95 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cwoe_5062 on replicon NC_013739
Organism: Conexibacter woesei DSM 14684



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013739  Cwoe_5062  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  100 
 
 		 286 aa  565  1e-160  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1934  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  42.44 
 
 		 281 aa  176  3e-43  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1980  xylose isomerase domain-containing protein  25.19 
 
 		 274 aa  62.8  0.000000007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0621  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  27.17 
 
 		 281 aa  61.2  0.00000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0779  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  27.19 
 
 		 276 aa  58.9  0.00000008  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1781  hydroxypyruvate isomerase  29.94 
 
 		 269 aa  58.9  0.00000008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.168778  normal  0.857209 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3955  xylose isomerase domain-containing protein  28.46 
 
 		 276 aa  58.9  0.00000009  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  decreased coverage  0.00177251  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1020  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  31.9 
 
 		 275 aa  58.5  0.0000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4206  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  25.62 
 
 		 247 aa  58.2  0.0000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.386672  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2966  oxidoreductase domain protein  34.78 
 
 		 699 aa  57.4  0.0000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2874  oxidoreductase domain protein  33.96 
 
 		 699 aa  56.2  0.0000006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2461  hydroxypyruvate isomerase  30.49 
 
 		 269 aa  55.1  0.000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.731976  normal  0.599526 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0409  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  30.62 
 
 		 274 aa  54.7  0.000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3088  hydroxypyruvate isomerase  30.57 
 
 		 263 aa  53.5  0.000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.645228  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0781  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  27.34 
 
 		 282 aa  53.1  0.000005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2172  hydroxypyruvate isomerase  29.87 
 
 		 269 aa  52  0.00001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.42054  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1324  putative myo-inositol catabolism LolE protein  30.5 
 
 		 308 aa  50.8  0.00002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2811  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  31.58 
 
 		 305 aa  51.2  0.00002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.279544  normal  0.182339 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1602  xylose isomerase domain-containing protein  30.83 
 
 		 306 aa  50.4  0.00003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.334485  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1722  xylose isomerase-like TIM barrel  29.46 
 
 		 299 aa  50.1  0.00005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.688264  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4760  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  27.32 
 
 		 274 aa  49.3  0.00006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.362033  normal  0.0199285 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0895  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  21.2 
 
 		 281 aa  49.7  0.00006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3741  hydroxypyruvate isomerase  28.66 
 
 		 259 aa  49.3  0.00007  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.476363  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5713  L-xylulose 5-phosphate 3-epimerase  28.1 
 
 		 284 aa  49.3  0.00008  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3796  hexulose-6-phosphate isomerase  28.1 
 
 		 284 aa  48.9  0.00008  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.542065  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4668  L-xylulose 5-phosphate 3-epimerase  28.1 
 
 		 284 aa  48.9  0.00009  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2300  hydroxypyruvate isomerase  29.22 
 
 		 262 aa  48.9  0.0001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.946761  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04026  hypothetical protein  28.1 
 
 		 284 aa  48.9  0.0001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2260  hydroxypyruvate isomerase  29.22 
 
 		 262 aa  48.9  0.0001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.654587  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04064  L-xylulose 5-phosphate 3-epimerase  28.1 
 
 		 284 aa  48.9  0.0001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4758  L-xylulose 5-phosphate 3-epimerase  28.1 
 
 		 284 aa  48.9  0.0001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0459  hydroxypyruvate isomerase  28.93 
 
 		 264 aa  48.9  0.0001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0230369  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2425  hydroxypyruvate isomerase  29.22 
 
 		 262 aa  48.9  0.0001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4441  L-xylulose 5-phosphate 3-epimerase  28.1 
 
 		 284 aa  48.9  0.0001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3700  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  27.18 
 
 		 299 aa  48.1  0.0002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1298  hydroxypyruvate isomerase  27.49 
 
 		 259 aa  48.1  0.0002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3436  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  21.15 
 
 		 288 aa  47.8  0.0002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2911  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  28.1 
 
 		 297 aa  47.8  0.0002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.180268  normal  0.124085 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4616  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  25.91 
 
 		 332 aa  47.8  0.0002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1537  xylose isomerase domain-containing protein  31.45 
 
 		 283 aa  47.4  0.0003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.505536  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1508  xylose isomerase-like TIM barrel  31.01 
 
 		 295 aa  47  0.0004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.291962  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4048  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  33.09 
 
 		 286 aa  46.6  0.0004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1621  hydroxypyruvate isomerase  26.62 
 
 		 266 aa  47  0.0004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.377689  normal  0.533551 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6321  xylose isomerase domain-containing protein  31.01 
 
 		 295 aa  47  0.0004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2880  xylose isomerase domain-containing protein  32.58 
 
 		 335 aa  46.6  0.0004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_28960  sugar phosphate isomerase/epimerase  27.35 
 
 		 260 aa  46.2  0.0006  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4309  hydroxypyruvate isomerase  28.48 
 
 		 271 aa  45.8  0.0007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0533507 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3816  L-xylulose 5-phosphate 3-epimerase  27.62 
 
