164 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bmul_1886 on replicon NC_010084
Organism: Burkholderia multivorans ATCC 17616



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010084  Bmul_1886  xylose isomerase domain-containing protein  100 
 
 
308 aa  630  1e-179  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.206917 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0947  xylose isomerase-like TIM barrel  90.58 
 
 
308 aa  572  1.0000000000000001e-162  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.348697  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1429  xylose isomerase domain-containing protein  90.58 
 
 
308 aa  572  1.0000000000000001e-162  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4573  xylose isomerase-like TIM barrel  88.96 
 
 
308 aa  568  1e-161  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1309  xylose isomerase domain-containing protein  89.29 
 
 
308 aa  565  1e-160  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1407  xylose isomerase domain-containing protein  89.29 
 
 
308 aa  563  1.0000000000000001e-159  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.872133 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1348  xylose isomerase domain-containing protein  88.64 
 
 
308 aa  559  1e-158  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1247  putative myo-inositol catabolism protein  81.82 
 
 
313 aa  523  1e-147  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.537579  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_50250  hypothetical protein  67.75 
 
 
307 aa  439  9.999999999999999e-123  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.508803  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3018  hypothetical protein  64.5 
 
 
307 aa  426  1e-118  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.130345  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1048  Myo-inosose-2 dehydratase  65.15 
 
 
307 aa  424  1e-117  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.513171  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2054  xylose isomerase domain-containing protein  52.44 
 
 
308 aa  343  2e-93  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1422  xylose isomerase-like  34.85 
 
 
297 aa  210  2e-53  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0452084  normal  0.457038 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3346  xylose isomerase-like TIM barrel  34.09 
 
 
297 aa  203  2e-51  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0217845  normal  0.180586 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1271  xylose isomerase domain protein TIM barrel  34.09 
 
 
298 aa  199  5e-50  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.713181 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7455  hypothetical protein  30.53 
 
 
292 aa  148  1.0000000000000001e-34  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.652021  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0657  Myo-inosose-2 dehydratase  29.64 
 
 
303 aa  143  4e-33  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.700284  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2746  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  30.04 
 
 
330 aa  139  3.9999999999999997e-32  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.717662  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0386  xylose isomerase domain-containing protein  28.75 
 
 
306 aa  135  7.000000000000001e-31  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3969  xylose isomerase domain-containing protein  32.82 
 
 
290 aa  132  6e-30  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0171269  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4055  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  29.97 
 
 
297 aa  132  9e-30  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1521  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  32.17 
 
 
294 aa  131  1.0000000000000001e-29  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1981  Myo-inosose-2 dehydratase  28.25 
 
 
301 aa  131  2.0000000000000002e-29  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.162742  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1696  Myo-inosose-2 dehydratase  30.57 
 
 
308 aa  129  6e-29  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2612  xylose isomerase domain-containing protein  31.37 
 
 
294 aa  124  2e-27  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0730  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  30.43 
 
 
295 aa  122  8e-27  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.200556  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0824  xylose isomerase domain-containing protein  28.1 
 
 
303 aa  122  9e-27  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0941  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  28.38 
 
 
303 aa  121  9.999999999999999e-27  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3079  Myo-inosose-2 dehydratase  33.54 
 
 
287 aa  119  4.9999999999999996e-26  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.977094  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1620  hypothetical protein  28.81 
 
 
298 aa  119  7e-26  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1615  hypothetical protein  28.47 
 
 
298 aa  118  9.999999999999999e-26  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0086  myo-inositol catabolism protein IolE  26.21 
 
 
297 aa  115  1.0000000000000001e-24  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8495  Myo-inosose-2 dehydratase  30.77 
 
 
311 aa  114  1.0000000000000001e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.795487 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1362  Myo-inosose-2 dehydratase  31.31 
 
 
294 aa  114  2.0000000000000002e-24  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0303  myo-inositol catabolism protein  26.8 
 
 
298 aa  110  2.0000000000000002e-23  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_50050  2-keto-myo-inositol dehydratase  28.75 
 
 
303 aa  110  2.0000000000000002e-23  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.602375  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6852  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  32.25 
 
 
284 aa  110  2.0000000000000002e-23  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0571066  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3352  Myo-inosose-2 dehydratase  28.83 
 
 
296 aa  110  2.0000000000000002e-23  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0467219  normal  0.0568196 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1816  xylose isomerase domain-containing protein  28.89 
 
 
304 aa  110  3e-23  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.670883 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3595  Myo-inosose-2 dehydratase  29.77 
 
 
297 aa  110  4.0000000000000004e-23  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3333  Myo-inosose-2 dehydratase  28.91 
 
 
296 aa  110  4.0000000000000004e-23  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4487  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  29.84 
 
 
289 aa  110  4.0000000000000004e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.411638  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2531  putative IolE protein  25.56 
 
 
298 aa  109  6e-23  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.32551e-17 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4013  Myo-inosose-2 dehydratase  25.81 
 
 
297 aa  108  8.000000000000001e-23  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2299  myo-inositol catabolism protein  25.56 
 
 
298 aa  108  1e-22  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4190  xylose isomerase-like TIM barrel  25.83 
 
 
371 aa  108  1e-22  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.720259  hitchhiker  0.00898811 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1596  xylose isomerase domain-containing protein  28.05 
 
