139 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cmaq_1496 on replicon NC_009954
Organism: Caldivirga maquilingensis IC-167



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009954  Cmaq_1496  xylose isomerase domain-containing protein  100 
 
 
279 aa  566  1e-160  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  hitchhiker  0.00334669  normal  0.969169 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1208  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  33.2 
 
 
309 aa  157  3e-37  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.116756  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2872  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  35.71 
 
 
300 aa  145  5e-34  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00133727  normal  0.0357921 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0948  xylose isomerase domain-containing protein  33.83 
 
 
272 aa  132  6e-30  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0121  putative L-xylulose 5-phosphate 3-epimerase  25 
 
 
290 aa  78.2  0.0000000000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0287  putative L-xylulose 5-phosphate 3-epimerase  24.3 
 
 
290 aa  76.6  0.0000000000004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.790888  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0649  putative L-xylulose 5-phosphate 3-epimerase  23.05 
 
 
282 aa  73.2  0.000000000004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5464  xylose isomerase domain-containing protein  26.17 
 
 
279 aa  71.6  0.00000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.448037  normal  0.953141 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2721  xylose isomerase domain-containing protein  27.43 
 
 
280 aa  70.1  0.00000000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.543869  normal  0.780906 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0126  hexulose-6-phosphate isomerase  22.57 
 
 
291 aa  70.1  0.00000000004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4185  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  25.9 
 
 
273 aa  69.3  0.00000000007  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0146  hexulose-6-phosphate isomerase  22.18 
 
 
291 aa  68.9  0.00000000009  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0781  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  26.09 
 
 
282 aa  68.2  0.0000000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2848  xylose isomerase-like TIM barrel  25.25 
 
 
282 aa  66.6  0.0000000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.561386  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0323  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  27.42 
 
 
536 aa  64.3  0.000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4727  L-xylulose 5-phosphate 3-epimerase  25.77 
 
 
284 aa  63.5  0.000000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.639292  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5713  L-xylulose 5-phosphate 3-epimerase  26.19 
 
 
284 aa  63.9  0.000000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04064  L-xylulose 5-phosphate 3-epimerase  26.19 
 
 
284 aa  63.5  0.000000004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4441  L-xylulose 5-phosphate 3-epimerase  26.19 
 
 
284 aa  63.5  0.000000004  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4758  L-xylulose 5-phosphate 3-epimerase  26.19 
 
 
284 aa  63.5  0.000000004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3816  L-xylulose 5-phosphate 3-epimerase  26.19 
 
 
284 aa  63.2  0.000000004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00643692 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4805  L-xylulose 5-phosphate 3-epimerase  25.82 
 
 
284 aa  63.5  0.000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.296767  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_04026  hypothetical protein  26.19 
 
 
284 aa  63.5  0.000000004  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4748  L-xylulose 5-phosphate 3-epimerase  25.82 
 
 
284 aa  63.2  0.000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0531  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  26.34 
 
 
258 aa  63.2  0.000000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1020  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  27 
 
 
275 aa  62.8  0.000000007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4668  L-xylulose 5-phosphate 3-epimerase  25.79 
 
 
284 aa  62.8  0.000000007  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3905  putative L-xylulose 5-phosphate 3-epimerase  25 
 
 
286 aa  62.4  0.000000009  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4655  L-xylulose 5-phosphate 3-epimerase  25.41 
 
 
284 aa  62  0.000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4784  L-xylulose 5-phosphate 3-epimerase  25.41 
 
 
284 aa  62  0.000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.871942  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03434  predicted L-xylulose 5-phosphate 3-epimerase  25 
 
 
286 aa  61.6  0.00000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4079  putative L-xylulose 5-phosphate 3-epimerase  25 
 
 
286 aa  61.6  0.00000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03385  hypothetical protein  25 
 
 
286 aa  61.6  0.00000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0128  hexulose-6-phosphate isomerase  25 
 
 
286 aa  60.8  0.00000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3796  hexulose-6-phosphate isomerase  25.79 
 
 
284 aa  61.2  0.00000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.542065  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3786  putative L-xylulose 5-phosphate 3-epimerase  25 
 
 
286 aa  60.8  0.00000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0132  putative L-xylulose 5-phosphate 3-epimerase  25 
 
 
286 aa  60.8  0.00000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.482678  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0779  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  23.23 
 
 
276 aa  61.2  0.00000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1912  xylose isomerase domain-containing protein  23.83 
 
 
271 aa  60.5  0.00000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.193983  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1981  xylose isomerase domain-containing protein  26.28 
 
 
287 aa  60.8  0.00000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3938  putative L-xylulose 5-phosphate 3-epimerase  24.9 
 
 
286 aa  60.5  0.00000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5488  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  26.74 
 
 
285 aa  60.1  0.00000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.479008 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0988  putative L-xylulose 5-phosphate 3-epimerase  23.67 
 
 
294 aa  60.1  0.00000004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0393582  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4665  L-xylulose 5-phosphate 3-epimerase  25 
 
 
284 aa  59.7  0.00000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.389961  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0511  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  25.45 
 
 
258 aa  58.9  0.00000008  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.717082  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3697  putative L-xylulose 5-phosphate 3-epimerase  24.08 
 
 
286 aa  58.2  0.0000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1320  hexulose-6-phosphate isomerase  23.35 
 
 
289 aa  57.8  0.0000002  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3894  putative L-xylulose 5-phosphate 3-epimerase  24.08 
 
