  normal  0.0119355 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1909  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  31.11 
 
 		 280 aa  53.1  0.000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1910  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  26.29 
 
 		 282 aa  53.1  0.000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6979  xylose isomerase domain-containing protein  25.6 
 
 		 295 aa  53.1  0.000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.363123  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01291  predicted enzyme  26.52 
 
 		 262 aa  52  0.00001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2332  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  26.52 
 
 		 262 aa  52  0.00001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.297697  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1429  AP endonuclease  26.52 
 
 		 262 aa  52  0.00001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1808  AP endonuclease  26.52 
 
 		 262 aa  52  0.00001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2811  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  27.01 
 
 		 305 aa  52  0.00001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.279544  normal  0.182339 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01302  hypothetical protein  26.52 
 
 		 262 aa  52  0.00001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3837  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  27.27 
 
 		 290 aa  51.6  0.00001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.746736  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1717  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  38.67 
 
 		 275 aa  52  0.00001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.393807 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1912  xylose isomerase domain-containing protein  29.27 
 
 		 271 aa  50.8  0.00002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.193983  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1524  AP endonuclease  26.52 
 
 		 262 aa  50.8  0.00002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4464  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  39.47 
 
 		 294 aa  50.8  0.00002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2524  xylose isomerase domain-containing protein  23.67 
 
 		 287 aa  50.4  0.00003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1959  AP endonuclease, family 2  26.26 
 
 		 262 aa  50.8  0.00003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0839995  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3436  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  22.09 
 
 		 288 aa  50.1  0.00004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6852  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  32.41 
 
 		 284 aa  50.1  0.00004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0571066  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3969  xylose isomerase domain-containing protein  28.8 
 
 		 290 aa  49.7  0.00005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0171269  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2311  xylose isomerase domain-containing protein  26.52 
 
 		 262 aa  49.7  0.00005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3285  xylose isomerase domain-containing protein  25.11 
 
 		 287 aa  49.7  0.00005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.515332 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2546  Hydroxypyruvate isomerase  41.25 
 
 		 265 aa  49.7  0.00006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0308483  normal  0.0587902 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5448  Myo-inosose-2 dehydratase  31.67 
 
 		 295 aa  49.7  0.00006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.10992  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1247  putative myo-inositol catabolism protein  28.32 
 
 		 313 aa  49.3  0.00007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.537579  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_50050  2-keto-myo-inositol dehydratase  30.83 
 
 		 303 aa  49.3  0.00007  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.602375  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_17470  sugar phosphate isomerase/epimerase  32.76 
 
 		 325 aa  49.3  0.00007  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.105049  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2054  xylose isomerase domain-containing protein  26.13 
 
 		 308 aa  48.9  0.00008  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1896  xylose isomerase domain-containing protein  27.96 
 
 		 341 aa  48.9  0.00009  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1886  xylose isomerase domain-containing protein  27.48 
 
 		 308 aa  48.1  0.0001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.206917 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1348  xylose isomerase domain-containing protein  28.97 
 
 		 308 aa  48.5  0.0001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1602  xylose isomerase domain-containing protein  34.38 
 
 		 306 aa  48.1  0.0001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.334485  normal  1 
 
 
-
 
NC_007488  RSP_3944  AP endonuclease  27.71 
 
 		 285 aa  47.8  0.0002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0718494  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0779  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  24.62 
 
 		 276 aa  47.4  0.0002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0435  xylose isomerase domain-containing protein  31.43 
 
 		 266 aa  47.8  0.0002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0980  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  28.74 
 
 		 305 aa  47.8  0.0002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1174  hydroxypyruvate isomerase  25.79 
 
 		 262 aa  48.1  0.0002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.970176  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0086  myo-inositol catabolism protein IolE  27.78 
 
 		 297 aa  47  0.0003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2188  xylose isomerase domain-containing protein  26.52 
 
 		 290 aa  47  0.0003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.686752  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2516  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  31.25 
 
 		 271 aa  47.4  0.0003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.610941  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1133  Myo-inosose-2 dehydratase  28.74 
 
 		 305 aa  47  0.0003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.459716  normal  0.18483 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1924  Hydroxypyruvate isomerase  27.92 
 
 		 280 aa  47  0.0004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.00000000334865  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0666  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  25.13 
 
