203 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acel_1816 on replicon NC_008578
Organism: Acidothermus cellulolyticus 11B



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008578  Acel_1816  xylose isomerase domain-containing protein  100 
 
 
304 aa  609  1e-173  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.670883 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2490  xylose isomerase domain-containing protein  41.12 
 
 
292 aa  177  2e-43  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00709656 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1717  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  38.61 
 
 
275 aa  171  2e-41  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.393807 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1722  xylose isomerase-like TIM barrel  34.55 
 
 
299 aa  160  2e-38  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.688264  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3352  Myo-inosose-2 dehydratase  31.77 
 
 
296 aa  151  1e-35  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0467219  normal  0.0568196 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1362  Myo-inosose-2 dehydratase  33.12 
 
 
294 aa  146  4.0000000000000006e-34  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2612  xylose isomerase domain-containing protein  33.94 
 
 
294 aa  137  2e-31  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4487  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  33.69 
 
 
289 aa  137  2e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.411638  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1696  Myo-inosose-2 dehydratase  31.53 
 
 
308 aa  137  3.0000000000000003e-31  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1521  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  28.71 
 
 
294 aa  133  3.9999999999999996e-30  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3595  Myo-inosose-2 dehydratase  30.43 
 
 
297 aa  131  1.0000000000000001e-29  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5562  Myo-inosose-2 dehydratase  35.23 
 
 
281 aa  130  3e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3969  xylose isomerase domain-containing protein  30.77 
 
 
290 aa  129  8.000000000000001e-29  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0171269  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6852  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  31.48 
 
 
284 aa  126  5e-28  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0571066  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2054  xylose isomerase domain-containing protein  30.41 
 
 
308 aa  124  2e-27  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3079  Myo-inosose-2 dehydratase  32.79 
 
 
287 aa  124  2e-27  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.977094  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8495  Myo-inosose-2 dehydratase  34.06 
 
 
311 aa  123  4e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.795487 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_50250  hypothetical protein  31.31 
 
 
307 aa  123  4e-27  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.508803  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3018  hypothetical protein  29.78 
 
 
307 aa  122  6e-27  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.130345  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1342  Myo-inosose-2 dehydratase  29.9 
 
 
296 aa  122  9e-27  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.606088  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2995  Myo-inosose-2 dehydratase  29.55 
 
 
296 aa  121  9.999999999999999e-27  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_50050  2-keto-myo-inositol dehydratase  29.93 
 
 
303 aa  120  1.9999999999999998e-26  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.602375  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1048  Myo-inosose-2 dehydratase  28.93 
 
 
307 aa  120  1.9999999999999998e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.513171  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1596  xylose isomerase domain-containing protein  28.98 
 
 
310 aa  119  4.9999999999999996e-26  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1247  putative myo-inositol catabolism protein  29.56 
 
 
313 aa  118  9.999999999999999e-26  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.537579  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1309  xylose isomerase domain-containing protein  30.19 
 
 
308 aa  118  9.999999999999999e-26  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3499  iolE protein  28.07 
 
 
301 aa  117  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3346  xylose isomerase-like TIM barrel  32.8 
 
 
297 aa  117  1.9999999999999998e-25  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0217845  normal  0.180586 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5448  Myo-inosose-2 dehydratase  33 
 
 
295 aa  118  1.9999999999999998e-25  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.10992  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3273  AP endonuclease  28.17 
 
 
301 aa  117  3e-25  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0853475  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1348  xylose isomerase domain-containing protein  29.56 
 
 
308 aa  115  7.999999999999999e-25  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2255  myo-inositol catabolism protein  25.08 
 
 
298 aa  115  1.0000000000000001e-24  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4013  Myo-inosose-2 dehydratase  24.83 
 
 
297 aa  115  1.0000000000000001e-24  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0086  myo-inositol catabolism protein IolE  25.1 
 
 
297 aa  115  1.0000000000000001e-24  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3560  xylose isomerase domain-containing protein  28.12 
 
 
300 aa  115  1.0000000000000001e-24  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.27811 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1271  xylose isomerase domain protein TIM barrel  31.53 
 
 
298 aa  114  1.0000000000000001e-24  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.713181 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0911  hypothetical protein  28.32 
 
 
306 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0303  myo-inositol catabolism protein  27.51 
 
 
298 aa  114  2.0000000000000002e-24  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1442  AP endonuclease  28.32 
 
 
306 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.609184  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0438  hypothetical protein  28.32 
 
 
306 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1653  AP endonuclease  28.32 
 
 
306 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.959785  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0724  AP endonuclease  28.32 
 
 
306 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.367793  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0947  xylose isomerase-like TIM barrel  29.56 
 
 
308 aa  114  3e-24  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.348697  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1429  xylose isomerase domain-containing protein  29.56 
 
 
308 aa  114  3e-24  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1615  hypothetical protein  26.01 
 
 
298 aa  113  4.0000000000000004e-24  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1829  hypothetical protein  28.32 
 
 
306 aa  113  4.0000000000000004e-24  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0766527  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1675  AP endonuclease  28.32 
 
 
306 aa  113  4.0000000000000004e-24  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.173299  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1407  xylose isomerase domain-containing protein  29.56 
 
 
308 aa  112  7.000000000000001e-24  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.872133 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3839  xylose isomerase domain-containing protein  27.24 
 
