217 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BTH_I2649 on replicon NC_007651
Organism: Burkholderia thailandensis E264



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007651  BTH_I2649  hypothetical protein  100 
 
 
306 aa  625  1e-178  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0432409  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0911  hypothetical protein  97.06 
 
 
306 aa  606  9.999999999999999e-173  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1829  hypothetical protein  96.73 
 
 
306 aa  603  9.999999999999999e-173  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0766527  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1442  AP endonuclease  97.06 
 
 
306 aa  606  9.999999999999999e-173  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.609184  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0438  hypothetical protein  97.06 
 
 
306 aa  606  9.999999999999999e-173  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1653  AP endonuclease  97.06 
 
 
306 aa  606  9.999999999999999e-173  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.959785  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1675  AP endonuclease  96.73 
 
 
306 aa  603  9.999999999999999e-173  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.173299  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0724  AP endonuclease  97.06 
 
 
306 aa  606  9.999999999999999e-173  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.367793  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1324  putative myo-inositol catabolism LolE protein  81.49 
 
 
308 aa  521  1e-147  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2811  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  80.98 
 
 
305 aa  517  1e-146  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.279544  normal  0.182339 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1602  xylose isomerase domain-containing protein  80.27 
 
 
306 aa  501  1e-141  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.334485  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_50050  2-keto-myo-inositol dehydratase  63.55 
 
 
303 aa  407  1e-113  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.602375  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3273  AP endonuclease  64.73 
 
 
301 aa  401  1e-111  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0853475  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3499  iolE protein  64.38 
 
 
301 aa  399  9.999999999999999e-111  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1301  xylose isomerase domain-containing protein  63.25 
 
 
309 aa  364  1e-100  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3316  xylose isomerase domain-containing protein  62.58 
 
 
309 aa  366  1e-100  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1340  xylose isomerase domain-containing protein  62.91 
 
 
309 aa  363  3e-99  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1894  xylose isomerase domain-containing protein  62.91 
 
 
309 aa  363  3e-99  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.21993 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0939  xylose isomerase-like TIM barrel  62.58 
 
 
309 aa  362  4e-99  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.00907131  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1421  xylose isomerase domain-containing protein  62.58 
 
 
309 aa  362  4e-99  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1399  xylose isomerase domain-containing protein  62.25 
 
 
309 aa  360  2e-98  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4565  xylose isomerase-like TIM barrel  61.92 
 
 
309 aa  358  9e-98  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0833957  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2932  xylose isomerase domain-containing protein  61.33 
 
 
308 aa  355  5.999999999999999e-97  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.688703 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1238  putative myo-inositol catabolism protein  61.26 
 
 
309 aa  354  8.999999999999999e-97  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0067  xylose isomerase domain-containing protein  62.91 
 
 
318 aa  354  8.999999999999999e-97  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0290166  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1596  xylose isomerase domain-containing protein  57.14 
 
 
310 aa  341  8e-93  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3040  xylose isomerase domain-containing protein  56.6 
 
 
368 aa  337  9.999999999999999e-92  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3333  Myo-inosose-2 dehydratase  55.94 
 
 
296 aa  337  1.9999999999999998e-91  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1869  AP endonuclease  56.6 
 
 
350 aa  337  1.9999999999999998e-91  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.0234676 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2968  AP endonuclease  56.6 
 
 
306 aa  335  7e-91  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1342  Myo-inosose-2 dehydratase  55.59 
 
 
296 aa  333  3e-90  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.606088  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2995  Myo-inosose-2 dehydratase  55.24 
 
 
296 aa  332  4e-90  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0043  xylose isomerase domain-containing protein  51.19 
 
 
308 aa  297  1e-79  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2414  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  48.49 
 
 
924 aa  271  1e-71  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1674  xylose isomerase domain-containing protein  47.28 
 
 
298 aa  265  5.999999999999999e-70  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2835  xylose isomerase domain-containing protein  49.31 
 
 
310 aa  264  1e-69  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.840707  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2325  xylose isomerase domain-containing protein  50.7 
 
 
303 aa  263  4e-69  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3560  xylose isomerase domain-containing protein  44.67 
 
 
300 aa  253  4.0000000000000004e-66  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.27811 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0486  putative myo-inositol catabolism protein  43.25 
 
 
297 aa  248  7e-65  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.425956  normal  0.198393 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0078  hypothetical protein  42.32 
 
 
300 aa  248  1e-64  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4213  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  44.6 
 
 
340 aa  246  2e-64  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3839  xylose isomerase domain-containing protein  43.45 
 
 
300 aa  242  7e-63  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0671  hypothetical protein  44.48 
 
 
300 aa  241  1e-62  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0980  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  43.64 
 
 
305 aa  240  2e-62  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0715  hypothetical protein  44.14 
 
 
300 aa  240  2.9999999999999997e-62  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7800  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  40.96 
 
 
301 aa  239  4e-62  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1133  Myo-inosose-2 dehydratase  43.3 
 
 
305 aa  238  1e-61  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.459716  normal  0.18483 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1577  myo-inositol catabolism protein  37.63 
 
 
298 aa  229  3e-59  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.357804  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_4017  xylose isomerase domain-containing protein  42.32 
 
 
302 aa  229  4e-59  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4013  Myo-inosose-2 dehydratase  38.01 
 
 
297 aa  229  5e-59  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2531  putative IolE protein  38.33 
 
