181 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbro_3595 on replicon NC_013441
Organism: Gordonia bronchialis DSM 43247



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013441  Gbro_3595  Myo-inosose-2 dehydratase  100 
 
 		 297 aa  591  1e-168  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1362  Myo-inosose-2 dehydratase  62.41 
 
 		 294 aa  345  6e-94  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3969  xylose isomerase domain-containing protein  58.74 
 
 		 290 aa  337  9.999999999999999e-92  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0171269  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2612  xylose isomerase domain-containing protein  59.52 
 
 		 294 aa  337  1.9999999999999998e-91  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3352  Myo-inosose-2 dehydratase  52.84 
 
 		 296 aa  308  8e-83  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0467219  normal  0.0568196 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3079  Myo-inosose-2 dehydratase  56.6 
 
 		 287 aa  286  2e-76  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.977094  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4487  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  54.74 
 
 		 289 aa  286  4e-76  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.411638  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5562  Myo-inosose-2 dehydratase  55.67 
 
 		 281 aa  280  3e-74  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8495  Myo-inosose-2 dehydratase  53.19 
 
 		 311 aa  264  1e-69  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.795487 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6852  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  52.48 
 
 		 284 aa  256  4e-67  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0571066  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5448  Myo-inosose-2 dehydratase  51.41 
 
 		 295 aa  244  9e-64  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.10992  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1722  xylose isomerase-like TIM barrel  44.6 
 
 		 299 aa  243  1.9999999999999999e-63  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.688264  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1521  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  32.97 
 
 		 294 aa  137  2e-31  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1816  xylose isomerase domain-containing protein  30.43 
 
 		 304 aa  131  1.0000000000000001e-29  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.670883 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2255  myo-inositol catabolism protein  28.06 
 
 		 298 aa  125  9e-28  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0303  myo-inositol catabolism protein  27.54 
 
 		 298 aa  123  3e-27  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2299  myo-inositol catabolism protein  26.98 
 
 		 298 aa  122  7e-27  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2531  putative IolE protein  26.81 
 
 		 298 aa  122  9.999999999999999e-27  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.32551e-17 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7455  hypothetical protein  31.73 
 
 		 292 aa  120  3e-26  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.652021  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_50250  hypothetical protein  31.48 
 
 		 307 aa  119  9e-26  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.508803  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4013  Myo-inosose-2 dehydratase  27.84 
 
 		 297 aa  117  3e-25  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4213  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  32.46 
 
 		 340 aa  116  3.9999999999999997e-25  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0086  myo-inositol catabolism protein IolE  26.01 
 
 		 297 aa  114  2.0000000000000002e-24  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_4017  xylose isomerase domain-containing protein  30.42 
 
 		 302 aa  113  3e-24  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3285  sugar phosphate isomerase/epimerase, IolE  30.42 
 
 		 302 aa  113  4.0000000000000004e-24  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1596  xylose isomerase domain-containing protein  30.77 
 
 		 310 aa  113  4.0000000000000004e-24  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1271  xylose isomerase domain protein TIM barrel  29.29 
 
 		 298 aa  112  6e-24  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.713181 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_50050  2-keto-myo-inositol dehydratase  27.84 
 
 		 303 aa  112  6e-24  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.602375  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0657  Myo-inosose-2 dehydratase  30.58 
 
 		 303 aa  112  7.000000000000001e-24  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.700284  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1247  putative myo-inositol catabolism protein  30.13 
 
 		 313 aa  112  9e-24  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.537579  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0386  xylose isomerase domain-containing protein  31.9 
 
 		 306 aa  112  9e-24  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1696  Myo-inosose-2 dehydratase  30.1 
 
 		 308 aa  111  2.0000000000000002e-23  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7800  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  29.15 
 
 		 301 aa  111  2.0000000000000002e-23  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2054  xylose isomerase domain-containing protein  30.99 
 
 		 308 aa  109  4.0000000000000004e-23  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1886  xylose isomerase domain-containing protein  29.77 
 
 		 308 aa  110  4.0000000000000004e-23  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.206917 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3560  xylose isomerase domain-containing protein  29.93 
 
 		 300 aa  109  5e-23  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.27811 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2746  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  34.32 
 
 		 330 aa  109  5e-23  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.717662  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2835  xylose isomerase domain-containing protein  30.3 
 
 		 310 aa  109  6e-23  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.840707  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3273  AP endonuclease  27.21 
 
 		 301 aa  108  1e-22  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0853475  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0078  hypothetical protein  29.28 
 
 		 300 aa  108  1e-22  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3499  iolE protein  26.57 
 
 		 301 aa  107  2e-22  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0730  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  31.2 
 
 		 295 aa  107  2e-22  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.200556  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4055  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  33.33 
 
 		 297 aa  107  3e-22  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3333  Myo-inosose-2 dehydratase  30.12 
 
 		 296 aa  106  4e-22  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1342  Myo-inosose-2 dehydratase  29.48 
 
 		 296 aa  106  6e-22  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.606088  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4190  xylose isomerase-like TIM barrel  27.09 
 
 		 371 aa  104  2e-21  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.720259  hitchhiker  0.00898811 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3346  xylose isomerase-like TIM barrel  28.03 
 
 		 297 aa  103  3e-21  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0217845  normal  0.180586 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4706  inosose dehydratase  26.3 
 
 		 301 aa  103  3e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000727756  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1407  xylose isomerase domain-containing protein  29.26 
 
