186 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bmul_1894 on replicon NC_010084
Organism: Burkholderia multivorans ATCC 17616



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010084  Bmul_1894  xylose isomerase domain-containing protein  100 
 
 
309 aa  637    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.21993 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1399  xylose isomerase domain-containing protein  97.41 
 
 
309 aa  622  1e-177  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4565  xylose isomerase-like TIM barrel  96.76 
 
 
309 aa  618  1e-176  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0833957  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0939  xylose isomerase-like TIM barrel  96.76 
 
 
309 aa  619  1e-176  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.00907131  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1421  xylose isomerase domain-containing protein  96.76 
 
 
309 aa  619  1e-176  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1340  xylose isomerase domain-containing protein  96.12 
 
 
309 aa  615  1e-175  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1301  xylose isomerase domain-containing protein  95.47 
 
 
309 aa  613  9.999999999999999e-175  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1238  putative myo-inositol catabolism protein  87.06 
 
 
309 aa  569  1e-161  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3316  xylose isomerase domain-containing protein  82.85 
 
 
309 aa  542  1e-153  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0067  xylose isomerase domain-containing protein  80.19 
 
 
318 aa  524  1e-148  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0290166  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2932  xylose isomerase domain-containing protein  78.96 
 
 
308 aa  521  1e-147  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.688703 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0911  hypothetical protein  63.58 
 
 
306 aa  365  1e-100  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1442  AP endonuclease  63.58 
 
 
306 aa  365  1e-100  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.609184  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0438  hypothetical protein  63.58 
 
 
306 aa  365  1e-100  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1653  AP endonuclease  63.58 
 
 
306 aa  365  1e-100  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.959785  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0724  AP endonuclease  63.58 
 
 
306 aa  365  1e-100  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.367793  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2649  hypothetical protein  62.91 
 
 
306 aa  363  3e-99  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0432409  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1829  hypothetical protein  63.25 
 
 
306 aa  362  4e-99  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0766527  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1675  AP endonuclease  63.25 
 
 
306 aa  362  4e-99  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.173299  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1324  putative myo-inositol catabolism LolE protein  59.87 
 
 
308 aa  355  5e-97  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2811  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  59.54 
 
 
305 aa  351  8e-96  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.279544  normal  0.182339 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_50050  2-keto-myo-inositol dehydratase  57.24 
 
 
303 aa  343  2.9999999999999997e-93  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.602375  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1602  xylose isomerase domain-containing protein  57.89 
 
 
306 aa  341  7e-93  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.334485  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3499  iolE protein  57.81 
 
 
301 aa  335  5.999999999999999e-91  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3273  AP endonuclease  57.14 
 
 
301 aa  328  7e-89  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0853475  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3333  Myo-inosose-2 dehydratase  49.33 
 
 
296 aa  282  4.0000000000000003e-75  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3040  xylose isomerase domain-containing protein  50.34 
 
 
368 aa  278  9e-74  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1869  AP endonuclease  50.34 
 
 
350 aa  278  1e-73  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.0234676 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2968  AP endonuclease  50.34 
 
 
306 aa  276  2e-73  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1342  Myo-inosose-2 dehydratase  48.84 
 
 
296 aa  276  3e-73  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.606088  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2995  Myo-inosose-2 dehydratase  48.18 
 
 
296 aa  273  2.0000000000000002e-72  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1596  xylose isomerase domain-containing protein  46.36 
 
 
310 aa  272  4.0000000000000004e-72  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2414  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  46.33 
 
 
924 aa  262  4.999999999999999e-69  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0043  xylose isomerase domain-containing protein  45.87 
 
 
308 aa  257  2e-67  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2835  xylose isomerase domain-containing protein  45.85 
 
 
310 aa  256  2e-67  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.840707  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4213  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  44.85 
 
 
340 aa  248  8e-65  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1674  xylose isomerase domain-containing protein  44.85 
 
 
298 aa  245  6.999999999999999e-64  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2325  xylose isomerase domain-containing protein  45.45 
 
 
303 aa  242  5e-63  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4013  Myo-inosose-2 dehydratase  40.73 
 
 
297 aa  241  9e-63  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0086  myo-inositol catabolism protein IolE  40.6 
 
 
297 aa  230  2e-59  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0486  putative myo-inositol catabolism protein  41.06 
 
 
297 aa  229  5e-59  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.425956  normal  0.198393 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2299  myo-inositol catabolism protein  38.59 
 
 
298 aa  227  2e-58  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0303  myo-inositol catabolism protein  38.26 
 
 
298 aa  225  8e-58  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2531  putative IolE protein  38.72 
 
 
298 aa  225  8e-58  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.32551e-17 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2255  myo-inositol catabolism protein  38.72 
 
 
298 aa  223  3e-57  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3839  xylose isomerase domain-containing protein  42.14 
 
 
300 aa  222  6e-57  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3285  sugar phosphate isomerase/epimerase, IolE  41.61 
 
 
302 aa  222  7e-57  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7800  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  41.42 
 
 
301 aa  222  7e-57  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_4017  xylose isomerase domain-containing protein  41.28 
 
 
302 aa  221  9e-57  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3560  xylose isomerase domain-containing protein  41.2 
 