 
310 aa  108  1e-22  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0043  xylose isomerase domain-containing protein  30.24 
 
 
308 aa  108  2e-22  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5562  Myo-inosose-2 dehydratase  30.13 
 
 
281 aa  107  2e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1722  xylose isomerase-like TIM barrel  27.62 
 
 
299 aa  106  4e-22  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.688264  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2255  myo-inositol catabolism protein  26.12 
 
 
298 aa  106  5e-22  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1342  Myo-inosose-2 dehydratase  28.57 
 
 
296 aa  104  2e-21  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.606088  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1238  putative myo-inositol catabolism protein  27.33 
 
 
309 aa  103  3e-21  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3138  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  24.52 
 
 
359 aa  101  1e-20  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0067  xylose isomerase domain-containing protein  28.57 
 
 
318 aa  101  1e-20  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0290166  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2981  Myo-inosose-2 dehydratase  24.52 
 
 
359 aa  101  1e-20  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.833328 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4565  xylose isomerase-like TIM barrel  28.18 
 
 
309 aa  101  2e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0833957  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2490  xylose isomerase domain-containing protein  27.56 
 
 
303 aa  101  2e-20  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.279776  normal  0.973607 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0939  xylose isomerase-like TIM barrel  27.15 
 
 
309 aa  100  3e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.00907131  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1421  xylose isomerase domain-containing protein  27.15 
 
 
309 aa  100  3e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1399  xylose isomerase domain-containing protein  28.08 
 
 
309 aa  100  3e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2995  Myo-inosose-2 dehydratase  28.38 
 
 
296 aa  99.8  6e-20  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1602  xylose isomerase domain-containing protein  28.38 
 
 
306 aa  99.4  6e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.334485  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5694  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  24.05 
 
 
300 aa  98.2  1e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.986609  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0911  hypothetical protein  29.59 
 
 
306 aa  97.8  2e-19  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1442  AP endonuclease  29.59 
 
 
306 aa  97.8  2e-19  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.609184  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0438  hypothetical protein  29.59 
 
 
306 aa  97.8  2e-19  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1653  AP endonuclease  29.59 
 
 
306 aa  97.8  2e-19  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.959785  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0724  AP endonuclease  29.59 
 
 
306 aa  97.8  2e-19  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.367793  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1894  xylose isomerase domain-containing protein  28.18 
 
 
309 aa  98.2  2e-19  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.21993 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1340  xylose isomerase domain-containing protein  27.84 
 
 
309 aa  97.4  2e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1301  xylose isomerase domain-containing protein  27.49 
 
 
309 aa  96.7  4e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_4017  xylose isomerase domain-containing protein  36.54 
 
 
302 aa  96.3  5e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4656  xylose isomerase domain-containing protein  24.52 
 
 
298 aa  96.7  5e-19  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.335563 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2932  xylose isomerase domain-containing protein  26.55 
 
 
308 aa  96.7  5e-19  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.688703 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2811  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  29.45 
 
 
305 aa  96.3  5e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.279544  normal  0.182339 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3285  sugar phosphate isomerase/epimerase, IolE  36.54 
 
 
302 aa  96.3  6e-19  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2649  hypothetical protein  29.39 
 
 
306 aa  95.9  7e-19  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0432409  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2968  AP endonuclease  28.52 
 
 
306 aa  95.9  7e-19  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3273  AP endonuclease  28.18 
 
 
301 aa  95.9  8e-19  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0853475  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1869  AP endonuclease  27 
 
 
350 aa  95.9  8e-19  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.0234676 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1829  hypothetical protein  29.25 
 
 
306 aa  95.1  1e-18  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0766527  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1675  AP endonuclease  29.25 
 
 
306 aa  95.1  1e-18  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.173299  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3040  xylose isomerase domain-containing protein  27 
 
 
368 aa  95.1  1e-18  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1324  putative myo-inositol catabolism LolE protein  28.52 
 
 
308 aa  94.4  2e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4706  inosose dehydratase  24.22 
 
 
301 aa  94.7  2e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000727756  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3316  xylose isomerase domain-containing protein  31.72 
 
 
309 aa  94  3e-18  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2414  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  28.47 
 
 
924 aa  94  3e-18  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3499  iolE protein  27.49 
 
 
301 aa  92.8  6e-18  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2336  hypothetical protein  28 
 
 
237 aa  92.8  7e-18  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5448  Myo-inosose-2 dehydratase  36.54 
 
 
295 aa  90.9  3e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.10992  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4213  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  28.96 
 
 
340 aa  88.6  1e-16  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1577  myo-inositol catabolism protein  24.24 
 
 
298 aa  87.8  2e-16  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.357804  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5989  xylose isomerase domain-containing protein  26.8 
 
 
312 aa  86.7  5e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.63499  normal  0.171061 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2325  xylose isomerase domain-containing protein  28.21 
 
 
303 aa  86.3  6e-16  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0980  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  27.06 
 
 
305 aa  85.9  8e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1133  Myo-inosose-2 dehydratase  27.61 
 
 
305 aa  85.9  9e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.459716  normal  0.18483 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0078  hypothetical protein  28.18 
 
 
300 aa  85.5  0.000000000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2835  xylose isomerase domain-containing protein  25.72 
 
 
310 aa  84.7  0.000000000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.840707  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0273  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  30.36 
 
 
278 aa  83.6  0.000000000000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>