57 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg2_0830 on replicon NC_011369
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011369  Rleg2_0830  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  100 
 
 		 272 aa  556  1e-157  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.801774  normal  0.909409 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0949  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  92.28 
 
 		 272 aa  518  1e-146  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6463  hypothetical protein  59.78 
 
 		 273 aa  340  2e-92  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.920651  normal  0.578843 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0319  xylose isomerase domain-containing protein TIM barrel  44.85 
 
 		 273 aa  230  2e-59  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0023  xylose isomerase domain-containing protein  27.6 
 
 		 277 aa  92.8  5e-18  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.140146  normal  0.179482 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3128  hypothetical protein  24.52 
 
 		 257 aa  81.3  0.00000000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3371  AP endonuclease  29.44 
 
 		 256 aa  75.1  0.000000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3876  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  26.27 
 
 		 256 aa  74.3  0.000000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.883338 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4159  xylose isomerase domain-containing protein  25.71 
 
 		 257 aa  73.9  0.000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3793  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  25.74 
 
 		 256 aa  72.4  0.000000000007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1143  xylose isomerase domain-containing protein  28.57 
 
 		 243 aa  70.1  0.00000000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2460  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  26.74 
 
 		 270 aa  65.9  0.0000000006  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.0967776 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1299  xylose isomerase domain-containing protein  28.29 
 
 		 237 aa  64.7  0.000000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.47167  normal  0.0132415 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1398  xylose isomerase-like TIM barrel  27.57 
 
 		 271 aa  63.9  0.000000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0876  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  23.36 
 
 		 255 aa  62.4  0.000000008  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2599  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  26.94 
 
 		 282 aa  61.6  0.00000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0027  xylose isomerase domain-containing protein  25.23 
 
 		 268 aa  59.7  0.00000004  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  decreased coverage  0.0054119  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0740  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  25.11 
 
 		 243 aa  59.7  0.00000004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.103383  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0064  xylose isomerase-like TIM barrel  23.16 
 
 		 256 aa  58.9  0.00000008  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2151  xylose isomerase-like TIM barrel  22.22 
 
 		 257 aa  58.9  0.00000009  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00601378  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1121  xylose isomerase domain-containing protein  24.65 
 
 		 268 aa  58.5  0.0000001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1257  xylose isomerase domain-containing protein  24.75 
 
 		 264 aa  58.2  0.0000001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.666664  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2972  xylose isomerase domain-containing protein  24.31 
 
 		 255 aa  57.4  0.0000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0797  xylose isomerase domain-containing protein  24.77 
 
 		 268 aa  56.6  0.0000004  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0606735  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2404  xylose isomerase domain-containing protein  25.25 
 
 		 262 aa  56.2  0.0000005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.167076 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1496  xylose isomerase domain-containing protein  24.64 
 
 		 279 aa  55.8  0.0000008  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  hitchhiker  0.00334669  normal  0.969169 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1364  hypothetical protein  22.58 
 
 		 256 aa  54.3  0.000002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.00000110599  hitchhiker  0.0000000254981 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1928  hypothetical protein  23.32 
 
 		 251 aa  54.7  0.000002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0655  AP endonuclease  26.61 
 
 		 278 aa  53.9  0.000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0973  hypothetical protein  27.17 
 
 		 257 aa  53.5  0.000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1379  hypothetical protein  23.08 
 
 		 242 aa  53.1  0.000005  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.100757  normal  0.0567681 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0174  xylose isomerase domain-containing protein  24.02 
 
 		 236 aa  52.4  0.000008  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1458  xylose isomerase domain-containing protein  26.19 
 
 		 255 aa  52  0.00001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.931629 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0361  xylose isomerase domain-containing protein  25.38 
 
 		 253 aa  50.4  0.00003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.934654  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3105  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  23.75 
 
 		 257 aa  49.7  0.00005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0600  xylose isomerase domain-containing protein  26.88 
 
 		 244 aa  48.5  0.0001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.352505  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0863  xylose isomerase domain-containing protein  21.8 
 
 		 268 aa  48.1  0.0002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.780816  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0649  xylose isomerase domain-containing protein  28.43 
 
 		 304 aa  46.6  0.0004  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  hitchhiker  0.0000488201  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3293  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  32.39 
 
 		 262 aa  46.6  0.0005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3760  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  30 
 
 		 288 aa  46.2  0.0006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4598  xylose isomerase-like TIM barrel  23.41 
 
 		 277 aa  45.8  0.0007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0036  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  25.12 
 
 		 283 aa  45.4  0.001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0432  xylose isomerase domain-containing protein  32.11 
 
 		 258 aa  45.4  0.001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0871  hypothetical protein  25.52 
 
 		 241 aa  44.3  0.002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.00496229  hitchhiker  0.00660497 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4666  endonuclease IV  28.77 
 
 		 269 aa  44.3  0.002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.343531  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0340  fructoselysine 3-epimerase  26.73 
 
 		 276 aa  43.1  0.005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.452792 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4684  fructoselysine 3-epimerase  26.73 
 
 		 275 aa  43.1  0.005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3842  fructoselysine 3-epimerase  26.73 
 
 		 276 aa  43.1  0.005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3568  fructoselysine 3-epimerase  24.11 
 
 		 276 aa  43.1  0.005  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03175  hypothetical protein  24.11 
 
 		 276 aa  43.1  0.005  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0340  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  24.11 
 
 		 276 aa  43.1  0.005  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03223  predicted isomerase  24.11 
 
 		 276 aa  43.1  0.005  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0997  xylose isomerase domain-containing protein  23.12 
 
 		 279 aa  42.7  0.006  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.596977  normal  0.586532 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3750  fructoselysine 3-epimerase  24.11 
 
 		 276 aa  42.4  0.008  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.238004  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0988  xylose isomerase domain-containing protein  25 
 
 		 253 aa  42.4  0.008  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.279783 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1715  xylose isomerase-like TIM barrel  22.67 
 
 		 256 aa  42.4  0.008  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.436698  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2030  xylose isomerase domain-containing protein  26.46 
 
 		 307 aa  42  0.01  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>