More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nmag_0781 on replicon NC_013922
Organism: Natrialba magadii ATCC 43099



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013922  Nmag_0781  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  100 
 
 
282 aa  563  1.0000000000000001e-159  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1981  xylose isomerase domain-containing protein  43.62 
 
 
287 aa  231  1e-59  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1980  xylose isomerase domain-containing protein  37.01 
 
 
274 aa  179  2.9999999999999997e-44  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0779  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  35.92 
 
 
276 aa  146  5e-34  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2286  xylose isomerase domain-containing protein  35.4 
 
 
277 aa  135  8e-31  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0370511  normal  0.0282506 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2684  xylose isomerase domain-containing protein  34.42 
 
 
297 aa  127  3e-28  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.16562  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2911  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  34.06 
 
 
297 aa  126  4.0000000000000003e-28  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.180268  normal  0.124085 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2806  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  33.59 
 
 
297 aa  118  9.999999999999999e-26  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2522  xylose isomerase domain-containing protein  28.96 
 
 
281 aa  112  5e-24  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1020  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  33.83 
 
 
275 aa  112  5e-24  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3593  xylose isomerase domain-containing protein  33.69 
 
 
290 aa  111  1.0000000000000001e-23  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.671139  decreased coverage  0.000150106 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3316  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  28.66 
 
 
313 aa  104  1e-21  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2326  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  32.06 
 
 
284 aa  101  1e-20  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  decreased coverage  0.00147679  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2524  xylose isomerase domain-containing protein  27.9 
 
 
287 aa  98.6  1e-19  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3432  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  31.23 
 
 
316 aa  95.1  1e-18  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0982928  normal  0.0112247 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11110  sugar phosphate isomerase/epimerase  30.25 
 
 
480 aa  94.4  2e-18  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.479367  normal  0.230414 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1910  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  30.45 
 
 
282 aa  84.7  0.000000000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3842  fructoselysine 3-epimerase  26.45 
 
 
276 aa  82.8  0.000000000000006  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4684  fructoselysine 3-epimerase  26.45 
 
 
275 aa  82.8  0.000000000000007  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0340  fructoselysine 3-epimerase  26.09 
 
 
276 aa  82  0.00000000000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.452792 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03223  predicted isomerase  26.09 
 
 
276 aa  80.9  0.00000000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0340  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  26.09 
 
 
276 aa  80.9  0.00000000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03175  hypothetical protein  26.09 
 
 
276 aa  80.9  0.00000000000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3568  fructoselysine 3-epimerase  26.09 
 
 
276 aa  81.3  0.00000000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3750  fructoselysine 3-epimerase  26.09 
 
 
276 aa  80.5  0.00000000000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.238004  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1244  putative protein implicated IN myo-inositol catabolique pathway  23.47 
 
 
303 aa  72.8  0.000000000006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.341536  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0945  xylose isomerase-like TIM barrel  25.12 
 
 
303 aa  72.4  0.000000000008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.879537  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1427  xylose isomerase domain-containing protein  25.12 
 
 
303 aa  72.4  0.000000000008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.815598  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1405  xylose isomerase domain-containing protein  24.49 
 
 
303 aa  71.6  0.00000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1346  xylose isomerase domain-containing protein  24.49 
 
 
304 aa  70.9  0.00000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1307  xylose isomerase domain-containing protein  24.65 
 
 
304 aa  70.5  0.00000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4299  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  22.93 
 
 
275 aa  70.1  0.00000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.172805  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4571  xylose isomerase-like TIM barrel  24.65 
 
 
303 aa  68.6  0.0000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.985344  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2368  hydroxypyruvate isomerase  29.45 
 
 
259 aa  67.8  0.0000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.592212  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1496  xylose isomerase domain-containing protein  26.09 
 
 
279 aa  68.2  0.0000000002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  hitchhiker  0.00334669  normal  0.969169 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1113  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  26.44 
 
 
277 aa  68.2  0.0000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1485  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  22.7 
 
 
310 aa  67  0.0000000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1888  xylose isomerase domain-containing protein  24.19 
 
 
303 aa  66.2  0.0000000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.289277 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8563  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  25.38 
 
 
278 aa  65.1  0.000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0314267  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1698  xylose isomerase domain-containing protein TIM barrel  26.79 
 
 
268 aa  65.1  0.000000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3113  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  26.29 
 
 
256 aa  65.5  0.000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.787534  normal  0.440249 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0504  xylose isomerase domain-containing protein  23.9 
 
 
270 aa  65.1  0.000000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000275929  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3693  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  23.31 
 
 
270 aa  63.2  0.000000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3371  Hydroxypyruvate isomerase  26.29 
 
 
256 aa  63.2  0.000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.55933  normal  0.171039 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6262  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  25.94 
 
 
278 aa  62.4  0.000000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0689378  normal  0.603305 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4701  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  26.92 
 
 
290 aa  62  0.000000009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0621  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  24.54 
 
 
281 aa  61.2  0.00000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5464  xylose isomerase domain-containing protein  24.26 
 
 
279 aa  60.8  0.00000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.448037  normal  0.953141 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4784  L-xylulose 5-phosphate 3-epimerase  24.6 
 
 
284 aa  60.5  0.00000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.871942  normal 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7804  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  22.48 
 
 
299 aa  60.5  0.00000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4655  L-xylulose 5-phosphate 3-epimerase  24.6 
 
