More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gdia_2414 on replicon NC_011365
Organism: Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011365  Gdia_2414  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  100 
 
 		 924 aa  1858    Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0981  thiamine pyrophosphate protein central region  61.95 
 
 		 616 aa  521  1e-146  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1134  thiamine pyrophosphate protein central region  61.68 
 
 		 616 aa  521  1e-146  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.474291 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3561  thiamine pyrophosphate protein central region  63.47 
 
 		 622 aa  519  1.0000000000000001e-145  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.238424 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0077  acetolactate synthase  58.74 
 
 		 607 aa  488  1e-136  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0714  TPP-requiring enzyme IolD  57.21 
 
 		 607 aa  478  1e-133  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.83955  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0670  TPP-requiring enzyme IolD  57.21 
 
 		 607 aa  478  1e-133  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3838  thiamine pyrophosphate protein central region  57.63 
 
 		 607 aa  475  1e-132  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7802  thiamine pyrophosphate protein central region  56.67 
 
 		 612 aa  466  9.999999999999999e-131  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.821593  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2314  thiamine pyrophosphate enzyme, central region  58.6 
 
 		 612 aa  464  1e-129  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.284269  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1675  thiamine pyrophosphate binding domain-containing protein  57.98 
 
 		 609 aa  462  9.999999999999999e-129  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.915417 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2648  iolD protein  58 
 
 		 667 aa  446  1.0000000000000001e-124  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.190604  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1595  thiamine pyrophosphate protein central region  54.97 
 
 		 620 aa  447  1.0000000000000001e-124  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0912  iolD protein  58.35 
 
 		 661 aa  444  1e-123  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1601  thiamine pyrophosphate protein central region  55.87 
 
 		 649 aa  446  1e-123  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.392192  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1830  iolD protein  58.35 
 
 		 661 aa  444  1e-123  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.301996  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0437  iolD protein  58.35 
 
 		 646 aa  444  1e-123  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1654  iolD protein  58.35 
 
 		 646 aa  445  1e-123  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.72162  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0725  iolD protein  58.35 
 
 		 646 aa  444  1e-123  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.165076  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1676  iolD protein  58.35 
 
 		 646 aa  443  1e-123  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.479049  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1443  iolD protein  58.35 
 
 		 646 aa  444  1e-123  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3284  acetolactate synthase  55.53 
 
 		 614 aa  434  1e-120  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.787406  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0487  putative malonic semialdehyde oxidative decarboxylase  53.78 
 
 		 610 aa  434  1e-120  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.853743  normal  0.367436 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_4016  thiamine pyrophosphate enzyme, central region  55.29 
 
 		 614 aa  431  1e-119  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3315  thiamine pyrophosphate protein central region  55.84 
 
 		 618 aa  429  1e-119  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2810  thiamine pyrophosphate protein central region  55.04 
 
 		 657 aa  422  1e-116  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.595591  normal  0.165764 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1325  putative myo-inositol catabolism LolD protein  54.8 
 
 		 659 aa  421  1e-116  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1341  thiamine pyrophosphate protein central region  54.84 
 
 		 627 aa  419  9.999999999999999e-116  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1718  thiamine pyrophosphate enzyme, central region  52.69 
 
 		 626 aa  419  9.999999999999999e-116  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1239  putative acetolactate synthase protein  53.69 
 
 		 627 aa  414  1e-114  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4566  acetolactate synthase  55.25 
 
 		 636 aa  410  1e-113  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.958598  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1400  thiamine pyrophosphate protein central region  55.02 
 
 		 627 aa  407  1.0000000000000001e-112  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0066  thiamine pyrophosphate binding domain-containing protein  54.04 
 
 		 627 aa  407  1.0000000000000001e-112  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.354472  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2834  thiamine pyrophosphate protein central region  49.88 
 
 		 613 aa  403  1e-111  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0940  thiamine pyrophosphate enzyme-like TPP-binding  55.3 
 