 
286 aa  57  0.0000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1980  xylose isomerase domain-containing protein  22.09 
 
 
274 aa  56.6  0.0000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4299  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  22.26 
 
 
275 aa  56.2  0.0000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.172805  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2200  xylose isomerase domain-containing protein  26.12 
 
 
288 aa  55.8  0.0000007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0830  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  24.64 
 
 
272 aa  55.8  0.0000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.801774  normal  0.909409 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1811  putative L-xylulose 5-phosphate 3-epimerase  25.2 
 
 
287 aa  55.5  0.0000009  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.00140377  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1537  xylose isomerase domain-containing protein  23.74 
 
 
283 aa  55.1  0.000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.505536  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1909  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  30.12 
 
 
280 aa  54.3  0.000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0504  xylose isomerase domain-containing protein  23.19 
 
 
270 aa  54.7  0.000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000275929  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0331  putative L-xylulose 5-phosphate 3-epimerase  22.75 
 
 
282 aa  54.7  0.000002  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1257  xylose isomerase domain-containing protein  25.69 
 
 
264 aa  53.9  0.000003  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.666664  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2326  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  22.42 
 
 
284 aa  53.9  0.000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  decreased coverage  0.00147679  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3999  putative L-xylulose 5-phosphate 3-epimerase  24.6 
 
 
286 aa  53.9  0.000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.873782 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3890  putative L-xylulose 5-phosphate 3-epimerase  24.6 
 
 
286 aa  53.9  0.000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4061  putative L-xylulose 5-phosphate 3-epimerase  24.6 
 
 
286 aa  53.9  0.000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.849569 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0949  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  24.77 
 
 
272 aa  53.5  0.000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3954  putative L-xylulose 5-phosphate 3-epimerase  24.6 
 
 
286 aa  53.5  0.000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.139672  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1910  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  28.57 
 
 
282 aa  53.1  0.000005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0772  putative L-xylulose 5-phosphate 3-epimerase  22.98 
 
 
290 aa  53.1  0.000005  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.692507  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0622  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  24.46 
 
 
308 aa  53.1  0.000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3648  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  27.32 
 
 
286 aa  53.1  0.000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.0394614 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1662  xylose isomerase domain-containing protein  23.6 
 
 
274 aa  53.1  0.000005  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.36383  hitchhiker  0.00346458 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2522  xylose isomerase domain-containing protein  21.6 
 
 
281 aa  52.8  0.000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3700  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  25.76 
 
 
299 aa  52.8  0.000006  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3874  putative L-xylulose 5-phosphate 3-epimerase  24.6 
 
 
286 aa  52.8  0.000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3269  putative L-xylulose 5-phosphate 3-epimerase  23.2 
 
 
293 aa  52  0.00001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0931  putative L-xylulose 5-phosphate 3-epimerase  23.2 
 
 
293 aa  51.6  0.00001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.298482 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3402  putative L-xylulose 5-phosphate 3-epimerase  23.2 
 
 
293 aa  52  0.00001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3316  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  21.53 
 
 
313 aa  51.2  0.00002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0542  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  24.76 
 
 
250 aa  50.8  0.00002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5867  xylose isomerase domain-containing protein  23.02 
 
 
295 aa  50.4  0.00003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.102013  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2368  hydroxypyruvate isomerase  23.31 
 
 
259 aa  50.4  0.00003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.592212  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1136  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  20.85 
 
 
312 aa  50.4  0.00003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0782  xylose isomerase domain-containing protein  25.48 
 
 
289 aa  50.1  0.00004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4045  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  25.75 
 
 
278 aa  50.1  0.00004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4979  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  25.1 
 
 
283 aa  49.7  0.00005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.426661  normal 
 
 
-
 
NC_007488  RSP_3944  AP endonuclease  26.23 
 
 
285 aa  49.3  0.00007  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0718494  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2151  xylose isomerase-like TIM barrel  24.86 
 
 
257 aa  49.3  0.00007  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00601378  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1485  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  22.84 
 
 
310 aa  49.3  0.00007  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0568  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  24.39 
 
 
272 aa  48.9  0.0001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3708  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  26.03 
 
 
286 aa  48.5  0.0001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3271  xylose isomerase domain-containing protein  23.11 
 
 
295 aa  48.1  0.0001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.170281  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0234  AMP-dependent synthetase and ligase  31.09 
 
 
843 aa  48.1  0.0001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.0000591284  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4672  Mannonate dehydratase  25 
 
 
318 aa  48.5  0.0001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4980  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  22.81 
 
 
295 aa  48.9  0.0001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.263775  normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1348  hypothetical protein  24.61 
 
 
271 aa  47.8  0.0002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.359859  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0036  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  26.54 
 
 
283 aa  47.4  0.0002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29070  sugar phosphate isomerase/epimerase  25.33 
 
 
288 aa  47.4  0.0002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.92681  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0582  xylose isomerase domain-containing protein  30.72 
 
 
305 aa  47  0.0003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0101642  normal  0.477879 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0433  xylose isomerase domain-containing protein  29.57 
 
 
279 aa  47  0.0003  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0435  xylose isomerase domain-containing protein  24.42 
 
 
266 aa  47  0.0003  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0529  xylose isomerase-like TIM barrel  23.9 
 
 
281 aa  46.6  0.0004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0189964  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1993  putative L-xylulose 5-phosphate 3-epimerase  22.92 
 
 
287 aa  46.6  0.0005  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>