More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPF_0086 on replicon NC_008261
Organism: Clostridium perfringens ATCC 13124



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008261  CPF_0086  myo-inositol catabolism protein IolE  100 
 
 		 297 aa  608  1e-173  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4013  Myo-inosose-2 dehydratase  76.43 
 
 		 297 aa  486  1e-136  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0303  myo-inositol catabolism protein  71.14 
 
 		 298 aa  446  1.0000000000000001e-124  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2299  myo-inositol catabolism protein  70.81 
 
 		 298 aa  443  1e-123  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2531  putative IolE protein  70.47 
 
 		 298 aa  441  1e-123  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.32551e-17 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2255  myo-inositol catabolism protein  69.8 
 
 		 298 aa  437  1e-121  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1577  myo-inositol catabolism protein  65.2 
 
 		 298 aa  390  1e-107  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.357804  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4656  xylose isomerase domain-containing protein  58.67 
 
 		 298 aa  366  1e-100  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.335563 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5694  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  54.39 
 
 		 300 aa  350  2e-95  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.986609  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2336  hypothetical protein  67.51 
 
 		 237 aa  338  7e-92  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1615  hypothetical protein  50.52 
 
 		 298 aa  301  7.000000000000001e-81  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1620  hypothetical protein  50.17 
 
 		 298 aa  299  5e-80  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4706  inosose dehydratase  48.81 
 
 		 301 aa  298  6e-80  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000727756  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4190  xylose isomerase-like TIM barrel  47.3 
 
 		 371 aa  268  7e-71  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.720259  hitchhiker  0.00898811 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1596  xylose isomerase domain-containing protein  42.51 
 
 		 310 aa  263  4e-69  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3333  Myo-inosose-2 dehydratase  43.21 
 
 		 296 aa  257  1e-67  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1342  Myo-inosose-2 dehydratase  42.86 
 
 		 296 aa  257  2e-67  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.606088  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2995  Myo-inosose-2 dehydratase  42.86 
 
 		 296 aa  256  5e-67  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2414  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  42.51 
 
 		 924 aa  249  3e-65  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3138  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  42.67 
 
 		 359 aa  249  4e-65  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2981  Myo-inosose-2 dehydratase  42.67 
 
 		 359 aa  249  4e-65  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.833328 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3316  xylose isomerase domain-containing protein  42.28 
 
 		 309 aa  248  7e-65  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3040  xylose isomerase domain-containing protein  41.84 
 
 		 368 aa  246  2e-64  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2968  AP endonuclease  41.84 
 
 		 306 aa  247  2e-64  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1869  AP endonuclease  41.84 
 
 		 350 aa  247  2e-64  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.0234676 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3839  xylose isomerase domain-containing protein  44.76 
 
 		 300 aa  247  2e-64  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_50050  2-keto-myo-inositol dehydratase  41.41 
 
 		 303 aa  241  7e-63  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.602375  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0715  hypothetical protein  43.01 
 
 		 300 aa  241  1e-62  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0671  hypothetical protein  42.66 
 
 		 300 aa  239  5e-62  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2932  xylose isomerase domain-containing protein  40.2 
 
 		 308 aa  238  5.999999999999999e-62  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.688703 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3560  xylose isomerase domain-containing protein  41.87 
 
 		 300 aa  238  8e-62  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.27811 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0078  hypothetical protein  42.24 
 
 		 300 aa  238  1e-61  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1238  putative myo-inositol catabolism protein  40.6 
 
 		 309 aa  237  2e-61  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5989  xylose isomerase domain-containing protein  42.81 
 
 		 312 aa  236  3e-61  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.63499  normal  0.171061 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1399  xylose isomerase domain-containing protein  41.28 
 
 		 309 aa  234  1.0000000000000001e-60  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3273  AP endonuclease  40.21 
 
 		 301 aa  233  2.0000000000000002e-60  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0853475  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0939  xylose isomerase-like TIM barrel  40.6 
 
 		 309 aa  234  2.0000000000000002e-60  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.00907131  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1421  xylose isomerase domain-containing protein  40.6 
 
 		 309 aa  234  2.0000000000000002e-60  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1340  xylose isomerase domain-containing protein  40.6 
 
 		 309 aa  234  2.0000000000000002e-60  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1301  xylose isomerase domain-containing protein  40.6 
 
 		 309 aa  233  3e-60  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4565  xylose isomerase-like TIM barrel  40.6 
 
 		 309 aa  232  5e-60  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0833957  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1324  putative myo-inositol catabolism LolE protein  39.04 
 
 		 308 aa  232  5e-60  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1602  xylose isomerase domain-containing protein  39.12 
 
 		 306 aa  231  2e-59  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.334485  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3499  iolE protein  40.97 
 
 		 301 aa  230  2e-59  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1894  xylose isomerase domain-containing protein  40.6 
 
 		 309 aa  230  2e-59  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.21993 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2325  xylose isomerase domain-containing protein  42.2 
 
 		 303 aa  229  4e-59  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2811  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  39.04 
 
 		 305 aa  228  8e-59  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.279544  normal  0.182339 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0043  xylose isomerase domain-containing protein  38.93 
 
 		 308 aa  228  9e-59  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2835  xylose isomerase domain-containing protein  40.99 
 
 		 310 aa  226  2e-58  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.840707  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0911  hypothetical protein  37.67 
 
 		 306 aa  226  4e-58  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1442  AP endonuclease  37.67 
 