 
300 aa  221  9.999999999999999e-57  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.27811 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0715  hypothetical protein  41.08 
 
 
300 aa  214  1.9999999999999998e-54  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0671  hypothetical protein  41.08 
 
 
300 aa  214  1.9999999999999998e-54  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4706  inosose dehydratase  39.07 
 
 
301 aa  211  1e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000727756  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1577  myo-inositol catabolism protein  38.08 
 
 
298 aa  209  4e-53  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.357804  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0078  hypothetical protein  39.93 
 
 
300 aa  209  5e-53  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1620  hypothetical protein  37.95 
 
 
298 aa  207  2e-52  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4656  xylose isomerase domain-containing protein  37.33 
 
 
298 aa  207  2e-52  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.335563 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1615  hypothetical protein  37.95 
 
 
298 aa  205  8e-52  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5694  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  36.36 
 
 
300 aa  204  1e-51  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.986609  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0980  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  37.37 
 
 
305 aa  197  2.0000000000000003e-49  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1133  Myo-inosose-2 dehydratase  36.54 
 
 
305 aa  191  2e-47  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.459716  normal  0.18483 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4190  xylose isomerase-like TIM barrel  37.25 
 
 
371 aa  180  2.9999999999999997e-44  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.720259  hitchhiker  0.00898811 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2336  hypothetical protein  38.24 
 
 
237 aa  177  3e-43  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3138  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  32.29 
 
 
359 aa  153  2.9999999999999998e-36  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2981  Myo-inosose-2 dehydratase  32.29 
 
 
359 aa  153  2.9999999999999998e-36  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.833328 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5989  xylose isomerase domain-containing protein  34.53 
 
 
312 aa  145  6e-34  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.63499  normal  0.171061 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1521  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  31.23 
 
 
294 aa  132  5e-30  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4855  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  40.82 
 
 
205 aa  124  3e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0821972  normal  0.0636139 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1696  Myo-inosose-2 dehydratase  28.57 
 
 
308 aa  122  8e-27  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4055  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  31.12 
 
 
297 aa  118  9.999999999999999e-26  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1722  xylose isomerase-like TIM barrel  29.07 
 
 
299 aa  105  1e-21  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.688264  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0730  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  29.37 
 
 
295 aa  103  5e-21  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.200556  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1247  putative myo-inositol catabolism protein  28.72 
 
 
313 aa  102  6e-21  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.537579  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2054  xylose isomerase domain-containing protein  27.21 
 
 
308 aa  102  6e-21  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3346  xylose isomerase-like TIM barrel  29.07 
 
 
297 aa  102  8e-21  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0217845  normal  0.180586 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1048  Myo-inosose-2 dehydratase  27.65 
 
 
307 aa  100  2e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.513171  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3595  Myo-inosose-2 dehydratase  29.29 
 
 
297 aa  100  3e-20  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0947  xylose isomerase-like TIM barrel  29.49 
 
 
308 aa  100  4e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.348697  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1429  xylose isomerase domain-containing protein  29.49 
 
 
308 aa  100  4e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1348  xylose isomerase domain-containing protein  29.21 
 
 
308 aa  100  4e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1407  xylose isomerase domain-containing protein  29.43 
 
 
308 aa  99.4  6e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.872133 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3352  Myo-inosose-2 dehydratase  27.78 
 
 
296 aa  99.4  7e-20  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0467219  normal  0.0568196 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1816  xylose isomerase domain-containing protein  26.75 
 
 
304 aa  98.2  1e-19  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.670883 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4487  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  28.72 
 
 
289 aa  98.6  1e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.411638  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1309  xylose isomerase domain-containing protein  28.52 
 
 
308 aa  97.8  2e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1886  xylose isomerase domain-containing protein  28.18 
 
 
308 aa  98.2  2e-19  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.206917 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2612  xylose isomerase domain-containing protein  28.93 
 
 
294 aa  97.1  3e-19  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_50250  hypothetical protein  28.47 
 
 
307 aa  97.4  3e-19  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.508803  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1271  xylose isomerase domain protein TIM barrel  26.64 
 
 
298 aa  96.7  4e-19  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.713181 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4573  xylose isomerase-like TIM barrel  28.47 
 
 
308 aa  96.3  6e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1362  Myo-inosose-2 dehydratase  29.39 
 
 
294 aa  94.4  2e-18  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3079  Myo-inosose-2 dehydratase  29.03 
 
 
287 aa  94  3e-18  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.977094  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3969  xylose isomerase domain-containing protein  28.67 
 
 
290 aa  94  3e-18  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0171269  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6852  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  32.04 
 
 
284 aa  91.3  2e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0571066  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3018  hypothetical protein  32.67 
 
 
307 aa  89  9e-17  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.130345  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1422  xylose isomerase-like  26.32 
 
 
297 aa  87  4e-16  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0452084  normal  0.457038 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0386  xylose isomerase domain-containing protein  28.32 
 
 
306 aa  86.3  7e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1912  xylose isomerase domain-containing protein  28.52 
 
 
271 aa  84.3  0.000000000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.193983  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8495  Myo-inosose-2 dehydratase  28.48 
 
 
311 aa  82  0.00000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.795487 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5562  Myo-inosose-2 dehydratase  29.43 
 
 
281 aa  80.5  0.00000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>