 
300 aa  111  1.0000000000000001e-23  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1620  hypothetical protein  25.68 
 
 
298 aa  111  2.0000000000000002e-23  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3333  Myo-inosose-2 dehydratase  27.78 
 
 
296 aa  111  2.0000000000000002e-23  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1577  myo-inositol catabolism protein  24.75 
 
 
298 aa  110  3e-23  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.357804  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1602  xylose isomerase domain-containing protein  29.54 
 
 
306 aa  110  3e-23  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.334485  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1886  xylose isomerase domain-containing protein  28.89 
 
 
308 aa  110  3e-23  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.206917 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0078  hypothetical protein  27.86 
 
 
300 aa  110  4.0000000000000004e-23  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2531  putative IolE protein  32.56 
 
 
298 aa  110  4.0000000000000004e-23  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.32551e-17 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1422  xylose isomerase-like  31.85 
 
 
297 aa  109  5e-23  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0452084  normal  0.457038 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0486  putative myo-inositol catabolism protein  28.84 
 
 
297 aa  109  5e-23  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.425956  normal  0.198393 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2811  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  28.32 
 
 
305 aa  109  6e-23  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.279544  normal  0.182339 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2299  myo-inositol catabolism protein  26.12 
 
 
298 aa  108  9.000000000000001e-23  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2336  hypothetical protein  31.79 
 
 
237 aa  108  1e-22  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4573  xylose isomerase-like TIM barrel  28.62 
 
 
308 aa  108  1e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1324  putative myo-inositol catabolism LolE protein  28.32 
 
 
308 aa  108  1e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4213  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  30.56 
 
 
340 aa  108  1e-22  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_4017  xylose isomerase domain-containing protein  29.89 
 
 
302 aa  107  2e-22  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3040  xylose isomerase domain-containing protein  27.08 
 
 
368 aa  106  4e-22  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4706  inosose dehydratase  24.58 
 
 
301 aa  106  5e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000727756  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2968  AP endonuclease  27.08 
 
 
306 aa  106  5e-22  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1869  AP endonuclease  27.08 
 
 
350 aa  106  5e-22  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.0234676 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5989  xylose isomerase domain-containing protein  27.27 
 
 
312 aa  105  8e-22  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.63499  normal  0.171061 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2649  hypothetical protein  27.14 
 
 
306 aa  104  1e-21  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0432409  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4190  xylose isomerase-like TIM barrel  25.52 
 
 
371 aa  104  2e-21  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.720259  hitchhiker  0.00898811 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5694  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  24.76 
 
 
300 aa  103  4e-21  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.986609  normal 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3285  sugar phosphate isomerase/epimerase, IolE  29.55 
 
 
302 aa  103  4e-21  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0939  xylose isomerase-like TIM barrel  26.47 
 
 
309 aa  103  5e-21  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.00907131  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1421  xylose isomerase domain-containing protein  26.47 
 
 
309 aa  103  5e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0043  xylose isomerase domain-containing protein  27.27 
 
 
308 aa  103  5e-21  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4055  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  29.51 
 
 
297 aa  103  5e-21  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1399  xylose isomerase domain-containing protein  25.82 
 
 
309 aa  102  7e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4565  xylose isomerase-like TIM barrel  26.14 
 
 
309 aa  102  1e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0833957  normal 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0671  hypothetical protein  26.16 
 
 
300 aa  100  3e-20  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3316  xylose isomerase domain-containing protein  25.42 
 
 
309 aa  100  3e-20  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0715  hypothetical protein  26.16 
 
 
300 aa  99.4  7e-20  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2835  xylose isomerase domain-containing protein  27.97 
 
 
310 aa  99.4  7e-20  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.840707  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1912  xylose isomerase domain-containing protein  29.8 
 
 
271 aa  99  8e-20  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.193983  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1894  xylose isomerase domain-containing protein  26.75 
 
 
309 aa  98.2  1e-19  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.21993 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1340  xylose isomerase domain-containing protein  25.24 
 
 
309 aa  97.4  3e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0067  xylose isomerase domain-containing protein  26.05 
 
 
318 aa  97.4  3e-19  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0290166  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1301  xylose isomerase domain-containing protein  24.92 
 
 
309 aa  96.7  4e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0730  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  30.04 
 
 
295 aa  96.3  6e-19  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.200556  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2325  xylose isomerase domain-containing protein  28.97 
 
 
303 aa  95.9  8e-19  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2414  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  26.92 
 
 
924 aa  95.1  1e-18  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7800  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  28.2 
 
 
301 aa  95.1  1e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7455  hypothetical protein  27.6 
 
 
292 aa  95.1  1e-18  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.652021  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1346  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  36.18 
 
 
301 aa  94.4  2e-18  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4656  xylose isomerase domain-containing protein  24.24 
 
 
298 aa  93.6  3e-18  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.335563 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0986  xylose isomerase domain-containing protein  28.33 
 
 
273 aa  93.2  5e-18  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1238  putative myo-inositol catabolism protein  24.18 
 
 
309 aa  92.8  6e-18  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4781  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  29.96 
 
 
270 aa  92.8  7e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.269917  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2932  xylose isomerase domain-containing protein  26.13 
 
 
308 aa  92.4  8e-18  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.688703 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>