133 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gobs_2746 on replicon NC_013757
Organism: Geodermatophilus obscurus DSM 43160



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013757  Gobs_2746  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  100 
 
 		 330 aa  674    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.717662  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1981  Myo-inosose-2 dehydratase  61.2 
 
 		 301 aa  395  1e-109  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.162742  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0386  xylose isomerase domain-containing protein  60.53 
 
 		 306 aa  393  1e-108  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4055  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  59.04 
 
 		 297 aa  360  2e-98  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0657  Myo-inosose-2 dehydratase  54.08 
 
 		 303 aa  342  5.999999999999999e-93  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.700284  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0824  xylose isomerase domain-containing protein  51.71 
 
 		 303 aa  328  1.0000000000000001e-88  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0941  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  52.05 
 
 		 303 aa  327  1.0000000000000001e-88  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2490  xylose isomerase domain-containing protein  51.21 
 
 		 303 aa  306  3e-82  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.279776  normal  0.973607 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0730  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  44.6 
 
 		 295 aa  256  3e-67  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.200556  normal  1 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7455  hypothetical protein  37.98 
 
 		 292 aa  214  1.9999999999999998e-54  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.652021  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1271  xylose isomerase domain protein TIM barrel  33.33 
 
 		 298 aa  164  2.0000000000000002e-39  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.713181 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3346  xylose isomerase-like TIM barrel  30.8 
 
 		 297 aa  161  1e-38  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0217845  normal  0.180586 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1422  xylose isomerase-like  32.07 
 
 		 297 aa  158  2e-37  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0452084  normal  0.457038 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_50250  hypothetical protein  33.92 
 
 		 307 aa  156  6e-37  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.508803  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1247  putative myo-inositol catabolism protein  32.28 
 
 		 313 aa  152  8.999999999999999e-36  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.537579  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1048  Myo-inosose-2 dehydratase  32.04 
 
 		 307 aa  146  5e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.513171  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0947  xylose isomerase-like TIM barrel  30.39 
 
 		 308 aa  145  1e-33  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.348697  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1309  xylose isomerase domain-containing protein  30.04 
 
 		 308 aa  145  1e-33  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1429  xylose isomerase domain-containing protein  30.39 
 
 		 308 aa  145  1e-33  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1407  xylose isomerase domain-containing protein  30.74 
 
 		 308 aa  145  1e-33  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.872133 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4573  xylose isomerase-like TIM barrel  30.04 
 
 		 308 aa  143  4e-33  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1348  xylose isomerase domain-containing protein  29.68 
 
 		 308 aa  141  9.999999999999999e-33  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3018  hypothetical protein  31.1 
 
 		 307 aa  139  4.999999999999999e-32  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.130345  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1886  xylose isomerase domain-containing protein  30.04 
 
 		 308 aa  139  6e-32  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.206917 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1521  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  32.01 
 
 		 294 aa  139  7e-32  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1696  Myo-inosose-2 dehydratase  31.79 
 
 		 308 aa  139  7.999999999999999e-32  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2054  xylose isomerase domain-containing protein  31.67 
 
 		 308 aa  134  1.9999999999999998e-30  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1620  hypothetical protein  27.7 
 
 		 298 aa  129  5.0000000000000004e-29  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1615  hypothetical protein  27.7 
 
 		 298 aa  127  2.0000000000000002e-28  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2612  xylose isomerase domain-containing protein  33.58 
 
 		 294 aa  119  9e-26  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3969  xylose isomerase domain-containing protein  31.62 
 
 		 290 aa  110  3e-23  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0171269  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6852  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  34.81 
 
 		 284 aa  109  5e-23  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0571066  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3595  Myo-inosose-2 dehydratase  33.81 
 
 		 297 aa  109  6e-23  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1722  xylose isomerase-like TIM barrel  31.62 
 
 		 299 aa  106  4e-22  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.688264  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5562  Myo-inosose-2 dehydratase  34.6 
 
 		 281 aa  106  5e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4487  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  32.35 
 
 		 289 aa  106  6e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.411638  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3352  Myo-inosose-2 dehydratase  31.18 
 
 		 296 aa  105  1e-21  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0467219  normal  0.0568196 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1362  Myo-inosose-2 dehydratase  30.69 
 
 		 294 aa  103  5e-21  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4706  inosose dehydratase  25.85 
 
 		 301 aa  100  3e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000727756  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3079  Myo-inosose-2 dehydratase  32.35 
 
 		 287 aa  100  4e-20  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.977094  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8495  Myo-inosose-2 dehydratase  29.54 
 
 		 311 aa  99.8  7e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.795487 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4013  Myo-inosose-2 dehydratase  23.89 
 
 		 297 aa  97.8  3e-19  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0303  myo-inositol catabolism protein  25.51 
 
 		 298 aa  95.5  1e-18  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0086  myo-inositol catabolism protein IolE  22.44 
 
 		 297 aa  94.4  3e-18  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0078  hypothetical protein  28.09 
 
 		 300 aa  93.6  5e-18  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5448  Myo-inosose-2 dehydratase  30.48 
 
 		 295 aa  92.4  9e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.10992  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5694  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  25.9 
 
 		 300 aa  92.4  1e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.986609  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2299  myo-inositol catabolism protein  24.75 
 
 		 298 aa  91.7  2e-17  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4190  xylose isomerase-like TIM barrel  26.36 
 
 		 371 aa  91.7  2e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.720259  hitchhiker  0.00898811 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2531  putative IolE protein  25.17 
 