 		 306 aa  226  4e-58  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.609184  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0438  hypothetical protein  37.67 
 
 		 306 aa  226  4e-58  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1653  AP endonuclease  37.67 
 
 		 306 aa  226  4e-58  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.959785  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0724  AP endonuclease  37.67 
 
 		 306 aa  226  4e-58  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.367793  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1829  hypothetical protein  37.33 
 
 		 306 aa  223  2e-57  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0766527  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0067  xylose isomerase domain-containing protein  39.93 
 
 		 318 aa  224  2e-57  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0290166  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1675  AP endonuclease  37.33 
 
 		 306 aa  223  2e-57  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.173299  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2649  hypothetical protein  37.67 
 
 		 306 aa  223  4e-57  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0432409  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1674  xylose isomerase domain-containing protein  40.55 
 
 		 298 aa  221  9.999999999999999e-57  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1133  Myo-inosose-2 dehydratase  40.5 
 
 		 305 aa  221  1.9999999999999999e-56  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.459716  normal  0.18483 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4213  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  37.99 
 
 		 340 aa  219  6e-56  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0980  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  39.78 
 
 		 305 aa  214  9.999999999999999e-55  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7800  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  35.74 
 
 		 301 aa  209  6e-53  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0486  putative myo-inositol catabolism protein  36.93 
 
 		 297 aa  208  8e-53  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.425956  normal  0.198393 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_4017  xylose isomerase domain-containing protein  36.82 
 
 		 302 aa  206  3e-52  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3285  sugar phosphate isomerase/epimerase, IolE  36.46 
 
 		 302 aa  203  2e-51  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1521  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  36.08 
 
 		 294 aa  197  2.0000000000000003e-49  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1696  Myo-inosose-2 dehydratase  28.12 
 
 		 308 aa  132  5e-30  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1362  Myo-inosose-2 dehydratase  27.94 
 
 		 294 aa  132  1.0000000000000001e-29  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3969  xylose isomerase domain-containing protein  26.94 
 
 		 290 aa  131  1.0000000000000001e-29  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0171269  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2612  xylose isomerase domain-containing protein  29.14 
 
 		 294 aa  130  2.0000000000000002e-29  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3352  Myo-inosose-2 dehydratase  26.01 
 
 		 296 aa  127  2.0000000000000002e-28  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0467219  normal  0.0568196 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4055  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  28.76 
 
 		 297 aa  124  2e-27  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1422  xylose isomerase-like  26.17 
 
 		 297 aa  118  9.999999999999999e-26  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0452084  normal  0.457038 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4487  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  26.02 
 
 		 289 aa  115  6.9999999999999995e-25  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.411638  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1816  xylose isomerase domain-containing protein  25.1 
 
 		 304 aa  115  8.999999999999998e-25  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.670883 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1886  xylose isomerase domain-containing protein  26.21 
 
 		 308 aa  115  8.999999999999998e-25  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.206917 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7455  hypothetical protein  25.17 
 
 		 292 aa  114  1.0000000000000001e-24  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.652021  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3595  Myo-inosose-2 dehydratase  26.01 
 
 		 297 aa  114  2.0000000000000002e-24  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4573  xylose isomerase-like TIM barrel  26.55 
 
 		 308 aa  113  3e-24  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3346  xylose isomerase-like TIM barrel  26.28 
 
 		 297 aa  114  3e-24  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0217845  normal  0.180586 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1309  xylose isomerase domain-containing protein  25.68 
 
 		 308 aa  114  3e-24  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1722  xylose isomerase-like TIM barrel  26.18 
 
 		 299 aa  112  7.000000000000001e-24  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.688264  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1048  Myo-inosose-2 dehydratase  25.96 
 
 		 307 aa  112  1.0000000000000001e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.513171  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0947  xylose isomerase-like TIM barrel  26.21 
 
 		 308 aa  112  1.0000000000000001e-23  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.348697  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1429  xylose isomerase domain-containing protein  26.21 
 
 		 308 aa  112  1.0000000000000001e-23  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1348  xylose isomerase domain-containing protein  25.34 
 
 		 308 aa  111  2.0000000000000002e-23  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1247  putative myo-inositol catabolism protein  26.71 
 
 		 313 aa  110  3e-23  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.537579  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6852  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  28.1 
 
 		 284 aa  110  3e-23  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0571066  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3018  hypothetical protein  26.38 
 
 		 307 aa  109  6e-23  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.130345  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0657  Myo-inosose-2 dehydratase  26.26 
 
 		 303 aa  108  1e-22  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.700284  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8495  Myo-inosose-2 dehydratase  28.4 
 
 		 311 aa  107  2e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.795487 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_50250  hypothetical protein  26.07 
 
 		 307 aa  106  4e-22  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.508803  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4855  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  32.81 
 
 		 205 aa  106  4e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0821972  normal  0.0636139 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1981  Myo-inosose-2 dehydratase  27.55 
 
 		 301 aa  106  5e-22  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.162742  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1407  xylose isomerase domain-containing protein  25.52 
 
 		 308 aa  105  7e-22  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.872133 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1271  xylose isomerase domain protein TIM barrel  24.5 
 
 		 298 aa  105  9e-22  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.713181 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0824  xylose isomerase domain-containing protein  27.91 
 
 		 303 aa  104  2e-21  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0273  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  26.76 
 
 		 278 aa  103  4e-21  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0941  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  27.24 
 
 		 303 aa  102  7e-21  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>