80 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Memar_1143 on replicon NC_009051
Organism: Methanoculleus marisnigri JR1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009051  Memar_1143  xylose isomerase domain-containing protein  100 
 
 		 243 aa  496  1e-139  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0740  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  62.29 
 
 		 243 aa  310  9e-84  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.103383  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0871  hypothetical protein  57.26 
 
 		 241 aa  273  3e-72  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.00496229  hitchhiker  0.00660497 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0174  xylose isomerase domain-containing protein  56.78 
 
 		 236 aa  270  1e-71  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1299  xylose isomerase domain-containing protein  52.97 
 
 		 237 aa  259  2e-68  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.47167  normal  0.0132415 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0442  hypothetical protein  35.74 
 
 		 240 aa  160  1e-38  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1379  hypothetical protein  38.91 
 
 		 242 aa  156  3e-37  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.100757  normal  0.0567681 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0600  xylose isomerase domain-containing protein  39.83 
 
 		 244 aa  152  5e-36  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.352505  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0988  xylose isomerase domain-containing protein  36.28 
 
 		 253 aa  133  3e-30  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.279783 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1555  xylose isomerase domain-containing protein  35.85 
 
 		 257 aa  110  2.0000000000000002e-23  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.123696  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0122  xylose isomerase domain-containing protein  25.98 
 
 		 254 aa  99.4  4e-20  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.668761  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1121  xylose isomerase domain-containing protein  31.03 
 
 		 268 aa  99.4  4e-20  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0027  xylose isomerase domain-containing protein  31.03 
 
 		 268 aa  98.2  1e-19  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  decreased coverage  0.0054119  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1715  xylose isomerase-like TIM barrel  29.89 
 
 		 256 aa  97.8  1e-19  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.436698  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1364  hypothetical protein  35.36 
 
 		 256 aa  97.4  2e-19  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.00000110599  hitchhiker  0.0000000254981 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0797  xylose isomerase domain-containing protein  31.03 
 
 		 268 aa  97.1  2e-19  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0606735  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0863  xylose isomerase domain-containing protein  31.72 
 
 		 268 aa  97.4  2e-19  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.780816  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1974  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  32.88 
 
 		 256 aa  95.5  7e-19  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.520711 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2151  xylose isomerase-like TIM barrel  29.3 
 
 		 257 aa  95.1  1e-18  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00601378  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0361  xylose isomerase domain-containing protein  32.81 
 
 		 253 aa  94  2e-18  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.934654  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1592  xylose isomerase domain-containing protein  33.17 
 
 		 257 aa  92.8  5e-18  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.234456 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1257  xylose isomerase domain-containing protein  29.54 
 
 		 264 aa  90.9  1e-17  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.666664  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0973  hypothetical protein  28.89 
 
 		 257 aa  85.1  0.000000000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6463  hypothetical protein  30.63 
 
 		 273 aa  74.7  0.000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.920651  normal  0.578843 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0531  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  34.22 
 
 		 258 aa  73.6  0.000000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0949  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  28.57 
 
 		 272 aa  71.2  0.00000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3793  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  30.1 
 
 		 256 aa  70.9  0.00000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1398  xylose isomerase-like TIM barrel  32.39 
 
 		 271 aa  70.9  0.00000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0830  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  28.57 
 
 		 272 aa  70.1  0.00000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.801774  normal  0.909409 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0319  xylose isomerase domain-containing protein TIM barrel  28.97 
 
 		 273 aa  69.7  0.00000000004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0511  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  31.89 
 
 		 258 aa  68.2  0.0000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.717082  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3876  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  30.57 
 
 		 256 aa  68.2  0.0000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.883338 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1458  xylose isomerase domain-containing protein  30.77 
 
 		 255 aa  67.4  0.0000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.931629 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0036  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  27.64 
 
 		 264 aa  65.5  0.0000000008  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.875943  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4163  xylose isomerase domain-containing protein  33.74 
 
 		 257 aa  64.7  0.000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3371  AP endonuclease  31.07 
 
 		 256 aa  64.3  0.000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0474  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  29.95 
 
 		 256 aa  63.5  0.000000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1537  xylose isomerase domain-containing protein  24.76 
 
 		 265 aa  62.4  0.000000007  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.36398  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4159  xylose isomerase domain-containing protein  28.14 
 
 		 257 aa  61.2  0.00000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0023  xylose isomerase domain-containing protein  27.83 
 