 		 298 aa  91.3  2e-17  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.32551e-17 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7800  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  27.76 
 
 		 301 aa  90.9  3e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2255  myo-inositol catabolism protein  25.17 
 
 		 298 aa  89.4  7e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_4017  xylose isomerase domain-containing protein  27.82 
 
 		 302 aa  89  9e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3285  sugar phosphate isomerase/epimerase, IolE  29.33 
 
 		 302 aa  88.2  2e-16  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4656  xylose isomerase domain-containing protein  23.67 
 
 		 298 aa  85.1  0.000000000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.335563 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2336  hypothetical protein  28.92 
 
 		 237 aa  83.6  0.000000000000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3333  Myo-inosose-2 dehydratase  26.18 
 
 		 296 aa  83.2  0.000000000000005  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2811  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  25.52 
 
 		 305 aa  82.8  0.000000000000007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.279544  normal  0.182339 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0486  putative myo-inositol catabolism protein  24.83 
 
 		 297 aa  81.6  0.00000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.425956  normal  0.198393 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1577  myo-inositol catabolism protein  23.83 
 
 		 298 aa  80.9  0.00000000000003  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.357804  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1324  putative myo-inositol catabolism LolE protein  25.17 
 
 		 308 aa  80.5  0.00000000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2981  Myo-inosose-2 dehydratase  25.49 
 
 		 359 aa  79.7  0.00000000000006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.833328 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0043  xylose isomerase domain-containing protein  26.28 
 
 		 308 aa  79.7  0.00000000000006  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3138  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  25.49 
 
 		 359 aa  79.7  0.00000000000006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2932  xylose isomerase domain-containing protein  27.11 
 
 		 308 aa  79.7  0.00000000000007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.688703 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0911  hypothetical protein  27.3 
 
 		 306 aa  78.6  0.0000000000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1442  AP endonuclease  27.3 
 
 		 306 aa  78.6  0.0000000000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.609184  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0438  hypothetical protein  27.3 
 
 		 306 aa  78.6  0.0000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1653  AP endonuclease  27.3 
 
 		 306 aa  78.6  0.0000000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.959785  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0724  AP endonuclease  27.3 
 
 		 306 aa  78.6  0.0000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.367793  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2835  xylose isomerase domain-containing protein  26.9 
 
 		 310 aa  79  0.0000000000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.840707  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1829  hypothetical protein  27.3 
 
 		 306 aa  77.8  0.0000000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0766527  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1675  AP endonuclease  27.3 
 
 		 306 aa  77.8  0.0000000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.173299  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0671  hypothetical protein  26.59 
 
 		 300 aa  77.8  0.0000000000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1816  xylose isomerase domain-containing protein  26.33 
 
 		 304 aa  77.4  0.0000000000003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.670883 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_50050  2-keto-myo-inositol dehydratase  25.36 
 
 		 303 aa  77  0.0000000000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.602375  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4213  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  28.57 
 
 		 340 aa  76.6  0.0000000000005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2325  xylose isomerase domain-containing protein  28.21 
 
 		 303 aa  76.3  0.0000000000007  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3316  xylose isomerase domain-containing protein  25.82 
 
 		 309 aa  76.3  0.0000000000007  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0715  hypothetical protein  26.22 
 
 		 300 aa  76.3  0.0000000000008  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1596  xylose isomerase domain-containing protein  24.83 
 
 		 310 aa  75.5  0.000000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1399  xylose isomerase domain-containing protein  24.65 
 
 		 309 aa  75.5  0.000000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1238  putative myo-inositol catabolism protein  25.96 
 
 		 309 aa  74.3  0.000000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0939  xylose isomerase-like TIM barrel  24.3 
 
 		 309 aa  74.7  0.000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.00907131  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1421  xylose isomerase domain-containing protein  24.3 
 
 		 309 aa  74.7  0.000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1602  xylose isomerase domain-containing protein  23.89 
 
 		 306 aa  74.3  0.000000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.334485  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2649  hypothetical protein  25.85 
 
 		 306 aa  73.6  0.000000000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0432409  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1301  xylose isomerase domain-containing protein  24.65 
 
 		 309 aa  73.2  0.000000000006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3839  xylose isomerase domain-containing protein  26.34 
 
 		 300 aa  72.4  0.00000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1340  xylose isomerase domain-containing protein  24.3 
 
 		 309 aa  72  0.00000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3273  AP endonuclease  25.36 
 
 		 301 aa  71.2  0.00000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0853475  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1342  Myo-inosose-2 dehydratase  25.18 
 
 		 296 aa  71.6  0.00000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.606088  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2995  Myo-inosose-2 dehydratase  24.82 
 
 		 296 aa  70.9  0.00000000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5989  xylose isomerase domain-containing protein  23.9 
 
 		 312 aa  70.9  0.00000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.63499  normal  0.171061 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1674  xylose isomerase domain-containing protein  25 
 
 		 298 aa  70.1  0.00000000005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0986  xylose isomerase domain-containing protein  24.12 
 
 		 273 aa  69.7  0.00000000007  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2414  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  27.43 
 
 		 924 aa  69.3  0.00000000009  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4565  xylose isomerase-like TIM barrel  23.94 
 
 		 309 aa  68.9  0.0000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0833957  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0067  xylose isomerase domain-containing protein  25.35 
 
 		 318 aa  68.9  0.0000000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0290166  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3560  xylose isomerase domain-containing protein  27.27 
 
 		 300 aa  68.2  0.0000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.27811 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>