 		 627 aa  405  1e-111  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0172702  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1302  thiamine pyrophosphate binding domain-containing protein  55.07 
 
 		 627 aa  405  1e-111  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1422  thiamine pyrophosphate binding domain-containing protein  55.3 
 
 		 627 aa  405  1e-111  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2931  thiamine pyrophosphate protein central region  52.89 
 
 		 627 aa  402  9.999999999999999e-111  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.224802 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1893  thiamine pyrophosphate protein central region  55.2 
 
 		 638 aa  401  9.999999999999999e-111  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.259574 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3002  thiamine pyrophosphate protein domain protein TPP-binding protein  54.38 
 
 		 643 aa  389  1e-107  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3495  iolD protein  47.77 
 
 		 645 aa  390  1e-107  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0154384  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1621  hypothetical protein  48.35 
 
 		 623 aa  388  1e-106  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1616  hypothetical protein  48.58 
 
 		 623 aa  389  1e-106  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3269  pyruvate decarboxylase:pyruvate decarboxylase  46.36 
 
 		 645 aa  387  1e-106  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.149274  normal  0.620007 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3608  thiamine pyrophosphate protein central region  48.97 
 
 		 669 aa  388  1e-106  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.908775  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3121  thiamine pyrophosphate protein central region  51.17 
 
 		 652 aa  386  1e-105  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1524  thiamine pyrophosphate protein central region  49.65 
 
 		 623 aa  385  1e-105  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0659  thiamine pyrophosphate protein central region  51.05 
 
 		 623 aa  381  1e-104  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.101601  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1335  thiamine pyrophosphate protein domain protein TPP-binding  54.64 
 
 		 643 aa  382  1e-104  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1695  thiamine pyrophosphate protein central region  50.58 
 
 		 624 aa  378  1e-103  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2335  iolD protein  48.28 
 
 		 644 aa  379  1e-103  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.646914  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2298  malonic semialdehyde oxidative decarboxylase  48.28 
 
 		 644 aa  379  1e-103  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2745  thiamine pyrophosphate protein central region  50.23 
 
 		 649 aa  378  1e-103  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2530  putative iolD protein  48.28 
 
 		 644 aa  379  1e-103  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000612889 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2599  thiamine pyrophosphate enzyme, central region  48.62 
 
 		 649 aa  378  1e-103  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.443683  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2976  thiamine pyrophosphate-dependent enzyme  54.31 
 
 		 648 aa  378  1e-103  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2514  acetolactate synthase IolD  48.28 
 
 		 644 aa  379  1e-103  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.868451  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1876  thiamine pyrophosphate-dependent enzyme  54.31 
 
 		 648 aa  378  1e-103  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00662616 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3048  thiamine pyrophosphate binding domain-containing protein  54.91 
 
 		 648 aa  378  1e-103  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2254  myo-inositol catabolism protein, malonic semialdehyde oxidative decarboxylase  48.28 
 
 		 644 aa  376  1e-102  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5695  thiamine pyrophosphate protein central region  46.35 
 
 		 621 aa  375  1e-102  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.728148 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0302  myo-inositol catabolism protein  48.54 
 
 		 644 aa  375  1e-102  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0084  myo-inositol catabolism protein IolD  43.24 
 
 		 639 aa  375  1e-102  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_50100  myo-inositol catabolism protein IolD  48.1 
 
 		 645 aa  370  1e-101  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.443282  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1578  myo-inositol catabolism protein  43.91 
 
 		 645 aa  370  1e-101  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.505237  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1800  thiamine pyrophosphate binding domain-containing protein  49.77 
 
 		 626 aa  372  1e-101  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.749934 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4491  thiamine pyrophosphate protein central region  52.21 
 
 		 637 aa  368  1e-100  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0431429  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4714  probable malonic semialdehyde oxidative decarboxylase  49.74 
 