 		 284 aa  45.8  0.0009  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00643692 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4186  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  30.36 
 
 		 300 aa  45.8  0.001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3113  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  25.98 
 
 		 256 aa  45.1  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.787534  normal  0.440249 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1675  AP endonuclease  30.25 
 
 		 306 aa  45.1  0.001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.173299  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2948  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  23.99 
 
 		 323 aa  45.4  0.001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0043  xylose isomerase domain-containing protein  29.32 
 
 		 308 aa  45.4  0.001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4727  L-xylulose 5-phosphate 3-epimerase  27.14 
 
 		 284 aa  45.1  0.001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.639292  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6979  xylose isomerase domain-containing protein  30.23 
 
 		 295 aa  45.4  0.001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.363123  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2684  xylose isomerase domain-containing protein  27.14 
 
 		 297 aa  45.1  0.001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.16562  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1829  hypothetical protein  30.25 
 
 		 306 aa  45.1  0.001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0766527  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2770  hydroxypyruvate isomerase  25.71 
 
 		 265 aa  45.1  0.001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0252433  normal  0.732675 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2649  hypothetical protein  30.25 
 
 		 306 aa  44.3  0.002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0432409  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1910  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  26.64 
 
 		 282 aa  44.7  0.002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2249  Sugar phosphate isomerase/epimerase-like protein  31.41 
 
 		 263 aa  44.7  0.002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.622554 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0119  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  24.76 
 
 		 338 aa  44.3  0.002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2806  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  27.65 
 
 		 297 aa  44.3  0.002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4748  L-xylulose 5-phosphate 3-epimerase  26.72 
 
 		 284 aa  44.3  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1577  myo-inositol catabolism protein  27.14 
 
 		 298 aa  43.9  0.003  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.357804  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0724  AP endonuclease  30.25 
 
 		 306 aa  44.3  0.003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.367793  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1079  Xylose isomerase domain-containing protein TIM barrel  29.59 
 
 		 266 aa  43.9  0.003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0911  hypothetical protein  30.25 
 
 		 306 aa  44.3  0.003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1597  hydroxypyruvate isomerase  26.54 
 
 		 260 aa  43.9  0.003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00143749  normal  0.674901 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1653  AP endonuclease  30.25 
 
 		 306 aa  44.3  0.003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.959785  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0438  hypothetical protein  30.25 
 
 		 306 aa  44.3  0.003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3352  Myo-inosose-2 dehydratase  25.55 
 
 		 296 aa  43.9  0.003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0467219  normal  0.0568196 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1442  AP endonuclease  30.25 
 
 		 306 aa  44.3  0.003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.609184  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3955  hydroxypyruvate isomerase  27.16 
 
 		 259 aa  44.3  0.003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4784  L-xylulose 5-phosphate 3-epimerase  26.24 
 
 		 284 aa  43.5  0.004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.871942  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4655  L-xylulose 5-phosphate 3-epimerase  26.24 
 
 		 284 aa  43.5  0.004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4665  L-xylulose 5-phosphate 3-epimerase  26.24 
 
 		 284 aa  43.5  0.004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.389961  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0958  hydroxypyruvate isomerase  27.5 
 
 		 267 aa  43.5  0.004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0086  xylose isomerase domain-containing protein  28.24 
 
 		 334 aa  43.1  0.005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2256  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  25.26 
 
 		 321 aa  43.1  0.005  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.480899 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2296  xylose isomerase domain-containing protein  29.05 
 
 		 284 aa  43.1  0.006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.837995  normal  0.299582 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4979  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  24.21 
 
 		 283 aa  43.1  0.006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.426661  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1134  hydroxypyruvate isomerase  27.68 
 
 		 259 aa  42.7  0.006  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.852559 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2326  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  26.92 
 
 		 284 aa  42.7  0.007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  decreased coverage  0.00147679  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5560  hydroxypyruvate isomerase  25.81 
 
 		 261 aa  42.7  0.007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.446227  normal  0.0996892 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3378  hydroxypyruvate isomerase  26.92 
 
 		 264 aa  42.7  0.007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.490297  normal  0.0397331 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1521  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  27.46 
 
 		 294 aa  42.7  0.008  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2155  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  22.54 
 
 		 322 aa  42.4  0.008  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1496  xylose isomerase domain-containing protein  26.44 
 
 		 279 aa  42.4  0.009  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  hitchhiker  0.00334669  normal  0.969169 
 
 
-
 
NC_007488  RSP_3944  AP endonuclease  31.74 
 
 		 285 aa  42.4  0.009  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0718494  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4805  L-xylulose 5-phosphate 3-epimerase  25.74 
 
 		 284 aa  42.4  0.009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.296767  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1715  xylose isomerase-like TIM barrel  25.77 
 
 		 272 aa  42  0.01  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1208  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  21.36 
 
 		 309 aa  42  0.01  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.116756  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3195  hydroxypyruvate isomerase  28.77 
 
 		 263 aa  42  0.01  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.568718  normal  0.0120723 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11150  sugar phosphate isomerase/epimerase  32.06 
 
 		 335 aa  42  0.01  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.750375  normal  0.0940368 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>