68 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Glov_0876 on replicon NC_010814
Organism: Geobacter lovleyi SZ



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010814  Glov_0876  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  100 
 
 		 255 aa  532  1e-150  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2972  xylose isomerase domain-containing protein  52.55 
 
 		 255 aa  285  4e-76  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4159  xylose isomerase domain-containing protein  50.79 
 
 		 257 aa  276  2e-73  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3793  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  48.24 
 
 		 256 aa  270  1e-71  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3371  AP endonuclease  49.21 
 
 		 256 aa  270  2e-71  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0064  xylose isomerase-like TIM barrel  48.03 
 
 		 256 aa  268  7e-71  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3876  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  47.84 
 
 		 256 aa  265  5e-70  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.883338 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3128  hypothetical protein  42.34 
 
 		 257 aa  206  3e-52  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0023  xylose isomerase domain-containing protein  32.4 
 
 		 277 aa  148  7e-35  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.140146  normal  0.179482 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3105  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  32.78 
 
 		 257 aa  125  6e-28  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0655  AP endonuclease  31.54 
 
 		 278 aa  115  5e-25  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2460  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  29.75 
 
 		 270 aa  110  2.0000000000000002e-23  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.0967776 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2404  xylose isomerase domain-containing protein  28.45 
 
 		 262 aa  103  3e-21  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.167076 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1257  xylose isomerase domain-containing protein  28.37 
 
 		 264 aa  100  3e-20  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.666664  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1121  xylose isomerase domain-containing protein  29.78 
 
 		 268 aa  97.8  1e-19  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0027  xylose isomerase domain-containing protein  29.33 
 
 		 268 aa  97.4  2e-19  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  decreased coverage  0.0054119  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2599  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  29.3 
 
 		 282 aa  97.1  3e-19  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0797  xylose isomerase domain-containing protein  28.89 
 
 		 268 aa  95.9  5e-19  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0606735  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0863  xylose isomerase domain-containing protein  26.11 
 
 		 268 aa  90.9  2e-17  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.780816  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14000  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  27.33 
 
 		 254 aa  86.7  3e-16  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.50908  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0973  hypothetical protein  28.7 
 
 		 257 aa  84  0.000000000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1715  xylose isomerase-like TIM barrel  31.25 
 
 		 256 aa  82.8  0.000000000000005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.436698  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2151  xylose isomerase-like TIM barrel  26.13 
 
 		 257 aa  80.5  0.00000000000003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00601378  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0036  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  25.23 
 
 		 264 aa  79.7  0.00000000000005  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.875943  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1364  hypothetical protein  29.1 
 
 		 256 aa  79  0.00000000000007  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.00000110599  hitchhiker  0.0000000254981 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1592  xylose isomerase domain-containing protein  31.56 
 
 		 257 aa  74.7  0.000000000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.234456 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1528  xylose isomerase-like TIM barrel  25.77 
 
 		 269 aa  73.9  0.000000000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.317464  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0361  xylose isomerase domain-containing protein  28.02 
 
 		 253 aa  73.6  0.000000000003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.934654  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1928  hypothetical protein  28.85 
 
 		 251 aa  72.4  0.000000000007  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0122  xylose isomerase domain-containing protein  24.53 
 
 		 254 aa  71.6  0.00000000001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.668761  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1263  hypothetical protein  27.69 
 
 		 269 aa  71.2  0.00000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1555  xylose isomerase domain-containing protein  28.75 
 
 		 257 aa  70.5  0.00000000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.123696  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6463  hypothetical protein  23.94 
 
 		 273 aa  68.6  0.0000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.920651  normal  0.578843 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0949  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  23.77 
 
 		 272 aa  67  0.0000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0474  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  25.12 
 
 		 256 aa  66.2  0.0000000005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4598  xylose isomerase-like TIM barrel  28.65 
 
 		 277 aa  63.9  0.000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0830  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  23.36 
 
 		 272 aa  62.4  0.000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.801774  normal  0.909409 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1398  xylose isomerase-like TIM barrel  28.99 
 
 		 271 aa  61.2  0.00000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1458  xylose isomerase domain-containing protein  27.57 
 
 		 255 aa  59.7  0.00000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.931629 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0247  xylose isomerase domain-containing protein TIM barrel  30.73 
 
 		 253 aa  59.3  0.00000006  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1379  hypothetical protein  26.7 
 
 		 242 aa  59.3  0.00000006  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.100757  normal  0.0567681 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1974  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  28.44 
 
 		 256 aa  58.2  0.0000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.520711 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0988  xylose isomerase domain-containing protein  25 
 
 		 253 aa  57  0.0000003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.279783 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0319  xylose isomerase domain-containing protein TIM barrel  24.61 
 
 		 273 aa  56.6  0.0000004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0531  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  30.91 
 
 		 258 aa  56.2  0.0000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0499  xylose isomerase domain-containing protein  21.05 
 
 		 304 aa  53.5  0.000003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00421742  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0871  hypothetical protein  29.12 
 
 		 241 aa  52.8  0.000005  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.00496229  hitchhiker  0.00660497 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0600  xylose isomerase domain-containing protein  26.32 
 
 		 244 aa  52.8  0.000006  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.352505  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1980  xylose isomerase domain-containing protein  27.5 
 
 		 274 aa  52  0.000009  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0511  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  28.92 
 
 		 258 aa  50.8  0.00002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.717082  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3010  xylose isomerase-like TIM barrel  23.98 
 
 		 281 aa  50.8  0.00002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0325  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  29.36 
 
 		 305 aa  48.1  0.0002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.105989  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0174  xylose isomerase domain-containing protein  24.32 
 
 		 236 aa  47.4  0.0002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3156  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  28.22 
 
 		 331 aa  47.8  0.0002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1143  xylose isomerase domain-containing protein  24.07 
 
 		 243 aa  47  0.0003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0740  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  23.36 
 
 		 243 aa  46.2  0.0005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.103383  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3448  N-acylneuraminate-9-phosphate synthase  24.73 
 
 		 749 aa  45.8  0.0006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2668  N-acylneuraminate-9-phosphate synthase  24.73 
 
 		 749 aa  45.8  0.0006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2522  xylose isomerase domain-containing protein  25.69 
 
 		 281 aa  45.8  0.0007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1580  N-acylneuraminate-9-phosphate synthase  31.51 
 
 		 749 aa  45.4  0.0009  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3693  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  21.13 
 
 		 270 aa  44.3  0.002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4027  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  32.61 
 
 		 275 aa  44.3  0.002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.383869  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1494  xylose isomerase domain-containing protein  23.62 
 
 		 269 aa  44.7  0.002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.747131  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1299  xylose isomerase domain-containing protein  25.53 
 
 		 237 aa  44.3  0.002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.47167  normal  0.0132415 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0530  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  23.98 
 
 		 273 aa  43.1  0.004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.297775  normal  0.967129 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4942  N-acetylneuraminate synthase  31.51 
 
 		 748 aa  42.7  0.006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0458  N-acylneuraminate-9-phosphate synthase  32.88 
 
 		 762 aa  42.4  0.007  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.147767  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4163  xylose isomerase domain-containing protein  25.3 
 
 		 257 aa  42  0.01  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>