194 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cwoe_5448 on replicon NC_013739
Organism: Conexibacter woesei DSM 14684



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013739  Cwoe_5448  Myo-inosose-2 dehydratase  100 
 
 
295 aa  568  1e-161  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.10992  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4487  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  56.75 
 
 
289 aa  299  3e-80  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.411638  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3969  xylose isomerase domain-containing protein  56.74 
 
 
290 aa  298  6e-80  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0171269  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2612  xylose isomerase domain-containing protein  55.17 
 
 
294 aa  298  1e-79  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3079  Myo-inosose-2 dehydratase  56.99 
 
 
287 aa  291  9e-78  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.977094  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3352  Myo-inosose-2 dehydratase  51.92 
 
 
296 aa  290  3e-77  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0467219  normal  0.0568196 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5562  Myo-inosose-2 dehydratase  57.39 
 
 
281 aa  286  4e-76  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1362  Myo-inosose-2 dehydratase  53.29 
 
 
294 aa  272  5.000000000000001e-72  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3595  Myo-inosose-2 dehydratase  51.76 
 
 
297 aa  270  2e-71  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8495  Myo-inosose-2 dehydratase  54.04 
 
 
311 aa  269  4e-71  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.795487 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1722  xylose isomerase-like TIM barrel  49.66 
 
 
299 aa  261  1e-68  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.688264  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6852  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  55.88 
 
 
284 aa  239  5.999999999999999e-62  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0571066  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1521  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  30.87 
 
 
294 aa  145  1e-33  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1816  xylose isomerase domain-containing protein  33 
 
 
304 aa  135  8e-31  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.670883 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1981  Myo-inosose-2 dehydratase  33.7 
 
 
301 aa  125  6e-28  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.162742  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0657  Myo-inosose-2 dehydratase  34.57 
 
 
303 aa  125  1e-27  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.700284  normal 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3346  xylose isomerase-like TIM barrel  30.56 
 
 
297 aa  122  5e-27  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0217845  normal  0.180586 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7455  hypothetical protein  31.77 
 
 
292 aa  122  7e-27  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.652021  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4013  Myo-inosose-2 dehydratase  28.27 
 
 
297 aa  122  8e-27  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0386  xylose isomerase domain-containing protein  32.98 
 
 
306 aa  122  9.999999999999999e-27  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2054  xylose isomerase domain-containing protein  31.49 
 
 
308 aa  121  9.999999999999999e-27  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1271  xylose isomerase domain protein TIM barrel  32.78 
 
 
298 aa  121  1.9999999999999998e-26  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.713181 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3333  Myo-inosose-2 dehydratase  29.53 
 
 
296 aa  120  3e-26  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1596  xylose isomerase domain-containing protein  30.1 
 
 
310 aa  119  3.9999999999999996e-26  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0086  myo-inositol catabolism protein IolE  27.27 
 
 
297 aa  118  9.999999999999999e-26  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_4017  xylose isomerase domain-containing protein  30.45 
 
 
302 aa  117  3e-25  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0303  myo-inositol catabolism protein  26.24 
 
 
298 aa  116  5e-25  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1048  Myo-inosose-2 dehydratase  30.91 
 
 
307 aa  116  5e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.513171  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_50050  2-keto-myo-inositol dehydratase  28.81 
 
 
303 aa  115  6e-25  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.602375  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3018  hypothetical protein  28.89 
 
 
307 aa  115  8.999999999999998e-25  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.130345  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1422  xylose isomerase-like  29.04 
 
 
297 aa  115  8.999999999999998e-25  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0452084  normal  0.457038 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2531  putative IolE protein  25.53 
 
 
298 aa  115  8.999999999999998e-25  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.32551e-17 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3839  xylose isomerase domain-containing protein  28.42 
 
 
300 aa  115  8.999999999999998e-25  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3285  sugar phosphate isomerase/epimerase, IolE  30.8 
 
 
302 aa  115  1.0000000000000001e-24  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1342  Myo-inosose-2 dehydratase  29.64 
 
 
296 aa  114  2.0000000000000002e-24  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.606088  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2968  AP endonuclease  29.93 
 
 
306 aa  114  3e-24  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4706  inosose dehydratase  26.33 
 
 
301 aa  113  3e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000727756  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1869  AP endonuclease  30.72 
 
 
350 aa  113  4.0000000000000004e-24  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.0234676 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0078  hypothetical protein  28.32 
 
 
300 aa  113  4.0000000000000004e-24  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3273  AP endonuclease  29.05 
 
 
301 aa  113  5e-24  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0853475  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3040  xylose isomerase domain-containing protein  30.72 
 
 
368 aa  112  5e-24  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2299  myo-inositol catabolism protein  25.53 
 
 
298 aa  111  1.0000000000000001e-23  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0671  hypothetical protein  27.34 
 
 
300 aa  111  1.0000000000000001e-23  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0715  hypothetical protein  26.98 
 
 
300 aa  110  2.0000000000000002e-23  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0911  hypothetical protein  31.06 
 
 
306 aa  110  2.0000000000000002e-23  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2995  Myo-inosose-2 dehydratase  28.57 
 
 
296 aa  110  2.0000000000000002e-23  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1442  AP endonuclease  31.06 
 
 
306 aa  110  2.0000000000000002e-23  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.609184  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0438  hypothetical protein  31.06 
 