 		 264 aa  46.6  0.0004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.539887 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2835  xylose isomerase domain-containing protein  29.8 
 
 		 310 aa  47  0.0004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.840707  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0911  hypothetical protein  31.68 
 
 		 306 aa  46.6  0.0005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2649  hypothetical protein  32.67 
 
 		 306 aa  46.6  0.0005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0432409  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3410  xylose isomerase domain-containing protein  36.84 
 
 		 272 aa  46.6  0.0005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.498178  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0658  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  35.87 
 
 		 280 aa  46.6  0.0005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1309  xylose isomerase domain-containing protein  28.28 
 
 		 308 aa  46.6  0.0005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1442  AP endonuclease  31.68 
 
 		 306 aa  46.6  0.0005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.609184  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0438  hypothetical protein  31.68 
 
 		 306 aa  46.6  0.0005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1653  AP endonuclease  31.68 
 
 		 306 aa  46.6  0.0005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.959785  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0724  AP endonuclease  31.68 
 
 		 306 aa  46.6  0.0005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.367793  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5021  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  22.47 
 
 		 297 aa  46.6  0.0005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.672095  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1346  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  25.38 
 
 		 301 aa  46.2  0.0005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1807  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  25.25 
 
 		 277 aa  46.2  0.0005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2531  putative IolE protein  28 
 
 		 298 aa  46.2  0.0006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.32551e-17 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0340  xylose isomerase domain-containing protein  39.19 
 
 		 302 aa  45.8  0.0007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3869  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  34.02 
 
 		 274 aa  45.8  0.0007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0966717  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0500  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  22.92 
 
 		 266 aa  45.8  0.0007  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.00000000106724  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0947  xylose isomerase-like TIM barrel  28.28 
 
 		 308 aa  45.8  0.0008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.348697  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1429  xylose isomerase domain-containing protein  28.28 
 
 		 308 aa  45.8  0.0008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1980  xylose isomerase domain-containing protein  23.85 
 
 		 274 aa  45.8  0.0008  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2160  xylose isomerase domain-containing protein  25 
 
 		 262 aa  45.8  0.0008  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.26775 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0155  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  29.57 
 
 		 332 aa  45.4  0.0009  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1079  Xylose isomerase domain-containing protein TIM barrel  29.01 
 
 		 266 aa  45.4  0.0009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1362  Myo-inosose-2 dehydratase  30.19 
 
 		 294 aa  45.1  0.001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1829  hypothetical protein  30.77 
 
 		 306 aa  45.1  0.001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0766527  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1675  AP endonuclease  30.77 
 
 		 306 aa  45.1  0.001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.173299  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1892  xylose isomerase domain-containing protein  32.18 
 
 		 304 aa  45.1  0.001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0241791  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1893  xylose isomerase domain-containing protein  32.18 
 
 		 304 aa  45.1  0.001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0559869  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1407  xylose isomerase domain-containing protein  27.59 
 
 		 308 aa  44.7  0.001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.872133 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1735  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  23.6 
 
 		 286 aa  45.1  0.001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.340783  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4567  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  26.75 
 
 		 317 aa  45.4  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.181708  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1971  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  23.1 
 
 		 265 aa  45.1  0.001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6358  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  30.34 
 
 		 316 aa  45.1  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3653  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  25.64 
 
 		 292 aa  45.4  0.001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.142923  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3079  Myo-inosose-2 dehydratase  28.3 
 
 		 287 aa  44.7  0.002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.977094  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2299  myo-inositol catabolism protein  27.43 
 
 		 298 aa  44.3  0.002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2255  myo-inositol catabolism protein  27.43 
 
 		 298 aa  44.7  0.002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3273  AP endonuclease  30.21 
 
 		 301 aa  44.3  0.002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0853475  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3346  xylose isomerase-like TIM barrel  29.13 
 
 		 297 aa  44.7  0.002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0217845  normal  0.180586 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4609  xylose isomerase domain-containing protein  33.33 
 
 		 351 aa  44.3  0.002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0474989 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4328  xylose isomerase domain-containing protein  31.2 
 
 		 352 aa  44.7  0.002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.462116 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00428  Twin-arginine translocation pathway signal  22.89 
 
 		 334 aa  44.7  0.002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_50250  hypothetical protein  29.55 
 
 		 307 aa  44.7  0.002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.508803  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>