 		 277 aa  61.2  0.00000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.140146  normal  0.179482 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1528  xylose isomerase-like TIM barrel  29.39 
 
 		 269 aa  58.2  0.0000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.317464  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1263  hypothetical protein  27.6 
 
 		 269 aa  57.4  0.0000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3128  hypothetical protein  27.09 
 
 		 257 aa  57  0.0000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4598  xylose isomerase-like TIM barrel  29.94 
 
 		 277 aa  57  0.0000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0499  xylose isomerase domain-containing protein  25.89 
 
 		 304 aa  57  0.0000003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00421742  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0064  xylose isomerase-like TIM barrel  26.47 
 
 		 256 aa  54.7  0.000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2404  xylose isomerase domain-containing protein  28.41 
 
 		 262 aa  54.3  0.000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.167076 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9360  apurinic endonuclease Apn1  27.86 
 
 		 252 aa  53.5  0.000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.480693  normal  0.839717 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4952  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  27.14 
 
 		 256 aa  53.5  0.000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0990  endonuclease IV  30.81 
 
 		 268 aa  53.1  0.000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.238948  normal  0.511136 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1000  endonuclease IV  30.81 
 
 		 268 aa  53.1  0.000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.445691 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0972  endonuclease IV  30.81 
 
 		 268 aa  53.1  0.000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0247  xylose isomerase domain-containing protein TIM barrel  30.96 
 
 		 253 aa  52  0.000008  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2972  xylose isomerase domain-containing protein  31.84 
 
 		 255 aa  52  0.000009  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2094  xylose isomerase domain-containing protein  29.2 
 
 		 291 aa  50.4  0.00003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.253985  normal  0.225095 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1261  endonuclease IV  25.23 
 
 		 259 aa  49.7  0.00004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.645529  normal  0.628172 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10684  endonuclease IV  26.77 
 
 		 252 aa  48.1  0.0001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0188886  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3693  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  28.96 
 
 		 270 aa  48.1  0.0001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4666  endonuclease IV  25.12 
 
 		 269 aa  47.4  0.0002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.343531  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5093  endonuclease IV  26.39 
 
 		 250 aa  47.8  0.0002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.254368  normal  0.214987 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0876  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  24.07 
 
 		 255 aa  47  0.0003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1978  xylose isomerase domain-containing protein  28.3 
 
 		 274 aa  46.6  0.0003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0339  endonuclease IV  28.16 
 
 		 262 aa  46.2  0.0005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.699481 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2460  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  25.59 
 
 		 270 aa  45.8  0.0006  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.0967776 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3648  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  28.48 
 
 		 286 aa  45.8  0.0006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.0394614 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7037  endonuclease IV  25.98 
 
 		 256 aa  45.8  0.0006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0655  AP endonuclease  25.58 
 
 		 278 aa  45.8  0.0006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1496  xylose isomerase domain-containing protein  27.22 
 
 		 279 aa  45.1  0.001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  hitchhiker  0.00334669  normal  0.969169 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39360  Endonuclease IV  30.86 
 
 		 256 aa  45.1  0.001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.548212 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5713  L-xylulose 5-phosphate 3-epimerase  25.3 
 
 		 284 aa  44.3  0.002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3816  L-xylulose 5-phosphate 3-epimerase  24.7 
 
 		 284 aa  43.9  0.002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00643692 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0680  apurinic endonuclease Apn1  26.87 
 
 		 253 aa  44.3  0.002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000161396 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04064  L-xylulose 5-phosphate 3-epimerase  24.7 
 
 		 284 aa  43.1  0.004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04026  hypothetical protein  24.7 
 
 		 284 aa  43.1  0.004  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4668  L-xylulose 5-phosphate 3-epimerase  24.7 
 
 		 284 aa  43.1  0.004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4758  L-xylulose 5-phosphate 3-epimerase  24.7 
 
 		 284 aa  43.1  0.004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4441  L-xylulose 5-phosphate 3-epimerase  24.7 
 
 		 284 aa  43.1  0.004  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4727  L-xylulose 5-phosphate 3-epimerase  24.7 
 
 		 284 aa  42.7  0.006  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.639292  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3631  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  23.4 
 
 		 275 aa  42.4  0.006  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.9121  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3796  hexulose-6-phosphate isomerase  24.7 
 
 		 284 aa  42.4  0.007  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.542065  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>