 
306 aa  110  2.0000000000000002e-23  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1653  AP endonuclease  31.06 
 
 
306 aa  110  2.0000000000000002e-23  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.959785  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0724  AP endonuclease  31.06 
 
 
306 aa  110  2.0000000000000002e-23  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.367793  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1247  putative myo-inositol catabolism protein  29.81 
 
 
313 aa  110  3e-23  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.537579  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1407  xylose isomerase domain-containing protein  30.79 
 
 
308 aa  110  3e-23  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.872133 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4055  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  31.19 
 
 
297 aa  109  4.0000000000000004e-23  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0947  xylose isomerase-like TIM barrel  30.48 
 
 
308 aa  109  5e-23  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.348697  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1429  xylose isomerase domain-containing protein  30.48 
 
 
308 aa  109  5e-23  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4656  xylose isomerase domain-containing protein  27.05 
 
 
298 aa  109  5e-23  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.335563 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1829  hypothetical protein  31.06 
 
 
306 aa  108  7.000000000000001e-23  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0766527  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1675  AP endonuclease  31.06 
 
 
306 aa  108  7.000000000000001e-23  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.173299  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2255  myo-inositol catabolism protein  25.18 
 
 
298 aa  108  8.000000000000001e-23  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3499  iolE protein  28.04 
 
 
301 aa  108  1e-22  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_50250  hypothetical protein  30.89 
 
 
307 aa  108  1e-22  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.508803  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5694  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  27.52 
 
 
300 aa  108  2e-22  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.986609  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4573  xylose isomerase-like TIM barrel  30.16 
 
 
308 aa  107  3e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2649  hypothetical protein  30.68 
 
 
306 aa  107  3e-22  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0432409  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1309  xylose isomerase domain-containing protein  29.78 
 
 
308 aa  107  3e-22  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1324  putative myo-inositol catabolism LolE protein  31.06 
 
 
308 aa  106  4e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2746  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  31.6 
 
 
330 aa  107  4e-22  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.717662  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1348  xylose isomerase domain-containing protein  29.78 
 
 
308 aa  106  6e-22  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4213  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  33.71 
 
 
340 aa  104  2e-21  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0730  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  29.93 
 
 
295 aa  104  2e-21  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.200556  normal 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7800  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  28.52 
 
 
301 aa  104  2e-21  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1886  xylose isomerase domain-containing protein  29.84 
 
 
308 aa  104  2e-21  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.206917 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2414  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  29.53 
 
 
924 aa  103  3e-21  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4190  xylose isomerase-like TIM barrel  25.91 
 
 
371 aa  102  6e-21  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.720259  hitchhiker  0.00898811 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1615  hypothetical protein  26.26 
 
 
298 aa  102  7e-21  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1696  Myo-inosose-2 dehydratase  27.51 
 
 
308 aa  101  1e-20  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0486  putative myo-inositol catabolism protein  26.44 
 
 
297 aa  101  1e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.425956  normal  0.198393 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0824  xylose isomerase domain-containing protein  28.15 
 
 
303 aa  100  3e-20  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1620  hypothetical protein  25.93 
 
 
298 aa  100  4e-20  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0043  xylose isomerase domain-containing protein  30.1 
 
 
308 aa  100  4e-20  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1577  myo-inositol catabolism protein  25.25 
 
 
298 aa  99.4  6e-20  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.357804  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0941  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  27.61 
 
 
303 aa  98.2  2e-19  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2811  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  29.17 
 
 
305 aa  97.8  2e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.279544  normal  0.182339 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1602  xylose isomerase domain-containing protein  27.36 
 
 
306 aa  96.7  4e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.334485  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2336  hypothetical protein  26.83 
 
 
237 aa  94.7  1e-18  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2325  xylose isomerase domain-containing protein  30.77 
 
 
303 aa  95.1  1e-18  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5989  xylose isomerase domain-containing protein  26.89 
 
 
312 aa  94.7  1e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.63499  normal  0.171061 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1674  xylose isomerase domain-containing protein  27.96 
 
 
298 aa  93.2  4e-18  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3560  xylose isomerase domain-containing protein  26.49 
 
 
300 aa  93.2  4e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.27811 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2835  xylose isomerase domain-containing protein  28.07 
 
 
310 aa  93.2  5e-18  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.840707  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1912  xylose isomerase domain-containing protein  30.88 
 
 
271 aa  92.8  6e-18  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.193983  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0939  xylose isomerase-like TIM barrel  27.21 
 
 
309 aa  92.4  8e-18  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.00907131  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1421  xylose isomerase domain-containing protein  27.21 
 
 
309 aa  92.4  8e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1238  putative myo-inositol catabolism protein  27.42 
 
 
309 aa  91.7  1e-17  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4565  xylose isomerase-like TIM barrel  27.45 
 
 
309 aa  92  1e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0833957  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1399  xylose isomerase domain-containing protein  26.89 
 
 
309 aa  91.3  2e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2932  xylose isomerase domain-containing protein  27.74 
 
 
308 aa  90.9  3e-17  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.688703 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2490  xylose isomerase domain-containing protein  31.22 
 
 
303 aa  89.4  6e-17  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.279776  normal  0.973607 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1894  xylose isomerase domain-containing protein  27.21 
 
 
309 aa  89  8e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.21993 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1340  xylose isomerase domain-containing protein  26.89 
 
 
309 aa  88.6  1e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>