 
284 aa  60.5  0.00000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1810  xylose isomerase domain-containing protein  22.14 
 
 
287 aa  60.1  0.00000004  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.753291 
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4583  xylose isomerase domain-containing protein  24.41 
 
 
278 aa  60.1  0.00000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0943  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  25.33 
 
 
291 aa  60.1  0.00000005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4748  L-xylulose 5-phosphate 3-epimerase  24.6 
 
 
284 aa  59.7  0.00000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3267  AP endonuclease  22.26 
 
 
286 aa  59.7  0.00000006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3493  iolH protein  22.26 
 
 
286 aa  59.3  0.00000008  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.00667421  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0509  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  22.8 
 
 
289 aa  58.9  0.00000008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.440598  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_50120  myo-inositol catabolism protein IolH  22.67 
 
 
285 aa  58.9  0.00000008  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2394  xylose isomerase domain-containing protein  30.61 
 
 
259 aa  58.9  0.00000009  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1807  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  28.57 
 
 
277 aa  58.9  0.0000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2613  hydroxypyruvate isomerase  31.33 
 
 
267 aa  58.5  0.0000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0797  xylose isomerase domain-containing protein  27.37 
 
 
268 aa  58.5  0.0000001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0606735  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1971  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  26.42 
 
 
265 aa  58.5  0.0000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0027  xylose isomerase domain-containing protein  27.89 
 
 
268 aa  58.5  0.0000001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  decreased coverage  0.0054119  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3648  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  25 
 
 
286 aa  58.5  0.0000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.0394614 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4727  L-xylulose 5-phosphate 3-epimerase  23.79 
 
 
284 aa  58.2  0.0000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.639292  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2927  xylose isomerase domain-containing protein  20.47 
 
 
307 aa  57.8  0.0000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0837933  normal  0.217068 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0155  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  26.64 
 
 
332 aa  57.8  0.0000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4665  L-xylulose 5-phosphate 3-epimerase  24.19 
 
 
284 aa  58.2  0.0000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.389961  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4538  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  26.42 
 
 
281 aa  57.8  0.0000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.535239 
 
 
-
 
NC_007488  RSP_3944  AP endonuclease  26.64 
 
 
285 aa  57  0.0000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0718494  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1528  xylose isomerase-like TIM barrel  22.82 
 
 
269 aa  57.4  0.0000003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.317464  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0991  xylose isomerase domain-containing protein  24.03 
 
 
304 aa  57  0.0000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1257  xylose isomerase domain-containing protein  23.05 
 
 
264 aa  57  0.0000003  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.666664  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4441  L-xylulose 5-phosphate 3-epimerase  23.79 
 
 
284 aa  57  0.0000004  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3816  L-xylulose 5-phosphate 3-epimerase  23.85 
 
 
284 aa  57  0.0000004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00643692 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0287  putative L-xylulose 5-phosphate 3-epimerase  24.54 
 
 
290 aa  56.6  0.0000004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.790888  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0423  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  25.68 
 
 
287 aa  56.6  0.0000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.985837  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4719  hydroxypyruvate isomerase  30.36 
 
 
258 aa  57  0.0000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00317481 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0128  hexulose-6-phosphate isomerase  23.72 
 
 
286 aa  56.2  0.0000005  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4865  hydroxypyruvate isomerase Gcxl  23.55 
 
 
260 aa  56.6  0.0000005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.798851  normal  0.469511 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5713  L-xylulose 5-phosphate 3-epimerase  23.85 
 
 
284 aa  56.2  0.0000005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3786  putative L-xylulose 5-phosphate 3-epimerase  23.72 
 
 
286 aa  56.2  0.0000005  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0132  putative L-xylulose 5-phosphate 3-epimerase  23.72 
 
 
286 aa  56.2  0.0000005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.482678  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4027  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  23.68 
 
 
275 aa  56.2  0.0000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.383869  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0529  xylose isomerase-like TIM barrel  25.26 
 
 
281 aa  56.2  0.0000006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0189964  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0820  xylose isomerase domain-containing protein  31.03 
 
 
278 aa  56.2  0.0000006  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3268  xylose isomerase domain-containing protein  30.43 
 
 
333 aa  56.2  0.0000006  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.60758 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04064  L-xylulose 5-phosphate 3-epimerase  23.85 
 
 
284 aa  55.8  0.0000007  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4758  L-xylulose 5-phosphate 3-epimerase  23.85 
 
 
284 aa  55.8  0.0000007  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2425  hydroxypyruvate isomerase  23.97 
 
 
262 aa  55.8  0.0000007  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0086  myo-inositol catabolism protein IolE  26.57 
 
 
297 aa  55.8  0.0000007  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1167  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  23.73 
 
 
306 aa  55.8  0.0000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.100222 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4979  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  24.32 
 
 
283 aa  55.8  0.0000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.426661  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2260  hydroxypyruvate isomerase  23.97 
 
 
262 aa  55.8  0.0000007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.654587  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2300  hydroxypyruvate isomerase  23.97 
 
 
262 aa  55.8  0.0000007  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.946761  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04026  hypothetical protein  23.85 
 
 
284 aa  55.8  0.0000007  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4805  L-xylulose 5-phosphate 3-epimerase  23.85 
 
 
284 aa  55.8  0.0000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.296767  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1158  hydroxypyruvate isomerase  25.98 
 
 
268 aa  55.8  0.0000008  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.671898  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>