 		 646 aa  369  1e-100  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.163823  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3075  thiamine pyrophosphate protein central region  55.41 
 
 		 623 aa  367  1e-100  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.433048  normal  0.875201 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4539  thiamine pyrophosphate protein central region  47.56 
 
 		 637 aa  365  2e-99  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.366125  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4019  thiamine pyrophosphate binding domain-containing protein  49.08 
 
 		 649 aa  363  8e-99  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.14756 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6846  thiamine pyrophosphate protein central region  51.37 
 
 		 616 aa  362  2e-98  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.243842  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0728  thiamine pyrophosphate protein central region  48.99 
 
 		 645 aa  361  3e-98  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.244688  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5566  thiamine pyrophosphate binding domain-containing protein  49.07 
 
 		 612 aa  359  9.999999999999999e-98  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1269  thiamine pyrophosphate protein central region  49.41 
 
 		 621 aa  359  9.999999999999999e-98  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.710125 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4056  thiamine pyrophosphate protein central region  50.23 
 
 		 643 aa  356  8.999999999999999e-97  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0138  thiamine pyrophosphate protein central region  46.1 
 
 		 653 aa  355  2e-96  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4015  thiamine pyrophosphate protein central region  47.75 
 
 		 638 aa  354  4e-96  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3342  thiamine pyrophosphate protein domain protein TPP-binding  46.4 
 
 		 643 aa  353  7e-96  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.621165  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4659  thiamine pyrophosphate protein central region  46.21 
 
 		 646 aa  353  1e-95  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3348  thiamine pyrophosphate enzyme, central region  47.41 
 
 		 622 aa  352  2e-95  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0194169  normal  0.142166 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1420  thiamine pyrophosphate enzyme protein  48.82 
 
 		 623 aa  349  1e-94  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.406796  normal  0.238501 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0939  thiamine pyrophosphate protein central region  47.03 
 
 		 660 aa  347  4e-94  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5446  thiamine pyrophosphate protein central region  47.09 
 
 		 664 aa  340  5.9999999999999996e-92  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.432939  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0822  thiamine pyrophosphate binding domain-containing protein  46.91 
 
 		 654 aa  338  2.9999999999999997e-91  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.837061  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1596  xylose isomerase domain-containing protein  52.54 
 
 		 310 aa  330  6e-89  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1369  thiamine pyrophosphate protein central region  47.97 
 
 		 644 aa  327  6e-88  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3333  Myo-inosose-2 dehydratase  51.69 
 
 		 296 aa  322  1.9999999999999998e-86  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0043  xylose isomerase domain-containing protein  52.54 
 
 		 308 aa  316  9.999999999999999e-85  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4209  thiamine pyrophosphate protein central region  49.19 
 
 		 624 aa  310  6.999999999999999e-83  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.423105  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2995  Myo-inosose-2 dehydratase  50.34 
 
 		 296 aa  308  2.0000000000000002e-82  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1342  Myo-inosose-2 dehydratase  50.34 
 
 		 296 aa  308  4.0000000000000004e-82  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.606088  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3040  xylose isomerase domain-containing protein  50.17 
 
 		 368 aa  305  3.0000000000000004e-81  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1869  AP endonuclease  50.17 
 
 		 350 aa  305  4.0000000000000003e-81  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.0234676 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2968  AP endonuclease  50.17 
 
 		 306 aa  303  1e-80  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1238  putative myo-inositol catabolism protein  48.69 
 
 		 309 aa  280  1e-73  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4213  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  52.26 
 
 		 340 aa  279  2e-73  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2932  xylose isomerase domain-containing protein  50.17 
 
 		 308 aa  276  1.0000000000000001e-72  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.688703 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1324  putative myo-inositol catabolism LolE protein  47.64 
 
 		 308 aa  274  6e-72  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0067  xylose isomerase domain-containing protein  50 
 
 		 318 aa  272  2e-71  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0290166  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>