 
298 aa  229  5e-59  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.32551e-17 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3285  sugar phosphate isomerase/epimerase, IolE  42.66 
 
 
302 aa  229  6e-59  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0303  myo-inositol catabolism protein  38.33 
 
 
298 aa  226  4e-58  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2299  myo-inositol catabolism protein  37.98 
 
 
298 aa  225  9e-58  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0086  myo-inositol catabolism protein IolE  37.67 
 
 
297 aa  223  4e-57  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2255  myo-inositol catabolism protein  37.98 
 
 
298 aa  222  6e-57  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4656  xylose isomerase domain-containing protein  36.52 
 
 
298 aa  219  3.9999999999999997e-56  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.335563 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5694  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  37.25 
 
 
300 aa  216  5.9999999999999996e-55  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.986609  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1620  hypothetical protein  38.36 
 
 
298 aa  205  7e-52  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1615  hypothetical protein  38.36 
 
 
298 aa  205  7e-52  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4706  inosose dehydratase  37.29 
 
 
301 aa  203  4e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000727756  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2336  hypothetical protein  37.28 
 
 
237 aa  174  1.9999999999999998e-42  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4190  xylose isomerase-like TIM barrel  35.14 
 
 
371 aa  172  5e-42  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.720259  hitchhiker  0.00898811 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2981  Myo-inosose-2 dehydratase  32.57 
 
 
359 aa  155  1e-36  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.833328 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3138  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  32.57 
 
 
359 aa  155  1e-36  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5989  xylose isomerase domain-containing protein  32.89 
 
 
312 aa  143  4e-33  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.63499  normal  0.171061 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1521  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  31.74 
 
 
294 aa  137  2e-31  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4855  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  42.47 
 
 
205 aa  135  9.999999999999999e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0821972  normal  0.0636139 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3346  xylose isomerase-like TIM barrel  29.24 
 
 
297 aa  115  1.0000000000000001e-24  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0217845  normal  0.180586 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1271  xylose isomerase domain protein TIM barrel  29.18 
 
 
298 aa  115  1.0000000000000001e-24  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.713181 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6852  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  34.19 
 
 
284 aa  115  1.0000000000000001e-24  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0571066  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4487  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  30.45 
 
 
289 aa  114  2.0000000000000002e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.411638  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3352  Myo-inosose-2 dehydratase  29.54 
 
 
296 aa  111  2.0000000000000002e-23  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0467219  normal  0.0568196 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1696  Myo-inosose-2 dehydratase  30.16 
 
 
308 aa  110  4.0000000000000004e-23  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2612  xylose isomerase domain-containing protein  29.48 
 
 
294 aa  109  7.000000000000001e-23  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3079  Myo-inosose-2 dehydratase  32.84 
 
 
287 aa  107  3e-22  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.977094  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1816  xylose isomerase domain-containing protein  27.14 
 
 
304 aa  104  1e-21  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.670883 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3969  xylose isomerase domain-containing protein  29.96 
 
 
290 aa  104  2e-21  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0171269  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1247  putative myo-inositol catabolism protein  29.55 
 
 
313 aa  102  9e-21  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.537579  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1422  xylose isomerase-like  28.57 
 
 
297 aa  101  1e-20  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0452084  normal  0.457038 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1362  Myo-inosose-2 dehydratase  30.6 
 
 
294 aa  101  1e-20  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1722  xylose isomerase-like TIM barrel  28.36 
 
 
299 aa  100  3e-20  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.688264  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3595  Myo-inosose-2 dehydratase  28.36 
 
 
297 aa  97.4  2e-19  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_50250  hypothetical protein  27.95 
 
 
307 aa  97.1  3e-19  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.508803  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3018  hypothetical protein  27.65 
 
 
307 aa  95.9  7e-19  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.130345  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1886  xylose isomerase domain-containing protein  29.39 
 
 
308 aa  95.9  7e-19  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.206917 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1407  xylose isomerase domain-containing protein  28.32 
 
 
308 aa  95.5  9e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.872133 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0947  xylose isomerase-like TIM barrel  27.97 
 
 
308 aa  94.4  2e-18  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.348697  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1429  xylose isomerase domain-containing protein  27.97 
 
 
308 aa  94.4  2e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7455  hypothetical protein  28.46 
 
 
292 aa  94.4  2e-18  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.652021  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2054  xylose isomerase domain-containing protein  27.46 
 
 
308 aa  94.4  2e-18  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8495  Myo-inosose-2 dehydratase  29.41 
 
 
311 aa  93.2  5e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.795487 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4573  xylose isomerase-like TIM barrel  27.62 
 
 
308 aa  90.5  4e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1348  xylose isomerase domain-containing protein  28.33 
 
 
308 aa  89.7  6e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1912  xylose isomerase domain-containing protein  30.08 
 
 
271 aa  89.4  7e-17  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.193983  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5448  Myo-inosose-2 dehydratase  29.92 
 
 
295 aa  89.4  7e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.10992  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4055  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  27.4 
 
 
297 aa  86.3  6e-16  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1309  xylose isomerase domain-containing protein  27.99 
 
 
308 aa  85.5  0.000000000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0730  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  27.44 
 
 
295 aa  82.8  0.000000000000007  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.200556  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5562  Myo-inosose-2 dehydratase  31.34 
 
 
281 aa  82.4  0.000000000000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>