 		 308 aa  103  3e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.872133 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1674  xylose isomerase domain-containing protein  29.17 
 
 		 298 aa  103  4e-21  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1981  Myo-inosose-2 dehydratase  32.92 
 
 		 301 aa  103  4e-21  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.162742  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2932  xylose isomerase domain-containing protein  30.25 
 
 		 308 aa  102  6e-21  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.688703 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1048  Myo-inosose-2 dehydratase  29.21 
 
 		 307 aa  102  7e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.513171  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2325  xylose isomerase domain-containing protein  30.22 
 
 		 303 aa  102  9e-21  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2995  Myo-inosose-2 dehydratase  29.73 
 
 		 296 aa  102  9e-21  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0947  xylose isomerase-like TIM barrel  28.94 
 
 		 308 aa  101  1e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.348697  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1429  xylose isomerase domain-containing protein  28.94 
 
 		 308 aa  101  1e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1324  putative myo-inositol catabolism LolE protein  28.31 
 
 		 308 aa  100  2e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2336  hypothetical protein  31.54 
 
 		 237 aa  100  3e-20  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1829  hypothetical protein  28.73 
 
 		 306 aa  100  3e-20  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0766527  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1912  xylose isomerase domain-containing protein  35.54 
 
 		 271 aa  100  3e-20  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.193983  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1675  AP endonuclease  28.73 
 
 		 306 aa  100  3e-20  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.173299  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1894  xylose isomerase domain-containing protein  29.29 
 
 		 309 aa  100  3e-20  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.21993 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3018  hypothetical protein  28.37 
 
 		 307 aa  100  4e-20  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.130345  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0911  hypothetical protein  28.73 
 
 		 306 aa  99.8  5e-20  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1442  AP endonuclease  28.73 
 
 		 306 aa  99.8  5e-20  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.609184  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0438  hypothetical protein  28.73 
 
 		 306 aa  99.8  5e-20  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1653  AP endonuclease  28.73 
 
 		 306 aa  99.8  5e-20  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.959785  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0724  AP endonuclease  28.73 
 
 		 306 aa  99.8  5e-20  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.367793  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2414  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  28.89 
 
 		 924 aa  99.4  6e-20  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1340  xylose isomerase domain-containing protein  31.07 
 
 		 309 aa  99.4  6e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5989  xylose isomerase domain-containing protein  27.73 
 
 		 312 aa  99  8e-20  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.63499  normal  0.171061 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1399  xylose isomerase domain-containing protein  30.71 
 
 		 309 aa  99  8e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1309  xylose isomerase domain-containing protein  27.94 
 
 		 308 aa  99  9e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4565  xylose isomerase-like TIM barrel  30.36 
 
 		 309 aa  98.2  1e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0833957  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1422  xylose isomerase-like  27.44 
 
 		 297 aa  98.2  1e-19  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0452084  normal  0.457038 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0939  xylose isomerase-like TIM barrel  30.14 
 
 		 309 aa  98.6  1e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.00907131  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1421  xylose isomerase domain-containing protein  30.14 
 
 		 309 aa  98.6  1e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4573  xylose isomerase-like TIM barrel  27.97 
 
 		 308 aa  97.8  2e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2649  hypothetical protein  28.36 
 
 		 306 aa  97.4  2e-19  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0432409  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1348  xylose isomerase domain-containing protein  28.43 
 
 		 308 aa  98.2  2e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0980  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  27.07 
 
 		 305 aa  97.1  3e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0486  putative myo-inositol catabolism protein  26.49 
 
 		 297 aa  97.1  3e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.425956  normal  0.198393 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1301  xylose isomerase domain-containing protein  30.36 
 
 		 309 aa  96.7  4e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0043  xylose isomerase domain-containing protein  28.36 
 
 		 308 aa  96.7  4e-19  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1133  Myo-inosose-2 dehydratase  27.44 
 
 		 305 aa  97.1  4e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.459716  normal  0.18483 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2811  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  28.1 
 
 		 305 aa  96.3  5e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.279544  normal  0.182339 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3839  xylose isomerase domain-containing protein  26.82 
 
 		 300 aa  96.3  5e-19  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5694  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  26.45 
 
 		 300 aa  95.9  8e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.986609  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0715  hypothetical protein  27.59 
 
 		 300 aa  94  2e-18  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0671  hypothetical protein  27.59 
 
 		 300 aa  94.4  2e-18  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1620  hypothetical protein  24.36 
 
 		 298 aa  92.8  7e-18  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3138  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  30.72 
 
 		 359 aa  92.4  8e-18  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2981  Myo-inosose-2 dehydratase  30.72 
 
 		 359 aa  92.4  8e-18  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.833328 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1238  putative myo-inositol catabolism protein  29.23 
 
 		 309 aa  92  1e-17  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1602  xylose isomerase domain-containing protein  26.77 
 
 		 306 aa  91.7  1e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.334485  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4656  xylose isomerase domain-containing protein  24.54 
 
 		 298 aa  92  1e-17  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.335563 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1615  hypothetical protein  24.36 
 
 		 298 aa  91.3  2e-17  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3316  xylose isomerase domain-containing protein  27.46 
 
 		 309 aa  90.5  3e-17  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0067  xylose isomerase domain-containing protein  27.04 
 
 		 318 aa  90.1  4e-17  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0290166  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>